MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_014834	CGA	2	6	306322	306327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931666
8003	NC_014834	CAG	2	6	306329	306334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931666
8004	NC_014834	CGGC	2	8	306370	306377	0 %	0 %	50 %	50 %	316931666
8005	NC_014834	CG	4	8	306398	306405	0 %	0 %	50 %	50 %	316931666
8006	NC_014834	GCA	2	6	306412	306417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931666
8007	NC_014834	CGA	2	6	306427	306432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931666
8008	NC_014834	CCG	2	6	306442	306447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931666
8009	NC_014834	CCA	2	6	306560	306565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931666
8010	NC_014834	GCG	2	6	306571	306576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931666
8011	NC_014834	CGC	3	9	306586	306594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931666
8012	NC_014834	ATC	2	6	306600	306605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931666
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8014	NC_014834	GCCGC	2	10	306635	306644	0 %	0 %	40 %	60 %	316931666
8015	NC_014834	GCC	2	6	306657	306662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931666
8016	NC_014834	CGA	2	6	306673	306678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931666
8017	NC_014834	GCC	2	6	306738	306743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931666
8018	NC_014834	GCGCG	2	10	306748	306757	0 %	0 %	60 %	40 %	316931666
8019	NC_014834	ATGG	2	8	306782	306789	25 %	25 %	50 %	0 %	316931666
8020	NC_014834	GCA	3	9	306805	306813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931666
8021	NC_014834	GAA	2	6	306848	306853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931666
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8024	NC_014834	CAG	2	6	306962	306967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931666
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8028	NC_014834	TCG	2	6	307089	307094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931666
8029	NC_014834	CG	3	6	307105	307110	0 %	0 %	50 %	50 %	316931666
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8032	NC_014834	GAC	2	6	307169	307174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931666
8033	NC_014834	GCG	2	6	307238	307243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931666
8034	NC_014834	GCG	2	6	307290	307295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_014834	CAT	2	6	307298	307303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_014834	CGGC	2	8	307310	307317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_014834	CGG	2	6	307338	307343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_014834	CCGT	2	8	307361	307368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_014834	GCCGG	2	10	307376	307385	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8040	NC_014834	ACC	2	6	307412	307417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931667
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8045	NC_014834	CGAGCG	2	12	307567	307578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931667
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8053	NC_014834	AGC	2	6	307860	307865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931667
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8081	NC_014834	GGCCGC	2	12	308945	308956	0 %	0 %	50 %	50 %	316931667
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8366	NC_014834	CGA	2	6	318960	318965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931676
8367	NC_014834	ACG	2	6	318986	318991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931676
8368	NC_014834	GAT	2	6	319002	319007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931676
8369	NC_014834	AGT	2	6	319010	319015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931676
8370	NC_014834	CGG	3	9	319017	319025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8371	NC_014834	GTT	2	6	319030	319035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8372	NC_014834	GAG	2	6	319038	319043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8373	NC_014834	CGA	2	6	319049	319054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8374	NC_014834	GCTTC	2	10	319089	319098	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8375	NC_014834	AACT	2	8	319139	319146	50 %	25 %	0 %	25 %	316931677
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8378	NC_014834	GTTCGA	2	12	319284	319295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	316931677
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8392	NC_014834	TGG	2	6	319851	319856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931677
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8394	NC_014834	GGC	2	6	319885	319890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931677
8395	NC_014834	CGG	2	6	319904	319909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931677
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8467	NC_014834	CTG	2	6	322888	322893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931680
8468	NC_014834	ACG	2	6	322901	322906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931680
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8472	NC_014834	GGGC	2	8	323038	323045	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8473	NC_014834	GCCGAG	2	12	323097	323108	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931681
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8478	NC_014834	CGGC	2	8	323365	323372	0 %	0 %	50 %	50 %	316931681
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8480	NC_014834	CGA	2	6	323441	323446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931681
8481	NC_014834	GTC	2	6	323463	323468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931681
8482	NC_014834	GGC	2	6	323496	323501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931681
8483	NC_014834	CAG	2	6	323502	323507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931681
8484	NC_014834	CAC	3	9	323538	323546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931681
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8486	NC_014834	GAT	2	6	323607	323612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931681
8487	NC_014834	CGA	2	6	323678	323683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931681
8488	NC_014834	CAG	2	6	323724	323729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931681
8489	NC_014834	AGC	2	6	323776	323781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931681
8490	NC_014834	GC	3	6	323801	323806	0 %	0 %	50 %	50 %	316931681
8491	NC_014834	CAC	2	6	323814	323819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931681
8492	NC_014834	GCC	2	6	323865	323870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931681
8493	NC_014834	CGC	2	6	323927	323932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8494	NC_014834	CCG	2	6	323988	323993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8495	NC_014834	CGA	4	12	324029	324040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931682
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8499	NC_014834	CCCA	2	8	324286	324293	25 %	0 %	0 %	75 %	316931682
8500	NC_014834	CGTT	2	8	324328	324335	0 %	50 %	25 %	25 %	316931683

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