MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_014834	CGG	2	6	268428	268433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931631
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7010	NC_014834	GCCG	2	8	268662	268669	0 %	0 %	50 %	50 %	316931631
7011	NC_014834	CGG	2	6	268722	268727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931631
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7013	NC_014834	CGG	2	6	268767	268772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931631
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7022	NC_014834	CATC	2	8	269133	269140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7023	NC_014834	GGAT	2	8	269154	269161	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_014834	GGCA	2	8	269245	269252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7025	NC_014834	CGA	2	6	269316	269321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931632
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7049	NC_014834	ACCC	2	8	270334	270341	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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7122	NC_014834	ACG	2	6	272749	272754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931634
7123	NC_014834	GCGCC	2	10	272766	272775	0 %	0 %	40 %	60 %	316931634
7124	NC_014834	TTC	2	6	272803	272808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931634
7125	NC_014834	AGCA	2	8	272812	272819	50 %	0 %	25 %	25 %	316931634
7126	NC_014834	CGGA	2	8	272928	272935	25 %	0 %	50 %	25 %	316931634
7127	NC_014834	CTG	2	6	272950	272955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931634
7128	NC_014834	GCG	3	9	273005	273013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931634
7129	NC_014834	GGC	2	6	273063	273068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931634
7130	NC_014834	CTT	2	6	273075	273080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931634
7131	NC_014834	CGC	2	6	273087	273092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931634
7132	NC_014834	GC	3	6	273094	273099	0 %	0 %	50 %	50 %	316931634
7133	NC_014834	CAT	2	6	273102	273107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931634
7134	NC_014834	CGA	2	6	273114	273119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931634
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7137	NC_014834	GCG	2	6	273283	273288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7138	NC_014834	TCC	2	6	273299	273304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931635
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7145	NC_014834	AGT	2	6	273519	273524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931635
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7150	NC_014834	TCGTCA	2	12	273657	273668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316931635
7151	NC_014834	CGG	2	6	273685	273690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7152	NC_014834	TCA	2	6	273692	273697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7153	NC_014834	CCGC	2	8	273724	273731	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7154	NC_014834	CGC	2	6	273811	273816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931636
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7161	NC_014834	TGTC	2	8	274066	274073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7162	NC_014834	CGC	2	6	274103	274108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7163	NC_014834	GC	3	6	274112	274117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7164	NC_014834	CCG	2	6	274119	274124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7165	NC_014834	TCG	2	6	274174	274179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7166	NC_014834	GC	3	6	274241	274246	0 %	0 %	50 %	50 %	316931637
7167	NC_014834	GGAC	2	8	274266	274273	25 %	0 %	50 %	25 %	316931637
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7172	NC_014834	CGA	2	6	274440	274445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931637
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7180	NC_014834	GCCG	2	8	274839	274846	0 %	0 %	50 %	50 %	316931637
7181	NC_014834	GCT	2	6	274887	274892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931637
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7195	NC_014834	GCT	2	6	275427	275432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931637
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7197	NC_014834	CCG	2	6	275465	275470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931637
7198	NC_014834	GCT	3	9	275616	275624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931637
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7200	NC_014834	GCC	2	6	275643	275648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931637
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7207	NC_014834	GCCG	2	8	275780	275787	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
7208	NC_014834	CAG	2	6	275794	275799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
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7220	NC_014834	CCGT	2	8	276109	276116	0 %	25 %	25 %	50 %	316931638
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7223	NC_014834	TCG	2	6	276213	276218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931638
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7227	NC_014834	GGCG	2	8	276267	276274	0 %	0 %	75 %	25 %	316931638
7228	NC_014834	CAGC	2	8	276298	276305	25 %	0 %	25 %	50 %	316931638
7229	NC_014834	CGC	2	6	276333	276338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
7230	NC_014834	TGCCA	2	10	276359	276368	20 %	20 %	20 %	40 %	316931638
7231	NC_014834	GCC	2	6	276408	276413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
7232	NC_014834	GC	3	6	276422	276427	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
7233	NC_014834	CCA	2	6	276456	276461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931638
7234	NC_014834	CAC	2	6	276487	276492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931638
7235	NC_014834	GCC	2	6	276495	276500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
7236	NC_014834	GCA	2	6	276519	276524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
7237	NC_014834	GTG	2	6	276584	276589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931638
7238	NC_014834	CGC	3	9	276603	276611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
7239	NC_014834	GCA	2	6	276638	276643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
7240	NC_014834	GCG	3	9	276737	276745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931638
7241	NC_014834	GAT	2	6	276750	276755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931638
7242	NC_014834	CG	3	6	276758	276763	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
7243	NC_014834	GATC	2	8	276792	276799	25 %	25 %	25 %	25 %	316931638
7244	NC_014834	ATCG	2	8	276808	276815	25 %	25 %	25 %	25 %	316931638
7245	NC_014834	GTG	2	6	276824	276829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931638
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7311	NC_014834	CGAT	2	8	279767	279774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7315	NC_014834	TGTT	2	8	280016	280023	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7316	NC_014834	GATTGC	2	12	280033	280044	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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7366	NC_014834	CGGCG	2	10	282148	282157	0 %	0 %	60 %	40 %	316931641
7367	NC_014834	CGG	2	6	282214	282219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931641
7368	NC_014834	CGGCTG	2	12	282265	282276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931641
7369	NC_014834	CGA	2	6	282289	282294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931641
7370	NC_014834	TCG	2	6	282303	282308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931641
7371	NC_014834	TCGGCA	2	12	282324	282335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931641
7372	NC_014834	CCG	2	6	282350	282355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7373	NC_014834	GCGAG	2	10	282360	282369	20 %	0 %	60 %	20 %	316931641
7374	NC_014834	CGC	2	6	282400	282405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7375	NC_014834	GC	3	6	282445	282450	0 %	0 %	50 %	50 %	316931641
7376	NC_014834	GCC	2	6	282476	282481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7377	NC_014834	GAT	2	6	282514	282519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931641
7378	NC_014834	GGT	2	6	282664	282669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931641
7379	NC_014834	GATC	2	8	282691	282698	25 %	25 %	25 %	25 %	316931641
7380	NC_014834	GCC	2	6	282705	282710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7381	NC_014834	GGTCA	2	10	282749	282758	20 %	20 %	40 %	20 %	316931641
7382	NC_014834	CGC	2	6	282832	282837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7383	NC_014834	CGA	2	6	282859	282864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931641
7384	NC_014834	CGC	2	6	282922	282927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7385	NC_014834	CGG	2	6	282997	283002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931641
7386	NC_014834	CG	4	8	283009	283016	0 %	0 %	50 %	50 %	316931641
7387	NC_014834	CGC	2	6	283045	283050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7388	NC_014834	CGA	2	6	283060	283065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931641
7389	NC_014834	CAA	2	6	283084	283089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931641
7390	NC_014834	CCG	2	6	283093	283098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7391	NC_014834	CGC	2	6	283107	283112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7392	NC_014834	CG	4	8	283144	283151	0 %	0 %	50 %	50 %	316931641
7393	NC_014834	GCGCCC	2	12	283185	283196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7394	NC_014834	TTC	2	6	283226	283231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931641
7395	NC_014834	CGC	2	6	283248	283253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
7396	NC_014834	TTC	2	6	283256	283261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931641
7397	NC_014834	GC	3	6	283275	283280	0 %	0 %	50 %	50 %	316931641
7398	NC_014834	CGAT	2	8	283311	283318	25 %	25 %	25 %	25 %	316931641
7399	NC_014834	TGA	2	6	283355	283360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7400	NC_014834	CG	3	6	283368	283373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7401	NC_014834	GCA	2	6	283375	283380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7402	NC_014834	CAT	2	6	283623	283628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931642
7403	NC_014834	CCG	2	6	283659	283664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931642
7404	NC_014834	TGG	2	6	283675	283680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931642
7405	NC_014834	GTGCT	2	10	283714	283723	0 %	40 %	40 %	20 %	316931642
7406	NC_014834	GCC	3	9	283841	283849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931642
7407	NC_014834	CGC	3	9	283854	283862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931642
7408	NC_014834	CCG	2	6	283863	283868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931642
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7411	NC_014834	CTC	2	6	283974	283979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931642
7412	NC_014834	T	6	6	284038	284043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7413	NC_014834	ACTC	2	8	284094	284101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7414	NC_014834	CCCT	2	8	284145	284152	0 %	25 %	0 %	75 %	316931643
7415	NC_014834	ACGTCA	2	12	284156	284167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316931643
7416	NC_014834	CGG	2	6	284184	284189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931643
7417	NC_014834	GCC	2	6	284218	284223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931643
7418	NC_014834	TGG	3	9	284231	284239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931643
7419	NC_014834	GAC	2	6	284305	284310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931643
7420	NC_014834	TGA	2	6	284366	284371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931643
7421	NC_014834	CGA	2	6	284403	284408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931643
7422	NC_014834	ACG	2	6	284417	284422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931643
7423	NC_014834	AGA	2	6	284423	284428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931643
7424	NC_014834	CGT	2	6	284441	284446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931643
7425	NC_014834	CTT	2	6	284523	284528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931643
7426	NC_014834	TGC	2	6	284570	284575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931643
7427	NC_014834	GCG	2	6	284582	284587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931643
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7429	NC_014834	GCGGTC	2	12	284736	284747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931644
7430	NC_014834	ACA	2	6	284767	284772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931644
7431	NC_014834	TCGCCG	2	12	284797	284808	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316931644
7432	NC_014834	GCC	2	6	284813	284818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931644
7433	NC_014834	CGA	2	6	284828	284833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931644
7434	NC_014834	GC	4	8	284930	284937	0 %	0 %	50 %	50 %	316931644
7435	NC_014834	TCG	2	6	284986	284991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931644
7436	NC_014834	GTG	2	6	285069	285074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931644
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7438	NC_014834	GCC	2	6	285110	285115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931644
7439	NC_014834	GCG	2	6	285121	285126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931644
7440	NC_014834	GGC	2	6	285135	285140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931644
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7443	NC_014834	ACG	2	6	285262	285267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931644
7444	NC_014834	AGG	2	6	285268	285273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931644
7445	NC_014834	GCG	2	6	285286	285291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931644
7446	NC_014834	GCT	2	6	285308	285313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931644
7447	NC_014834	CGA	2	6	285347	285352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931644
7448	NC_014834	TCG	2	6	285471	285476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931644
7449	NC_014834	GCC	2	6	285479	285484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931644
7450	NC_014834	GGC	3	9	285509	285517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931644
7451	NC_014834	GCT	3	9	285650	285658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931644
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7454	NC_014834	GAC	3	9	285701	285709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931644
7455	NC_014834	TGC	2	6	285748	285753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931644
7456	NC_014834	CTG	2	6	285786	285791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931644
7457	NC_014834	CCG	3	9	285885	285893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931644
7458	NC_014834	TGA	2	6	285979	285984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931644
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7461	NC_014834	GCATCA	2	12	286096	286107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316931644
7462	NC_014834	CGG	2	6	286156	286161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931644
7463	NC_014834	CG	3	6	286175	286180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7464	NC_014834	GCA	2	6	286204	286209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7465	NC_014834	GTC	2	6	286219	286224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7466	NC_014834	GC	3	6	286275	286280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7467	NC_014834	CG	3	6	286332	286337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7468	NC_014834	GGC	2	6	286377	286382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931645
7469	NC_014834	CAG	2	6	286398	286403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931645
7470	NC_014834	TCA	2	6	286415	286420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931645
7471	NC_014834	CGC	2	6	286427	286432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931645
7472	NC_014834	CCT	2	6	286460	286465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931645
7473	NC_014834	TCG	2	6	286471	286476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931645
7474	NC_014834	GCC	2	6	286506	286511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931645
7475	NC_014834	AGC	2	6	286690	286695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931645
7476	NC_014834	ATG	3	9	286783	286791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931645
7477	NC_014834	GCG	2	6	286799	286804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931645
7478	NC_014834	GCCG	2	8	286838	286845	0 %	0 %	50 %	50 %	316931645
7479	NC_014834	CCG	2	6	286955	286960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931645
7480	NC_014834	CGG	2	6	287012	287017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931645
7481	NC_014834	CCT	2	6	287048	287053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931645
7482	NC_014834	TGCTTG	2	12	287059	287070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	316931645
7483	NC_014834	CAC	2	6	287112	287117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931645
7484	NC_014834	GGTC	2	8	287141	287148	0 %	25 %	50 %	25 %	316931645
7485	NC_014834	CG	3	6	287155	287160	0 %	0 %	50 %	50 %	316931645
7486	NC_014834	CGG	2	6	287165	287170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931645
7487	NC_014834	GC	3	6	287179	287184	0 %	0 %	50 %	50 %	316931645
7488	NC_014834	GAT	2	6	287196	287201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931645
7489	NC_014834	GAT	2	6	287211	287216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931645
7490	NC_014834	GTC	2	6	287229	287234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7491	NC_014834	CGGAG	2	10	287286	287295	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7492	NC_014834	ATT	2	6	287334	287339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	316931646
7493	NC_014834	CGG	2	6	287340	287345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931646
7494	NC_014834	GCC	2	6	287351	287356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931646
7495	NC_014834	GGC	2	6	287361	287366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931646
7496	NC_014834	CAG	2	6	287437	287442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931646
7497	NC_014834	CAG	2	6	287479	287484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931646
7498	NC_014834	CGC	2	6	287508	287513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931646
7499	NC_014834	CCGG	2	8	287547	287554	0 %	0 %	50 %	50 %	316931646
7500	NC_014834	GTC	2	6	287584	287589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931646

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