MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 95531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24005	NC_014664	TTCG	2	8	995519	995526	0 %	50 %	25 %	25 %	312113672
24006	NC_014664	CG	3	6	995533	995538	0 %	0 %	50 %	50 %	312113672
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24121	NC_014664	CGT	2	6	999697	999702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113676
24122	NC_014664	CGA	2	6	999712	999717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113676
24123	NC_014664	CTG	2	6	999720	999725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113676
24124	NC_014664	ACC	2	6	999754	999759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113676
24125	NC_014664	CTC	2	6	999771	999776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113676
24126	NC_014664	CAT	3	9	999791	999799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113676
24127	NC_014664	TCG	2	6	999828	999833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113676
24128	NC_014664	GCCT	2	8	999835	999842	0 %	25 %	25 %	50 %	312113676
24129	NC_014664	GGGC	2	8	999866	999873	0 %	0 %	75 %	25 %	312113676
24130	NC_014664	TCG	2	6	999931	999936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113676
24131	NC_014664	TCA	2	6	999955	999960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113676
24132	NC_014664	GC	3	6	999989	999994	0 %	0 %	50 %	50 %	312113676
24133	NC_014664	GCT	2	6	1000013	1000018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113676
24134	NC_014664	CGC	2	6	1000103	1000108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113676
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24137	NC_014664	CGG	2	6	1000178	1000183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113676
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24144	NC_014664	CTT	2	6	1000409	1000414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113677
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24152	NC_014664	GCC	2	6	1000689	1000694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113677
24153	NC_014664	GGC	2	6	1000734	1000739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113677
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24177	NC_014664	CGG	2	6	1001685	1001690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24178	NC_014664	GAG	2	6	1001753	1001758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24180	NC_014664	GGA	2	6	1001816	1001821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24183	NC_014664	GGA	2	6	1001885	1001890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24184	NC_014664	TCC	2	6	1001950	1001955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24185	NC_014664	CTC	2	6	1001988	1001993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24188	NC_014664	TTA	2	6	1002248	1002253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24189	NC_014664	CA	3	6	1002300	1002305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24190	NC_014664	CTC	2	6	1002324	1002329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113678
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24226	NC_014664	GC	3	6	1003629	1003634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24227	NC_014664	CGG	2	6	1003734	1003739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113679
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24234	NC_014664	CG	4	8	1003942	1003949	0 %	0 %	50 %	50 %	312113679
24235	NC_014664	GC	3	6	1003977	1003982	0 %	0 %	50 %	50 %	312113679
24236	NC_014664	GGCG	2	8	1004014	1004021	0 %	0 %	75 %	25 %	312113679
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24238	NC_014664	CGG	2	6	1004127	1004132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113679
24239	NC_014664	CCG	2	6	1004238	1004243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113679
24240	NC_014664	GCG	2	6	1004267	1004272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113679
24241	NC_014664	CGA	2	6	1004374	1004379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113679
24242	NC_014664	CGC	2	6	1004410	1004415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113679
24243	NC_014664	GGC	2	6	1004453	1004458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113679
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24245	NC_014664	TATAA	2	10	1004544	1004553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24246	NC_014664	CCA	2	6	1004555	1004560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24247	NC_014664	AGC	2	6	1004632	1004637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24248	NC_014664	GC	3	6	1004643	1004648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24249	NC_014664	TTG	2	6	1004650	1004655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24250	NC_014664	GCC	2	6	1004663	1004668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24251	NC_014664	GT	3	6	1004669	1004674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24252	NC_014664	T	7	7	1004725	1004731	0 %	100 %	0 %	0 %	312113680
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24255	NC_014664	GCA	2	6	1004825	1004830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113680
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24258	NC_014664	TCGACC	2	12	1004933	1004944	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312113680
24259	NC_014664	GTC	2	6	1004958	1004963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113680
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24273	NC_014664	GC	4	8	1005626	1005633	0 %	0 %	50 %	50 %	312113680
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24275	NC_014664	CCA	2	6	1005660	1005665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24303	NC_014664	TAA	2	6	1006967	1006972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24338	NC_014664	GGC	2	6	1008460	1008465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113682
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24341	NC_014664	CG	3	6	1008591	1008596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24342	NC_014664	CATC	2	8	1008652	1008659	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24343	NC_014664	CGTG	2	8	1008672	1008679	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24344	NC_014664	GC	3	6	1008735	1008740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24345	NC_014664	AGC	2	6	1008762	1008767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24346	NC_014664	TTC	2	6	1008809	1008814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113683
24347	NC_014664	CGG	2	6	1008886	1008891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113683
24348	NC_014664	GGCT	2	8	1008926	1008933	0 %	25 %	50 %	25 %	312113683
24349	NC_014664	CGG	2	6	1008934	1008939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113683
24350	NC_014664	GC	3	6	1008953	1008958	0 %	0 %	50 %	50 %	312113683
24351	NC_014664	GGC	2	6	1008962	1008967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113683
24352	NC_014664	CCGC	2	8	1009056	1009063	0 %	0 %	25 %	75 %	312113683
24353	NC_014664	CGA	2	6	1009084	1009089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113683
24354	NC_014664	AATG	2	8	1009093	1009100	50 %	25 %	25 %	0 %	312113683
24355	NC_014664	GC	5	10	1009132	1009141	0 %	0 %	50 %	50 %	312113683
24356	NC_014664	CAC	2	6	1009142	1009147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113683
24357	NC_014664	CCG	2	6	1009170	1009175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113683
24358	NC_014664	GAC	2	6	1009216	1009221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113683
24359	NC_014664	CG	3	6	1009242	1009247	0 %	0 %	50 %	50 %	312113683
24360	NC_014664	CCG	2	6	1009255	1009260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113683
24361	NC_014664	GC	3	6	1009313	1009318	0 %	0 %	50 %	50 %	312113683
24362	NC_014664	TGG	3	9	1009350	1009358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113683
24363	NC_014664	CTG	2	6	1009421	1009426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113683
24364	NC_014664	GCG	2	6	1009479	1009484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113683
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24366	NC_014664	TCG	2	6	1009647	1009652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113683
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24370	NC_014664	CGC	2	6	1009774	1009779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113683
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24372	NC_014664	CAC	2	6	1009840	1009845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113683
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24388	NC_014664	GC	3	6	1010514	1010519	0 %	0 %	50 %	50 %	312113684
24389	NC_014664	CGC	2	6	1010568	1010573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113684
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24399	NC_014664	CGA	2	6	1010820	1010825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113684
24400	NC_014664	CG	4	8	1010884	1010891	0 %	0 %	50 %	50 %	312113684
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24420	NC_014664	CG	3	6	1011854	1011859	0 %	0 %	50 %	50 %	312113685
24421	NC_014664	CGCC	2	8	1011922	1011929	0 %	0 %	25 %	75 %	312113685
24422	NC_014664	GA	3	6	1011953	1011958	50 %	0 %	50 %	0 %	312113685
24423	NC_014664	GCC	2	6	1012017	1012022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113685
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24426	NC_014664	GAG	2	6	1012160	1012165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113686
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24461	NC_014664	GGC	2	6	1013599	1013604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113687
24462	NC_014664	CGG	2	6	1013627	1013632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113687
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24465	NC_014664	GCG	3	9	1013709	1013717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113687
24466	NC_014664	GAA	2	6	1013760	1013765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113687
24467	NC_014664	CGT	2	6	1013804	1013809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113687
24468	NC_014664	CG	4	8	1013846	1013853	0 %	0 %	50 %	50 %	312113687
24469	NC_014664	CGC	2	6	1013946	1013951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113687
24470	NC_014664	CGC	2	6	1014148	1014153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24471	NC_014664	CGG	2	6	1014314	1014319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24472	NC_014664	GCT	2	6	1014353	1014358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113688
24473	NC_014664	CCT	2	6	1014419	1014424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113688
24474	NC_014664	GCC	2	6	1014436	1014441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113688
24475	NC_014664	GGC	2	6	1014459	1014464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113688
24476	NC_014664	CGA	2	6	1014494	1014499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113688
24477	NC_014664	CGA	3	9	1014596	1014604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113688
24478	NC_014664	CGT	2	6	1014611	1014616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113688
24479	NC_014664	AGC	2	6	1014636	1014641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113688
24480	NC_014664	AGA	3	9	1014661	1014669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113688
24481	NC_014664	GCC	2	6	1014712	1014717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24482	NC_014664	CTT	2	6	1014747	1014752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113689
24483	NC_014664	GC	3	6	1014953	1014958	0 %	0 %	50 %	50 %	312113689
24484	NC_014664	TCT	2	6	1014989	1014994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113689
24485	NC_014664	ATGAG	2	10	1015009	1015018	40 %	20 %	40 %	0 %	312113689
24486	NC_014664	TCG	2	6	1015022	1015027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113689
24487	NC_014664	GCTGA	2	10	1015078	1015087	20 %	20 %	40 %	20 %	312113690
24488	NC_014664	GACGC	2	10	1015169	1015178	20 %	0 %	40 %	40 %	312113690
24489	NC_014664	CCGG	2	8	1015366	1015373	0 %	0 %	50 %	50 %	312113690
24490	NC_014664	CGC	2	6	1015477	1015482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113690
24491	NC_014664	GC	3	6	1015521	1015526	0 %	0 %	50 %	50 %	312113690
24492	NC_014664	TCG	2	6	1015538	1015543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113690
24493	NC_014664	GAG	2	6	1015564	1015569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113690
24494	NC_014664	CG	4	8	1015626	1015633	0 %	0 %	50 %	50 %	312113690
24495	NC_014664	GCC	2	6	1015654	1015659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113690
24496	NC_014664	GCC	2	6	1015667	1015672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113690
24497	NC_014664	CGC	2	6	1015749	1015754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113690
24498	NC_014664	GTG	2	6	1015760	1015765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113690
24499	NC_014664	CGA	2	6	1015785	1015790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113690
24500	NC_014664	GTC	2	6	1015807	1015812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113690

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