MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 142821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014834	GGCC	2	8	248038	248045	0 %	0 %	50 %	50 %	316931613
6502	NC_014834	CAC	2	6	248065	248070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931613
6503	NC_014834	ACG	2	6	248229	248234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931613
6504	NC_014834	CCCGCA	2	12	248250	248261	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	316931613
6505	NC_014834	TGC	2	6	248271	248276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931613
6506	NC_014834	GC	3	6	248307	248312	0 %	0 %	50 %	50 %	316931613
6507	NC_014834	GCG	2	6	248394	248399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931613
6508	NC_014834	GCC	3	9	248453	248461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931613
6509	NC_014834	GCT	2	6	248542	248547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931613
6510	NC_014834	GGT	2	6	248614	248619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931613
6511	NC_014834	CGG	2	6	248629	248634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931613
6512	NC_014834	GGT	2	6	248647	248652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931613
6513	NC_014834	GAC	2	6	248713	248718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931613
6514	NC_014834	CG	3	6	248750	248755	0 %	0 %	50 %	50 %	316931613
6515	NC_014834	CGT	2	6	248767	248772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931613
6516	NC_014834	ACC	2	6	248804	248809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931613
6517	NC_014834	GAA	2	6	248821	248826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931613
6518	NC_014834	GCA	2	6	248833	248838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931613
6519	NC_014834	TGG	2	6	248862	248867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931613
6520	NC_014834	CTCTT	2	10	248883	248892	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6521	NC_014834	GATCGC	2	12	248914	248925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_014834	ACA	2	6	248976	248981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_014834	CCAG	2	8	248999	249006	25 %	0 %	25 %	50 %	316931614
6524	NC_014834	CGAT	2	8	249050	249057	25 %	25 %	25 %	25 %	316931614
6525	NC_014834	AAG	2	6	249097	249102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931614
6526	NC_014834	ACG	2	6	249107	249112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931614
6527	NC_014834	CGA	2	6	249132	249137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931614
6528	NC_014834	CGG	2	6	249168	249173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931614
6529	NC_014834	GGC	2	6	249207	249212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931614
6530	NC_014834	AAG	2	6	249226	249231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931614
6531	NC_014834	CGGCTG	2	12	249277	249288	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931614
6532	NC_014834	CGC	2	6	249303	249308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931614
6533	NC_014834	CGG	2	6	249330	249335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931614
6534	NC_014834	GCC	2	6	249401	249406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931614
6535	NC_014834	GATC	2	8	249423	249430	25 %	25 %	25 %	25 %	316931614
6536	NC_014834	GGC	2	6	249504	249509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931614
6537	NC_014834	CGA	2	6	249510	249515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931614
6538	NC_014834	CG	3	6	249551	249556	0 %	0 %	50 %	50 %	316931614
6539	NC_014834	CG	4	8	249569	249576	0 %	0 %	50 %	50 %	316931614
6540	NC_014834	CCTG	2	8	249614	249621	0 %	25 %	25 %	50 %	316931614
6541	NC_014834	GCA	2	6	249645	249650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931614
6542	NC_014834	GCG	2	6	249692	249697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931614
6543	NC_014834	GGC	2	6	249761	249766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931614
6544	NC_014834	CGG	2	6	249801	249806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_014834	GCC	2	6	249877	249882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_014834	CAT	2	6	249897	249902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_014834	GAA	2	6	249952	249957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_014834	CGA	2	6	250013	250018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931615
6549	NC_014834	CG	3	6	250178	250183	0 %	0 %	50 %	50 %	316931615
6550	NC_014834	TCG	2	6	250225	250230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931615
6551	NC_014834	GTTG	2	8	250238	250245	0 %	50 %	50 %	0 %	316931615
6552	NC_014834	TGG	2	6	250295	250300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931615
6553	NC_014834	CCG	2	6	250319	250324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931615
6554	NC_014834	GCT	2	6	250346	250351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931615
6555	NC_014834	CG	3	6	250372	250377	0 %	0 %	50 %	50 %	316931615
6556	NC_014834	GCA	2	6	250384	250389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931615
6557	NC_014834	GAT	2	6	250404	250409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931615
6558	NC_014834	GCC	2	6	250411	250416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931615
6559	NC_014834	AGC	2	6	250555	250560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931615
6560	NC_014834	GCG	2	6	250634	250639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931615
6561	NC_014834	GCG	2	6	250658	250663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931615
6562	NC_014834	CGT	2	6	250673	250678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931615
6563	NC_014834	CCG	2	6	250694	250699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_014834	GGT	2	6	250770	250775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_014834	GCC	2	6	250811	250816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931616
6566	NC_014834	GCT	2	6	250866	250871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931616
6567	NC_014834	GCC	2	6	250879	250884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931616
6568	NC_014834	CGCCTT	2	12	250905	250916	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	316931616
6569	NC_014834	GC	4	8	250918	250925	0 %	0 %	50 %	50 %	316931616
6570	NC_014834	CGGG	2	8	250929	250936	0 %	0 %	75 %	25 %	316931616
6571	NC_014834	GCA	2	6	250937	250942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931616
6572	NC_014834	CGGC	2	8	250967	250974	0 %	0 %	50 %	50 %	316931616
6573	NC_014834	TGC	2	6	250976	250981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931616
6574	NC_014834	GGC	3	9	251037	251045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_014834	CGA	2	6	251307	251312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6576	NC_014834	GCCG	2	8	251316	251323	0 %	0 %	50 %	50 %	316931617
6577	NC_014834	ACA	2	6	251390	251395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931617
6578	NC_014834	CGA	2	6	251454	251459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6579	NC_014834	GGTC	2	8	251502	251509	0 %	25 %	50 %	25 %	316931617
6580	NC_014834	GCA	2	6	251543	251548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6581	NC_014834	TGGCGC	2	12	251558	251569	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931617
6582	NC_014834	GTG	2	6	251572	251577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931617
6583	NC_014834	GC	3	6	251611	251616	0 %	0 %	50 %	50 %	316931617
6584	NC_014834	TGC	3	9	251636	251644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6585	NC_014834	CGC	2	6	251667	251672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931617
6586	NC_014834	CGA	2	6	251682	251687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6587	NC_014834	TCG	2	6	251738	251743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6588	NC_014834	GC	3	6	251795	251800	0 %	0 %	50 %	50 %	316931617
6589	NC_014834	GGCC	2	8	251826	251833	0 %	0 %	50 %	50 %	316931617
6590	NC_014834	CG	3	6	251858	251863	0 %	0 %	50 %	50 %	316931617
6591	NC_014834	GTC	2	6	251872	251877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6592	NC_014834	GATG	2	8	251883	251890	25 %	25 %	50 %	0 %	316931617
6593	NC_014834	GCT	2	6	251932	251937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6594	NC_014834	CTG	2	6	251951	251956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6595	NC_014834	CGC	3	9	251967	251975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931617
6596	NC_014834	AAG	2	6	251992	251997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931617
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6598	NC_014834	TGC	3	9	252026	252034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931617
6599	NC_014834	GAAG	2	8	252063	252070	50 %	0 %	50 %	0 %	316931617
6600	NC_014834	GGCAAA	2	12	252075	252086	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	316931617
6601	NC_014834	GTA	2	6	252110	252115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931617
6602	NC_014834	CAC	2	6	252138	252143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_014834	GCTT	2	8	252217	252224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_014834	TC	3	6	252237	252242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_014834	TC	3	6	252286	252291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6606	NC_014834	GC	3	6	252330	252335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6607	NC_014834	GAC	2	6	252344	252349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_014834	CGG	2	6	252369	252374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931618
6609	NC_014834	TTC	2	6	252385	252390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931618
6610	NC_014834	AGCG	2	8	252457	252464	25 %	0 %	50 %	25 %	316931618
6611	NC_014834	ATC	2	6	252526	252531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931618
6612	NC_014834	GAA	2	6	252543	252548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931618
6613	NC_014834	GAT	2	6	252594	252599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931618
6614	NC_014834	TCG	2	6	252607	252612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931618
6615	NC_014834	GCCG	2	8	252620	252627	0 %	0 %	50 %	50 %	316931618
6616	NC_014834	CAC	2	6	252651	252656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931618
6617	NC_014834	CTG	2	6	252663	252668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931618
6618	NC_014834	CGA	2	6	252674	252679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931618
6619	NC_014834	GGT	2	6	252708	252713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931618
6620	NC_014834	CGA	2	6	252839	252844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931618
6621	NC_014834	CCTT	2	8	252874	252881	0 %	50 %	0 %	50 %	316931618
6622	NC_014834	GTC	2	6	253011	253016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931618
6623	NC_014834	TCG	2	6	253060	253065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931618
6624	NC_014834	GC	3	6	253071	253076	0 %	0 %	50 %	50 %	316931618
6625	NC_014834	GGCC	2	8	253085	253092	0 %	0 %	50 %	50 %	316931618
6626	NC_014834	GGC	2	6	253152	253157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931618
6627	NC_014834	GATC	2	8	253185	253192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6628	NC_014834	GCA	2	6	253242	253247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6630	NC_014834	GCCG	2	8	253273	253280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6631	NC_014834	GCC	2	6	253287	253292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6632	NC_014834	CT	3	6	253315	253320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6637	NC_014834	GCT	3	9	253487	253495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931619
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6740	NC_014834	ACG	2	6	257454	257459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931621
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6744	NC_014834	CGCC	2	8	257632	257639	0 %	0 %	25 %	75 %	316931621
6745	NC_014834	GAG	2	6	257660	257665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931621
6746	NC_014834	CGA	2	6	257689	257694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931621
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6748	NC_014834	GCT	2	6	257755	257760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931621
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6987	NC_014834	GAC	3	9	267834	267842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931630
6988	NC_014834	CGC	2	6	267934	267939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931630
6989	NC_014834	GCC	2	6	267948	267953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931630
6990	NC_014834	CGCC	2	8	267961	267968	0 %	0 %	25 %	75 %	316931630
6991	NC_014834	CG	3	6	267982	267987	0 %	0 %	50 %	50 %	316931630
6992	NC_014834	CGC	2	6	268004	268009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931630
6993	NC_014834	TCA	2	6	268036	268041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931630
6994	NC_014834	TCA	2	6	268077	268082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6995	NC_014834	CGG	2	6	268172	268177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6996	NC_014834	CTG	2	6	268202	268207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6997	NC_014834	CG	3	6	268231	268236	0 %	0 %	50 %	50 %	316931631
6998	NC_014834	GCA	2	6	268266	268271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931631
6999	NC_014834	GC	3	6	268299	268304	0 %	0 %	50 %	50 %	316931631
7000	NC_014834	CAC	2	6	268315	268320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931631

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