MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_013715	GC	3	6	1559567	1559572	0 %	0 %	50 %	50 %	283458414
35002	NC_013715	CTGG	2	8	1559609	1559616	0 %	25 %	50 %	25 %	283458414
35003	NC_013715	GGT	2	6	1559631	1559636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458414
35004	NC_013715	CGG	2	6	1559642	1559647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458414
35005	NC_013715	CTG	2	6	1559685	1559690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458414
35006	NC_013715	TGC	2	6	1559726	1559731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458414
35007	NC_013715	TGC	2	6	1559755	1559760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458414
35008	NC_013715	TCC	3	9	1559772	1559780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458414
35009	NC_013715	CAG	2	6	1559850	1559855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458414
35010	NC_013715	GCTT	2	8	1559874	1559881	0 %	50 %	25 %	25 %	283458414
35011	NC_013715	GAA	2	6	1559897	1559902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458414
35012	NC_013715	TCT	2	6	1559953	1559958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458414
35013	NC_013715	CAA	2	6	1559960	1559965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458414
35014	NC_013715	CTG	2	6	1559970	1559975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458414
35015	NC_013715	ACC	2	6	1559976	1559981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458414
35016	NC_013715	GCA	2	6	1560003	1560008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458414
35017	NC_013715	CGG	2	6	1560134	1560139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458414
35018	NC_013715	GTT	2	6	1560147	1560152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458414
35019	NC_013715	CA	3	6	1560238	1560243	50 %	0 %	0 %	50 %	283458414
35020	NC_013715	CGTG	2	8	1560245	1560252	0 %	25 %	50 %	25 %	283458414
35021	NC_013715	CGG	2	6	1560344	1560349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458414
35022	NC_013715	GTT	2	6	1560420	1560425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458414
35023	NC_013715	ACC	2	6	1560429	1560434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458414
35024	NC_013715	GCA	2	6	1560444	1560449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458414
35025	NC_013715	GCG	2	6	1560481	1560486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458414
35026	NC_013715	GCTG	2	8	1560523	1560530	0 %	25 %	50 %	25 %	283458414
35027	NC_013715	GAA	2	6	1560575	1560580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458414
35028	NC_013715	ACGGC	2	10	1560652	1560661	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35029	NC_013715	GCT	2	6	1560683	1560688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35030	NC_013715	AGC	2	6	1560710	1560715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35031	NC_013715	GCG	2	6	1560759	1560764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35032	NC_013715	CCG	2	6	1560822	1560827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35033	NC_013715	GTT	2	6	1560843	1560848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35034	NC_013715	CGA	2	6	1560913	1560918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35035	NC_013715	TTTA	2	8	1560932	1560939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35036	NC_013715	GCG	2	6	1560971	1560976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35037	NC_013715	TTG	2	6	1561081	1561086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35038	NC_013715	TGT	2	6	1561102	1561107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35039	NC_013715	GTTT	2	8	1561127	1561134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35040	NC_013715	AT	3	6	1561169	1561174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35041	NC_013715	ATTCT	2	10	1561185	1561194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35042	NC_013715	GGTT	2	8	1561211	1561218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35043	NC_013715	GGT	2	6	1561237	1561242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35044	NC_013715	GA	3	6	1561253	1561258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35045	NC_013715	AGG	2	6	1561271	1561276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458415
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35049	NC_013715	CT	3	6	1561363	1561368	0 %	50 %	0 %	50 %	283458415
35050	NC_013715	ACTG	2	8	1561442	1561449	25 %	25 %	25 %	25 %	283458415
35051	NC_013715	CTA	2	6	1561475	1561480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458415
35052	NC_013715	CAC	2	6	1561572	1561577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458415
35053	NC_013715	AGC	2	6	1561598	1561603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458415
35054	NC_013715	TGCC	2	8	1561616	1561623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35055	NC_013715	GCC	2	6	1561646	1561651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35056	NC_013715	ACCGGT	2	12	1561654	1561665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35057	NC_013715	GGC	2	6	1561668	1561673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35058	NC_013715	ATT	2	6	1561720	1561725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35059	NC_013715	CGA	2	6	1561795	1561800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35060	NC_013715	CAA	2	6	1561834	1561839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35061	NC_013715	ACCCA	2	10	1561843	1561852	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
35062	NC_013715	GAG	2	6	1561853	1561858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35063	NC_013715	GCC	2	6	1561962	1561967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35064	NC_013715	CT	3	6	1562059	1562064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35065	NC_013715	CGTAC	2	10	1562131	1562140	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35066	NC_013715	TTA	2	6	1562235	1562240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35068	NC_013715	GT	3	6	1562415	1562420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35069	NC_013715	AT	3	6	1562503	1562508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35070	NC_013715	GGTAC	2	10	1562539	1562548	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35071	NC_013715	CCCCT	2	10	1562556	1562565	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
35072	NC_013715	ATG	2	6	1562566	1562571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35073	NC_013715	AC	3	6	1562609	1562614	50 %	0 %	0 %	50 %	283458416
35074	NC_013715	CGC	2	6	1562656	1562661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458416
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35078	NC_013715	TTG	2	6	1562746	1562751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458416
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35081	NC_013715	CTT	2	6	1562941	1562946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458416
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35085	NC_013715	TAT	2	6	1563116	1563121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283458416
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35088	NC_013715	GGGGT	2	10	1563280	1563289	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
35089	NC_013715	C	9	9	1563306	1563314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35090	NC_013715	TCAGC	2	10	1563432	1563441	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35091	NC_013715	AG	3	6	1563448	1563453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35092	NC_013715	CGA	2	6	1563530	1563535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458417
35093	NC_013715	ACT	2	6	1563547	1563552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458417
35094	NC_013715	CT	3	6	1563633	1563638	0 %	50 %	0 %	50 %	283458417
35095	NC_013715	CGC	2	6	1563657	1563662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458417
35096	NC_013715	TCG	2	6	1563671	1563676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458417
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35098	NC_013715	CG	3	6	1563780	1563785	0 %	0 %	50 %	50 %	283458417
35099	NC_013715	GCC	2	6	1563828	1563833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458417
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35102	NC_013715	CGGG	2	8	1564012	1564019	0 %	0 %	75 %	25 %	283458417
35103	NC_013715	CGAG	2	8	1564048	1564055	25 %	0 %	50 %	25 %	283458417
35104	NC_013715	GGA	2	6	1564076	1564081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458417
35105	NC_013715	CTT	2	6	1564110	1564115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458417
35106	NC_013715	TGG	2	6	1564192	1564197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458417
35107	NC_013715	TGG	2	6	1564207	1564212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458417
35108	NC_013715	GC	3	6	1564274	1564279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35109	NC_013715	GTT	2	6	1564297	1564302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35110	NC_013715	TCG	2	6	1564377	1564382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35111	NC_013715	CAG	2	6	1564418	1564423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458418
35112	NC_013715	CGG	2	6	1564424	1564429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458418
35113	NC_013715	CACC	2	8	1564531	1564538	25 %	0 %	0 %	75 %	283458418
35114	NC_013715	TGC	2	6	1564574	1564579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458418
35115	NC_013715	GCC	2	6	1564617	1564622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458418
35116	NC_013715	TGG	2	6	1564630	1564635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458418
35117	NC_013715	TTC	2	6	1564646	1564651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458418
35118	NC_013715	GTA	2	6	1564752	1564757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458418
35119	NC_013715	TTCT	2	8	1564821	1564828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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35121	NC_013715	AAG	2	6	1564878	1564883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35239	NC_013715	GTA	2	6	1569903	1569908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458421
35240	NC_013715	CGG	2	6	1569923	1569928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458421
35241	NC_013715	GCT	2	6	1569964	1569969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458421
35242	NC_013715	AGCG	2	8	1570062	1570069	25 %	0 %	50 %	25 %	283458421
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35245	NC_013715	GCG	2	6	1570184	1570189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458421
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35266	NC_013715	CAA	2	6	1571077	1571082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458421
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35268	NC_013715	GCT	2	6	1571104	1571109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458421
35269	NC_013715	CTTCCT	2	12	1571110	1571121	0 %	50 %	0 %	50 %	283458421
35270	NC_013715	CAG	2	6	1571144	1571149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458421
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35278	NC_013715	TGCT	2	8	1571590	1571597	0 %	50 %	25 %	25 %	283458423
35279	NC_013715	GC	3	6	1571643	1571648	0 %	0 %	50 %	50 %	283458423
35280	NC_013715	CAG	2	6	1571673	1571678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458423
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35297	NC_013715	CTC	2	6	1572741	1572746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458424
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35299	NC_013715	CA	3	6	1572804	1572809	50 %	0 %	0 %	50 %	283458424
35300	NC_013715	AGC	2	6	1572873	1572878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458424
35301	NC_013715	CAGC	2	8	1572959	1572966	25 %	0 %	25 %	50 %	283458424
35302	NC_013715	CAC	2	6	1572996	1573001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458424
35303	NC_013715	CG	3	6	1573047	1573052	0 %	0 %	50 %	50 %	283458424
35304	NC_013715	CGGCAC	2	12	1573061	1573072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	283458424
35305	NC_013715	ACC	2	6	1573093	1573098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458424
35306	NC_013715	GCG	2	6	1573114	1573119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458424
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35310	NC_013715	CAG	2	6	1573257	1573262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458424
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35317	NC_013715	AGG	2	6	1573703	1573708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458425
35318	NC_013715	GGTG	2	8	1573709	1573716	0 %	25 %	75 %	0 %	283458425
35319	NC_013715	CGT	2	6	1573736	1573741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458425
35320	NC_013715	CAG	4	12	1573746	1573757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458425
35321	NC_013715	GGC	2	6	1573778	1573783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458425
35322	NC_013715	CTCA	2	8	1573800	1573807	25 %	25 %	0 %	50 %	283458425
35323	NC_013715	GGA	2	6	1573809	1573814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458425
35324	NC_013715	TGG	2	6	1573859	1573864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458425
35325	NC_013715	CGG	2	6	1573874	1573879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458425
35326	NC_013715	TTG	2	6	1573882	1573887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458425
35327	NC_013715	TTC	2	6	1574025	1574030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458425
35328	NC_013715	CGG	2	6	1574038	1574043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458425
35329	NC_013715	CAG	2	6	1574064	1574069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458425
35330	NC_013715	CGT	2	6	1574087	1574092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458425
35331	NC_013715	CGG	2	6	1574134	1574139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458425
35332	NC_013715	CGC	2	6	1574177	1574182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458425
35333	NC_013715	GGC	2	6	1574216	1574221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458425
35334	NC_013715	GCG	2	6	1574229	1574234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458425
35335	NC_013715	CTT	2	6	1574295	1574300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458425
35336	NC_013715	CTT	2	6	1574310	1574315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458425
35337	NC_013715	CTT	2	6	1574325	1574330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458425
35338	NC_013715	GCC	2	6	1574349	1574354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458425
35339	NC_013715	GCC	2	6	1574427	1574432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458425
35340	NC_013715	GAG	2	6	1574437	1574442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458425
35341	NC_013715	TTC	2	6	1574461	1574466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458425
35342	NC_013715	CGTT	2	8	1574510	1574517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35343	NC_013715	CTC	2	6	1574607	1574612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458426
35344	NC_013715	CAG	3	9	1574637	1574645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458426
35345	NC_013715	CGC	2	6	1574669	1574674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458426
35346	NC_013715	AGC	2	6	1574716	1574721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458426
35347	NC_013715	CCGCGT	2	12	1574732	1574743	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283458426
35348	NC_013715	GCT	2	6	1574783	1574788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458426
35349	NC_013715	GC	3	6	1574859	1574864	0 %	0 %	50 %	50 %	283458426
35350	NC_013715	CCT	2	6	1574905	1574910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458426
35351	NC_013715	CG	3	6	1574933	1574938	0 %	0 %	50 %	50 %	283458426
35352	NC_013715	TCT	2	6	1574962	1574967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458426
35353	NC_013715	TTC	2	6	1574979	1574984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458426
35354	NC_013715	TCGT	2	8	1575030	1575037	0 %	50 %	25 %	25 %	283458426
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35469	NC_013715	GAG	2	6	1580048	1580053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458432
35470	NC_013715	CTT	2	6	1580085	1580090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458432
35471	NC_013715	GCT	2	6	1580094	1580099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458432
35472	NC_013715	GCGGTG	2	12	1580125	1580136	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	283458432
35473	NC_013715	GCC	2	6	1580224	1580229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458432
35474	NC_013715	CGA	2	6	1580247	1580252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458432
35475	NC_013715	GGA	2	6	1580314	1580319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458432
35476	NC_013715	TGCG	2	8	1580343	1580350	0 %	25 %	50 %	25 %	283458432
35477	NC_013715	GCC	2	6	1580461	1580466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458432
35478	NC_013715	TGG	2	6	1580498	1580503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458432
35479	NC_013715	TCG	2	6	1580513	1580518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458432
35480	NC_013715	GTT	2	6	1580563	1580568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458432
35481	NC_013715	GCC	2	6	1580575	1580580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458432
35482	NC_013715	GACA	2	8	1580599	1580606	50 %	0 %	25 %	25 %	283458432
35483	NC_013715	CTG	2	6	1580658	1580663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458432
35484	NC_013715	AGT	2	6	1580733	1580738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458432
35485	NC_013715	GTC	2	6	1580749	1580754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458432
35486	NC_013715	TGC	2	6	1580932	1580937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458432
35487	NC_013715	GAA	2	6	1581010	1581015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458432
35488	NC_013715	TGC	2	6	1581052	1581057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458432
35489	NC_013715	ACC	2	6	1581094	1581099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458432
35490	NC_013715	TGA	3	9	1581108	1581116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458432
35491	NC_013715	TCG	2	6	1581167	1581172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458432
35492	NC_013715	CGC	2	6	1581213	1581218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458432
35493	NC_013715	GGA	2	6	1581238	1581243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458432
35494	NC_013715	GGT	2	6	1581256	1581261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458432
35495	NC_013715	CGT	2	6	1581336	1581341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458432
35496	NC_013715	AG	3	6	1581427	1581432	50 %	0 %	50 %	0 %	283458432
35497	NC_013715	GAA	2	6	1581444	1581449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458432
35498	NC_013715	GA	3	6	1581484	1581489	50 %	0 %	50 %	0 %	283458432
35499	NC_013715	CGC	2	6	1581498	1581503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458432
35500	NC_013715	T	7	7	1581560	1581566	0 %	100 %	0 %	0 %	283458432

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