MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL03

Total Repeats: 382

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014826	ACA	2	6	13	18	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014826	GCGG	2	8	23	30	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014826	AGT	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014826	TAG	3	9	75	83	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014826	TG	3	6	105	110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014826	AGT	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014826	AG	3	6	163	168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014826	GATC	2	8	169	176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014826	CA	3	6	215	220	50 %	0 %	0 %	50 %	315630410
10	NC_014826	TGC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630410
11	NC_014826	GAT	2	6	515	520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630410
12	NC_014826	GGCT	2	8	571	578	0 %	25 %	50 %	25 %	315630410
13	NC_014826	GAC	2	6	624	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630410
14	NC_014826	AAG	2	6	717	722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630410
15	NC_014826	GCT	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630410
16	NC_014826	AGA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630410
17	NC_014826	GCT	3	9	795	803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630410
18	NC_014826	TAC	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630410
19	NC_014826	TTGA	2	8	964	971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014826	A	7	7	1005	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014826	T	7	7	1040	1046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014826	A	6	6	1063	1068	100 %	0 %	0 %	0 %	315630411
23	NC_014826	TTA	2	6	1072	1077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630411
24	NC_014826	TA	3	6	1109	1114	50 %	50 %	0 %	0 %	315630411
25	NC_014826	GAT	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630411
26	NC_014826	GTTT	2	8	1136	1143	0 %	75 %	25 %	0 %	315630411
27	NC_014826	TTTTCT	2	12	1180	1191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	315630411
28	NC_014826	TGT	2	6	1205	1210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014826	TA	3	6	1216	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014826	TA	3	6	1237	1242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014826	TGC	2	6	1287	1292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630412
32	NC_014826	TGC	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630412
33	NC_014826	CAT	2	6	1308	1313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630412
34	NC_014826	CGG	2	6	1349	1354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315630412
35	NC_014826	ATA	2	6	1366	1371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630412
36	NC_014826	TAT	3	9	1374	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630412
37	NC_014826	T	6	6	1445	1450	0 %	100 %	0 %	0 %	315630413
38	NC_014826	TCTT	2	8	1459	1466	0 %	75 %	0 %	25 %	315630413
39	NC_014826	TAC	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
40	NC_014826	ATC	2	6	1547	1552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
41	NC_014826	CTA	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
42	NC_014826	TAA	2	6	1680	1685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630413
43	NC_014826	AT	3	6	1787	1792	50 %	50 %	0 %	0 %	315630413
44	NC_014826	AAAG	2	8	1803	1810	75 %	0 %	25 %	0 %	315630413
45	NC_014826	TCA	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
46	NC_014826	T	6	6	1858	1863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014826	TAAA	2	8	1868	1875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014826	AT	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014826	AG	3	6	1987	1992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014826	TAAA	2	8	2014	2021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014826	A	6	6	2019	2024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014826	AAT	2	6	2100	2105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014826	AT	3	6	2134	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014826	AT	6	12	2163	2174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014826	TG	3	6	2194	2199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014826	TAT	2	6	2327	2332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014826	A	7	7	2376	2382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014826	TGA	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014826	TATT	2	8	2460	2467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014826	TGC	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630414
61	NC_014826	TGT	2	6	2596	2601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315630414
62	NC_014826	CTT	3	9	2659	2667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630414
63	NC_014826	GCG	2	6	2668	2673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315630414
64	NC_014826	TG	3	6	2689	2694	0 %	50 %	50 %	0 %	315630414
65	NC_014826	GTG	2	6	2720	2725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315630414
66	NC_014826	GTT	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315630414
67	NC_014826	TAT	2	6	2881	2886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630414
68	NC_014826	A	7	7	3026	3032	100 %	0 %	0 %	0 %	315630414
69	NC_014826	ATG	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630414
70	NC_014826	GAT	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630414
71	NC_014826	TTA	2	6	3216	3221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630414
72	NC_014826	TTTAT	2	10	3233	3242	20 %	80 %	0 %	0 %	315630414
73	NC_014826	TTC	2	6	3328	3333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630414
74	NC_014826	TGGC	2	8	3377	3384	0 %	25 %	50 %	25 %	315630414
75	NC_014826	TA	3	6	3432	3437	50 %	50 %	0 %	0 %	315630414
76	NC_014826	A	6	6	3473	3478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014826	CCT	2	6	3481	3486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014826	AACG	2	8	3515	3522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014826	CAT	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014826	GTT	2	6	3608	3613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014826	T	7	7	3671	3677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014826	TAT	2	6	3683	3688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014826	TAT	2	6	3708	3713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014826	TTA	2	6	3718	3723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014826	ATTT	2	8	3785	3792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014826	TTA	2	6	3824	3829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014826	A	8	8	3836	3843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014826	CTTCC	2	10	3848	3857	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_014826	AT	3	6	3860	3865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014826	T	6	6	3900	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014826	AGCA	2	8	3964	3971	50 %	0 %	25 %	25 %	315630415
92	NC_014826	AG	3	6	3983	3988	50 %	0 %	50 %	0 %	315630415
93	NC_014826	TGA	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630415
94	NC_014826	TGA	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630415
95	NC_014826	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630415
96	NC_014826	AAG	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630415
97	NC_014826	CAG	2	6	4378	4383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630415
98	NC_014826	AGAT	2	8	4403	4410	50 %	25 %	25 %	0 %	315630415
99	NC_014826	AAC	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315630415
100	NC_014826	CGG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315630415
101	NC_014826	AGA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630415
102	NC_014826	A	6	6	4585	4590	100 %	0 %	0 %	0 %	315630415
103	NC_014826	TTC	2	6	4594	4599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630415
104	NC_014826	A	6	6	4729	4734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014826	T	6	6	4789	4794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014826	AC	3	6	4812	4817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014826	CCAG	2	8	4924	4931	25 %	0 %	25 %	50 %	315630416
108	NC_014826	CAG	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630416
109	NC_014826	GAT	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630416
110	NC_014826	A	7	7	5062	5068	100 %	0 %	0 %	0 %	315630416
111	NC_014826	AT	3	6	5073	5078	50 %	50 %	0 %	0 %	315630416
112	NC_014826	TCA	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014826	ATA	2	6	5242	5247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014826	ATT	2	6	5262	5267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014826	CG	3	6	5285	5290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014826	T	8	8	5322	5329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014826	AT	3	6	5332	5337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014826	TTC	2	6	5372	5377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014826	TGT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014826	TTGA	2	8	5507	5514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014826	CAC	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014826	A	7	7	5613	5619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014826	ATA	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014826	TAA	2	6	5665	5670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014826	AT	3	6	5781	5786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014826	T	6	6	5826	5831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014826	CCA	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014826	CCT	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014826	T	6	6	5891	5896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014826	TTA	2	6	5904	5909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014826	TTA	2	6	5927	5932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014826	ATTA	2	8	5998	6005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014826	T	7	7	6009	6015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014826	TA	4	8	6033	6040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014826	T	6	6	6041	6046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014826	GAC	2	6	6080	6085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630417
137	NC_014826	A	6	6	6109	6114	100 %	0 %	0 %	0 %	315630417
138	NC_014826	CAG	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630417
139	NC_014826	ATT	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630417
140	NC_014826	AAGA	2	8	6271	6278	75 %	0 %	25 %	0 %	315630417
141	NC_014826	TAC	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630417
142	NC_014826	ATA	2	6	6296	6301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630417
143	NC_014826	GAT	2	6	6377	6382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630417
144	NC_014826	ATG	2	6	6423	6428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630417
145	NC_014826	A	6	6	6468	6473	100 %	0 %	0 %	0 %	315630417
146	NC_014826	TA	3	6	6494	6499	50 %	50 %	0 %	0 %	315630417
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276	NC_014826	T	6	6	11330	11335	0 %	100 %	0 %	0 %	315630423
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279	NC_014826	AAG	2	6	11399	11404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630423
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281	NC_014826	AT	4	8	11467	11474	50 %	50 %	0 %	0 %	315630423
282	NC_014826	ATT	2	6	11530	11535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630423
283	NC_014826	AT	3	6	11549	11554	50 %	50 %	0 %	0 %	315630423
284	NC_014826	A	6	6	11603	11608	100 %	0 %	0 %	0 %	315630423
285	NC_014826	CACTG	2	10	11632	11641	20 %	20 %	20 %	40 %	315630423
286	NC_014826	AAT	2	6	11676	11681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630423
287	NC_014826	AGA	2	6	11729	11734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630423
288	NC_014826	TAC	2	6	11759	11764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630423
289	NC_014826	TA	3	6	11872	11877	50 %	50 %	0 %	0 %	315630424
290	NC_014826	CTGA	2	8	11936	11943	25 %	25 %	25 %	25 %	315630424
291	NC_014826	TGA	2	6	11959	11964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630424
292	NC_014826	TGTC	2	8	11965	11972	0 %	50 %	25 %	25 %	315630424
293	NC_014826	TAC	2	6	11986	11991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630424
294	NC_014826	GAA	2	6	12002	12007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630424
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298	NC_014826	T	7	7	12105	12111	0 %	100 %	0 %	0 %	315630424
299	NC_014826	TCC	2	6	12118	12123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315630424
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312	NC_014826	AACAG	2	10	12648	12657	60 %	0 %	20 %	20 %	315630424
313	NC_014826	AG	3	6	12710	12715	50 %	0 %	50 %	0 %	315630424
314	NC_014826	GAT	2	6	12746	12751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630424
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316	NC_014826	TAT	2	6	12814	12819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630424
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379	NC_014826	A	6	6	15755	15760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_014826	CTT	2	6	15854	15859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.