MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 95531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014664	CGG	3	9	664289	664297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113367
16002	NC_014664	CAG	2	6	664320	664325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113367
16003	NC_014664	CGG	2	6	664334	664339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113367
16004	NC_014664	CGC	2	6	664376	664381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113367
16005	NC_014664	GCC	3	9	664404	664412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113367
16006	NC_014664	GC	3	6	664656	664661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16007	NC_014664	TTG	2	6	664669	664674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_014664	CGG	3	9	664728	664736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_014664	GAT	2	6	664963	664968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113368
16010	NC_014664	GT	3	6	664970	664975	0 %	50 %	50 %	0 %	312113368
16011	NC_014664	CAGC	2	8	665031	665038	25 %	0 %	25 %	50 %	312113368
16012	NC_014664	CCT	2	6	665049	665054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113368
16013	NC_014664	ATGC	2	8	665082	665089	25 %	25 %	25 %	25 %	312113368
16014	NC_014664	GC	3	6	665272	665277	0 %	0 %	50 %	50 %	312113368
16015	NC_014664	CAG	2	6	665343	665348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113368
16016	NC_014664	ACC	2	6	665377	665382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113368
16017	NC_014664	CGAT	2	8	665395	665402	25 %	25 %	25 %	25 %	312113368
16018	NC_014664	TCG	2	6	665465	665470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113368
16019	NC_014664	CG	3	6	665522	665527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16020	NC_014664	CGA	2	6	665558	665563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113369
16021	NC_014664	AAGA	2	8	665580	665587	75 %	0 %	25 %	0 %	312113369
16022	NC_014664	ACAAG	2	10	665588	665597	60 %	0 %	20 %	20 %	312113369
16023	NC_014664	GTCCA	2	10	665661	665670	20 %	20 %	20 %	40 %	312113369
16024	NC_014664	GAA	2	6	665700	665705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113369
16025	NC_014664	AAC	2	6	665743	665748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312113369
16026	NC_014664	CGA	2	6	665795	665800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113369
16027	NC_014664	CGC	2	6	665810	665815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113369
16028	NC_014664	ATC	2	6	665866	665871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113369
16029	NC_014664	GTTT	2	8	665872	665879	0 %	75 %	25 %	0 %	312113369
16030	NC_014664	TCC	2	6	665889	665894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16031	NC_014664	T	8	8	665899	665906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_014664	GCC	3	9	666104	666112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113370
16033	NC_014664	GCT	2	6	666155	666160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113370
16034	NC_014664	GCG	2	6	666174	666179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113370
16035	NC_014664	CGG	2	6	666224	666229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113370
16036	NC_014664	CCA	2	6	666319	666324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113370
16037	NC_014664	GGAT	2	8	666349	666356	25 %	25 %	50 %	0 %	312113370
16038	NC_014664	GCC	2	6	666374	666379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113370
16039	NC_014664	GCG	2	6	666413	666418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113370
16040	NC_014664	CG	3	6	666417	666422	0 %	0 %	50 %	50 %	312113370
16041	NC_014664	GCC	2	6	666459	666464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113370
16042	NC_014664	GCC	3	9	666479	666487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113370
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16045	NC_014664	TCG	2	6	666579	666584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113370
16046	NC_014664	TAG	2	6	666588	666593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113370
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16050	NC_014664	CGC	2	6	666760	666765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113370
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16052	NC_014664	CTG	2	6	666896	666901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113370
16053	NC_014664	TTG	2	6	666918	666923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312113370
16054	NC_014664	ATG	3	9	666924	666932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113370
16055	NC_014664	GAG	2	6	666979	666984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113370
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16058	NC_014664	GCG	2	6	667146	667151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113370
16059	NC_014664	CGG	2	6	667165	667170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113370
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16061	NC_014664	CGG	2	6	667294	667299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113370
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16063	NC_014664	GTC	2	6	667317	667322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113370
16064	NC_014664	CGA	2	6	667328	667333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113370
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16069	NC_014664	GAT	2	6	667561	667566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113371
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16080	NC_014664	GCCGGT	2	12	668017	668028	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312113371
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16090	NC_014664	GGC	2	6	668362	668367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113371
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16101	NC_014664	GC	3	6	668954	668959	0 %	0 %	50 %	50 %	312113372
16102	NC_014664	ACG	2	6	668964	668969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113372
16103	NC_014664	GTCT	2	8	669088	669095	0 %	50 %	25 %	25 %	312113372
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16108	NC_014664	GCG	2	6	669227	669232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113372
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16110	NC_014664	GCT	2	6	669298	669303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113372
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16114	NC_014664	TCA	2	6	669632	669637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113373
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16120	NC_014664	ATC	2	6	669796	669801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113373
16121	NC_014664	T	6	6	669916	669921	0 %	100 %	0 %	0 %	312113374
16122	NC_014664	AGA	2	6	669951	669956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113374
16123	NC_014664	CAGG	2	8	669958	669965	25 %	0 %	50 %	25 %	312113374
16124	NC_014664	CTC	2	6	670048	670053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113374
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16126	NC_014664	CG	4	8	670251	670258	0 %	0 %	50 %	50 %	312113374
16127	NC_014664	CTC	2	6	670264	670269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113374
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16145	NC_014664	GC	3	6	671031	671036	0 %	0 %	50 %	50 %	312113374
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16153	NC_014664	CAT	2	6	671491	671496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113374
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16156	NC_014664	AGCC	2	8	671567	671574	25 %	0 %	25 %	50 %	312113374
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16220	NC_014664	CTT	3	9	674281	674289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113377
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16222	NC_014664	CGA	2	6	674358	674363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113377
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16226	NC_014664	GTTG	2	8	674527	674534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16227	NC_014664	TGC	2	6	674575	674580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113378
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16229	NC_014664	TCG	2	6	674635	674640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113378
16230	NC_014664	CG	4	8	674651	674658	0 %	0 %	50 %	50 %	312113378
16231	NC_014664	GC	3	6	674736	674741	0 %	0 %	50 %	50 %	312113378
16232	NC_014664	CGCC	2	8	674777	674784	0 %	0 %	25 %	75 %	312113378
16233	NC_014664	AGA	2	6	674785	674790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113378
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16236	NC_014664	GCCC	2	8	674927	674934	0 %	0 %	25 %	75 %	312113379
16237	NC_014664	CGT	2	6	675060	675065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113379
16238	NC_014664	TTC	2	6	675098	675103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113379
16239	NC_014664	CGG	3	9	675108	675116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113379
16240	NC_014664	CGT	2	6	675150	675155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113379
16241	NC_014664	GGC	2	6	675187	675192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113379
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16315	NC_014664	TCAT	2	8	678287	678294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16343	NC_014664	TGT	2	6	679552	679557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312113385
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16345	NC_014664	TGC	2	6	679710	679715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113385
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16351	NC_014664	GC	3	6	679932	679937	0 %	0 %	50 %	50 %	312113385
16352	NC_014664	CCAA	2	8	679942	679949	50 %	0 %	0 %	50 %	312113385
16353	NC_014664	TGA	2	6	679995	680000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113385
16354	NC_014664	G	6	6	680017	680022	0 %	0 %	100 %	0 %	312113385
16355	NC_014664	TCG	2	6	680046	680051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113385
16356	NC_014664	GTC	2	6	680078	680083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113385
16357	NC_014664	CG	3	6	680104	680109	0 %	0 %	50 %	50 %	312113385
16358	NC_014664	ATC	3	9	680144	680152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113385
16359	NC_014664	GTC	2	6	680162	680167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113385
16360	NC_014664	TCC	2	6	680240	680245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113385
16361	NC_014664	CA	3	6	680419	680424	50 %	0 %	0 %	50 %	312113386
16362	NC_014664	TCG	2	6	680425	680430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113386
16363	NC_014664	CGG	2	6	680447	680452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113386
16364	NC_014664	TCA	2	6	680455	680460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113386
16365	NC_014664	TCA	2	6	680509	680514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113386
16366	NC_014664	CGTCC	2	10	680537	680546	0 %	20 %	20 %	60 %	312113386
16367	NC_014664	GAT	2	6	680580	680585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113386
16368	NC_014664	CGA	2	6	680747	680752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113386
16369	NC_014664	TCG	3	9	680860	680868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113386
16370	NC_014664	GCG	2	6	680936	680941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113386
16371	NC_014664	CAC	2	6	681060	681065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113386
16372	NC_014664	CG	3	6	681083	681088	0 %	0 %	50 %	50 %	312113386
16373	NC_014664	GAG	2	6	681123	681128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113386
16374	NC_014664	AAG	2	6	681150	681155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113386
16375	NC_014664	GAT	2	6	681182	681187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113386
16376	NC_014664	GCG	2	6	681220	681225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113386
16377	NC_014664	CG	3	6	681244	681249	0 %	0 %	50 %	50 %	312113386
16378	NC_014664	TCGG	2	8	681303	681310	0 %	25 %	50 %	25 %	312113386
16379	NC_014664	CCG	2	6	681327	681332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113386
16380	NC_014664	TG	3	6	681467	681472	0 %	50 %	50 %	0 %	312113386
16381	NC_014664	TCG	2	6	681505	681510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113386
16382	NC_014664	CGC	2	6	681526	681531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113386
16383	NC_014664	GGC	2	6	681644	681649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113386
16384	NC_014664	AG	3	6	681698	681703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16385	NC_014664	GAG	2	6	681783	681788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16386	NC_014664	ATC	2	6	681856	681861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113387
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16388	NC_014664	CGG	3	9	681914	681922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113387
16389	NC_014664	TTC	2	6	681946	681951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113387
16390	NC_014664	GCT	2	6	681969	681974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113387
16391	NC_014664	GAA	2	6	681978	681983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113387
16392	NC_014664	GAT	2	6	682032	682037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113387
16393	NC_014664	ATG	2	6	682105	682110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113387
16394	NC_014664	AAG	3	9	682123	682131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113387
16395	NC_014664	CGA	2	6	682146	682151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113387
16396	NC_014664	GAT	2	6	682185	682190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113387
16397	NC_014664	AAGA	2	8	682225	682232	75 %	0 %	25 %	0 %	312113387
16398	NC_014664	CGG	2	6	682257	682262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113387
16399	NC_014664	AAAAC	2	10	682324	682333	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16400	NC_014664	GGA	2	6	682355	682360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16401	NC_014664	A	7	7	682424	682430	100 %	0 %	0 %	0 %	312113388
16402	NC_014664	GGC	2	6	682451	682456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113388
16403	NC_014664	CTTC	2	8	682503	682510	0 %	50 %	0 %	50 %	312113388
16404	NC_014664	GAC	2	6	682516	682521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113388
16405	NC_014664	CGA	2	6	682542	682547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113388
16406	NC_014664	CCAGCG	2	12	682630	682641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16407	NC_014664	ACGA	2	8	682662	682669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16408	NC_014664	GC	3	6	682740	682745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16409	NC_014664	ACG	2	6	682794	682799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16410	NC_014664	AGG	2	6	682857	682862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16411	NC_014664	ACAA	2	8	682930	682937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16412	NC_014664	CAC	2	6	682969	682974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113389
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16414	NC_014664	CTA	2	6	683025	683030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113389
16415	NC_014664	GGC	2	6	683060	683065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113389
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16417	NC_014664	ACT	2	6	683120	683125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113389
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16420	NC_014664	CGC	2	6	683526	683531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113389
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16422	NC_014664	TCG	2	6	683543	683548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113389
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16424	NC_014664	GC	3	6	683570	683575	0 %	0 %	50 %	50 %	312113389
16425	NC_014664	GTC	2	6	683578	683583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113389
16426	NC_014664	GCAC	2	8	683603	683610	25 %	0 %	25 %	50 %	312113389
16427	NC_014664	CGG	2	6	683703	683708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113389
16428	NC_014664	GCTC	2	8	683784	683791	0 %	25 %	25 %	50 %	312113389
16429	NC_014664	GCT	2	6	683812	683817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113389
16430	NC_014664	ATC	2	6	683867	683872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113389
16431	NC_014664	ATC	2	6	683932	683937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113389
16432	NC_014664	GGCG	2	8	683946	683953	0 %	0 %	75 %	25 %	312113389
16433	NC_014664	GCC	2	6	684021	684026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113389
16434	NC_014664	CAT	2	6	684048	684053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113389
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16436	NC_014664	TGC	2	6	684328	684333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113390
16437	NC_014664	CGA	2	6	684346	684351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113390
16438	NC_014664	AGAC	2	8	684365	684372	50 %	0 %	25 %	25 %	312113390
16439	NC_014664	GCC	2	6	684383	684388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113390
16440	NC_014664	TGC	2	6	684392	684397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113390
16441	NC_014664	CGC	2	6	684437	684442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113390
16442	NC_014664	GGCCGG	2	12	684448	684459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113390
16443	NC_014664	TCC	2	6	684524	684529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113390
16444	NC_014664	CG	3	6	684536	684541	0 %	0 %	50 %	50 %	312113390
16445	NC_014664	ATCG	2	8	684677	684684	25 %	25 %	25 %	25 %	312113390
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16447	NC_014664	TGC	2	6	684770	684775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113390
16448	NC_014664	GGT	2	6	684895	684900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113390
16449	NC_014664	CTTGT	2	10	684903	684912	0 %	60 %	20 %	20 %	312113390
16450	NC_014664	CAAG	2	8	684931	684938	50 %	0 %	25 %	25 %	312113390
16451	NC_014664	GC	4	8	684975	684982	0 %	0 %	50 %	50 %	312113390
16452	NC_014664	CG	3	6	684999	685004	0 %	0 %	50 %	50 %	312113390
16453	NC_014664	CGCT	2	8	685011	685018	0 %	25 %	25 %	50 %	312113390
16454	NC_014664	ACC	2	6	685032	685037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113390
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16456	NC_014664	TCGG	2	8	685080	685087	0 %	25 %	50 %	25 %	312113390
16457	NC_014664	CAG	2	6	685106	685111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113390
16458	NC_014664	A	6	6	685259	685264	100 %	0 %	0 %	0 %	312113390
16459	NC_014664	AGG	2	6	685281	685286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113390
16460	NC_014664	ATA	2	6	685430	685435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312113390
16461	NC_014664	AGC	2	6	685458	685463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113390
16462	NC_014664	TGGC	2	8	685468	685475	0 %	25 %	50 %	25 %	312113390
16463	NC_014664	GCCC	2	8	685557	685564	0 %	0 %	25 %	75 %	312113390
16464	NC_014664	TGC	2	6	685721	685726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113391
16465	NC_014664	ACC	2	6	685733	685738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113391
16466	NC_014664	CGA	2	6	685739	685744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113391
16467	NC_014664	CGA	3	9	685758	685766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113391
16468	NC_014664	CCT	2	6	685854	685859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113391
16469	NC_014664	GCGGA	2	10	685867	685876	20 %	0 %	60 %	20 %	312113391
16470	NC_014664	GAA	2	6	685891	685896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113391
16471	NC_014664	TGA	2	6	685914	685919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113391
16472	NC_014664	GGC	2	6	685926	685931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113391
16473	NC_014664	CGC	2	6	685965	685970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113391
16474	NC_014664	CCCG	2	8	685984	685991	0 %	0 %	25 %	75 %	312113391
16475	NC_014664	CG	3	6	685997	686002	0 %	0 %	50 %	50 %	312113391
16476	NC_014664	GGT	2	6	686007	686012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113391
16477	NC_014664	CTC	2	6	686053	686058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113391
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16479	NC_014664	CGC	2	6	686127	686132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113391
16480	NC_014664	CAAG	2	8	686166	686173	50 %	0 %	25 %	25 %	312113391
16481	NC_014664	CGA	2	6	686289	686294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113391
16482	NC_014664	CCG	2	6	686368	686373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113391
16483	NC_014664	CGA	2	6	686388	686393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113391
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