MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 95531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014664	GCTTC	2	10	523529	523538	0 %	40 %	20 %	40 %	312113235
12502	NC_014664	CGG	2	6	523539	523544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113235
12503	NC_014664	CCG	3	9	523575	523583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113235
12504	NC_014664	CACG	2	8	523653	523660	25 %	0 %	25 %	50 %	312113235
12505	NC_014664	AGC	2	6	523709	523714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113235
12506	NC_014664	GC	3	6	523713	523718	0 %	0 %	50 %	50 %	312113235
12507	NC_014664	CGAG	2	8	523734	523741	25 %	0 %	50 %	25 %	312113235
12508	NC_014664	ACG	2	6	523745	523750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113235
12509	NC_014664	GCG	2	6	523764	523769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113235
12510	NC_014664	ACG	2	6	523778	523783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113235
12511	NC_014664	GCC	2	6	523788	523793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113235
12512	NC_014664	CG	4	8	523818	523825	0 %	0 %	50 %	50 %	312113235
12513	NC_014664	CG	3	6	523892	523897	0 %	0 %	50 %	50 %	312113235
12514	NC_014664	CGC	2	6	523990	523995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113235
12515	NC_014664	TGT	2	6	524035	524040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312113235
12516	NC_014664	CCG	2	6	524084	524089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113235
12517	NC_014664	ATC	2	6	524123	524128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113235
12518	NC_014664	GTCTT	2	10	524130	524139	0 %	60 %	20 %	20 %	312113236
12519	NC_014664	CGG	2	6	524192	524197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113236
12520	NC_014664	TCT	2	6	524251	524256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113236
12521	NC_014664	GTC	2	6	524282	524287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113236
12522	NC_014664	GC	4	8	524308	524315	0 %	0 %	50 %	50 %	312113236
12523	NC_014664	GGCCG	2	10	524363	524372	0 %	0 %	60 %	40 %	312113236
12524	NC_014664	TGA	2	6	524428	524433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113236
12525	NC_014664	GCA	2	6	524437	524442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113236
12526	NC_014664	CCG	2	6	524467	524472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113236
12527	NC_014664	TGA	2	6	524518	524523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113236
12528	NC_014664	GTC	2	6	524553	524558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113236
12529	NC_014664	GCC	2	6	524568	524573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113237
12530	NC_014664	CGC	2	6	524625	524630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113237
12531	NC_014664	CG	3	6	524662	524667	0 %	0 %	50 %	50 %	312113237
12532	NC_014664	CGG	3	9	524688	524696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113237
12533	NC_014664	GTC	2	6	524719	524724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113237
12534	NC_014664	CG	4	8	524739	524746	0 %	0 %	50 %	50 %	312113237
12535	NC_014664	TGC	2	6	524750	524755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113237
12536	NC_014664	AGC	2	6	524765	524770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113237
12537	NC_014664	CCG	2	6	524837	524842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113237
12538	NC_014664	CTT	2	6	524865	524870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113237
12539	NC_014664	GC	3	6	524957	524962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12540	NC_014664	CCG	2	6	524984	524989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12541	NC_014664	CGA	2	6	524995	525000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_014664	CG	4	8	525001	525008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12543	NC_014664	CGG	2	6	525059	525064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113238
12544	NC_014664	CGG	2	6	525119	525124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113238
12545	NC_014664	TTCA	2	8	525147	525154	25 %	50 %	0 %	25 %	312113238
12546	NC_014664	ATA	2	6	525156	525161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312113238
12547	NC_014664	AGC	2	6	525178	525183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113238
12548	NC_014664	CGC	2	6	525192	525197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113238
12549	NC_014664	GAA	2	6	525207	525212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113238
12550	NC_014664	CGA	3	9	525215	525223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113238
12551	NC_014664	CGG	2	6	525289	525294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113238
12552	NC_014664	GCC	2	6	525331	525336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113238
12553	NC_014664	A	6	6	525368	525373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_014664	CGA	2	6	525395	525400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_014664	CGC	2	6	525403	525408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_014664	GCAA	2	8	525469	525476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12557	NC_014664	TGT	2	6	525510	525515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_014664	GAC	2	6	525585	525590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_014664	CCG	2	6	525639	525644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113239
12560	NC_014664	CAC	2	6	525705	525710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113239
12561	NC_014664	CG	3	6	525795	525800	0 %	0 %	50 %	50 %	312113239
12562	NC_014664	TGCT	2	8	525820	525827	0 %	50 %	25 %	25 %	312113239
12563	NC_014664	TAG	2	6	525868	525873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113239
12564	NC_014664	CG	3	6	526057	526062	0 %	0 %	50 %	50 %	312113239
12565	NC_014664	CGG	2	6	526082	526087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113239
12566	NC_014664	GTTCG	2	10	526113	526122	0 %	40 %	40 %	20 %	312113239
12567	NC_014664	TCGC	2	8	526168	526175	0 %	25 %	25 %	50 %	312113239
12568	NC_014664	GTC	2	6	526195	526200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113239
12569	NC_014664	CGC	2	6	526284	526289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12570	NC_014664	ACG	2	6	526294	526299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_014664	GAAC	2	8	526385	526392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12572	NC_014664	TGA	2	6	526412	526417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113240
12573	NC_014664	GCG	2	6	526486	526491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113240
12574	NC_014664	GAA	2	6	526536	526541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113240
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12577	NC_014664	TCG	2	6	526664	526669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113240
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12580	NC_014664	ACG	2	6	526723	526728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113240
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12583	NC_014664	TGA	2	6	526802	526807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113240
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12586	NC_014664	AGCG	2	8	526902	526909	25 %	0 %	50 %	25 %	312113240
12587	NC_014664	AGA	2	6	526940	526945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113240
12588	NC_014664	GGCCG	2	10	526965	526974	0 %	0 %	60 %	40 %	312113240
12589	NC_014664	CGC	2	6	527042	527047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113240
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12591	NC_014664	CGG	2	6	527076	527081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113240
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12593	NC_014664	CGT	2	6	527157	527162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113240
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12596	NC_014664	CCG	2	6	527251	527256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12597	NC_014664	TGG	2	6	527300	527305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113241
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12599	NC_014664	CCG	2	6	527366	527371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113241
12600	NC_014664	GCG	2	6	527441	527446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113241
12601	NC_014664	CGC	2	6	527511	527516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113241
12602	NC_014664	CGG	3	9	527543	527551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113241
12603	NC_014664	CGT	2	6	527561	527566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113241
12604	NC_014664	CGA	2	6	527580	527585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113241
12605	NC_014664	GCG	2	6	527650	527655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113241
12606	NC_014664	CGCT	2	8	527803	527810	0 %	25 %	25 %	50 %	312113241
12607	NC_014664	CGG	2	6	527816	527821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113241
12608	NC_014664	CGA	2	6	527856	527861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113241
12609	NC_014664	GCTTC	3	15	527873	527887	0 %	40 %	20 %	40 %	312113241
12610	NC_014664	TGG	2	6	527918	527923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113241
12611	NC_014664	CG	3	6	527932	527937	0 %	0 %	50 %	50 %	312113241
12612	NC_014664	GC	3	6	527954	527959	0 %	0 %	50 %	50 %	312113241
12613	NC_014664	GGC	2	6	527961	527966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113241
12614	NC_014664	TCGA	2	8	528013	528020	25 %	25 %	25 %	25 %	312113241
12615	NC_014664	GGCTC	2	10	528030	528039	0 %	20 %	40 %	40 %	312113241
12616	NC_014664	GCG	3	9	528053	528061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113241
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12618	NC_014664	GCC	2	6	528205	528210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113241
12619	NC_014664	GCC	2	6	528247	528252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113241
12620	NC_014664	GAA	2	6	528279	528284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113241
12621	NC_014664	AT	3	6	528520	528525	50 %	50 %	0 %	0 %	312113242
12622	NC_014664	CG	3	6	528558	528563	0 %	0 %	50 %	50 %	312113242
12623	NC_014664	GGCT	2	8	528574	528581	0 %	25 %	50 %	25 %	312113242
12624	NC_014664	CGG	2	6	528627	528632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113242
12625	NC_014664	GCT	2	6	528687	528692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113242
12626	NC_014664	GC	3	6	528720	528725	0 %	0 %	50 %	50 %	312113242
12627	NC_014664	GACG	2	8	528756	528763	25 %	0 %	50 %	25 %	312113242
12628	NC_014664	GAG	2	6	528811	528816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113242
12629	NC_014664	CGCGAT	2	12	528822	528833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312113242
12630	NC_014664	CGG	2	6	528882	528887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113242
12631	NC_014664	GTC	2	6	528955	528960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113242
12632	NC_014664	GGC	2	6	528967	528972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113242
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12634	NC_014664	GCG	2	6	529067	529072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113242
12635	NC_014664	GCG	2	6	529090	529095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12636	NC_014664	GAG	2	6	529229	529234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12637	NC_014664	GCG	2	6	529380	529385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113243
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12643	NC_014664	CGG	2	6	529661	529666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113243
12644	NC_014664	GC	3	6	529709	529714	0 %	0 %	50 %	50 %	312113243
12645	NC_014664	CG	4	8	529744	529751	0 %	0 %	50 %	50 %	312113243
12646	NC_014664	T	6	6	529783	529788	0 %	100 %	0 %	0 %	312113243
12647	NC_014664	TCG	2	6	529805	529810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113243
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12663	NC_014664	CTG	2	6	530332	530337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12665	NC_014664	GCG	2	6	530358	530363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12666	NC_014664	GGC	2	6	530426	530431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12667	NC_014664	GCC	2	6	530464	530469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12672	NC_014664	GCG	2	6	530793	530798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113244
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12687	NC_014664	GCC	3	9	531319	531327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12688	NC_014664	CA	3	6	531331	531336	50 %	0 %	0 %	50 %	312113245
12689	NC_014664	CGG	2	6	531374	531379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113245
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12726	NC_014664	CGA	3	9	532631	532639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113245
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12730	NC_014664	GAA	2	6	532731	532736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113245
12731	NC_014664	GTA	2	6	532737	532742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113245
12732	NC_014664	ACG	2	6	532837	532842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113245
12733	NC_014664	TGCT	2	8	532855	532862	0 %	50 %	25 %	25 %	312113245
12734	NC_014664	GGT	2	6	532874	532879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113245
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12736	NC_014664	CCT	2	6	532892	532897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113245
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12738	NC_014664	TGG	2	6	532957	532962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113245
12739	NC_014664	TCGGCG	2	12	533038	533049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312113245
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12864	NC_014664	CCCG	2	8	538065	538072	0 %	0 %	25 %	75 %	312113250
12865	NC_014664	CGG	2	6	538141	538146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113251
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12961	NC_014664	TAAAT	2	10	541606	541615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12977	NC_014664	TCG	2	6	542198	542203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113254
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12983	NC_014664	C	6	6	542425	542430	0 %	0 %	0 %	100 %	312113254
12984	NC_014664	GCC	2	6	542452	542457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113254
12985	NC_014664	AAG	2	6	542477	542482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113254
12986	NC_014664	GTC	2	6	542494	542499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113254
12987	NC_014664	GCCGGA	2	12	542544	542555	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312113254
12988	NC_014664	GCG	2	6	542643	542648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113254
12989	NC_014664	CTC	2	6	542650	542655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113254
12990	NC_014664	CGC	2	6	542697	542702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113255
12991	NC_014664	CTG	2	6	542715	542720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113255
12992	NC_014664	AGCG	2	8	542737	542744	25 %	0 %	50 %	25 %	312113255
12993	NC_014664	GCA	2	6	542777	542782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113255
12994	NC_014664	GCC	2	6	542792	542797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113255
12995	NC_014664	CG	4	8	542971	542978	0 %	0 %	50 %	50 %	312113255
12996	NC_014664	GAC	2	6	542995	543000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113255
12997	NC_014664	CGT	2	6	543103	543108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113255
12998	NC_014664	CGG	2	6	543118	543123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113255
12999	NC_014664	CGG	2	6	543154	543159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113255
13000	NC_014664	CGT	2	6	543187	543192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113255

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