MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 95531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_014664	GCC	2	6	345376	345381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113088
8503	NC_014664	TCG	2	6	345411	345416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113088
8504	NC_014664	CG	3	6	345439	345444	0 %	0 %	50 %	50 %	312113088
8505	NC_014664	GC	3	6	345540	345545	0 %	0 %	50 %	50 %	312113088
8506	NC_014664	GGC	2	6	345558	345563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113088
8507	NC_014664	CAG	2	6	345640	345645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113088
8508	NC_014664	GCC	2	6	345657	345662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113088
8509	NC_014664	GAG	2	6	345679	345684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113088
8510	NC_014664	ATG	2	6	345685	345690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113088
8511	NC_014664	GA	3	6	345809	345814	50 %	0 %	50 %	0 %	312113088
8512	NC_014664	CG	3	6	345830	345835	0 %	0 %	50 %	50 %	312113088
8513	NC_014664	CGG	2	6	345855	345860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113088
8514	NC_014664	CCTCGC	2	12	345891	345902	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	312113088
8515	NC_014664	GTCCGC	2	12	345920	345931	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312113088
8516	NC_014664	CCG	2	6	346011	346016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113088
8517	NC_014664	CG	3	6	346015	346020	0 %	0 %	50 %	50 %	312113088
8518	NC_014664	AGCA	2	8	346169	346176	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8519	NC_014664	GAC	3	9	346202	346210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113089
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8521	NC_014664	CGG	2	6	346249	346254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113089
8522	NC_014664	TGC	2	6	346273	346278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113089
8523	NC_014664	GTG	2	6	346338	346343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113089
8524	NC_014664	GC	3	6	346360	346365	0 %	0 %	50 %	50 %	312113089
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8529	NC_014664	GGCG	2	8	346469	346476	0 %	0 %	75 %	25 %	312113089
8530	NC_014664	GCC	2	6	346485	346490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113089
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8538	NC_014664	GGC	2	6	346951	346956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113089
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8549	NC_014664	TTG	2	6	347744	347749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_014664	TCG	2	6	347804	347809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8552	NC_014664	CAA	2	6	348013	348018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8554	NC_014664	T	6	6	348032	348037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_014664	GCG	2	6	348118	348123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113090
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8559	NC_014664	CGC	2	6	348279	348284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113090
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8623	NC_014664	GCG	2	6	350604	350609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8746	NC_014664	GCG	2	6	356414	356419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113097
8747	NC_014664	GC	3	6	356434	356439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8748	NC_014664	GC	3	6	356446	356451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8866	NC_014664	CAT	3	9	361243	361251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113102
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8869	NC_014664	GAG	2	6	361340	361345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113102
8870	NC_014664	AGCCGC	2	12	361377	361388	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312113102
8871	NC_014664	CCCGT	2	10	361410	361419	0 %	20 %	20 %	60 %	312113102
8872	NC_014664	CGG	3	9	361429	361437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113102
8873	NC_014664	CGCC	2	8	361480	361487	0 %	0 %	25 %	75 %	312113102
8874	NC_014664	CCG	2	6	361524	361529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113102
8875	NC_014664	GAC	4	12	361547	361558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113102
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8877	NC_014664	AAG	2	6	361646	361651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113102
8878	NC_014664	CGA	2	6	361693	361698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113102
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8880	NC_014664	AGC	2	6	361806	361811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113102
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8882	NC_014664	GCC	2	6	361848	361853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113102
8883	NC_014664	CCG	2	6	361882	361887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113102
8884	NC_014664	CGA	2	6	361888	361893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113102
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8889	NC_014664	CGC	2	6	362069	362074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113102
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8893	NC_014664	GTG	2	6	362290	362295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113102
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8895	NC_014664	GC	3	6	362333	362338	0 %	0 %	50 %	50 %	312113102
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8903	NC_014664	CTCGC	2	10	362636	362645	0 %	20 %	20 %	60 %	312113102
8904	NC_014664	CG	3	6	362652	362657	0 %	0 %	50 %	50 %	312113102
8905	NC_014664	TCGGCA	2	12	362682	362693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312113102
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8907	NC_014664	TCG	2	6	362933	362938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8908	NC_014664	GCCGG	2	10	362947	362956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8909	NC_014664	TCGC	2	8	363028	363035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8919	NC_014664	CGG	2	6	363716	363721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8922	NC_014664	CG	3	6	363841	363846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8923	NC_014664	CGCC	2	8	363852	363859	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8924	NC_014664	CGT	2	6	363862	363867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8926	NC_014664	GATCA	2	10	363910	363919	40 %	20 %	20 %	20 %	312113105
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8941	NC_014664	TCCT	2	8	365084	365091	0 %	50 %	0 %	50 %	312113105
8942	NC_014664	GGC	2	6	365107	365112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113105
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8953	NC_014664	TGC	2	6	365587	365592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113105
8954	NC_014664	CAT	2	6	365665	365670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113105
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8956	NC_014664	GAT	2	6	365852	365857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113105
8957	NC_014664	GTTTTT	2	12	365933	365944	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312113105
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8959	NC_014664	TGAG	2	8	365988	365995	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8960	NC_014664	TCA	2	6	366006	366011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8963	NC_014664	TGC	2	6	366065	366070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113106
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8965	NC_014664	GT	3	6	366107	366112	0 %	50 %	50 %	0 %	312113106
8966	NC_014664	GTGGG	2	10	366147	366156	0 %	20 %	80 %	0 %	312113106
8967	NC_014664	GCG	3	9	366172	366180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113106
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8975	NC_014664	AGACG	2	10	366609	366618	40 %	0 %	40 %	20 %	312113106
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8980	NC_014664	CCA	2	6	366731	366736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113106
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8982	NC_014664	GCTC	2	8	366873	366880	0 %	25 %	25 %	50 %	312113106
8983	NC_014664	GCT	2	6	366927	366932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8984	NC_014664	CAT	2	6	366958	366963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113107
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8987	NC_014664	GC	3	6	367038	367043	0 %	0 %	50 %	50 %	312113107
8988	NC_014664	GC	4	8	367070	367077	0 %	0 %	50 %	50 %	312113107
8989	NC_014664	CCG	2	6	367097	367102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113107
8990	NC_014664	AGCG	2	8	367119	367126	25 %	0 %	50 %	25 %	312113107
8991	NC_014664	GCA	2	6	367136	367141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113107
8992	NC_014664	GCGCC	2	10	367177	367186	0 %	0 %	40 %	60 %	312113107
8993	NC_014664	TCG	2	6	367187	367192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113107
8994	NC_014664	CGT	2	6	367215	367220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113107
8995	NC_014664	ATG	2	6	367226	367231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113107
8996	NC_014664	GA	3	6	367274	367279	50 %	0 %	50 %	0 %	312113107
8997	NC_014664	CGC	2	6	367291	367296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113107
8998	NC_014664	CGT	2	6	367368	367373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113107
8999	NC_014664	CGG	2	6	367374	367379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113107
9000	NC_014664	GGC	3	9	367393	367401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113107

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