MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 91706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014307	CCT	2	6	417362	417367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702754
11002	NC_014307	ACC	2	6	417371	417376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702754
11003	NC_014307	GTG	2	6	417409	417414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702754
11004	NC_014307	TTGA	2	8	417436	417443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_014307	TAGTG	2	10	417480	417489	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_014307	CGTC	2	8	417610	417617	0 %	25 %	25 %	50 %	300702755
11007	NC_014307	CAC	2	6	417644	417649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702755
11008	NC_014307	CCG	2	6	417659	417664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702755
11009	NC_014307	CG	3	6	417698	417703	0 %	0 %	50 %	50 %	300702755
11010	NC_014307	CGG	2	6	417710	417715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702755
11011	NC_014307	GTC	2	6	417801	417806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702755
11012	NC_014307	CGCT	2	8	417828	417835	0 %	25 %	25 %	50 %	300702755
11013	NC_014307	ATC	2	6	417837	417842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702755
11014	NC_014307	CAC	2	6	417851	417856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702755
11015	NC_014307	AGA	2	6	417860	417865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702755
11016	NC_014307	TCA	2	6	417904	417909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702755
11017	NC_014307	CAA	2	6	417911	417916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702755
11018	NC_014307	TCG	2	6	417964	417969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702755
11019	NC_014307	CGG	2	6	417971	417976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702755
11020	NC_014307	TCG	2	6	418003	418008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702755
11021	NC_014307	CCA	2	6	418015	418020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702755
11022	NC_014307	CAT	2	6	418055	418060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702755
11023	NC_014307	CGA	2	6	418076	418081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702755
11024	NC_014307	GCT	2	6	418091	418096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702755
11025	NC_014307	CGACTA	2	12	418097	418108	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300702755
11026	NC_014307	CAT	2	6	418133	418138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702755
11027	NC_014307	CG	3	6	418147	418152	0 %	0 %	50 %	50 %	300702755
11028	NC_014307	CGC	2	6	418163	418168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702755
11029	NC_014307	GCC	2	6	418186	418191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702755
11030	NC_014307	TTC	2	6	418233	418238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702755
11031	NC_014307	CG	3	6	418278	418283	0 %	0 %	50 %	50 %	300702755
11032	NC_014307	GT	3	6	418376	418381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_014307	CTGC	2	8	418390	418397	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_014307	CGC	2	6	418531	418536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702756
11035	NC_014307	CCA	2	6	418561	418566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702756
11036	NC_014307	GT	3	6	418572	418577	0 %	50 %	50 %	0 %	300702756
11037	NC_014307	GCG	2	6	418582	418587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702756
11038	NC_014307	TGG	2	6	418635	418640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702756
11039	NC_014307	CGC	2	6	418726	418731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702756
11040	NC_014307	TGC	2	6	418735	418740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702756
11041	NC_014307	CTGG	2	8	418771	418778	0 %	25 %	50 %	25 %	300702756
11042	NC_014307	GGC	2	6	418783	418788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702756
11043	NC_014307	TCC	3	9	418916	418924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702756
11044	NC_014307	CCCGCG	2	12	418944	418955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702756
11045	NC_014307	GAA	2	6	418963	418968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702756
11046	NC_014307	GCC	2	6	419033	419038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702756
11047	NC_014307	CTAT	2	8	419050	419057	25 %	50 %	0 %	25 %	300702756
11048	NC_014307	CCT	2	6	419160	419165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702756
11049	NC_014307	GCC	2	6	419197	419202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702756
11050	NC_014307	TGC	2	6	419212	419217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702756
11051	NC_014307	GTT	2	6	419345	419350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_014307	CGAAAG	2	12	419401	419412	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11053	NC_014307	GGC	2	6	419425	419430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_014307	GGT	2	6	419466	419471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_014307	CGG	2	6	419478	419483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_014307	TGA	2	6	419509	419514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_014307	A	6	6	419516	419521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_014307	TTC	2	6	419522	419527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_014307	GTT	2	6	419533	419538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_014307	CGA	2	6	419544	419549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_014307	CTG	2	6	419575	419580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_014307	AACA	3	12	419628	419639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11063	NC_014307	TGA	2	6	419659	419664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_014307	GCG	2	6	419670	419675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_014307	CAG	2	6	419787	419792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940463
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11067	NC_014307	TGG	2	6	420046	420051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11069	NC_014307	GCA	2	6	420144	420149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_014307	GT	3	6	420197	420202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_014307	GAA	2	6	420203	420208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_014307	GAAA	2	8	420239	420246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_014307	GAA	2	6	420284	420289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_014307	CAG	2	6	420312	420317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_014307	GT	3	6	420449	420454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_014307	GGA	2	6	420503	420508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_014307	CCT	2	6	420528	420533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11078	NC_014307	GTT	2	6	420622	420627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_014307	GAT	2	6	420737	420742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_014307	TACC	2	8	420774	420781	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11081	NC_014307	TGC	2	6	420844	420849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_014307	GTC	2	6	420856	420861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_014307	TCGTG	2	10	420865	420874	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11084	NC_014307	AG	3	6	420940	420945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_014307	GGA	2	6	420963	420968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_014307	AC	3	6	421183	421188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_014307	AGT	2	6	421223	421228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_014307	G	6	6	421243	421248	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_014307	CCT	2	6	421324	421329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11090	NC_014307	GTTT	2	8	421369	421376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_014307	GGT	2	6	421405	421410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_014307	CCA	2	6	421462	421467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11093	NC_014307	GTC	2	6	421545	421550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_014307	TCC	2	6	421566	421571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11095	NC_014307	AGT	2	6	421641	421646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_014307	GTA	2	6	421676	421681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_014307	TGA	2	6	421699	421704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_014307	CAA	2	6	421713	421718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_014307	TGG	2	6	421850	421855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_014307	GTA	2	6	421886	421891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_014307	AGT	2	6	422065	422070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_014307	GCGA	2	8	422072	422079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11103	NC_014307	G	6	6	422233	422238	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_014307	TCC	2	6	422243	422248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11105	NC_014307	GGGAG	2	10	422315	422324	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_014307	GCAT	2	8	422344	422351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11107	NC_014307	GGA	2	6	422549	422554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_014307	AAAC	2	8	422612	422619	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11109	NC_014307	TC	3	6	422635	422640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11110	NC_014307	G	6	6	422701	422706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_014307	GACA	2	8	422766	422773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11112	NC_014307	AAC	2	6	422804	422809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_014307	AGG	2	6	422877	422882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_014307	AGC	2	6	422893	422898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_014307	AAAG	2	8	422907	422914	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_014307	GTC	2	6	422935	422940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_014307	CGT	2	6	423222	423227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_014307	ATG	2	6	423228	423233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_014307	G	6	6	423238	423243	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_014307	GCGA	2	8	423340	423347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11121	NC_014307	GA	3	6	423462	423467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_014307	TGG	2	6	423573	423578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_014307	TAA	2	6	423590	423595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_014307	ATG	2	6	423666	423671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_014307	TTGA	2	8	423684	423691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_014307	CGG	2	6	423704	423709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_014307	TCC	2	6	423797	423802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11128	NC_014307	TGA	2	6	423830	423835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_014307	ACC	2	6	423975	423980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11130	NC_014307	GTTT	2	8	423984	423991	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11131	NC_014307	TCC	2	6	424062	424067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11132	NC_014307	GGA	2	6	424079	424084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_014307	GGT	2	6	424199	424204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_014307	CGG	2	6	424286	424291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11135	NC_014307	CTCAT	2	10	424313	424322	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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11140	NC_014307	GGC	2	6	424780	424785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11141	NC_014307	CAA	2	6	424806	424811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11142	NC_014307	ACC	2	6	424842	424847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11151	NC_014307	TCT	2	6	425325	425330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11153	NC_014307	GTCCG	2	10	425480	425489	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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11158	NC_014307	CCA	2	6	425698	425703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11239	NC_014307	GTTC	2	8	429260	429267	0 %	50 %	25 %	25 %	300702762
11240	NC_014307	CTG	2	6	429301	429306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702762
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11242	NC_014307	TGGGCG	2	12	429380	429391	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300702762
11243	NC_014307	GCTG	3	12	429411	429422	0 %	25 %	50 %	25 %	300702762
11244	NC_014307	ACCC	2	8	429458	429465	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11245	NC_014307	TC	3	6	429480	429485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11246	NC_014307	GCAG	2	8	429554	429561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11247	NC_014307	CGC	2	6	429563	429568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11249	NC_014307	CGT	2	6	429774	429779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11366	NC_014307	GCG	3	9	435315	435323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11367	NC_014307	AGC	2	6	435345	435350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11371	NC_014307	GTG	2	6	435842	435847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702766
11372	NC_014307	CGC	2	6	435864	435869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702766
11373	NC_014307	AAG	2	6	435872	435877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702766
11374	NC_014307	CGA	2	6	435916	435921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702766
11375	NC_014307	GCT	2	6	435973	435978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702766
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11489	NC_014307	GCG	2	6	440137	440142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702767
11490	NC_014307	GCCC	2	8	440203	440210	0 %	0 %	25 %	75 %	300702767
11491	NC_014307	GAC	2	6	440234	440239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702767
11492	NC_014307	GCC	2	6	440312	440317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702767
11493	NC_014307	GC	3	6	440364	440369	0 %	0 %	50 %	50 %	300702767
11494	NC_014307	GC	3	6	440394	440399	0 %	0 %	50 %	50 %	300702767
11495	NC_014307	GGC	2	6	440485	440490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702767
11496	NC_014307	GC	3	6	440508	440513	0 %	0 %	50 %	50 %	300702767
11497	NC_014307	GAC	2	6	440522	440527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702767
11498	NC_014307	GCCG	2	8	440566	440573	0 %	0 %	50 %	50 %	300702767
11499	NC_014307	GCCG	2	8	440578	440585	0 %	0 %	50 %	50 %	300702767
11500	NC_014307	CAG	2	6	440630	440635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702767

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