MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_014834	GCC	2	6	287593	287598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931646
7502	NC_014834	CCG	2	6	287679	287684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931647
7503	NC_014834	GAT	2	6	287737	287742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931647
7504	NC_014834	CCG	2	6	287759	287764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931647
7505	NC_014834	GCA	2	6	287772	287777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931647
7506	NC_014834	CAG	2	6	287794	287799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931647
7507	NC_014834	CGA	2	6	287838	287843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931647
7508	NC_014834	ACG	2	6	287861	287866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931647
7509	NC_014834	CAGGA	2	10	287882	287891	40 %	0 %	40 %	20 %	316931647
7510	NC_014834	CAG	2	6	287905	287910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931647
7511	NC_014834	GAT	2	6	287929	287934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931647
7512	NC_014834	GC	3	6	287954	287959	0 %	0 %	50 %	50 %	316931647
7513	NC_014834	CGATGA	2	12	288057	288068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7514	NC_014834	CCG	2	6	288080	288085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7515	NC_014834	GGC	2	6	288123	288128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_014834	ACCG	2	8	288152	288159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7517	NC_014834	CGT	2	6	288190	288195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_014834	CGG	2	6	288211	288216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_014834	CCA	2	6	288234	288239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7520	NC_014834	CG	3	6	288344	288349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7521	NC_014834	CAA	2	6	288353	288358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7522	NC_014834	TTC	2	6	288372	288377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_014834	TCGT	2	8	288405	288412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7524	NC_014834	GTG	2	6	288502	288507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_014834	GCC	2	6	288526	288531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7526	NC_014834	GCG	2	6	288565	288570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931648
7527	NC_014834	CGA	2	6	288580	288585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931648
7528	NC_014834	CCTT	2	8	288597	288604	0 %	50 %	0 %	50 %	316931648
7529	NC_014834	GTC	2	6	288608	288613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931648
7530	NC_014834	GCGA	2	8	288618	288625	25 %	0 %	50 %	25 %	316931648
7531	NC_014834	TCG	2	6	288652	288657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931648
7532	NC_014834	TCG	2	6	288819	288824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931648
7533	NC_014834	CGG	2	6	288834	288839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931648
7534	NC_014834	CAG	3	9	288845	288853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931648
7535	NC_014834	CGA	2	6	288874	288879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931648
7536	NC_014834	GCA	2	6	288886	288891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931648
7537	NC_014834	GC	3	6	288926	288931	0 %	0 %	50 %	50 %	316931648
7538	NC_014834	GGT	2	6	288938	288943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931648
7539	NC_014834	CGG	2	6	288958	288963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931648
7540	NC_014834	CGG	2	6	289006	289011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931648
7541	NC_014834	GAT	2	6	289031	289036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931648
7542	NC_014834	CGGCG	2	10	289081	289090	0 %	0 %	60 %	40 %	316931648
7543	NC_014834	CGG	2	6	289103	289108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931648
7544	NC_014834	CGG	2	6	289114	289119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931648
7545	NC_014834	CGG	2	6	289122	289127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931648
7546	NC_014834	CGGA	2	8	289132	289139	25 %	0 %	50 %	25 %	316931648
7547	NC_014834	GCA	2	6	289150	289155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931648
7548	NC_014834	CGGCGC	2	12	289165	289176	0 %	0 %	50 %	50 %	316931648
7549	NC_014834	CCG	2	6	289218	289223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931648
7550	NC_014834	GCC	2	6	289230	289235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931648
7551	NC_014834	TGC	2	6	289236	289241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931648
7552	NC_014834	CCGG	2	8	289294	289301	0 %	0 %	50 %	50 %	316931648
7553	NC_014834	TTG	2	6	289382	289387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_014834	GC	3	6	289392	289397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7555	NC_014834	CGCC	2	8	289419	289426	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7556	NC_014834	GGCGC	2	10	289444	289453	0 %	0 %	60 %	40 %	316931649
7557	NC_014834	GCT	2	6	289494	289499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931649
7558	NC_014834	CAGC	2	8	289501	289508	25 %	0 %	25 %	50 %	316931649
7559	NC_014834	CGC	2	6	289572	289577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931649
7560	NC_014834	GCC	2	6	289609	289614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931649
7561	NC_014834	CAC	2	6	289645	289650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931649
7562	NC_014834	GTCGC	2	10	289757	289766	0 %	20 %	40 %	40 %	316931649
7563	NC_014834	CAT	2	6	289783	289788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931649
7564	NC_014834	CCG	2	6	289890	289895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931649
7565	NC_014834	CG	3	6	289894	289899	0 %	0 %	50 %	50 %	316931649
7566	NC_014834	CAG	2	6	289912	289917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931649
7567	NC_014834	CG	3	6	289919	289924	0 %	0 %	50 %	50 %	316931649
7568	NC_014834	CTC	2	6	289927	289932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931649
7569	NC_014834	GA	3	6	289985	289990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_014834	GAA	2	6	290028	290033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_014834	GGACA	2	10	290042	290051	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7572	NC_014834	CG	3	6	290140	290145	0 %	0 %	50 %	50 %	316931650
7573	NC_014834	GAA	2	6	290147	290152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931650
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7577	NC_014834	CCG	2	6	290245	290250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931650
7578	NC_014834	CCCG	2	8	290292	290299	0 %	0 %	25 %	75 %	316931650
7579	NC_014834	CTG	2	6	290300	290305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931650
7580	NC_014834	TCGG	2	8	290310	290317	0 %	25 %	50 %	25 %	316931650
7581	NC_014834	CCGGG	2	10	290320	290329	0 %	0 %	60 %	40 %	316931650
7582	NC_014834	GTA	2	6	290414	290419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931650
7583	NC_014834	GCCGGG	2	12	290429	290440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931650
7584	NC_014834	CCG	2	6	290475	290480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931650
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7586	NC_014834	TTG	2	6	290610	290615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931650
7587	NC_014834	CTCGAC	2	12	290624	290635	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316931650
7588	NC_014834	GCCG	2	8	290636	290643	0 %	0 %	50 %	50 %	316931650
7589	NC_014834	CGG	2	6	290668	290673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931650
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7591	NC_014834	CCG	2	6	290737	290742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931650
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7593	NC_014834	CCA	2	6	290773	290778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931650
7594	NC_014834	AAC	2	6	290917	290922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_014834	AAGC	2	8	290939	290946	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7596	NC_014834	CCT	2	6	290974	290979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7597	NC_014834	GC	3	6	291148	291153	0 %	0 %	50 %	50 %	316931651
7598	NC_014834	CAT	2	6	291210	291215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931651
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7601	NC_014834	CGGA	2	8	291395	291402	25 %	0 %	50 %	25 %	316931651
7602	NC_014834	TCGA	2	8	291409	291416	25 %	25 %	25 %	25 %	316931651
7603	NC_014834	CAG	2	6	291429	291434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931651
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7605	NC_014834	GCC	2	6	291456	291461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931651
7606	NC_014834	TCG	2	6	291463	291468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931651
7607	NC_014834	TTC	2	6	291477	291482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931651
7608	NC_014834	CGA	2	6	291497	291502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931651
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7610	NC_014834	TC	3	6	291539	291544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7611	NC_014834	TC	3	6	291546	291551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7612	NC_014834	TCG	2	6	291567	291572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_014834	ACG	2	6	291693	291698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931652
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7615	NC_014834	GAC	2	6	291721	291726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931652
7616	NC_014834	GTA	2	6	291746	291751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931652
7617	NC_014834	CGA	2	6	291777	291782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931652
7618	NC_014834	CGCCAG	2	12	291787	291798	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316931652
7619	NC_014834	CGG	2	6	291877	291882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931652
7620	NC_014834	GCA	2	6	291951	291956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931652
7621	NC_014834	CGT	2	6	291978	291983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931652
7622	NC_014834	GCT	2	6	292022	292027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931652
7623	NC_014834	CGG	2	6	292048	292053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931652
7624	NC_014834	TCG	2	6	292070	292075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931652
7625	NC_014834	CG	3	6	292081	292086	0 %	0 %	50 %	50 %	316931652
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7627	NC_014834	TGG	2	6	292236	292241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931652
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7656	NC_014834	CG	3	6	293137	293142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7733	NC_014834	CG	3	6	296338	296343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7734	NC_014834	GTT	2	6	296399	296404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931657
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7740	NC_014834	TCG	2	6	296572	296577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931657
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7742	NC_014834	GCG	2	6	296603	296608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931657
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7745	NC_014834	TCG	2	6	296724	296729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931657
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7990	NC_014834	GCT	2	6	305926	305931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931666
7991	NC_014834	CCG	2	6	305947	305952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931666
7992	NC_014834	CCGG	2	8	306031	306038	0 %	0 %	50 %	50 %	316931666
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