MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 48596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014643	TCCG	2	8	566595	566602	0 %	25 %	25 %	50 %	311112183
11002	NC_014643	CCT	2	6	566887	566892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311112183
11003	NC_014643	TGG	2	6	566896	566901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112183
11004	NC_014643	CTA	2	6	566928	566933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112183
11005	NC_014643	ACC	2	6	567023	567028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112183
11006	NC_014643	GTG	2	6	567084	567089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112183
11007	NC_014643	CGGCTA	2	12	567126	567137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311112183
11008	NC_014643	CTA	2	6	567156	567161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112183
11009	NC_014643	AAG	2	6	567222	567227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_014643	TG	3	6	567279	567284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_014643	CAT	2	6	567306	567311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_014643	AC	3	6	567332	567337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11013	NC_014643	TGA	2	6	567358	567363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_014643	TCTGC	2	10	567387	567396	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11015	NC_014643	ATG	2	6	567420	567425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_014643	GCT	2	6	567435	567440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_014643	TAG	2	6	567449	567454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_014643	TA	3	6	567575	567580	50 %	50 %	0 %	0 %	311112184
11019	NC_014643	CATG	2	8	567729	567736	25 %	25 %	25 %	25 %	311112184
11020	NC_014643	TG	3	6	567768	567773	0 %	50 %	50 %	0 %	311112184
11021	NC_014643	CAT	2	6	567834	567839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112184
11022	NC_014643	TAT	2	6	567865	567870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311112184
11023	NC_014643	GTG	2	6	567878	567883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112184
11024	NC_014643	CTT	2	6	567981	567986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112184
11025	NC_014643	GGC	2	6	568036	568041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112184
11026	NC_014643	TGT	2	6	568057	568062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311112184
11027	NC_014643	GGCA	3	12	568083	568094	25 %	0 %	50 %	25 %	311112184
11028	NC_014643	T	6	6	568142	568147	0 %	100 %	0 %	0 %	311112184
11029	NC_014643	ATGT	2	8	568169	568176	25 %	50 %	25 %	0 %	311112184
11030	NC_014643	GAA	2	6	568180	568185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112184
11031	NC_014643	CTG	2	6	568216	568221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112184
11032	NC_014643	TAT	2	6	568262	568267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311112184
11033	NC_014643	GAT	2	6	568408	568413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112184
11034	NC_014643	GCG	2	6	568433	568438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112184
11035	NC_014643	TCG	2	6	568518	568523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112184
11036	NC_014643	GGC	2	6	568609	568614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112184
11037	NC_014643	TTGC	2	8	568616	568623	0 %	50 %	25 %	25 %	311112184
11038	NC_014643	CAT	2	6	568627	568632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112184
11039	NC_014643	AAG	2	6	568714	568719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112184
11040	NC_014643	CCCT	2	8	568783	568790	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11041	NC_014643	ATT	2	6	568802	568807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_014643	AAT	2	6	568810	568815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_014643	CGC	2	6	568840	568845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_014643	GCA	2	6	569035	569040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112185
11045	NC_014643	GCAA	2	8	569044	569051	50 %	0 %	25 %	25 %	311112185
11046	NC_014643	CCGC	2	8	569090	569097	0 %	0 %	25 %	75 %	311112185
11047	NC_014643	CGT	2	6	569114	569119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112185
11048	NC_014643	GC	3	6	569166	569171	0 %	0 %	50 %	50 %	311112185
11049	NC_014643	GAGCA	2	10	569187	569196	40 %	0 %	40 %	20 %	311112185
11050	NC_014643	GCG	2	6	569276	569281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112185
11051	NC_014643	CCCGG	2	10	569376	569385	0 %	0 %	40 %	60 %	311112185
11052	NC_014643	AGC	2	6	569395	569400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112185
11053	NC_014643	TCGTAT	2	12	569410	569421	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	311112185
11054	NC_014643	CGC	2	6	569426	569431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112185
11055	NC_014643	CAAT	2	8	569446	569453	50 %	25 %	0 %	25 %	311112185
11056	NC_014643	TG	3	6	569458	569463	0 %	50 %	50 %	0 %	311112185
11057	NC_014643	GAA	2	6	569520	569525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112185
11058	NC_014643	TGC	2	6	569692	569697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112185
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11061	NC_014643	ACC	2	6	569872	569877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112185
11062	NC_014643	GA	3	6	569928	569933	50 %	0 %	50 %	0 %	311112185
11063	NC_014643	ATG	2	6	569968	569973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112185
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11065	NC_014643	GTT	2	6	570047	570052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311112186
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11067	NC_014643	CG	3	6	570148	570153	0 %	0 %	50 %	50 %	311112186
11068	NC_014643	GGT	2	6	570193	570198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112186
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11070	NC_014643	CTG	2	6	570362	570367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112186
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11072	NC_014643	GTA	2	6	570494	570499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112186
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11079	NC_014643	GAT	2	6	570765	570770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112186
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11085	NC_014643	GTA	2	6	570993	570998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112186
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11088	NC_014643	TATG	2	8	571069	571076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_014643	CA	3	6	571119	571124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11090	NC_014643	GCC	2	6	571235	571240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11091	NC_014643	GC	3	6	571340	571345	0 %	0 %	50 %	50 %	311112187
11092	NC_014643	CTGC	2	8	571376	571383	0 %	25 %	25 %	50 %	311112187
11093	NC_014643	GC	3	6	571495	571500	0 %	0 %	50 %	50 %	311112187
11094	NC_014643	CGTTG	2	10	571512	571521	0 %	40 %	40 %	20 %	311112187
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11099	NC_014643	GCAC	2	8	571753	571760	25 %	0 %	25 %	50 %	311112187
11100	NC_014643	TAG	2	6	571783	571788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112187
11101	NC_014643	T	6	6	571800	571805	0 %	100 %	0 %	0 %	311112187
11102	NC_014643	GC	3	6	571818	571823	0 %	0 %	50 %	50 %	311112187
11103	NC_014643	ATC	2	6	571890	571895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112187
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11105	NC_014643	TC	3	6	571911	571916	0 %	50 %	0 %	50 %	311112188
11106	NC_014643	TGCGA	2	10	571960	571969	20 %	20 %	40 %	20 %	311112188
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11112	NC_014643	CGA	2	6	572328	572333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112189
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11115	NC_014643	CCA	2	6	572499	572504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11116	NC_014643	GC	3	6	572513	572518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11117	NC_014643	CT	3	6	572534	572539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11118	NC_014643	TTG	2	6	572585	572590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_014643	TTC	2	6	572632	572637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_014643	CG	3	6	572737	572742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11122	NC_014643	GCTG	2	8	572812	572819	0 %	25 %	50 %	25 %	311112190
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11228	NC_014643	T	6	6	578656	578661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11242	NC_014643	GACCTT	2	12	579407	579418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	311112194
11243	NC_014643	GCA	2	6	579498	579503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112194
11244	NC_014643	CAT	2	6	579544	579549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112194
11245	NC_014643	CAG	2	6	579598	579603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112194
11246	NC_014643	CTT	2	6	579652	579657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112194
11247	NC_014643	CATT	2	8	579660	579667	25 %	50 %	0 %	25 %	311112194
11248	NC_014643	GAAA	2	8	579671	579678	75 %	0 %	25 %	0 %	311112194
11249	NC_014643	GGGAA	2	10	579743	579752	40 %	0 %	60 %	0 %	311112194
11250	NC_014643	TGC	2	6	579764	579769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112194
11251	NC_014643	GTA	2	6	579777	579782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112194
11252	NC_014643	T	7	7	579835	579841	0 %	100 %	0 %	0 %	311112194
11253	NC_014643	TA	3	6	579855	579860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11254	NC_014643	T	6	6	579910	579915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11255	NC_014643	ATT	2	6	579924	579929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11256	NC_014643	ATC	2	6	579976	579981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11257	NC_014643	TTTC	2	8	580020	580027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11258	NC_014643	A	8	8	580028	580035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11259	NC_014643	T	6	6	580071	580076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11260	NC_014643	AGC	2	6	580083	580088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11261	NC_014643	TTC	2	6	580128	580133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112195
11262	NC_014643	CG	3	6	580172	580177	0 %	0 %	50 %	50 %	311112195
11263	NC_014643	CGCA	2	8	580224	580231	25 %	0 %	25 %	50 %	311112195
11264	NC_014643	GCT	2	6	580254	580259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112195
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11268	NC_014643	CTG	3	9	580314	580322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112195
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11283	NC_014643	CCTG	2	8	581131	581138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11284	NC_014643	TAT	2	6	581188	581193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11285	NC_014643	CAT	2	6	581219	581224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112196
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11290	NC_014643	TGG	2	6	581551	581556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112196
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11295	NC_014643	CCT	2	6	581906	581911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11306	NC_014643	CTC	2	6	582999	583004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11307	NC_014643	AT	4	8	583005	583012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11355	NC_014643	ACCA	2	8	585274	585281	50 %	0 %	0 %	50 %	311112199
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11363	NC_014643	CAG	3	9	585790	585798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112199
11364	NC_014643	CTT	2	6	585922	585927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112199
11365	NC_014643	GCG	2	6	586082	586087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112199
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11368	NC_014643	CTA	2	6	586195	586200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11484	NC_014643	GAA	2	6	592397	592402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112205
11485	NC_014643	ATC	2	6	592403	592408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112205
11486	NC_014643	CG	3	6	592454	592459	0 %	0 %	50 %	50 %	311112205
11487	NC_014643	ACG	2	6	592476	592481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112205
11488	NC_014643	TGC	2	6	592545	592550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112205
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11491	NC_014643	GGC	2	6	592591	592596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112205
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11500	NC_014643	CGG	2	6	592996	593001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112205

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