MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 48596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_014643	CAGA	2	8	2096627	2096634	50 %	0 %	25 %	25 %	311113550
41002	NC_014643	ACC	2	6	2096871	2096876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113550
41003	NC_014643	CTT	2	6	2096948	2096953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113550
41004	NC_014643	A	6	6	2096982	2096987	100 %	0 %	0 %	0 %	311113550
41005	NC_014643	TA	3	6	2096990	2096995	50 %	50 %	0 %	0 %	311113550
41006	NC_014643	CATGC	2	10	2097017	2097026	20 %	20 %	20 %	40 %	311113550
41007	NC_014643	CGC	2	6	2097172	2097177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113550
41008	NC_014643	GTTG	2	8	2097263	2097270	0 %	50 %	50 %	0 %	311113550
41009	NC_014643	GAT	2	6	2097316	2097321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113550
41010	NC_014643	TGA	2	6	2097330	2097335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113550
41011	NC_014643	CG	3	6	2097346	2097351	0 %	0 %	50 %	50 %	311113550
41012	NC_014643	CTC	2	6	2097374	2097379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311113550
41013	NC_014643	GTA	2	6	2097390	2097395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113550
41014	NC_014643	GC	3	6	2097411	2097416	0 %	0 %	50 %	50 %	311113550
41015	NC_014643	GAA	2	6	2097536	2097541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113550
41016	NC_014643	TGC	2	6	2097604	2097609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113550
41017	NC_014643	GTG	2	6	2097687	2097692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113550
41018	NC_014643	GAA	2	6	2097796	2097801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113550
41019	NC_014643	CCGA	2	8	2097833	2097840	25 %	0 %	25 %	50 %	311113550
41020	NC_014643	AAG	2	6	2097861	2097866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113550
41021	NC_014643	TTC	2	6	2097986	2097991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113551
41022	NC_014643	CAG	2	6	2098072	2098077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113551
41023	NC_014643	CCG	2	6	2098125	2098130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113551
41024	NC_014643	AT	3	6	2098144	2098149	50 %	50 %	0 %	0 %	311113551
41025	NC_014643	ATT	2	6	2098157	2098162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311113551
41026	NC_014643	TGC	2	6	2098284	2098289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113551
41027	NC_014643	AGCGA	2	10	2098302	2098311	40 %	0 %	40 %	20 %	311113551
41028	NC_014643	AT	3	6	2098366	2098371	50 %	50 %	0 %	0 %	311113551
41029	NC_014643	GCC	3	9	2098376	2098384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113551
41030	NC_014643	ACC	2	6	2098394	2098399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113551
41031	NC_014643	GCC	2	6	2098409	2098414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113551
41032	NC_014643	GCA	2	6	2098545	2098550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113551
41033	NC_014643	ATCA	2	8	2098559	2098566	50 %	25 %	0 %	25 %	311113551
41034	NC_014643	CTA	2	6	2098618	2098623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113551
41035	NC_014643	CG	3	6	2098714	2098719	0 %	0 %	50 %	50 %	311113551
41036	NC_014643	AG	3	6	2098794	2098799	50 %	0 %	50 %	0 %	311113551
41037	NC_014643	AAT	2	6	2098835	2098840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113551
41038	NC_014643	TTG	2	6	2098923	2098928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113551
41039	NC_014643	CATA	2	8	2099039	2099046	50 %	25 %	0 %	25 %	311113552
41040	NC_014643	CTG	2	6	2099115	2099120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113552
41041	NC_014643	AAT	2	6	2099142	2099147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113552
41042	NC_014643	CTG	2	6	2099225	2099230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113552
41043	NC_014643	AGCCA	2	10	2099270	2099279	40 %	0 %	20 %	40 %	311113552
41044	NC_014643	CCA	2	6	2099553	2099558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113552
41045	NC_014643	CA	3	6	2099557	2099562	50 %	0 %	0 %	50 %	311113552
41046	NC_014643	AAT	2	6	2099640	2099645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113552
41047	NC_014643	TAT	2	6	2099711	2099716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311113552
41048	NC_014643	ACC	2	6	2099809	2099814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113552
41049	NC_014643	GCT	3	9	2099829	2099837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113552
41050	NC_014643	AGA	2	6	2099857	2099862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113552
41051	NC_014643	GT	3	6	2099896	2099901	0 %	50 %	50 %	0 %	311113552
41052	NC_014643	TCT	2	6	2099953	2099958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113553
41053	NC_014643	GCG	2	6	2100085	2100090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113553
41054	NC_014643	TCA	2	6	2100240	2100245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113553
41055	NC_014643	AGA	2	6	2100314	2100319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113553
41056	NC_014643	CGCA	2	8	2100371	2100378	25 %	0 %	25 %	50 %	311113553
41057	NC_014643	GCG	2	6	2100401	2100406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113553
41058	NC_014643	TCA	2	6	2100471	2100476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113553
41059	NC_014643	CGC	2	6	2100496	2100501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113553
41060	NC_014643	ATC	2	6	2100548	2100553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113553
41061	NC_014643	TCC	2	6	2100621	2100626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311113553
41062	NC_014643	CAT	2	6	2100691	2100696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113553
41063	NC_014643	CGG	2	6	2100866	2100871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113553
41064	NC_014643	CG	3	6	2100901	2100906	0 %	0 %	50 %	50 %	311113553
41065	NC_014643	CAC	2	6	2100941	2100946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113553
41066	NC_014643	ACG	2	6	2100947	2100952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113553
41067	NC_014643	GTC	2	6	2100971	2100976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113553
41068	NC_014643	CAT	2	6	2100985	2100990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113553
41069	NC_014643	AG	3	6	2101055	2101060	50 %	0 %	50 %	0 %	311113553
41070	NC_014643	TCA	3	9	2101137	2101145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113553
41071	NC_014643	TTC	2	6	2101220	2101225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113553
41072	NC_014643	ATC	2	6	2101253	2101258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113553
41073	NC_014643	CAA	2	6	2101285	2101290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311113553
41074	NC_014643	CAA	2	6	2101307	2101312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311113553
41075	NC_014643	GAA	2	6	2101379	2101384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113553
41076	NC_014643	CG	3	6	2101426	2101431	0 %	0 %	50 %	50 %	311113553
41077	NC_014643	AGAT	2	8	2101468	2101475	50 %	25 %	25 %	0 %	311113553
41078	NC_014643	GA	3	6	2101570	2101575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41079	NC_014643	AGCG	2	8	2101584	2101591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41080	NC_014643	ATT	2	6	2101665	2101670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41083	NC_014643	AG	3	6	2101946	2101951	50 %	0 %	50 %	0 %	311113554
41084	NC_014643	AGA	2	6	2102043	2102048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113554
41085	NC_014643	TTCA	2	8	2102136	2102143	25 %	50 %	0 %	25 %	311113554
41086	NC_014643	GAA	2	6	2102178	2102183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113554
41087	NC_014643	AG	3	6	2102205	2102210	50 %	0 %	50 %	0 %	311113554
41088	NC_014643	CTT	2	6	2102231	2102236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113554
41089	NC_014643	CGT	2	6	2102477	2102482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113554
41090	NC_014643	AT	3	6	2102499	2102504	50 %	50 %	0 %	0 %	311113554
41091	NC_014643	AGC	2	6	2102523	2102528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113554
41092	NC_014643	ACGT	2	8	2102529	2102536	25 %	25 %	25 %	25 %	311113554
41093	NC_014643	AGT	2	6	2102541	2102546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113554
41094	NC_014643	CTT	2	6	2102561	2102566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113554
41095	NC_014643	AGC	2	6	2102613	2102618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113554
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41097	NC_014643	TGA	2	6	2102684	2102689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113554
41098	NC_014643	ATC	2	6	2102730	2102735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113554
41099	NC_014643	AG	3	6	2102760	2102765	50 %	0 %	50 %	0 %	311113554
41100	NC_014643	AGCT	2	8	2102892	2102899	25 %	25 %	25 %	25 %	311113555
41101	NC_014643	GCG	2	6	2102908	2102913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113555
41102	NC_014643	TTC	2	6	2102919	2102924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113555
41103	NC_014643	AGC	2	6	2102925	2102930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113555
41104	NC_014643	ACG	2	6	2102935	2102940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113555
41105	NC_014643	TGC	2	6	2103081	2103086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113555
41106	NC_014643	AAC	2	6	2103159	2103164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311113555
41107	NC_014643	CATAA	2	10	2103273	2103282	60 %	20 %	0 %	20 %	311113555
41108	NC_014643	CG	3	6	2103287	2103292	0 %	0 %	50 %	50 %	311113555
41109	NC_014643	TGAA	2	8	2103333	2103340	50 %	25 %	25 %	0 %	311113555
41110	NC_014643	TCTT	2	8	2103400	2103407	0 %	75 %	0 %	25 %	311113555
41111	NC_014643	TTCG	2	8	2103438	2103445	0 %	50 %	25 %	25 %	311113555
41112	NC_014643	GC	3	6	2103481	2103486	0 %	0 %	50 %	50 %	311113555
41113	NC_014643	TTGG	2	8	2103506	2103513	0 %	50 %	50 %	0 %	311113555
41114	NC_014643	TGGG	2	8	2103514	2103521	0 %	25 %	75 %	0 %	311113555
41115	NC_014643	GAA	2	6	2103627	2103632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113555
41116	NC_014643	GCC	2	6	2103688	2103693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113555
41117	NC_014643	AC	3	6	2103719	2103724	50 %	0 %	0 %	50 %	311113555
41118	NC_014643	TCC	2	6	2103748	2103753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311113555
41119	NC_014643	GTT	2	6	2103786	2103791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113555
41120	NC_014643	TGG	2	6	2103794	2103799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113555
41121	NC_014643	TGC	2	6	2103882	2103887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113555
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41123	NC_014643	GCA	2	6	2104039	2104044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113555
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41128	NC_014643	CG	3	6	2104260	2104265	0 %	0 %	50 %	50 %	311113555
41129	NC_014643	GTCCA	2	10	2104318	2104327	20 %	20 %	20 %	40 %	311113555
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41134	NC_014643	TG	3	6	2104779	2104784	0 %	50 %	50 %	0 %	311113555
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41139	NC_014643	ACAA	2	8	2105051	2105058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41140	NC_014643	TAG	2	6	2105059	2105064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41141	NC_014643	GCA	2	6	2105081	2105086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41142	NC_014643	CAA	2	6	2105129	2105134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41143	NC_014643	CTT	2	6	2105179	2105184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41146	NC_014643	ACC	2	6	2105312	2105317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41147	NC_014643	GCT	2	6	2105332	2105337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41228	NC_014643	GCT	2	6	2109576	2109581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113559
41229	NC_014643	CT	3	6	2109611	2109616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41230	NC_014643	AG	3	6	2109630	2109635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41231	NC_014643	TAT	2	6	2109769	2109774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41232	NC_014643	GGTGT	2	10	2109822	2109831	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
41233	NC_014643	CAG	2	6	2109928	2109933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113560
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41236	NC_014643	TTC	2	6	2110004	2110009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113560
41237	NC_014643	GTG	2	6	2110010	2110015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113560
41238	NC_014643	CGC	2	6	2110074	2110079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113560
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41241	NC_014643	GC	3	6	2110231	2110236	0 %	0 %	50 %	50 %	311113560
41242	NC_014643	TGT	2	6	2110332	2110337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113560
41243	NC_014643	GGA	2	6	2110350	2110355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311113560
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41250	NC_014643	ACGT	2	8	2110577	2110584	25 %	25 %	25 %	25 %	311113560
41251	NC_014643	GT	3	6	2110732	2110737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41252	NC_014643	GAA	3	9	2110980	2110988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113561
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41317	NC_014643	GGGT	2	8	2114710	2114717	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41318	NC_014643	ACCC	2	8	2114736	2114743	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41319	NC_014643	TAC	2	6	2114775	2114780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41323	NC_014643	AT	3	6	2115156	2115161	50 %	50 %	0 %	0 %	311113565
41324	NC_014643	TCA	2	6	2115264	2115269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113565
41325	NC_014643	TGC	2	6	2115304	2115309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41327	NC_014643	AT	3	6	2115396	2115401	50 %	50 %	0 %	0 %	311113566
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41331	NC_014643	GAG	2	6	2115720	2115725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311113566
41332	NC_014643	A	7	7	2115736	2115742	100 %	0 %	0 %	0 %	311113566
41333	NC_014643	AT	3	6	2115769	2115774	50 %	50 %	0 %	0 %	311113566
41334	NC_014643	GCA	2	6	2115794	2115799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113566
41335	NC_014643	CAG	2	6	2115807	2115812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113566
41336	NC_014643	TTC	2	6	2115845	2115850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113566
41337	NC_014643	GTT	2	6	2115908	2115913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113566
41338	NC_014643	TACCT	2	10	2115958	2115967	20 %	40 %	0 %	40 %	311113566
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41340	NC_014643	TG	3	6	2116184	2116189	0 %	50 %	50 %	0 %	311113566
41341	NC_014643	AGA	2	6	2116223	2116228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113566
41342	NC_014643	CTG	2	6	2116287	2116292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113566
41343	NC_014643	CTG	2	6	2116309	2116314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113566
41344	NC_014643	AGT	2	6	2116332	2116337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113566
41345	NC_014643	ATGTG	2	10	2116436	2116445	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41346	NC_014643	TGT	2	6	2116608	2116613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41347	NC_014643	AAG	2	6	2116691	2116696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113567
41348	NC_014643	CAG	2	6	2116747	2116752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113567
41349	NC_014643	TCT	3	9	2116834	2116842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113567
41350	NC_014643	CTA	2	6	2116845	2116850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113567
41351	NC_014643	AT	3	6	2116860	2116865	50 %	50 %	0 %	0 %	311113567
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41476	NC_014643	CAG	2	6	2123317	2123322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113573
41477	NC_014643	GCG	2	6	2123336	2123341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113573
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41479	NC_014643	TGG	2	6	2123432	2123437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113573
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41481	NC_014643	CAT	2	6	2123457	2123462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113573
41482	NC_014643	TGG	2	6	2123467	2123472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113573
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41497	NC_014643	AC	3	6	2124836	2124841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41498	NC_014643	CT	3	6	2124866	2124871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41499	NC_014643	TGG	2	6	2124900	2124905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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