MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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101502	NC_014834	CAG	2	6	3865242	3865247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101503	NC_014834	GC	3	6	3865262	3865267	0 %	0 %	50 %	50 %	316934923
101504	NC_014834	CGG	2	6	3865316	3865321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934923
101505	NC_014834	CGT	2	6	3865331	3865336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101506	NC_014834	GGT	2	6	3865341	3865346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316934923
101507	NC_014834	GTA	2	6	3865380	3865385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316934923
101508	NC_014834	AGA	2	6	3865421	3865426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316934923
101509	NC_014834	ATC	2	6	3865428	3865433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316934923
101510	NC_014834	CGGCAC	2	12	3865491	3865502	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316934923
101511	NC_014834	GGT	2	6	3865518	3865523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316934923
101512	NC_014834	CAT	2	6	3865536	3865541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316934923
101513	NC_014834	GCA	2	6	3865565	3865570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101514	NC_014834	GCG	2	6	3865628	3865633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934923
101515	NC_014834	GCA	2	6	3865649	3865654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101516	NC_014834	ACC	2	6	3865717	3865722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316934923
101517	NC_014834	GGC	2	6	3865728	3865733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934923
101518	NC_014834	GC	3	6	3865804	3865809	0 %	0 %	50 %	50 %	316934923
101519	NC_014834	CAG	2	6	3865830	3865835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101520	NC_014834	GCA	2	6	3865850	3865855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101521	NC_014834	CGA	2	6	3865862	3865867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101522	NC_014834	CAG	2	6	3865896	3865901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101523	NC_014834	TGCGG	2	10	3865950	3865959	0 %	20 %	60 %	20 %	316934923
101524	NC_014834	GCC	3	9	3865989	3865997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934923
101525	NC_014834	GCA	2	6	3866013	3866018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101526	NC_014834	GCT	2	6	3866119	3866124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934923
101527	NC_014834	TTC	2	6	3866153	3866158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101528	NC_014834	GTT	2	6	3866169	3866174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101529	NC_014834	GCG	2	6	3866218	3866223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101530	NC_014834	CGA	2	6	3866294	3866299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101531	NC_014834	GCG	2	6	3866306	3866311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934924
101532	NC_014834	GGA	2	6	3866333	3866338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316934924
101533	NC_014834	CCG	2	6	3866392	3866397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934924
101534	NC_014834	GGT	2	6	3866408	3866413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316934924
101535	NC_014834	GCC	2	6	3866430	3866435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934924
101536	NC_014834	TGGC	2	8	3866451	3866458	0 %	25 %	50 %	25 %	316934924
101537	NC_014834	GAC	2	6	3866475	3866480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934924
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101539	NC_014834	CGG	2	6	3866495	3866500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934924
101540	NC_014834	GCT	2	6	3866528	3866533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934924
101541	NC_014834	CG	3	6	3866580	3866585	0 %	0 %	50 %	50 %	316934924
101542	NC_014834	GCG	2	6	3866620	3866625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934924
101543	NC_014834	GTG	2	6	3866715	3866720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316934924
101544	NC_014834	CTG	2	6	3866732	3866737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934924
101545	NC_014834	CGGC	2	8	3866744	3866751	0 %	0 %	50 %	50 %	316934924
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101549	NC_014834	GC	3	6	3866824	3866829	0 %	0 %	50 %	50 %	316934924
101550	NC_014834	GC	3	6	3866854	3866859	0 %	0 %	50 %	50 %	316934924
101551	NC_014834	GCG	2	6	3866871	3866876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934924
101552	NC_014834	TGCGC	2	10	3866882	3866891	0 %	20 %	40 %	40 %	316934924
101553	NC_014834	ACG	2	6	3866965	3866970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934924
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101557	NC_014834	ACCG	2	8	3867014	3867021	25 %	0 %	25 %	50 %	316934924
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101560	NC_014834	CG	3	6	3867135	3867140	0 %	0 %	50 %	50 %	316934924
101561	NC_014834	TGGC	2	8	3867153	3867160	0 %	25 %	50 %	25 %	316934924
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101565	NC_014834	CGG	2	6	3867284	3867289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934924
101566	NC_014834	CG	3	6	3867299	3867304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101567	NC_014834	GAG	2	6	3867376	3867381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101568	NC_014834	TCAA	2	8	3867502	3867509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101569	NC_014834	GCC	2	6	3867575	3867580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934925
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101572	NC_014834	CGA	2	6	3867810	3867815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934925
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101583	NC_014834	CGAT	2	8	3868199	3868206	25 %	25 %	25 %	25 %	316934925
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101585	NC_014834	TCGG	2	8	3868300	3868307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101586	NC_014834	GGCGC	2	10	3868308	3868317	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101587	NC_014834	GCTG	2	8	3868412	3868419	0 %	25 %	50 %	25 %	316934926
101588	NC_014834	CG	3	6	3868431	3868436	0 %	0 %	50 %	50 %	316934926
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101599	NC_014834	CGG	3	9	3868995	3869003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101600	NC_014834	GCC	2	6	3869006	3869011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101601	NC_014834	GCA	2	6	3869033	3869038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934927
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101603	NC_014834	CTG	2	6	3869052	3869057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934927
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101607	NC_014834	CGAAC	2	10	3869232	3869241	40 %	0 %	20 %	40 %	316934927
101608	NC_014834	GGC	2	6	3869271	3869276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934927
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101615	NC_014834	GCC	2	6	3869622	3869627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934927
101616	NC_014834	TCGA	2	8	3869686	3869693	25 %	25 %	25 %	25 %	316934927
101617	NC_014834	TGT	2	6	3869702	3869707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316934927
101618	NC_014834	GGC	2	6	3869709	3869714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934927
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101620	NC_014834	GCC	2	6	3869902	3869907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934927
101621	NC_014834	CGA	2	6	3869982	3869987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934927
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101623	NC_014834	CGT	2	6	3870080	3870085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934927
101624	NC_014834	GTTGCC	2	12	3870117	3870128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934927
101625	NC_014834	CGTTCA	2	12	3870212	3870223	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316934927
101626	NC_014834	GTG	2	6	3870256	3870261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316934927
101627	NC_014834	GGT	2	6	3870267	3870272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316934927
101628	NC_014834	GCT	2	6	3870275	3870280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934927
101629	NC_014834	GGTCAG	2	12	3870282	3870293	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316934927
101630	NC_014834	TCGG	2	8	3870340	3870347	0 %	25 %	50 %	25 %	316934927
101631	NC_014834	CGA	2	6	3870372	3870377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934927
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101633	NC_014834	TCG	2	6	3870440	3870445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934927
101634	NC_014834	GATC	2	8	3870488	3870495	25 %	25 %	25 %	25 %	316934927
101635	NC_014834	TCG	2	6	3870554	3870559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934927
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101638	NC_014834	TGT	2	6	3870614	3870619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316934927
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101643	NC_014834	GCC	2	6	3870795	3870800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934927
101644	NC_014834	GCACC	2	10	3870818	3870827	20 %	0 %	20 %	60 %	316934927
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101678	NC_014834	GAA	2	6	3872340	3872345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316934928
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101680	NC_014834	TGC	2	6	3872356	3872361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934928
101681	NC_014834	CGT	2	6	3872393	3872398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934928
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101687	NC_014834	GAG	2	6	3872588	3872593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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101693	NC_014834	CG	3	6	3872784	3872789	0 %	0 %	50 %	50 %	316934929
101694	NC_014834	CCG	3	9	3872837	3872845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934929
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101700	NC_014834	GCC	2	6	3873061	3873066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934929
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101702	NC_014834	GCT	2	6	3873121	3873126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316934929
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101712	NC_014834	GGC	2	6	3873358	3873363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934930
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101714	NC_014834	CGC	3	9	3873419	3873427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934930
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101716	NC_014834	CGG	2	6	3873475	3873480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934931
101717	NC_014834	CGC	3	9	3873481	3873489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934931
101718	NC_014834	CGC	2	6	3873500	3873505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934931
101719	NC_014834	TCA	2	6	3873510	3873515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316934931
101720	NC_014834	GAT	2	6	3873554	3873559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316934931
101721	NC_014834	CG	3	6	3873571	3873576	0 %	0 %	50 %	50 %	316934931
101722	NC_014834	CGA	2	6	3873613	3873618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934931
101723	NC_014834	GGC	2	6	3873626	3873631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934931
101724	NC_014834	GC	3	6	3873655	3873660	0 %	0 %	50 %	50 %	316934931
101725	NC_014834	GCC	2	6	3873689	3873694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934931
101726	NC_014834	TGTT	2	8	3873720	3873727	0 %	75 %	25 %	0 %	316934931
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101728	NC_014834	GC	3	6	3873763	3873768	0 %	0 %	50 %	50 %	316934932
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101843	NC_014834	CGC	2	6	3876982	3876987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934938
101844	NC_014834	CGA	2	6	3877003	3877008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316934938
101845	NC_014834	CGC	2	6	3877049	3877054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934938
101846	NC_014834	GCC	2	6	3877059	3877064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934938
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101935	NC_014834	TGGCT	2	10	3880218	3880227	0 %	40 %	40 %	20 %	316934942
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101943	NC_014834	GATT	2	8	3880631	3880638	25 %	50 %	25 %	0 %	316934942
101944	NC_014834	ACT	2	6	3880641	3880646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316934943
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101947	NC_014834	GC	3	6	3880720	3880725	0 %	0 %	50 %	50 %	316934943
101948	NC_014834	CGG	2	6	3880732	3880737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934943
101949	NC_014834	GCC	2	6	3880817	3880822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316934943
101950	NC_014834	CTA	2	6	3880850	3880855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316934943
101951	NC_014834	CCA	2	6	3880933	3880938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316934943
101952	NC_014834	GGC	2	6	3880967	3880972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316934943
101953	NC_014834	C	6	6	3881006	3881011	0 %	0 %	0 %	100 %	316934943
101954	NC_014834	TCC	2	6	3881022	3881027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316934943
101955	NC_014834	CCT	3	9	3881034	3881042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316934943
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