MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 48596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_014643	GAGC	2	8	829282	829289	25 %	0 %	50 %	25 %	311112451
16503	NC_014643	GAGC	2	8	829404	829411	25 %	0 %	50 %	25 %	311112451
16504	NC_014643	ACG	2	6	829430	829435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112451
16505	NC_014643	CT	3	6	829443	829448	0 %	50 %	0 %	50 %	311112451
16506	NC_014643	CTG	2	6	829477	829482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112451
16507	NC_014643	ACA	2	6	829533	829538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311112451
16508	NC_014643	AG	3	6	829545	829550	50 %	0 %	50 %	0 %	311112451
16509	NC_014643	CGG	2	6	829551	829556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112451
16510	NC_014643	GCA	2	6	829584	829589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112452
16511	NC_014643	TGC	2	6	829671	829676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112452
16512	NC_014643	TCG	2	6	829713	829718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112452
16513	NC_014643	TAA	2	6	829879	829884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311112452
16514	NC_014643	CCA	2	6	829887	829892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112452
16515	NC_014643	TCC	2	6	829962	829967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311112452
16516	NC_014643	ACG	2	6	829973	829978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112452
16517	NC_014643	CGAC	2	8	829986	829993	25 %	0 %	25 %	50 %	311112452
16518	NC_014643	TGA	2	6	830098	830103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112452
16519	NC_014643	GAG	2	6	830114	830119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311112452
16520	NC_014643	CCA	2	6	830219	830224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112453
16521	NC_014643	ATG	2	6	830386	830391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112453
16522	NC_014643	GCC	2	6	830436	830441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112453
16523	NC_014643	CTTC	2	8	830537	830544	0 %	50 %	0 %	50 %	311112453
16524	NC_014643	TCT	2	6	830597	830602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112453
16525	NC_014643	CAG	2	6	830754	830759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112454
16526	NC_014643	GGATC	2	10	830814	830823	20 %	20 %	40 %	20 %	311112454
16527	NC_014643	GCG	2	6	830853	830858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112454
16528	NC_014643	ATC	3	9	830882	830890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112454
16529	NC_014643	GC	3	6	830898	830903	0 %	0 %	50 %	50 %	311112454
16530	NC_014643	CGA	2	6	830929	830934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112454
16531	NC_014643	GCAA	2	8	830995	831002	50 %	0 %	25 %	25 %	311112454
16532	NC_014643	GCG	2	6	831012	831017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112454
16533	NC_014643	G	6	6	831153	831158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16534	NC_014643	GGC	2	6	831274	831279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112455
16535	NC_014643	GCG	2	6	831280	831285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112455
16536	NC_014643	CGC	2	6	831328	831333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112455
16537	NC_014643	CAG	2	6	831364	831369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112455
16538	NC_014643	ACC	2	6	831370	831375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112455
16539	NC_014643	AAC	2	6	831415	831420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311112455
16540	NC_014643	GAA	2	6	831589	831594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112455
16541	NC_014643	CAA	2	6	831609	831614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311112455
16542	NC_014643	CAG	2	6	831727	831732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112455
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16545	NC_014643	CAG	2	6	831853	831858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112455
16546	NC_014643	GCA	2	6	831882	831887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112455
16547	NC_014643	CGC	2	6	831912	831917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112455
16548	NC_014643	AATA	2	8	831973	831980	75 %	25 %	0 %	0 %	311112455
16549	NC_014643	CAC	2	6	832087	832092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112455
16550	NC_014643	ATC	3	9	832166	832174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112455
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16552	NC_014643	CGT	2	6	832233	832238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112455
16553	NC_014643	CGCAG	2	10	832253	832262	20 %	0 %	40 %	40 %	311112455
16554	NC_014643	CG	4	8	832372	832379	0 %	0 %	50 %	50 %	311112455
16555	NC_014643	CCG	2	6	832383	832388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112455
16556	NC_014643	CAC	2	6	832423	832428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112455
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16558	NC_014643	GGGTT	2	10	832588	832597	0 %	40 %	60 %	0 %	311112455
16559	NC_014643	CGC	2	6	832611	832616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112455
16560	NC_014643	TGC	2	6	832638	832643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112455
16561	NC_014643	CAG	2	6	832663	832668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112455
16562	NC_014643	CGTG	2	8	832680	832687	0 %	25 %	50 %	25 %	311112455
16563	NC_014643	TTG	2	6	832742	832747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311112455
16564	NC_014643	CTT	2	6	832819	832824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16565	NC_014643	GGT	2	6	832837	832842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_014643	ACG	2	6	832908	832913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16567	NC_014643	GA	3	6	832924	832929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16568	NC_014643	TTCT	2	8	832983	832990	0 %	75 %	0 %	25 %	311112456
16569	NC_014643	TGG	2	6	832991	832996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112456
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16571	NC_014643	GC	3	6	833093	833098	0 %	0 %	50 %	50 %	311112456
16572	NC_014643	TGA	2	6	833111	833116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112456
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16577	NC_014643	GCA	2	6	833644	833649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112457
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16580	NC_014643	CCG	2	6	834000	834005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112457
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16587	NC_014643	CTG	2	6	834191	834196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112457
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16591	NC_014643	CG	3	6	834385	834390	0 %	0 %	50 %	50 %	311112457
16592	NC_014643	GCT	2	6	834459	834464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112457
16593	NC_014643	TGGCGA	2	12	834562	834573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311112457
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16595	NC_014643	CAAA	2	8	834632	834639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16596	NC_014643	TGTTT	2	10	834645	834654	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16597	NC_014643	ACTCT	2	10	834668	834677	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16598	NC_014643	AAT	2	6	834701	834706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_014643	CTC	2	6	834764	834769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16602	NC_014643	CGC	2	6	835000	835005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112458
16603	NC_014643	TGC	2	6	835095	835100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112458
16604	NC_014643	CCA	2	6	835143	835148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112458
16605	NC_014643	CGA	2	6	835246	835251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112458
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16607	NC_014643	CTG	2	6	835373	835378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112458
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16609	NC_014643	CTC	2	6	835478	835483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16610	NC_014643	CGG	2	6	835484	835489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16611	NC_014643	CGCA	2	8	835492	835499	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16612	NC_014643	GCGG	2	8	835547	835554	0 %	0 %	75 %	25 %	311112459
16613	NC_014643	CG	3	6	835665	835670	0 %	0 %	50 %	50 %	311112459
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16743	NC_014643	TAA	2	6	842061	842066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311112467
16744	NC_014643	AGA	2	6	842129	842134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112467
16745	NC_014643	GCGA	2	8	842306	842313	25 %	0 %	50 %	25 %	311112467
16746	NC_014643	CCG	2	6	842379	842384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112467
16747	NC_014643	AACGG	2	10	842412	842421	40 %	0 %	40 %	20 %	311112467
16748	NC_014643	CGT	2	6	842437	842442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112467
16749	NC_014643	TCG	2	6	842516	842521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112467
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16751	NC_014643	GAT	2	6	842588	842593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112467
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16753	NC_014643	ACG	2	6	842633	842638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16755	NC_014643	TGCC	2	8	842796	842803	0 %	25 %	25 %	50 %	311112468
16756	NC_014643	GCT	2	6	842811	842816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112468
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16797	NC_014643	A	6	6	844708	844713	100 %	0 %	0 %	0 %	311112471
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16837	NC_014643	TA	3	6	846359	846364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16987	NC_014643	TAC	2	6	853292	853297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112479
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16989	NC_014643	AGC	2	6	853333	853338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112479
16990	NC_014643	CGG	2	6	853390	853395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112479
16991	NC_014643	TAT	2	6	853453	853458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311112479
16992	NC_014643	AGC	2	6	853550	853555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112479
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16999	NC_014643	CT	3	6	853944	853949	0 %	50 %	0 %	50 %	311112479
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