MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_013715	GCC	2	6	1830690	1830695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458647
41002	NC_013715	CGC	2	6	1830698	1830703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458647
41003	NC_013715	GA	3	6	1830709	1830714	50 %	0 %	50 %	0 %	283458647
41004	NC_013715	CGT	2	6	1830764	1830769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458647
41005	NC_013715	TTC	2	6	1830835	1830840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458647
41006	NC_013715	TGC	2	6	1830852	1830857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458647
41007	NC_013715	GAGG	2	8	1830957	1830964	25 %	0 %	75 %	0 %	283458647
41008	NC_013715	CAG	2	6	1830969	1830974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458647
41009	NC_013715	CG	3	6	1830986	1830991	0 %	0 %	50 %	50 %	283458647
41010	NC_013715	ATG	2	6	1831042	1831047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458647
41011	NC_013715	CCA	3	9	1831165	1831173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458647
41012	NC_013715	ACG	2	6	1831177	1831182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458647
41013	NC_013715	ACG	3	9	1831194	1831202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458647
41014	NC_013715	TCG	2	6	1831360	1831365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458647
41015	NC_013715	GCGGT	2	10	1831411	1831420	0 %	20 %	60 %	20 %	283458647
41016	NC_013715	GA	3	6	1831435	1831440	50 %	0 %	50 %	0 %	283458647
41017	NC_013715	CTG	2	6	1831517	1831522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458647
41018	NC_013715	GGA	2	6	1831532	1831537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458647
41019	NC_013715	TCT	2	6	1831613	1831618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458647
41020	NC_013715	GCC	2	6	1831641	1831646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458647
41021	NC_013715	CGA	2	6	1831649	1831654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458647
41022	NC_013715	GGT	2	6	1831746	1831751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41023	NC_013715	AGC	2	6	1831837	1831842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41024	NC_013715	TGT	2	6	1831865	1831870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41025	NC_013715	TTTTA	2	10	1831872	1831881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41026	NC_013715	TGG	2	6	1831973	1831978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41027	NC_013715	TTA	2	6	1832033	1832038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41028	NC_013715	CCCCA	2	10	1832058	1832067	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
41029	NC_013715	CTT	2	6	1832190	1832195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458649
41030	NC_013715	CTT	2	6	1832200	1832205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458649
41031	NC_013715	GCG	2	6	1832212	1832217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458649
41032	NC_013715	GAT	2	6	1832238	1832243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458649
41033	NC_013715	TAA	2	6	1832322	1832327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458649
41034	NC_013715	GCC	2	6	1832348	1832353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458649
41035	NC_013715	CGG	2	6	1832362	1832367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458649
41036	NC_013715	TCC	2	6	1832381	1832386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458649
41037	NC_013715	CTC	2	6	1832434	1832439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458649
41038	NC_013715	GCA	2	6	1832450	1832455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458649
41039	NC_013715	CTCA	2	8	1832470	1832477	25 %	25 %	0 %	50 %	283458649
41040	NC_013715	CTG	2	6	1832479	1832484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458649
41041	NC_013715	ACCGTA	2	12	1832581	1832592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283458649
41042	NC_013715	CAT	2	6	1832619	1832624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458649
41043	NC_013715	GCC	2	6	1832657	1832662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458649
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41049	NC_013715	CGA	2	6	1832818	1832823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458649
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41051	NC_013715	AC	3	6	1832868	1832873	50 %	0 %	0 %	50 %	283458649
41052	NC_013715	TCG	2	6	1832880	1832885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458649
41053	NC_013715	CAA	2	6	1832934	1832939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458649
41054	NC_013715	TAA	2	6	1833024	1833029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458649
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41058	NC_013715	CCGTG	2	10	1833240	1833249	0 %	20 %	40 %	40 %	283458649
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41061	NC_013715	CAT	2	6	1833453	1833458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458649
41062	NC_013715	CCTC	2	8	1833543	1833550	0 %	25 %	0 %	75 %	283458649
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41067	NC_013715	CAC	2	6	1833711	1833716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458649
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41069	NC_013715	ACC	2	6	1833829	1833834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41070	NC_013715	TCG	2	6	1833972	1833977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458650
41071	NC_013715	CCGG	2	8	1834000	1834007	0 %	0 %	50 %	50 %	283458650
41072	NC_013715	CTC	2	6	1834024	1834029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458650
41073	NC_013715	GCGG	2	8	1834060	1834067	0 %	0 %	75 %	25 %	283458650
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41078	NC_013715	ATCGCC	2	12	1834405	1834416	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283458650
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41088	NC_013715	TCT	2	6	1834905	1834910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41089	NC_013715	TAT	2	6	1834914	1834919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41100	NC_013715	GA	3	6	1835461	1835466	50 %	0 %	50 %	0 %	283458651
41101	NC_013715	GCC	2	6	1835517	1835522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458651
41102	NC_013715	GTGC	2	8	1835527	1835534	0 %	25 %	50 %	25 %	283458651
41103	NC_013715	CAGGG	2	10	1835623	1835632	20 %	0 %	60 %	20 %	283458652
41104	NC_013715	GA	3	6	1835664	1835669	50 %	0 %	50 %	0 %	283458652
41105	NC_013715	TTC	2	6	1835707	1835712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458652
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41107	NC_013715	GGC	2	6	1835801	1835806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458652
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41117	NC_013715	CGG	3	9	1836073	1836081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458652
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41232	NC_013715	GGC	2	6	1841608	1841613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458657
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41235	NC_013715	CTTC	2	8	1841829	1841836	0 %	50 %	0 %	50 %	283458657
41236	NC_013715	GCA	2	6	1841882	1841887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458657
41237	NC_013715	CGG	2	6	1841892	1841897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458657
41238	NC_013715	GCA	2	6	1841901	1841906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458657
41239	NC_013715	CAG	2	6	1841928	1841933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458657
41240	NC_013715	GCC	2	6	1841984	1841989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458657
41241	NC_013715	CAG	2	6	1842066	1842071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458657
41242	NC_013715	TCC	2	6	1842083	1842088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458657
41243	NC_013715	CAG	2	6	1842102	1842107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458657
41244	NC_013715	CAG	2	6	1842151	1842156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458657
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41246	NC_013715	AG	3	6	1842239	1842244	50 %	0 %	50 %	0 %	283458657
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41249	NC_013715	CTG	2	6	1842274	1842279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458657
41250	NC_013715	GCC	2	6	1842296	1842301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458657
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41253	NC_013715	GCT	2	6	1842465	1842470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458657
41254	NC_013715	GCTC	2	8	1842507	1842514	0 %	25 %	25 %	50 %	283458657
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41262	NC_013715	GCA	2	6	1842758	1842763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458657
41263	NC_013715	TCG	2	6	1842806	1842811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458657
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41277	NC_013715	GCG	2	6	1843460	1843465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458657
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41295	NC_013715	CTG	3	9	1844119	1844127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458657
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41297	NC_013715	TTCT	2	8	1844182	1844189	0 %	75 %	0 %	25 %	283458657
41298	NC_013715	TTC	2	6	1844215	1844220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458657
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41300	NC_013715	AAG	2	6	1844258	1844263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458657
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41303	NC_013715	TA	3	6	1844469	1844474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41304	NC_013715	ACGG	2	8	1844574	1844581	25 %	0 %	50 %	25 %	283458658
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41311	NC_013715	TGCC	2	8	1844927	1844934	0 %	25 %	25 %	50 %	283458658
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41328	NC_013715	CGG	2	6	1845676	1845681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458658
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41331	NC_013715	CCG	2	6	1845788	1845793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41332	NC_013715	TACC	2	8	1845799	1845806	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41333	NC_013715	CAT	2	6	1845905	1845910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41334	NC_013715	GCC	2	6	1845943	1845948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41335	NC_013715	AGCG	2	8	1846008	1846015	25 %	0 %	50 %	25 %	283458659
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41337	NC_013715	CCTT	2	8	1846116	1846123	0 %	50 %	0 %	50 %	283458659
41338	NC_013715	CAT	2	6	1846156	1846161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458659
41339	NC_013715	CG	3	6	1846162	1846167	0 %	0 %	50 %	50 %	283458659
41340	NC_013715	AGA	2	6	1846231	1846236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458659
41341	NC_013715	TGC	2	6	1846256	1846261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458659
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41343	NC_013715	TGA	2	6	1846348	1846353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458659
41344	NC_013715	GAA	2	6	1846382	1846387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458659
41345	NC_013715	GGTCA	2	10	1846457	1846466	20 %	20 %	40 %	20 %	283458659
41346	NC_013715	CAG	2	6	1846475	1846480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458659
41347	NC_013715	CGG	2	6	1846554	1846559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458659
41348	NC_013715	CGGT	2	8	1846614	1846621	0 %	25 %	50 %	25 %	283458659
41349	NC_013715	GGA	2	6	1846661	1846666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458659
41350	NC_013715	CGA	2	6	1846683	1846688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458659
41351	NC_013715	TGA	2	6	1846693	1846698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458659
41352	NC_013715	GGAGTC	2	12	1846718	1846729	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283458659
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41357	NC_013715	TGC	2	6	1847124	1847129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458660
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41361	NC_013715	TGC	2	6	1847298	1847303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458660
41362	NC_013715	CTG	2	6	1847309	1847314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458660
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41436	NC_013715	TGCA	2	8	1851292	1851299	25 %	25 %	25 %	25 %	283458666
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41452	NC_013715	GC	3	6	1852064	1852069	0 %	0 %	50 %	50 %	283458666
41453	NC_013715	CTG	2	6	1852327	1852332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458666
41454	NC_013715	ACC	2	6	1852333	1852338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458666
41455	NC_013715	GACC	2	8	1852476	1852483	25 %	0 %	25 %	50 %	283458666
41456	NC_013715	AAG	2	6	1852492	1852497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458666
41457	NC_013715	TGA	2	6	1852541	1852546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458666
41458	NC_013715	TCC	2	6	1852588	1852593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458666
41459	NC_013715	TGAGGC	2	12	1852611	1852622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283458666
41460	NC_013715	TCC	2	6	1852666	1852671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458666
41461	NC_013715	TCGGCT	2	12	1852672	1852683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458666
41462	NC_013715	AG	3	6	1852765	1852770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41463	NC_013715	TC	3	6	1852797	1852802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41464	NC_013715	TATG	2	8	1852805	1852812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41465	NC_013715	GCCA	2	8	1852825	1852832	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41466	NC_013715	GCT	2	6	1852916	1852921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458667
41467	NC_013715	GGCA	2	8	1852923	1852930	25 %	0 %	50 %	25 %	283458667
41468	NC_013715	CGC	2	6	1853016	1853021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458667
41469	NC_013715	GC	3	6	1853139	1853144	0 %	0 %	50 %	50 %	283458667
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41492	NC_013715	CTT	2	6	1854510	1854515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458668
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41494	NC_013715	TGC	2	6	1854559	1854564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458668
41495	NC_013715	GCA	2	6	1854572	1854577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458668
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41497	NC_013715	CG	3	6	1854680	1854685	0 %	0 %	50 %	50 %	283458670
41498	NC_013715	ACC	2	6	1854787	1854792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458670
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