MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014834	GCC	2	6	419969	419974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931773
11002	NC_014834	TGG	2	6	420021	420026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931773
11003	NC_014834	GCG	2	6	420031	420036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931773
11004	NC_014834	CG	3	6	420044	420049	0 %	0 %	50 %	50 %	316931773
11005	NC_014834	CTA	2	6	420052	420057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931773
11006	NC_014834	TCG	2	6	420081	420086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931773
11007	NC_014834	ATC	2	6	420098	420103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931773
11008	NC_014834	CCGA	2	8	420122	420129	25 %	0 %	25 %	50 %	316931773
11009	NC_014834	CGC	2	6	420196	420201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931773
11010	NC_014834	GCT	2	6	420235	420240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931773
11011	NC_014834	GGGC	2	8	420304	420311	0 %	0 %	75 %	25 %	316931773
11012	NC_014834	CAG	2	6	420325	420330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_014834	CCG	2	6	420359	420364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11014	NC_014834	GAG	2	6	420412	420417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_014834	AGGATG	2	12	420440	420451	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_014834	TC	3	6	420466	420471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11017	NC_014834	AGC	2	6	420498	420503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931774
11018	NC_014834	CCG	2	6	420505	420510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931774
11019	NC_014834	CCGAT	2	10	420514	420523	20 %	20 %	20 %	40 %	316931774
11020	NC_014834	TGC	2	6	420580	420585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931774
11021	NC_014834	CGA	2	6	420593	420598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931774
11022	NC_014834	GAA	2	6	420624	420629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931774
11023	NC_014834	GCC	3	9	420650	420658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931774
11024	NC_014834	GC	3	6	420696	420701	0 %	0 %	50 %	50 %	316931774
11025	NC_014834	ATC	2	6	420712	420717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931774
11026	NC_014834	TGAT	2	8	420742	420749	25 %	50 %	25 %	0 %	316931774
11027	NC_014834	TGG	2	6	420769	420774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931774
11028	NC_014834	GC	4	8	420796	420803	0 %	0 %	50 %	50 %	316931774
11029	NC_014834	GC	3	6	420834	420839	0 %	0 %	50 %	50 %	316931774
11030	NC_014834	TCT	2	6	420952	420957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931774
11031	NC_014834	CAG	2	6	420960	420965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931774
11032	NC_014834	TTGCGT	2	12	420979	420990	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	316931774
11033	NC_014834	GC	3	6	421015	421020	0 %	0 %	50 %	50 %	316931774
11034	NC_014834	CG	3	6	421102	421107	0 %	0 %	50 %	50 %	316931774
11035	NC_014834	AC	3	6	421130	421135	50 %	0 %	0 %	50 %	316931774
11036	NC_014834	CGT	2	6	421187	421192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931775
11037	NC_014834	GGA	2	6	421250	421255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931775
11038	NC_014834	CG	3	6	421296	421301	0 %	0 %	50 %	50 %	316931775
11039	NC_014834	GCC	2	6	421325	421330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931775
11040	NC_014834	CGG	2	6	421349	421354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931775
11041	NC_014834	GGC	2	6	421365	421370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931775
11042	NC_014834	CGC	2	6	421410	421415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931775
11043	NC_014834	CTC	2	6	421470	421475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931775
11044	NC_014834	CGAG	2	8	421484	421491	25 %	0 %	50 %	25 %	316931775
11045	NC_014834	TCG	2	6	421504	421509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931775
11046	NC_014834	TCGG	2	8	421513	421520	0 %	25 %	50 %	25 %	316931775
11047	NC_014834	TCG	2	6	421639	421644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931775
11048	NC_014834	CAGGTG	2	12	421659	421670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316931775
11049	NC_014834	GATC	2	8	421730	421737	25 %	25 %	25 %	25 %	316931775
11050	NC_014834	CGC	2	6	421888	421893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931775
11051	NC_014834	GAT	2	6	421950	421955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931775
11052	NC_014834	CAG	2	6	422031	422036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931775
11053	NC_014834	GCG	2	6	422039	422044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931775
11054	NC_014834	ATG	2	6	422062	422067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931775
11055	NC_014834	TCT	2	6	422081	422086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931775
11056	NC_014834	GC	3	6	422123	422128	0 %	0 %	50 %	50 %	316931775
11057	NC_014834	GGC	2	6	422133	422138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931775
11058	NC_014834	GTC	2	6	422163	422168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931775
11059	NC_014834	CGC	2	6	422199	422204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931775
11060	NC_014834	GAT	2	6	422244	422249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931775
11061	NC_014834	GC	4	8	422262	422269	0 %	0 %	50 %	50 %	316931775
11062	NC_014834	CTG	2	6	422286	422291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931775
11063	NC_014834	GGC	2	6	422405	422410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931775
11064	NC_014834	TGA	2	6	422420	422425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931775
11065	NC_014834	GC	3	6	422458	422463	0 %	0 %	50 %	50 %	316931776
11066	NC_014834	GCC	2	6	422510	422515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931776
11067	NC_014834	TCA	2	6	422518	422523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931776
11068	NC_014834	TGTCGC	2	12	422533	422544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931776
11069	NC_014834	GCCG	2	8	422560	422567	0 %	0 %	50 %	50 %	316931776
11070	NC_014834	CCGT	2	8	422587	422594	0 %	25 %	25 %	50 %	316931776
11071	NC_014834	GCCGC	2	10	422608	422617	0 %	0 %	40 %	60 %	316931776
11072	NC_014834	GGC	2	6	422636	422641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931776
11073	NC_014834	CGA	2	6	422707	422712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931776
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11075	NC_014834	TCG	2	6	422802	422807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931776
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11080	NC_014834	GGCCG	2	10	422984	422993	0 %	0 %	60 %	40 %	316931776
11081	NC_014834	GC	3	6	423065	423070	0 %	0 %	50 %	50 %	316931776
11082	NC_014834	TTG	2	6	423117	423122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931776
11083	NC_014834	GCCGG	2	10	423154	423163	0 %	0 %	60 %	40 %	316931776
11084	NC_014834	GCA	3	9	423166	423174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931776
11085	NC_014834	GCC	2	6	423198	423203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931776
11086	NC_014834	CCGC	2	8	423205	423212	0 %	0 %	25 %	75 %	316931776
11087	NC_014834	CGGC	2	8	423217	423224	0 %	0 %	50 %	50 %	316931776
11088	NC_014834	ACC	2	6	423255	423260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931776
11089	NC_014834	GC	3	6	423310	423315	0 %	0 %	50 %	50 %	316931776
11090	NC_014834	CGC	2	6	423331	423336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11091	NC_014834	GCC	3	9	423373	423381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11092	NC_014834	GGC	2	6	423382	423387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_014834	CCG	2	6	423410	423415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_014834	CGGGA	2	10	423429	423438	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11095	NC_014834	CGGAT	2	10	423447	423456	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11096	NC_014834	CG	3	6	423486	423491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11097	NC_014834	TGC	2	6	423500	423505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_014834	GA	3	6	423546	423551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_014834	TGGAA	2	10	423552	423561	40 %	20 %	40 %	0 %	316931777
11100	NC_014834	CCTG	2	8	423566	423573	0 %	25 %	25 %	50 %	316931777
11101	NC_014834	GCA	2	6	423691	423696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931777
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11103	NC_014834	CGG	2	6	423854	423859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931777
11104	NC_014834	CCG	2	6	423887	423892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931777
11105	NC_014834	AG	3	6	423906	423911	50 %	0 %	50 %	0 %	316931777
11106	NC_014834	GGT	2	6	423930	423935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931777
11107	NC_014834	GATG	2	8	423981	423988	25 %	25 %	50 %	0 %	316931777
11108	NC_014834	GCT	2	6	424008	424013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931777
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11110	NC_014834	GAT	2	6	424069	424074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931777
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11113	NC_014834	ACA	2	6	424208	424213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931777
11114	NC_014834	CGA	2	6	424239	424244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931777
11115	NC_014834	AAG	2	6	424246	424251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931777
11116	NC_014834	GAG	2	6	424276	424281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931777
11117	NC_014834	ATGAA	2	10	424342	424351	60 %	20 %	20 %	0 %	316931777
11118	NC_014834	CGCT	2	8	424359	424366	0 %	25 %	25 %	50 %	316931778
11119	NC_014834	GCT	2	6	424374	424379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931778
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11121	NC_014834	TCG	2	6	424393	424398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931778
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11123	NC_014834	TCG	2	6	424438	424443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931778
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11228	NC_014834	TC	6	12	428640	428651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11229	NC_014834	CG	3	6	428684	428689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11230	NC_014834	CGT	2	6	428758	428763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931783
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11232	NC_014834	AAG	2	6	428789	428794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931783
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11235	NC_014834	CTCGAC	2	12	428912	428923	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316931783
11236	NC_014834	GC	3	6	428949	428954	0 %	0 %	50 %	50 %	316931783
11237	NC_014834	CCG	2	6	428988	428993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931783
11238	NC_014834	CAA	2	6	429016	429021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931783
11239	NC_014834	GCC	2	6	429056	429061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931783
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11241	NC_014834	GCGGT	2	10	429138	429147	0 %	20 %	60 %	20 %	316931784
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