MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 48596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_014643	TATC	2	8	2421234	2421241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47002	NC_014643	TCT	2	6	2421253	2421258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47003	NC_014643	TCC	2	6	2421338	2421343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311113822
47004	NC_014643	CAC	2	6	2421348	2421353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113822
47005	NC_014643	CT	3	6	2421391	2421396	0 %	50 %	0 %	50 %	311113822
47006	NC_014643	TAA	2	6	2421543	2421548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113822
47007	NC_014643	ATGA	2	8	2421550	2421557	50 %	25 %	25 %	0 %	311113822
47008	NC_014643	CTGCA	2	10	2421602	2421611	20 %	20 %	20 %	40 %	311113822
47009	NC_014643	TTA	2	6	2421620	2421625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311113822
47010	NC_014643	GGTTAG	2	12	2422084	2422095	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47011	NC_014643	GTTTT	2	10	2422126	2422135	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47012	NC_014643	TCG	2	6	2422201	2422206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47013	NC_014643	GCA	2	6	2422208	2422213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47014	NC_014643	GCG	2	6	2422250	2422255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113823
47015	NC_014643	AAGA	2	8	2422268	2422275	75 %	0 %	25 %	0 %	311113823
47016	NC_014643	TTC	2	6	2422285	2422290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113823
47017	NC_014643	ACG	2	6	2422404	2422409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113823
47018	NC_014643	ACT	2	6	2422416	2422421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113823
47019	NC_014643	ACCC	2	8	2422501	2422508	25 %	0 %	0 %	75 %	311113823
47020	NC_014643	TGC	2	6	2422576	2422581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113823
47021	NC_014643	CCT	2	6	2422591	2422596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311113823
47022	NC_014643	GAA	2	6	2422694	2422699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113823
47023	NC_014643	TTA	2	6	2422734	2422739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311113823
47024	NC_014643	GCA	2	6	2422740	2422745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113823
47025	NC_014643	AGC	2	6	2422746	2422751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113823
47026	NC_014643	CTA	2	6	2422752	2422757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113823
47027	NC_014643	TACG	2	8	2422859	2422866	25 %	25 %	25 %	25 %	311113823
47028	NC_014643	GCA	2	6	2422947	2422952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47029	NC_014643	TCT	2	6	2422997	2423002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47030	NC_014643	ATT	2	6	2423005	2423010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47031	NC_014643	GCA	2	6	2423049	2423054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47032	NC_014643	TTC	2	6	2423061	2423066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47033	NC_014643	C	10	10	2423072	2423081	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47034	NC_014643	AGC	2	6	2423087	2423092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47035	NC_014643	CAG	2	6	2423131	2423136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47036	NC_014643	TG	3	6	2423160	2423165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47037	NC_014643	CGA	2	6	2423166	2423171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47038	NC_014643	CT	3	6	2423172	2423177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47039	NC_014643	TAGCTC	2	12	2423191	2423202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47040	NC_014643	ATA	2	6	2423333	2423338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47041	NC_014643	CCCAT	2	10	2423368	2423377	20 %	20 %	0 %	60 %	311113824
47042	NC_014643	GA	3	6	2423378	2423383	50 %	0 %	50 %	0 %	311113824
47043	NC_014643	ACT	2	6	2423386	2423391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113824
47044	NC_014643	TCA	2	6	2423392	2423397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113824
47045	NC_014643	CCG	2	6	2423420	2423425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113824
47046	NC_014643	CAA	2	6	2423560	2423565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311113824
47047	NC_014643	AAG	2	6	2423598	2423603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113824
47048	NC_014643	GAT	2	6	2423619	2423624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113824
47049	NC_014643	CGG	2	6	2423630	2423635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113824
47050	NC_014643	GCC	2	6	2423658	2423663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113824
47051	NC_014643	GA	3	6	2423727	2423732	50 %	0 %	50 %	0 %	311113824
47052	NC_014643	TAC	2	6	2423774	2423779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113824
47053	NC_014643	CCA	2	6	2423827	2423832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113824
47054	NC_014643	ACA	2	6	2423923	2423928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311113824
47055	NC_014643	GATATC	2	12	2423946	2423957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	311113824
47056	NC_014643	GCCGT	2	10	2424035	2424044	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47057	NC_014643	AT	3	6	2424063	2424068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47058	NC_014643	ATT	2	6	2424097	2424102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47059	NC_014643	CCG	2	6	2424113	2424118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47060	NC_014643	GTA	2	6	2424191	2424196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47061	NC_014643	AATC	2	8	2424228	2424235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47062	NC_014643	CAC	2	6	2424244	2424249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47063	NC_014643	AC	3	6	2424248	2424253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47064	NC_014643	TTG	2	6	2424292	2424297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113825
47065	NC_014643	CAT	2	6	2424422	2424427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113825
47066	NC_014643	GAA	2	6	2424438	2424443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113825
47067	NC_014643	CGG	2	6	2424461	2424466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113825
47068	NC_014643	TGGT	2	8	2424514	2424521	0 %	50 %	50 %	0 %	311113825
47069	NC_014643	GCA	2	6	2424522	2424527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113825
47070	NC_014643	GCG	2	6	2424640	2424645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113825
47071	NC_014643	CCA	2	6	2424673	2424678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113825
47072	NC_014643	TCGCA	2	10	2424694	2424703	20 %	20 %	20 %	40 %	311113825
47073	NC_014643	ACC	2	6	2424741	2424746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113825
47074	NC_014643	GAA	2	6	2424848	2424853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113825
47075	NC_014643	TTG	2	6	2424868	2424873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113825
47076	NC_014643	AGG	2	6	2425045	2425050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311113825
47077	NC_014643	GGT	2	6	2425059	2425064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113825
47078	NC_014643	TTC	2	6	2425067	2425072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113825
47079	NC_014643	GCA	2	6	2425089	2425094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113825
47080	NC_014643	GAA	2	6	2425098	2425103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113825
47081	NC_014643	AAG	2	6	2425107	2425112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113825
47082	NC_014643	GTT	2	6	2425143	2425148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113825
47083	NC_014643	AAAC	2	8	2425217	2425224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47084	NC_014643	CGTT	2	8	2425237	2425244	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47085	NC_014643	AGA	2	6	2425275	2425280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47086	NC_014643	GCG	2	6	2425341	2425346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47087	NC_014643	GC	3	6	2425350	2425355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47088	NC_014643	AGAA	2	8	2425410	2425417	75 %	0 %	25 %	0 %	311113826
47089	NC_014643	T	6	6	2425428	2425433	0 %	100 %	0 %	0 %	311113826
47090	NC_014643	GCG	2	6	2425479	2425484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113826
47091	NC_014643	GCAT	2	8	2425519	2425526	25 %	25 %	25 %	25 %	311113826
47092	NC_014643	AC	3	6	2425548	2425553	50 %	0 %	0 %	50 %	311113826
47093	NC_014643	T	6	6	2425613	2425618	0 %	100 %	0 %	0 %	311113826
47094	NC_014643	ATCC	2	8	2425632	2425639	25 %	25 %	0 %	50 %	311113826
47095	NC_014643	GCG	2	6	2425655	2425660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113826
47096	NC_014643	T	7	7	2425661	2425667	0 %	100 %	0 %	0 %	311113826
47097	NC_014643	CATGG	2	10	2425674	2425683	20 %	20 %	40 %	20 %	311113826
47098	NC_014643	ACC	2	6	2425701	2425706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113826
47099	NC_014643	TGA	2	6	2425715	2425720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113826
47100	NC_014643	CGG	2	6	2425748	2425753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113826
47101	NC_014643	TCGC	2	8	2425754	2425761	0 %	25 %	25 %	50 %	311113826
47102	NC_014643	GGTGCT	2	12	2425809	2425820	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	311113826
47103	NC_014643	AGT	2	6	2425835	2425840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113826
47104	NC_014643	GTG	3	9	2425875	2425883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113826
47105	NC_014643	ATC	2	6	2425888	2425893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113826
47106	NC_014643	CG	3	6	2425894	2425899	0 %	0 %	50 %	50 %	311113826
47107	NC_014643	GAA	3	9	2425949	2425957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113826
47108	NC_014643	AT	3	6	2425979	2425984	50 %	50 %	0 %	0 %	311113826
47109	NC_014643	GTG	2	6	2426013	2426018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47110	NC_014643	CT	3	6	2426019	2426024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47111	NC_014643	GTT	2	6	2426039	2426044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47112	NC_014643	CGC	2	6	2426063	2426068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47113	NC_014643	ACT	2	6	2426085	2426090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47114	NC_014643	AGAC	2	8	2426188	2426195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47115	NC_014643	GGA	2	6	2426196	2426201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47116	NC_014643	ACC	2	6	2426255	2426260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47117	NC_014643	A	6	6	2426270	2426275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47118	NC_014643	A	6	6	2426277	2426282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47119	NC_014643	GCT	2	6	2426291	2426296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47121	NC_014643	AG	3	6	2426519	2426524	50 %	0 %	50 %	0 %	311113827
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47239	NC_014643	TCT	2	6	2432986	2432991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113829
47240	NC_014643	TGG	2	6	2433121	2433126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113829
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47243	NC_014643	GTG	2	6	2433232	2433237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113829
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47338	NC_014643	CGGG	2	8	2439038	2439045	0 %	0 %	75 %	25 %	311113831
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47340	NC_014643	GT	3	6	2439205	2439210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47341	NC_014643	A	6	6	2439385	2439390	100 %	0 %	0 %	0 %	311113832
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47344	NC_014643	AGT	2	6	2439467	2439472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113832
47345	NC_014643	CT	3	6	2439492	2439497	0 %	50 %	0 %	50 %	311113832
47346	NC_014643	CAT	2	6	2439500	2439505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113832
47347	NC_014643	TATG	2	8	2439510	2439517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47348	NC_014643	TA	3	6	2439526	2439531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47349	NC_014643	ACC	2	6	2439608	2439613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47350	NC_014643	TAT	2	6	2439624	2439629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47351	NC_014643	TAT	2	6	2439706	2439711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47352	NC_014643	GCTTA	2	10	2439744	2439753	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47353	NC_014643	AG	3	6	2439837	2439842	50 %	0 %	50 %	0 %	311113833
47354	NC_014643	CAGC	2	8	2439877	2439884	25 %	0 %	25 %	50 %	311113833
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47356	NC_014643	TCT	2	6	2440066	2440071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113833
47357	NC_014643	AGCTG	2	10	2440177	2440186	20 %	20 %	40 %	20 %	311113833
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47459	NC_014643	CA	3	6	2445257	2445262	50 %	0 %	0 %	50 %	311113837
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