MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 48596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_014643	TGCT	2	8	1688212	1688219	0 %	50 %	25 %	25 %	311113204
33502	NC_014643	TGA	2	6	1688237	1688242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113204
33503	NC_014643	ACG	2	6	1688251	1688256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113204
33504	NC_014643	GTC	2	6	1688404	1688409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113204
33505	NC_014643	CTT	2	6	1688417	1688422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113204
33506	NC_014643	AAG	2	6	1688466	1688471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113204
33507	NC_014643	CT	4	8	1688485	1688492	0 %	50 %	0 %	50 %	311113204
33508	NC_014643	T	8	8	1688633	1688640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33509	NC_014643	AAAG	2	8	1688674	1688681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33510	NC_014643	TC	3	6	1688770	1688775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33511	NC_014643	TCT	2	6	1688786	1688791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33512	NC_014643	GA	4	8	1688804	1688811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33513	NC_014643	GAC	2	6	1688956	1688961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113205
33514	NC_014643	GTC	2	6	1688966	1688971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113205
33515	NC_014643	CGG	2	6	1689006	1689011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113205
33516	NC_014643	CAG	2	6	1689055	1689060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113205
33517	NC_014643	GCA	2	6	1689064	1689069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113205
33518	NC_014643	GGC	2	6	1689103	1689108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113205
33519	NC_014643	CTT	2	6	1689114	1689119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113205
33520	NC_014643	CAGG	2	8	1689139	1689146	25 %	0 %	50 %	25 %	311113205
33521	NC_014643	TGA	2	6	1689191	1689196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113205
33522	NC_014643	CT	3	6	1689198	1689203	0 %	50 %	0 %	50 %	311113205
33523	NC_014643	AAG	2	6	1689227	1689232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113205
33524	NC_014643	CGC	2	6	1689295	1689300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113205
33525	NC_014643	CGGTGC	2	12	1689339	1689350	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311113205
33526	NC_014643	A	6	6	1689429	1689434	100 %	0 %	0 %	0 %	311113205
33527	NC_014643	GCAAC	2	10	1689519	1689528	40 %	0 %	20 %	40 %	311113205
33528	NC_014643	GT	3	6	1689533	1689538	0 %	50 %	50 %	0 %	311113205
33529	NC_014643	ATA	2	6	1689569	1689574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113205
33530	NC_014643	GTAAC	2	10	1689611	1689620	40 %	20 %	20 %	20 %	311113205
33531	NC_014643	A	6	6	1689727	1689732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33532	NC_014643	CGTAGC	2	12	1689809	1689820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33533	NC_014643	CGT	2	6	1689864	1689869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113206
33534	NC_014643	GAA	2	6	1689874	1689879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113206
33535	NC_014643	ACT	2	6	1689995	1690000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113206
33536	NC_014643	GC	3	6	1690004	1690009	0 %	0 %	50 %	50 %	311113206
33537	NC_014643	GCA	2	6	1690020	1690025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113206
33538	NC_014643	GCT	2	6	1690093	1690098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113206
33539	NC_014643	ACG	2	6	1690145	1690150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113206
33540	NC_014643	CGT	2	6	1690192	1690197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113206
33541	NC_014643	GCC	2	6	1690262	1690267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113206
33542	NC_014643	GAC	2	6	1690318	1690323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113206
33543	NC_014643	GCT	2	6	1690410	1690415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113206
33544	NC_014643	AC	3	6	1690439	1690444	50 %	0 %	0 %	50 %	311113207
33545	NC_014643	AAG	2	6	1690462	1690467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113207
33546	NC_014643	CGC	2	6	1690524	1690529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113207
33547	NC_014643	GGCGTA	2	12	1690534	1690545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311113207
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33549	NC_014643	CAA	2	6	1690650	1690655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311113207
33550	NC_014643	A	6	6	1690654	1690659	100 %	0 %	0 %	0 %	311113207
33551	NC_014643	CTTG	2	8	1690777	1690784	0 %	50 %	25 %	25 %	311113207
33552	NC_014643	TGG	2	6	1690793	1690798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311113207
33553	NC_014643	TGA	2	6	1690928	1690933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113207
33554	NC_014643	AGA	2	6	1691024	1691029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113207
33555	NC_014643	CGG	2	6	1691153	1691158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113207
33556	NC_014643	CCTG	2	8	1691217	1691224	0 %	25 %	25 %	50 %	311113207
33557	NC_014643	CGG	2	6	1691229	1691234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113207
33558	NC_014643	ATG	2	6	1691236	1691241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113207
33559	NC_014643	CT	3	6	1691306	1691311	0 %	50 %	0 %	50 %	311113207
33560	NC_014643	CGT	2	6	1691370	1691375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33561	NC_014643	TGA	2	6	1691386	1691391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33562	NC_014643	GCG	2	6	1691528	1691533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113208
33563	NC_014643	CAG	2	6	1691539	1691544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113208
33564	NC_014643	GTT	2	6	1691581	1691586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113208
33565	NC_014643	CGG	2	6	1691601	1691606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113208
33566	NC_014643	AGA	2	6	1691646	1691651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113208
33567	NC_014643	CGC	2	6	1691779	1691784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113208
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33569	NC_014643	CTCAA	2	10	1691852	1691861	40 %	20 %	0 %	40 %	311113208
33570	NC_014643	GAA	2	6	1691866	1691871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113208
33571	NC_014643	GAA	2	6	1691935	1691940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311113208
33572	NC_014643	GCA	2	6	1692038	1692043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33573	NC_014643	TTACT	2	10	1692148	1692157	20 %	60 %	0 %	20 %	311113209
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33576	NC_014643	CAG	2	6	1692303	1692308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113209
33577	NC_014643	TTG	2	6	1692331	1692336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113209
33578	NC_014643	CCA	2	6	1692337	1692342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113209
33579	NC_014643	GCC	2	6	1692390	1692395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113209
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33583	NC_014643	CCG	2	6	1692987	1692992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113209
33584	NC_014643	CGCAT	2	10	1693030	1693039	20 %	20 %	20 %	40 %	311113209
33585	NC_014643	CTG	2	6	1693117	1693122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113209
33586	NC_014643	GAT	2	6	1693127	1693132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113209
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33588	NC_014643	CGC	2	6	1693271	1693276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113209
33589	NC_014643	TTG	2	6	1693507	1693512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33590	NC_014643	TCA	2	6	1693553	1693558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113210
33591	NC_014643	AT	3	6	1693647	1693652	50 %	50 %	0 %	0 %	311113210
33592	NC_014643	T	6	6	1693673	1693678	0 %	100 %	0 %	0 %	311113210
33593	NC_014643	CCG	2	6	1693683	1693688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113210
33594	NC_014643	AT	3	6	1693731	1693736	50 %	50 %	0 %	0 %	311113210
33595	NC_014643	GAT	2	6	1693740	1693745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113210
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33597	NC_014643	GGGC	2	8	1694007	1694014	0 %	0 %	75 %	25 %	311113210
33598	NC_014643	TAA	2	6	1694088	1694093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113210
33599	NC_014643	TCT	2	6	1694266	1694271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113210
33600	NC_014643	CAGG	2	8	1694281	1694288	25 %	0 %	50 %	25 %	311113210
33601	NC_014643	AAT	2	6	1694290	1694295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311113210
33602	NC_014643	AGC	3	9	1694330	1694338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113210
33603	NC_014643	ACG	2	6	1694405	1694410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311113210
33604	NC_014643	GAT	2	6	1694424	1694429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311113210
33605	NC_014643	CGG	2	6	1694433	1694438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311113210
33606	NC_014643	TCTCT	2	10	1694577	1694586	0 %	60 %	0 %	40 %	311113210
33607	NC_014643	CTT	2	6	1694752	1694757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113210
33608	NC_014643	CCG	2	6	1694826	1694831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113210
33609	NC_014643	TGT	2	6	1694880	1694885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113210
33610	NC_014643	ATT	2	6	1694917	1694922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311113210
33611	NC_014643	GCC	2	6	1694923	1694928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113210
33612	NC_014643	TTA	2	6	1694933	1694938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311113210
33613	NC_014643	TCATC	2	10	1695040	1695049	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33614	NC_014643	GC	3	6	1695091	1695096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33615	NC_014643	GCG	2	6	1695121	1695126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33616	NC_014643	GGA	2	6	1695156	1695161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33617	NC_014643	CGC	2	6	1695218	1695223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113211
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33972	NC_014643	GTC	2	6	1714115	1714120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113228
33973	NC_014643	TA	3	6	1714124	1714129	50 %	50 %	0 %	0 %	311113228
33974	NC_014643	TCG	2	6	1714152	1714157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113228
33975	NC_014643	TTC	2	6	1714169	1714174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113228
33976	NC_014643	TTG	3	9	1714194	1714202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311113228
33977	NC_014643	GT	3	6	1714213	1714218	0 %	50 %	50 %	0 %	311113228
33978	NC_014643	GGAT	2	8	1714300	1714307	25 %	25 %	50 %	0 %	311113228
33979	NC_014643	GCGG	2	8	1714320	1714327	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33980	NC_014643	TGC	2	6	1714353	1714358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33981	NC_014643	AGA	2	6	1714427	1714432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33982	NC_014643	ATC	2	6	1714543	1714548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311113229
33983	NC_014643	TCG	2	6	1714611	1714616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113229
33984	NC_014643	CTGA	2	8	1714627	1714634	25 %	25 %	25 %	25 %	311113229
33985	NC_014643	CAC	2	6	1714660	1714665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311113229
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33988	NC_014643	GTC	3	9	1714694	1714702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113229
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33991	NC_014643	CGG	2	6	1714832	1714837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33992	NC_014643	ACA	2	6	1714964	1714969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33996	NC_014643	GCT	2	6	1715203	1715208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311113230
33997	NC_014643	CTT	2	6	1715251	1715256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311113230
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33999	NC_014643	GTTC	2	8	1715310	1715317	0 %	50 %	25 %	25 %	311113230
34000	NC_014643	CCG	2	6	1715320	1715325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311113230

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