MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 48596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_014643	TACC	2	8	2500505	2500512	25 %	25 %	0 %	50 %	311113883
48502	NC_014643	GCT	2	6	2500514	2500519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113883
48503	NC_014643	ATC	2	6	2500521	2500526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113883
48504	NC_014643	ATA	2	6	2500534	2500539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113883
48505	NC_014643	TCG	2	6	2500573	2500578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113883
48506	NC_014643	TTA	2	6	2500708	2500713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311113883
48507	NC_014643	CTT	2	6	2500715	2500720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113883
48508	NC_014643	GCG	2	6	2500739	2500744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113883
48509	NC_014643	GCG	2	6	2500779	2500784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113883
48510	NC_014643	CGC	2	6	2500847	2500852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113883
48511	NC_014643	GAA	3	9	2500873	2500881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113883
48512	NC_014643	CTCA	2	8	2500908	2500915	25 %	25 %	0 %	50 %	311113883
48513	NC_014643	TCT	2	6	2500981	2500986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113883
48514	NC_014643	TGGG	2	8	2501023	2501030	0 %	25 %	75 %	0 %	311113883
48515	NC_014643	ATA	2	6	2501052	2501057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113883
48516	NC_014643	GTC	2	6	2501143	2501148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113883
48517	NC_014643	TA	3	6	2501155	2501160	50 %	50 %	0 %	0 %	311113883
48518	NC_014643	AAG	2	6	2501274	2501279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113883
48519	NC_014643	GGT	2	6	2501283	2501288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113883
48520	NC_014643	TAA	2	6	2501327	2501332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113883
48521	NC_014643	TCA	2	6	2501506	2501511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48522	NC_014643	TCT	2	6	2501597	2501602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113884
48523	NC_014643	GCC	2	6	2501687	2501692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113884
48524	NC_014643	AAGG	2	8	2501951	2501958	50 %	0 %	50 %	0 %	311113884
48525	NC_014643	GA	3	6	2501994	2501999	50 %	0 %	50 %	0 %	311113884
48526	NC_014643	CGGT	2	8	2502056	2502063	0 %	25 %	50 %	25 %	311113884
48527	NC_014643	GGCGC	2	10	2502122	2502131	0 %	0 %	60 %	40 %	311113884
48528	NC_014643	CA	3	6	2502133	2502138	50 %	0 %	0 %	50 %	311113884
48529	NC_014643	GCA	3	9	2502164	2502172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113884
48530	NC_014643	CTG	2	6	2502179	2502184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113884
48531	NC_014643	CGC	2	6	2502244	2502249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113884
48532	NC_014643	GTG	2	6	2502271	2502276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113884
48533	NC_014643	GT	3	6	2502297	2502302	0 %	50 %	50 %	0 %	311113884
48534	NC_014643	ACG	2	6	2502428	2502433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113884
48535	NC_014643	GTGG	2	8	2502451	2502458	0 %	25 %	75 %	0 %	311113884
48536	NC_014643	CG	3	6	2502474	2502479	0 %	0 %	50 %	50 %	311113884
48537	NC_014643	TCC	2	6	2502488	2502493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311113884
48538	NC_014643	ATG	2	6	2502572	2502577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113884
48539	NC_014643	TC	3	6	2502581	2502586	0 %	50 %	0 %	50 %	311113884
48540	NC_014643	TGG	2	6	2502615	2502620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113884
48541	NC_014643	TGA	2	6	2502649	2502654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113884
48542	NC_014643	AGC	2	6	2502730	2502735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113885
48543	NC_014643	CAT	2	6	2502899	2502904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113885
48544	NC_014643	GCT	2	6	2503052	2503057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113885
48545	NC_014643	CCA	2	6	2503104	2503109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113885
48546	NC_014643	CTT	2	6	2503136	2503141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113885
48547	NC_014643	GGCCA	2	10	2503183	2503192	20 %	0 %	40 %	40 %	311113885
48548	NC_014643	GTTT	2	8	2503207	2503214	0 %	75 %	25 %	0 %	311113885
48549	NC_014643	GTTT	2	8	2503251	2503258	0 %	75 %	25 %	0 %	311113885
48550	NC_014643	ATA	2	6	2503272	2503277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113885
48551	NC_014643	TTC	2	6	2503309	2503314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113885
48552	NC_014643	ATC	2	6	2503335	2503340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113885
48553	NC_014643	CCAG	2	8	2503349	2503356	25 %	0 %	25 %	50 %	311113885
48554	NC_014643	GCA	2	6	2503394	2503399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113885
48555	NC_014643	CGG	2	6	2503469	2503474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113885
48556	NC_014643	CTG	2	6	2503566	2503571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113885
48557	NC_014643	CAG	2	6	2503575	2503580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113885
48558	NC_014643	AGC	2	6	2503634	2503639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113886
48559	NC_014643	GCT	2	6	2503682	2503687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113886
48560	NC_014643	ATG	2	6	2503729	2503734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113886
48561	NC_014643	TTC	2	6	2503797	2503802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113886
48562	NC_014643	TGG	3	9	2503852	2503860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113886
48563	NC_014643	TCA	2	6	2503915	2503920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113886
48564	NC_014643	TGA	2	6	2504163	2504168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113886
48565	NC_014643	TCGGTC	2	12	2504185	2504196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113886
48566	NC_014643	GCA	2	6	2504213	2504218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113886
48567	NC_014643	CCG	2	6	2504225	2504230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113886
48568	NC_014643	GTTGG	2	10	2504498	2504507	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
48569	NC_014643	TAT	2	6	2504516	2504521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48570	NC_014643	TG	3	6	2504596	2504601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48571	NC_014643	CAGC	2	8	2504604	2504611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48572	NC_014643	CAG	2	6	2504766	2504771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113887
48573	NC_014643	CATCAC	2	12	2504798	2504809	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	311113887
48574	NC_014643	ACC	2	6	2504838	2504843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113887
48575	NC_014643	CCG	2	6	2504911	2504916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113887
48576	NC_014643	GCT	2	6	2504951	2504956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113887
48577	NC_014643	CGTC	2	8	2505001	2505008	0 %	25 %	25 %	50 %	311113887
48578	NC_014643	TTC	2	6	2505018	2505023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113887
48579	NC_014643	ATT	2	6	2505096	2505101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311113887
48580	NC_014643	CGG	2	6	2505119	2505124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113887
48581	NC_014643	ATA	2	6	2505159	2505164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113887
48582	NC_014643	T	6	6	2505176	2505181	0 %	100 %	0 %	0 %	311113887
48583	NC_014643	TGG	2	6	2505188	2505193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113887
48584	NC_014643	CTG	2	6	2505414	2505419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113887
48585	NC_014643	CTG	2	6	2505447	2505452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113887
48586	NC_014643	TTG	2	6	2505483	2505488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113887
48587	NC_014643	GATGTG	2	12	2505538	2505549	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
48588	NC_014643	GTT	2	6	2505557	2505562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48589	NC_014643	A	6	6	2505577	2505582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48590	NC_014643	ACT	2	6	2505609	2505614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48591	NC_014643	CGTGT	2	10	2505659	2505668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48592	NC_014643	GTT	2	6	2505714	2505719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48593	NC_014643	ACC	2	6	2505721	2505726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48594	NC_014643	AGAT	2	8	2505800	2505807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48595	NC_014643	CAG	2	6	2505810	2505815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48596	NC_014643	TCTAG	2	10	2505927	2505936	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.