MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 91706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014307	TCG	2	6	532189	532194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702865
14002	NC_014307	CG	5	10	532193	532202	0 %	0 %	50 %	50 %	300702865
14003	NC_014307	ACG	2	6	532255	532260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702865
14004	NC_014307	CCG	2	6	532292	532297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702865
14005	NC_014307	CCG	2	6	532307	532312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702865
14006	NC_014307	CG	3	6	532311	532316	0 %	0 %	50 %	50 %	300702865
14007	NC_014307	CCA	2	6	532319	532324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702865
14008	NC_014307	GCT	2	6	532329	532334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702865
14009	NC_014307	GC	4	8	532343	532350	0 %	0 %	50 %	50 %	300702865
14010	NC_014307	GCC	2	6	532360	532365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702865
14011	NC_014307	TTC	3	9	532368	532376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702865
14012	NC_014307	TCC	2	6	532378	532383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702865
14013	NC_014307	TC	3	6	532407	532412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14014	NC_014307	CGC	2	6	532520	532525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14015	NC_014307	GCC	2	6	532538	532543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14016	NC_014307	GCT	2	6	532546	532551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702866
14017	NC_014307	GCC	2	6	532571	532576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14018	NC_014307	CGT	2	6	532620	532625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702866
14019	NC_014307	GTG	2	6	532646	532651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702866
14020	NC_014307	GCC	2	6	532658	532663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14021	NC_014307	CGA	2	6	532692	532697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702866
14022	NC_014307	GAT	2	6	532784	532789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702866
14023	NC_014307	CCG	2	6	532795	532800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14024	NC_014307	GC	3	6	532824	532829	0 %	0 %	50 %	50 %	300702866
14025	NC_014307	ACG	2	6	532884	532889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702866
14026	NC_014307	CGT	2	6	532932	532937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702866
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14028	NC_014307	CGCC	2	8	532999	533006	0 %	0 %	25 %	75 %	300702866
14029	NC_014307	CCG	2	6	533013	533018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14030	NC_014307	CCAC	2	8	533031	533038	25 %	0 %	0 %	75 %	300702866
14031	NC_014307	GCC	2	6	533135	533140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14032	NC_014307	CG	3	6	533146	533151	0 %	0 %	50 %	50 %	300702866
14033	NC_014307	CG	3	6	533180	533185	0 %	0 %	50 %	50 %	300702866
14034	NC_014307	CAC	2	6	533215	533220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702866
14035	NC_014307	CGC	2	6	533221	533226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14036	NC_014307	CGC	2	6	533242	533247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
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14039	NC_014307	GC	3	6	533375	533380	0 %	0 %	50 %	50 %	300702866
14040	NC_014307	GCA	2	6	533382	533387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702866
14041	NC_014307	CGC	2	6	533398	533403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14042	NC_014307	TCT	2	6	533469	533474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702866
14043	NC_014307	CGGGC	2	10	533557	533566	0 %	0 %	60 %	40 %	300702866
14044	NC_014307	TTGC	2	8	533567	533574	0 %	50 %	25 %	25 %	300702866
14045	NC_014307	CCG	2	6	533590	533595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702866
14046	NC_014307	TGC	2	6	533620	533625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702866
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14048	NC_014307	CGCC	2	8	533744	533751	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14049	NC_014307	CAA	2	6	533825	533830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_014307	GCC	2	6	533835	533840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14051	NC_014307	CGT	2	6	533919	533924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_014307	ATGAAA	2	12	533975	533986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300702867
14053	NC_014307	GCT	2	6	533996	534001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702867
14054	NC_014307	GCC	2	6	534014	534019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702867
14055	NC_014307	GCG	2	6	534099	534104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702867
14056	NC_014307	CG	3	6	534120	534125	0 %	0 %	50 %	50 %	300702867
14057	NC_014307	TGCAA	2	10	534127	534136	40 %	20 %	20 %	20 %	300702867
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14061	NC_014307	CGG	2	6	534460	534465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702867
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14067	NC_014307	CGTT	2	8	534784	534791	0 %	50 %	25 %	25 %	300702867
14068	NC_014307	CTGG	2	8	534802	534809	0 %	25 %	50 %	25 %	300702867
14069	NC_014307	CTGACG	2	12	534836	534847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300702867
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14077	NC_014307	CGAA	2	8	535148	535155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14078	NC_014307	GTGCT	2	10	535199	535208	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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14080	NC_014307	CGGCT	2	10	535309	535318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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14088	NC_014307	GCC	2	6	535518	535523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14089	NC_014307	CTG	2	6	535555	535560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702868
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14092	NC_014307	GGC	2	6	535604	535609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702868
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14094	NC_014307	GGCC	2	8	535773	535780	0 %	0 %	50 %	50 %	300702868
14095	NC_014307	CGG	2	6	535785	535790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702868
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14099	NC_014307	GCC	2	6	535981	535986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702868
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14102	NC_014307	ACGT	2	8	536206	536213	25 %	25 %	25 %	25 %	300702868
14103	NC_014307	GGC	2	6	536220	536225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702868
14104	NC_014307	GGTC	2	8	536274	536281	0 %	25 %	50 %	25 %	300702868
14105	NC_014307	ACC	2	6	536297	536302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702868
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14109	NC_014307	GCT	2	6	536439	536444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702868
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14121	NC_014307	CCA	2	6	537195	537200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702869
14122	NC_014307	CGG	2	6	537259	537264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702869
14123	NC_014307	CGG	2	6	537301	537306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702869
14124	NC_014307	TGC	2	6	537325	537330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702869
14125	NC_014307	GCG	2	6	537360	537365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702869
14126	NC_014307	TCA	2	6	537427	537432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702869
14127	NC_014307	GCG	3	9	537444	537452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702869
14128	NC_014307	GC	4	8	537454	537461	0 %	0 %	50 %	50 %	300702869
14129	NC_014307	ACC	2	6	537468	537473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702869
14130	NC_014307	GCA	3	9	537581	537589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702870
14131	NC_014307	CGGC	2	8	537608	537615	0 %	0 %	50 %	50 %	300702870
14132	NC_014307	CGCA	2	8	537645	537652	25 %	0 %	25 %	50 %	300702870
14133	NC_014307	CGCC	2	8	537731	537738	0 %	0 %	25 %	75 %	300702870
14134	NC_014307	TTC	2	6	537739	537744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702870
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14136	NC_014307	TGAA	2	8	537790	537797	50 %	25 %	25 %	0 %	300702870
14137	NC_014307	GC	3	6	537828	537833	0 %	0 %	50 %	50 %	300702870
14138	NC_014307	CGA	2	6	537869	537874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702870
14139	NC_014307	CGC	2	6	537885	537890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702870
14140	NC_014307	GAT	2	6	537894	537899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702870
14141	NC_014307	ACCG	2	8	537903	537910	25 %	0 %	25 %	50 %	300702870
14142	NC_014307	GCT	2	6	538009	538014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14143	NC_014307	AAGA	2	8	538050	538057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_014307	CTG	2	6	538253	538258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702871
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14153	NC_014307	GCT	2	6	538611	538616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702871
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14157	NC_014307	C	7	7	538756	538762	0 %	0 %	0 %	100 %	300702871
14158	NC_014307	TGA	2	6	538788	538793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702871
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14162	NC_014307	TGA	2	6	539015	539020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702872
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14205	NC_014307	CTGGC	2	10	540957	540966	0 %	20 %	40 %	40 %	300702873
14206	NC_014307	GCC	2	6	541113	541118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14207	NC_014307	ATG	2	6	541148	541153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702874
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14210	NC_014307	TGA	2	6	541275	541280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702874
14211	NC_014307	CAT	2	6	541339	541344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702874
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14215	NC_014307	GC	3	6	541405	541410	0 %	0 %	50 %	50 %	300702874
14216	NC_014307	CGCC	2	8	541414	541421	0 %	0 %	25 %	75 %	300702874
14217	NC_014307	CACG	2	8	541453	541460	25 %	0 %	25 %	50 %	300702874
14218	NC_014307	GC	4	8	541514	541521	0 %	0 %	50 %	50 %	300702874
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14221	NC_014307	GAA	2	6	541660	541665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702874
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14225	NC_014307	CGG	2	6	541790	541795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14226	NC_014307	TCA	2	6	541815	541820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702875
14227	NC_014307	TCG	2	6	541908	541913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702875
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14230	NC_014307	ACG	2	6	541950	541955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702875
14231	NC_014307	CG	3	6	542026	542031	0 %	0 %	50 %	50 %	300702875
14232	NC_014307	CAA	2	6	542068	542073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702875
14233	NC_014307	CG	4	8	542089	542096	0 %	0 %	50 %	50 %	300702875
14234	NC_014307	CGC	2	6	542136	542141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702875
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14237	NC_014307	GGC	2	6	542240	542245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702875
14238	NC_014307	GAC	2	6	542249	542254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702875
14239	NC_014307	GTC	2	6	542306	542311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702875
14240	NC_014307	GGCT	2	8	542317	542324	0 %	25 %	50 %	25 %	300702875
14241	NC_014307	TCA	2	6	542358	542363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14242	NC_014307	ATC	2	6	542384	542389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14243	NC_014307	A	6	6	542486	542491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_014307	GGC	2	6	542718	542723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702876
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14246	NC_014307	GAT	2	6	542795	542800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702876
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14261	NC_014307	GCA	2	6	543583	543588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702877
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14264	NC_014307	TCG	2	6	543666	543671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702877
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14281	NC_014307	TGC	2	6	544393	544398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702877
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14283	NC_014307	GAA	2	6	544579	544584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14329	NC_014307	GCG	2	6	546867	546872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14330	NC_014307	AAG	2	6	547017	547022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14331	NC_014307	CG	3	6	547025	547030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14332	NC_014307	GTC	2	6	547051	547056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14335	NC_014307	G	7	7	547198	547204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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14338	NC_014307	TGGC	2	8	547401	547408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14340	NC_014307	GGC	2	6	547512	547517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702881
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14343	NC_014307	GCGT	2	8	547581	547588	0 %	25 %	50 %	25 %	300702881
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14350	NC_014307	GGC	2	6	547951	547956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702881
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14359	NC_014307	CCA	2	6	548253	548258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702881
14360	NC_014307	GCT	2	6	548269	548274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702881
14361	NC_014307	GC	3	6	548375	548380	0 %	0 %	50 %	50 %	300702881
14362	NC_014307	CAT	2	6	548446	548451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702881
14363	NC_014307	CGGT	2	8	548699	548706	0 %	25 %	50 %	25 %	300702881
14364	NC_014307	AGC	2	6	548884	548889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702882
14365	NC_014307	GTA	3	9	548895	548903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702882
14366	NC_014307	CGA	2	6	548945	548950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702882
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14370	NC_014307	GCGGGC	2	12	549038	549049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702882
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14372	NC_014307	GGT	2	6	549114	549119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702882
14373	NC_014307	GC	3	6	549168	549173	0 %	0 %	50 %	50 %	300702882
14374	NC_014307	GGC	2	6	549183	549188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702882
14375	NC_014307	GTA	2	6	549222	549227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702882
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14381	NC_014307	GGT	2	6	549447	549452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702882
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14390	NC_014307	CAC	2	6	549717	549722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702882
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14418	NC_014307	CG	3	6	551012	551017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14419	NC_014307	TCA	2	6	551040	551045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14420	NC_014307	CGTGC	2	10	551124	551133	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14421	NC_014307	GCA	2	6	551225	551230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14422	NC_014307	TGG	2	6	551231	551236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14423	NC_014307	C	6	6	551252	551257	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14424	NC_014307	GAG	2	6	551305	551310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14425	NC_014307	CTT	2	6	551330	551335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702883
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14463	NC_014307	CCGA	2	8	553000	553007	25 %	0 %	25 %	50 %	300702883
14464	NC_014307	GC	3	6	553054	553059	0 %	0 %	50 %	50 %	300702883
14465	NC_014307	ACG	2	6	553064	553069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702883
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14467	NC_014307	CG	3	6	553118	553123	0 %	0 %	50 %	50 %	300702883
14468	NC_014307	ACG	2	6	553124	553129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702883
14469	NC_014307	CGG	2	6	553146	553151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702883
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14472	NC_014307	GC	3	6	553235	553240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14473	NC_014307	T	6	6	553251	553256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14474	NC_014307	GCG	2	6	553257	553262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14475	NC_014307	CGT	2	6	553337	553342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702884
14476	NC_014307	AGC	2	6	553343	553348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702884
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14478	NC_014307	AGA	2	6	553418	553423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702884
14479	NC_014307	GC	3	6	553472	553477	0 %	0 %	50 %	50 %	300702884
14480	NC_014307	GCA	2	6	553526	553531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702884
14481	NC_014307	TCCA	2	8	553552	553559	25 %	25 %	0 %	50 %	300702884
14482	NC_014307	TGGCG	2	10	553573	553582	0 %	20 %	60 %	20 %	300702884
14483	NC_014307	CGT	2	6	553616	553621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702884
14484	NC_014307	GGC	2	6	553656	553661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702884
14485	NC_014307	CGGA	2	8	553751	553758	25 %	0 %	50 %	25 %	300702884
14486	NC_014307	TGG	2	6	553789	553794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702884
14487	NC_014307	TGC	2	6	553826	553831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702884
14488	NC_014307	GGC	2	6	553862	553867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702884
14489	NC_014307	CGGT	2	8	553897	553904	0 %	25 %	50 %	25 %	300702884
14490	NC_014307	GGTTG	2	10	553911	553920	0 %	40 %	60 %	0 %	300702884
14491	NC_014307	CCACGC	2	12	553973	553984	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	300702884
14492	NC_014307	CGG	2	6	554012	554017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702884
14493	NC_014307	GCC	2	6	554022	554027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702884
14494	NC_014307	GGC	2	6	554063	554068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702884
14495	NC_014307	CTGGCG	2	12	554136	554147	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300702884
14496	NC_014307	GCG	2	6	554156	554161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702884
14497	NC_014307	GGTC	2	8	554189	554196	0 %	25 %	50 %	25 %	300702884
14498	NC_014307	CGA	2	6	554226	554231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702884
14499	NC_014307	CAG	2	6	554289	554294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702884
14500	NC_014307	GCCTGC	2	12	554326	554337	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300702884

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