MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 91706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_014307	AGAT	2	8	2355254	2355261	50 %	25 %	25 %	0 %	300704583
63003	NC_014307	CTT	2	6	2355271	2355276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300704583
63004	NC_014307	TCG	2	6	2355356	2355361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704583
63005	NC_014307	CTT	2	6	2355390	2355395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300704583
63006	NC_014307	GCA	2	6	2355402	2355407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704583
63007	NC_014307	CAG	2	6	2355427	2355432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704583
63008	NC_014307	CCG	2	6	2355473	2355478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300704583
63009	NC_014307	GCA	2	6	2355498	2355503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704583
63010	NC_014307	TCC	2	6	2355512	2355517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300704583
63011	NC_014307	TGC	2	6	2355525	2355530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704583
63012	NC_014307	CGT	2	6	2355531	2355536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704583
63013	NC_014307	CAG	2	6	2355562	2355567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704583
63014	NC_014307	CGA	2	6	2355587	2355592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704583
63015	NC_014307	GCT	2	6	2355633	2355638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704583
63016	NC_014307	CGA	2	6	2355732	2355737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704583
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63019	NC_014307	CGG	2	6	2355777	2355782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704583
63020	NC_014307	GGC	2	6	2355927	2355932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704583
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63023	NC_014307	TCCG	2	8	2356046	2356053	0 %	25 %	25 %	50 %	300704583
63024	NC_014307	GC	3	6	2356066	2356071	0 %	0 %	50 %	50 %	300704583
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63031	NC_014307	CGA	2	6	2356409	2356414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63032	NC_014307	GAGT	2	8	2356452	2356459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63033	NC_014307	GATC	2	8	2356474	2356481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63034	NC_014307	T	8	8	2356494	2356501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63035	NC_014307	AC	3	6	2356530	2356535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63036	NC_014307	GC	3	6	2356569	2356574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63037	NC_014307	CAGAT	2	10	2356576	2356585	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63038	NC_014307	CCA	2	6	2356709	2356714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63039	NC_014307	ATTTT	2	10	2356715	2356724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63040	NC_014307	CAA	2	6	2356728	2356733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63041	NC_014307	ATAAA	2	10	2356761	2356770	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63042	NC_014307	GCA	2	6	2356777	2356782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63043	NC_014307	A	6	6	2356957	2356962	100 %	0 %	0 %	0 %	300704584
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63045	NC_014307	GC	3	6	2357035	2357040	0 %	0 %	50 %	50 %	300704585
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63052	NC_014307	CGT	2	6	2357332	2357337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63053	NC_014307	CGATG	2	10	2357341	2357350	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63054	NC_014307	CGG	2	6	2357352	2357357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63055	NC_014307	TGC	2	6	2357373	2357378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63056	NC_014307	CGG	2	6	2357387	2357392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63057	NC_014307	CATGG	2	10	2357394	2357403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63058	NC_014307	CGGGC	2	10	2357415	2357424	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63059	NC_014307	GAC	2	6	2357477	2357482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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63061	NC_014307	GC	3	6	2357651	2357656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63062	NC_014307	CGG	2	6	2357822	2357827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704586
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63230	NC_014307	GCCG	2	8	2364783	2364790	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
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63239	NC_014307	GTT	2	6	2365087	2365092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300704594
63240	NC_014307	CAG	2	6	2365093	2365098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63241	NC_014307	GC	3	6	2365107	2365112	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63242	NC_014307	CGC	2	6	2365131	2365136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300704594
63243	NC_014307	TCG	2	6	2365205	2365210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63244	NC_014307	CGA	2	6	2365315	2365320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63245	NC_014307	CTG	2	6	2365324	2365329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63246	NC_014307	GC	3	6	2365333	2365338	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63247	NC_014307	CAG	2	6	2365339	2365344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63248	NC_014307	GCCCG	2	10	2365361	2365370	0 %	0 %	40 %	60 %	300704594
63249	NC_014307	GCG	2	6	2365410	2365415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704594
63250	NC_014307	AGCGC	2	10	2365437	2365446	20 %	0 %	40 %	40 %	300704594
63251	NC_014307	CTC	2	6	2365447	2365452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300704594
63252	NC_014307	GAT	2	6	2365501	2365506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300704594
63253	NC_014307	CCGG	3	12	2365512	2365523	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63254	NC_014307	TCG	2	6	2365526	2365531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63255	NC_014307	GCAT	2	8	2365544	2365551	25 %	25 %	25 %	25 %	300704594
63256	NC_014307	CGT	2	6	2365566	2365571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63257	NC_014307	CCA	2	6	2365584	2365589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300704594
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63259	NC_014307	TCG	2	6	2365652	2365657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63260	NC_014307	CAG	2	6	2365669	2365674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
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63263	NC_014307	CGG	2	6	2365740	2365745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704594
63264	NC_014307	GTGA	2	8	2365856	2365863	25 %	25 %	50 %	0 %	300704594
63265	NC_014307	TCG	2	6	2365961	2365966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63266	NC_014307	AGCGC	2	10	2365974	2365983	20 %	0 %	40 %	40 %	300704594
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63268	NC_014307	CGG	2	6	2366047	2366052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704594
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63273	NC_014307	AGC	2	6	2366153	2366158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63274	NC_014307	GC	3	6	2366157	2366162	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63275	NC_014307	GCA	2	6	2366181	2366186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63276	NC_014307	GCCA	2	8	2366192	2366199	25 %	0 %	25 %	50 %	300704594
63277	NC_014307	GC	3	6	2366209	2366214	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63278	NC_014307	CGC	2	6	2366274	2366279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300704594
63279	NC_014307	CCGGC	2	10	2366424	2366433	0 %	0 %	40 %	60 %	300704594
63280	NC_014307	CGG	2	6	2366499	2366504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704594
63281	NC_014307	GGT	2	6	2366544	2366549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300704594
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63283	NC_014307	CAC	2	6	2366593	2366598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300704594
63284	NC_014307	CGGGT	2	10	2366605	2366614	0 %	20 %	60 %	20 %	300704594
63285	NC_014307	GC	3	6	2366742	2366747	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63286	NC_014307	GGTC	2	8	2366760	2366767	0 %	25 %	50 %	25 %	300704594
63287	NC_014307	CAG	2	6	2366782	2366787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63288	NC_014307	CG	4	8	2366803	2366810	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63289	NC_014307	GCC	2	6	2366816	2366821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300704594
63290	NC_014307	CG	3	6	2366828	2366833	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63291	NC_014307	GC	3	6	2366848	2366853	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63292	NC_014307	GGCCAG	2	12	2366858	2366869	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300704594
63293	NC_014307	CGAC	2	8	2366870	2366877	25 %	0 %	25 %	50 %	300704594
63294	NC_014307	GTC	2	6	2366893	2366898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63295	NC_014307	CGA	2	6	2366904	2366909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
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63297	NC_014307	GCG	2	6	2366925	2366930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704594
63298	NC_014307	CGT	2	6	2366955	2366960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63299	NC_014307	GC	3	6	2366977	2366982	0 %	0 %	50 %	50 %	300704594
63300	NC_014307	CAC	2	6	2366983	2366988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300704594
63301	NC_014307	CAG	2	6	2367013	2367018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63302	NC_014307	CCA	2	6	2367030	2367035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300704594
63303	NC_014307	GCA	2	6	2367036	2367041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704594
63304	NC_014307	CGCA	2	8	2367055	2367062	25 %	0 %	25 %	50 %	300704594
63305	NC_014307	GTC	2	6	2367089	2367094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63306	NC_014307	TCA	2	6	2367126	2367131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300704595
63307	NC_014307	AGG	3	9	2367132	2367140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300704595
63308	NC_014307	CGC	2	6	2367148	2367153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300704595
63309	NC_014307	CGA	3	9	2367178	2367186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704595
63310	NC_014307	CG	3	6	2367213	2367218	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63311	NC_014307	ACC	2	6	2367222	2367227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300704595
63312	NC_014307	GTA	2	6	2367263	2367268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300704595
63313	NC_014307	CGG	2	6	2367278	2367283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704595
63314	NC_014307	ATC	2	6	2367291	2367296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300704595
63315	NC_014307	GCC	2	6	2367351	2367356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300704595
63316	NC_014307	GC	4	8	2367371	2367378	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63317	NC_014307	GCA	2	6	2367421	2367426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300704595
63318	NC_014307	CGT	2	6	2367430	2367435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704595
63319	NC_014307	CCG	2	6	2367445	2367450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300704595
63320	NC_014307	GCG	2	6	2367454	2367459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704595
63321	NC_014307	CGG	2	6	2367469	2367474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704595
63322	NC_014307	GC	3	6	2367484	2367489	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63323	NC_014307	CAC	2	6	2367497	2367502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300704595
63324	NC_014307	CCA	3	9	2367551	2367559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300704595
63325	NC_014307	CCT	2	6	2367592	2367597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300704595
63326	NC_014307	TGC	2	6	2367603	2367608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704595
63327	NC_014307	GC	3	6	2367634	2367639	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63328	NC_014307	CGG	2	6	2367640	2367645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704595
63329	NC_014307	GCC	2	6	2367663	2367668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300704595
63330	NC_014307	CGC	2	6	2367850	2367855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300704595
63331	NC_014307	CG	3	6	2367916	2367921	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63332	NC_014307	ATC	2	6	2367924	2367929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300704595
63333	NC_014307	GCG	2	6	2368020	2368025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704595
63334	NC_014307	CCCG	2	8	2368049	2368056	0 %	0 %	25 %	75 %	300704595
63335	NC_014307	GC	3	6	2368059	2368064	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63336	NC_014307	CGCCTG	2	12	2368085	2368096	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300704595
63337	NC_014307	CG	3	6	2368103	2368108	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63338	NC_014307	GCCG	2	8	2368151	2368158	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63339	NC_014307	CG	3	6	2368360	2368365	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63340	NC_014307	TCC	2	6	2368422	2368427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300704595
63341	NC_014307	CGG	2	6	2368462	2368467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300704595
63342	NC_014307	CG	3	6	2368477	2368482	0 %	0 %	50 %	50 %	300704595
63343	NC_014307	CAC	2	6	2368508	2368513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300704595
63344	NC_014307	TGC	3	9	2368584	2368592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704595
63345	NC_014307	CGT	2	6	2368612	2368617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704595
63346	NC_014307	CTG	2	6	2368655	2368660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704595
63347	NC_014307	GCACA	2	10	2368719	2368728	40 %	0 %	20 %	40 %	300704595
63348	NC_014307	GCGCC	2	10	2368732	2368741	0 %	0 %	40 %	60 %	300704595
63349	NC_014307	GGT	2	6	2368806	2368811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300704596
63350	NC_014307	TTC	2	6	2368858	2368863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300704596
63351	NC_014307	TGC	2	6	2368931	2368936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300704596
63352	NC_014307	CG	3	6	2368964	2368969	0 %	0 %	50 %	50 %	300704596
63353	NC_014307	CG	3	6	2369155	2369160	0 %	0 %	50 %	50 %	300704596
63354	NC_014307	ATC	2	6	2369196	2369201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300704596
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