MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 95531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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72504	NC_014664	CTT	2	6	3046726	3046731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312115511
72505	NC_014664	GC	3	6	3046746	3046751	0 %	0 %	50 %	50 %	312115511
72506	NC_014664	CGA	2	6	3046760	3046765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115511
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72616	NC_014664	GCG	2	6	3051324	3051329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115514
72617	NC_014664	GCG	3	9	3051332	3051340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115514
72618	NC_014664	CGA	2	6	3051347	3051352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115514
72619	NC_014664	GGC	2	6	3051398	3051403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115514
72620	NC_014664	GCG	2	6	3051469	3051474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115514
72621	NC_014664	CGG	2	6	3051566	3051571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115514
72622	NC_014664	GCA	2	6	3051719	3051724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115514
72623	NC_014664	AGAT	2	8	3051795	3051802	50 %	25 %	25 %	0 %	312115515
72624	NC_014664	GAT	2	6	3051923	3051928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312115515
72625	NC_014664	TCA	3	9	3051934	3051942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312115515
72626	NC_014664	GCTCGC	2	12	3051946	3051957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312115515
72627	NC_014664	GAC	2	6	3052084	3052089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115516
72628	NC_014664	ATG	2	6	3052100	3052105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312115516
72629	NC_014664	CGC	2	6	3052131	3052136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115516
72630	NC_014664	ACG	2	6	3052160	3052165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115516
72631	NC_014664	GCG	2	6	3052227	3052232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115516
72632	NC_014664	AGC	2	6	3052301	3052306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115516
72633	NC_014664	TTG	2	6	3052351	3052356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312115516
72634	NC_014664	CTC	2	6	3052366	3052371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312115517
72635	NC_014664	GCA	2	6	3052413	3052418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115517
72636	NC_014664	GGC	2	6	3052431	3052436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115517
72637	NC_014664	TGG	2	6	3052443	3052448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312115517
72638	NC_014664	CAATGA	2	12	3052461	3052472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312115517
72639	NC_014664	CGG	2	6	3052482	3052487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115517
72640	NC_014664	CGA	2	6	3052527	3052532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115517
72641	NC_014664	CGC	2	6	3052587	3052592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115517
72642	NC_014664	CGC	2	6	3052635	3052640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115517
72643	NC_014664	TCCGG	2	10	3052662	3052671	0 %	20 %	40 %	40 %	312115517
72644	NC_014664	GCC	2	6	3052698	3052703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115517
72645	NC_014664	GGT	2	6	3052720	3052725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312115517
72646	NC_014664	GCG	2	6	3052748	3052753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115517
72647	NC_014664	GATG	2	8	3052818	3052825	25 %	25 %	50 %	0 %	312115517
72648	NC_014664	CGT	2	6	3052840	3052845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115517
72649	NC_014664	GCC	2	6	3052861	3052866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115517
72650	NC_014664	TGA	2	6	3052883	3052888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312115517
72651	NC_014664	GCT	2	6	3052895	3052900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115517
72652	NC_014664	CGCTGG	2	12	3052916	3052927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312115517
72653	NC_014664	GC	3	6	3052940	3052945	0 %	0 %	50 %	50 %	312115517
72654	NC_014664	TCG	2	6	3052952	3052957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115517
72655	NC_014664	CCA	2	6	3053007	3053012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312115517
72656	NC_014664	CGGG	2	8	3053013	3053020	0 %	0 %	75 %	25 %	312115517
72657	NC_014664	CG	3	6	3053079	3053084	0 %	0 %	50 %	50 %	312115517
72658	NC_014664	TGG	2	6	3053088	3053093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312115517
72659	NC_014664	GGC	2	6	3053122	3053127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115517
72660	NC_014664	GC	3	6	3053158	3053163	0 %	0 %	50 %	50 %	312115517
72661	NC_014664	GGT	3	9	3053411	3053419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72662	NC_014664	TAA	2	6	3053470	3053475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72663	NC_014664	TAA	2	6	3053537	3053542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72664	NC_014664	CAT	2	6	3053703	3053708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72665	NC_014664	CCG	2	6	3053907	3053912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115518
72666	NC_014664	AAGCGG	2	12	3053921	3053932	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312115518
72667	NC_014664	AAG	2	6	3053951	3053956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312115518
72668	NC_014664	CAGC	2	8	3053968	3053975	25 %	0 %	25 %	50 %	312115518
72669	NC_014664	CGC	2	6	3054046	3054051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115518
72670	NC_014664	GCTC	2	8	3054130	3054137	0 %	25 %	25 %	50 %	312115518
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72672	NC_014664	GCTT	2	8	3054241	3054248	0 %	50 %	25 %	25 %	312115519
72673	NC_014664	TCAA	2	8	3054249	3054256	50 %	25 %	0 %	25 %	312115519
72674	NC_014664	GCT	2	6	3054265	3054270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115519
72675	NC_014664	TTTCG	2	10	3054274	3054283	0 %	60 %	20 %	20 %	312115519
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72677	NC_014664	CTTC	2	8	3054376	3054383	0 %	50 %	0 %	50 %	312115519
72678	NC_014664	GCT	2	6	3054406	3054411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115519
72679	NC_014664	GAG	2	6	3054485	3054490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72680	NC_014664	TGGGG	2	10	3054636	3054645	0 %	20 %	80 %	0 %	312115520
72681	NC_014664	AGGC	2	8	3054666	3054673	25 %	0 %	50 %	25 %	312115520
72682	NC_014664	CAA	2	6	3054746	3054751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312115520
72683	NC_014664	GGC	2	6	3054760	3054765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115520
72684	NC_014664	CG	3	6	3054840	3054845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72685	NC_014664	AGAGGC	2	12	3054933	3054944	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312115521
72686	NC_014664	TTCG	2	8	3054967	3054974	0 %	50 %	25 %	25 %	312115521
72687	NC_014664	TGA	2	6	3055006	3055011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312115521
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72689	NC_014664	GCCG	2	8	3055087	3055094	0 %	0 %	50 %	50 %	312115521
72690	NC_014664	CGA	2	6	3055123	3055128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115521
72691	NC_014664	GGC	2	6	3055236	3055241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115521
72692	NC_014664	AC	3	6	3055244	3055249	50 %	0 %	0 %	50 %	312115521
72693	NC_014664	CCGG	2	8	3055285	3055292	0 %	0 %	50 %	50 %	312115521
72694	NC_014664	CGA	2	6	3055360	3055365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115521
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72700	NC_014664	TCG	2	6	3055713	3055718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115522
72701	NC_014664	TCC	2	6	3055724	3055729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312115522
72702	NC_014664	TGG	2	6	3055737	3055742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312115522
72703	NC_014664	CGG	2	6	3055770	3055775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115522
72704	NC_014664	CCT	2	6	3055920	3055925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312115522
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72712	NC_014664	GC	3	6	3056167	3056172	0 %	0 %	50 %	50 %	312115522
72713	NC_014664	CGA	2	6	3056184	3056189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115522
72714	NC_014664	TCG	2	6	3056246	3056251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115522
72715	NC_014664	CCGG	2	8	3056253	3056260	0 %	0 %	50 %	50 %	312115522
72716	NC_014664	CG	3	6	3056271	3056276	0 %	0 %	50 %	50 %	312115522
72717	NC_014664	TGG	2	6	3056289	3056294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312115522
72718	NC_014664	TCGCCC	2	12	3056306	3056317	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	312115522
72719	NC_014664	ATC	2	6	3056330	3056335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312115522
72720	NC_014664	GC	3	6	3056376	3056381	0 %	0 %	50 %	50 %	312115522
72721	NC_014664	GAGC	2	8	3056395	3056402	25 %	0 %	50 %	25 %	312115522
72722	NC_014664	GC	3	6	3056417	3056422	0 %	0 %	50 %	50 %	312115522
72723	NC_014664	GGA	2	6	3056439	3056444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312115522
72724	NC_014664	CGA	2	6	3056487	3056492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115522
72725	NC_014664	CGA	2	6	3056511	3056516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115522
72726	NC_014664	TGCC	2	8	3056637	3056644	0 %	25 %	25 %	50 %	312115522
72727	NC_014664	T	6	6	3056647	3056652	0 %	100 %	0 %	0 %	312115522
72728	NC_014664	GCC	2	6	3056660	3056665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115522
72729	NC_014664	GAC	3	9	3056698	3056706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115522
72730	NC_014664	GA	3	6	3056720	3056725	50 %	0 %	50 %	0 %	312115522
72731	NC_014664	GGC	2	6	3056776	3056781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115522
72732	NC_014664	GCC	2	6	3056839	3056844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115522
72733	NC_014664	CGC	2	6	3056859	3056864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115522
72734	NC_014664	CTT	2	6	3056872	3056877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312115522
72735	NC_014664	CCGC	2	8	3056959	3056966	0 %	0 %	25 %	75 %	312115522
72736	NC_014664	TGCC	2	8	3057012	3057019	0 %	25 %	25 %	50 %	312115522
72737	NC_014664	GCC	2	6	3057049	3057054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115522
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72739	NC_014664	AG	3	6	3057093	3057098	50 %	0 %	50 %	0 %	312115522
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72741	NC_014664	GAT	2	6	3057126	3057131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312115522
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72743	NC_014664	CGTT	2	8	3057256	3057263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72744	NC_014664	GAGC	2	8	3057286	3057293	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72745	NC_014664	GTC	2	6	3057318	3057323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72746	NC_014664	CGC	2	6	3057328	3057333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72747	NC_014664	TTC	2	6	3057420	3057425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312115523
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72752	NC_014664	TCG	2	6	3057633	3057638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115523
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72831	NC_014664	CGG	2	6	3061746	3061751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115529
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72834	NC_014664	CCT	2	6	3061916	3061921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72835	NC_014664	CGTTC	2	10	3061962	3061971	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72836	NC_014664	CAA	2	6	3062062	3062067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72837	NC_014664	CGC	2	6	3062071	3062076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72838	NC_014664	CG	3	6	3062110	3062115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72839	NC_014664	CTG	2	6	3062182	3062187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72840	NC_014664	T	8	8	3062209	3062216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72841	NC_014664	ACG	2	6	3062218	3062223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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72844	NC_014664	GGC	2	6	3062325	3062330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115530
72845	NC_014664	TGC	2	6	3062390	3062395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115530
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72847	NC_014664	CG	4	8	3062468	3062475	0 %	0 %	50 %	50 %	312115530
72848	NC_014664	TGC	2	6	3062512	3062517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115530
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72969	NC_014664	GCG	2	6	3068458	3068463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115534
72970	NC_014664	GC	3	6	3068519	3068524	0 %	0 %	50 %	50 %	312115534
72971	NC_014664	AAC	2	6	3068630	3068635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312115534
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72973	NC_014664	GCG	2	6	3068687	3068692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115534
72974	NC_014664	CT	3	6	3068702	3068707	0 %	50 %	0 %	50 %	312115534
72975	NC_014664	TC	4	8	3068768	3068775	0 %	50 %	0 %	50 %	312115534
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72979	NC_014664	GC	3	6	3068992	3068997	0 %	0 %	50 %	50 %	312115535
72980	NC_014664	CGGCG	2	10	3069125	3069134	0 %	0 %	60 %	40 %	312115535
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72983	NC_014664	GC	3	6	3069188	3069193	0 %	0 %	50 %	50 %	312115535
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72988	NC_014664	CCG	2	6	3069451	3069456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115536
72989	NC_014664	CGT	2	6	3069460	3069465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312115536
72990	NC_014664	GGC	2	6	3069490	3069495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115536
72991	NC_014664	CGGG	2	8	3069505	3069512	0 %	0 %	75 %	25 %	312115536
72992	NC_014664	TTC	2	6	3069516	3069521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312115536
72993	NC_014664	CGA	2	6	3069535	3069540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312115536
72994	NC_014664	ACC	2	6	3069607	3069612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72995	NC_014664	GCC	2	6	3069683	3069688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312115537
72996	NC_014664	GCCG	2	8	3069694	3069701	0 %	0 %	50 %	50 %	312115537
72997	NC_014664	CATGC	2	10	3069762	3069771	20 %	20 %	20 %	40 %	312115537
72998	NC_014664	GCG	2	6	3069824	3069829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312115537
72999	NC_014664	CG	3	6	3069832	3069837	0 %	0 %	50 %	50 %	312115537
73000	NC_014664	CCAG	2	8	3069943	3069950	25 %	0 %	25 %	50 %	312115537

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