MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_013715	CAG	2	6	1512673	1512678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34002	NC_013715	TCA	2	6	1512717	1512722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458375
34003	NC_013715	GA	3	6	1512930	1512935	50 %	0 %	50 %	0 %	283458375
34004	NC_013715	TCGG	2	8	1513013	1513020	0 %	25 %	50 %	25 %	283458375
34005	NC_013715	GTG	2	6	1513021	1513026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458375
34006	NC_013715	TCA	2	6	1513034	1513039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458375
34007	NC_013715	CAC	2	6	1513062	1513067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458375
34008	NC_013715	GCG	2	6	1513078	1513083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458375
34009	NC_013715	CAGC	2	8	1513101	1513108	25 %	0 %	25 %	50 %	283458375
34010	NC_013715	GC	3	6	1513107	1513112	0 %	0 %	50 %	50 %	283458375
34011	NC_013715	AGC	2	6	1513159	1513164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34012	NC_013715	CGA	3	9	1513264	1513272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34013	NC_013715	GAA	2	6	1513274	1513279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458375
34014	NC_013715	CCG	2	6	1513317	1513322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458375
34015	NC_013715	CAC	2	6	1513336	1513341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458375
34016	NC_013715	CGC	2	6	1513351	1513356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458375
34017	NC_013715	GCC	2	6	1513367	1513372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458375
34018	NC_013715	CAT	2	6	1513389	1513394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458375
34019	NC_013715	CAC	2	6	1513405	1513410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458375
34020	NC_013715	GGT	2	6	1513488	1513493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458375
34021	NC_013715	CAC	2	6	1513510	1513515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458375
34022	NC_013715	TCA	2	6	1513556	1513561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458375
34023	NC_013715	ACG	2	6	1513647	1513652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34024	NC_013715	ACC	2	6	1513730	1513735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458375
34025	NC_013715	GCA	2	6	1513776	1513781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34026	NC_013715	CAA	2	6	1513806	1513811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458375
34027	NC_013715	CAC	2	6	1513846	1513851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458375
34028	NC_013715	CTG	2	6	1513879	1513884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34029	NC_013715	GCA	2	6	1513907	1513912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34030	NC_013715	CAG	2	6	1513926	1513931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34031	NC_013715	GCA	2	6	1513974	1513979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34032	NC_013715	CCA	2	6	1514009	1514014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458375
34033	NC_013715	CGG	2	6	1514068	1514073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458375
34034	NC_013715	TCA	2	6	1514106	1514111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458375
34035	NC_013715	CG	3	6	1514159	1514164	0 %	0 %	50 %	50 %	283458375
34036	NC_013715	CGC	2	6	1514190	1514195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458375
34037	NC_013715	CTC	2	6	1514214	1514219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458375
34038	NC_013715	CAG	2	6	1514286	1514291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34039	NC_013715	CCA	2	6	1514306	1514311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458375
34040	NC_013715	GCA	2	6	1514383	1514388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34041	NC_013715	CGC	2	6	1514403	1514408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458375
34042	NC_013715	CAG	2	6	1514421	1514426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34043	NC_013715	GCA	2	6	1514437	1514442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458375
34044	NC_013715	CAA	2	6	1514496	1514501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458377
34045	NC_013715	CCA	2	6	1514588	1514593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458377
34046	NC_013715	ATT	2	6	1514598	1514603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283458377
34047	NC_013715	CCA	2	6	1514738	1514743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458377
34048	NC_013715	CAC	2	6	1514850	1514855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458377
34049	NC_013715	CGG	2	6	1514889	1514894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458377
34050	NC_013715	CA	3	6	1514896	1514901	50 %	0 %	0 %	50 %	283458377
34051	NC_013715	CCAC	2	8	1514905	1514912	25 %	0 %	0 %	75 %	283458377
34052	NC_013715	GCG	2	6	1514949	1514954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458377
34053	NC_013715	CCA	2	6	1514968	1514973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458377
34054	NC_013715	GAAAGC	2	12	1514988	1514999	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	283458377
34055	NC_013715	CGC	2	6	1515024	1515029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458377
34056	NC_013715	CGG	2	6	1515089	1515094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458377
34057	NC_013715	CGG	2	6	1515173	1515178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458377
34058	NC_013715	CCA	2	6	1515181	1515186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458377
34059	NC_013715	CTT	2	6	1515210	1515215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458377
34060	NC_013715	CAT	2	6	1515250	1515255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34061	NC_013715	CTG	2	6	1515438	1515443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34062	NC_013715	TTC	2	6	1515511	1515516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458378
34063	NC_013715	GC	3	6	1515593	1515598	0 %	0 %	50 %	50 %	283458378
34064	NC_013715	GCAG	2	8	1515637	1515644	25 %	0 %	50 %	25 %	283458378
34065	NC_013715	GACG	2	8	1515652	1515659	25 %	0 %	50 %	25 %	283458378
34066	NC_013715	TGC	2	6	1515661	1515666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34067	NC_013715	GC	3	6	1515665	1515670	0 %	0 %	50 %	50 %	283458378
34068	NC_013715	GCT	2	6	1515707	1515712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34069	NC_013715	CTG	2	6	1515735	1515740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34070	NC_013715	GCTT	2	8	1515760	1515767	0 %	50 %	25 %	25 %	283458378
34071	NC_013715	GCG	2	6	1515772	1515777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458378
34072	NC_013715	CAG	2	6	1515788	1515793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34073	NC_013715	GCA	2	6	1515829	1515834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34074	NC_013715	AGC	2	6	1515861	1515866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34075	NC_013715	CTG	2	6	1515873	1515878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34076	NC_013715	CTT	2	6	1515903	1515908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458378
34077	NC_013715	CTTCTG	2	12	1515945	1515956	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	283458378
34078	NC_013715	CTG	2	6	1515969	1515974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34079	NC_013715	CTGCG	2	10	1515993	1516002	0 %	20 %	40 %	40 %	283458378
34080	NC_013715	CTG	2	6	1516062	1516067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34081	NC_013715	GCTCCT	2	12	1516082	1516093	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	283458378
34082	NC_013715	GCT	2	6	1516097	1516102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34083	NC_013715	GCT	2	6	1516127	1516132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34084	NC_013715	GCG	2	6	1516155	1516160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458378
34085	NC_013715	CAG	2	6	1516209	1516214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34086	NC_013715	CCT	3	9	1516241	1516249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458378
34087	NC_013715	ACG	2	6	1516275	1516280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34088	NC_013715	ACG	2	6	1516299	1516304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34089	NC_013715	CG	3	6	1516312	1516317	0 %	0 %	50 %	50 %	283458378
34090	NC_013715	CAA	3	9	1516380	1516388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458378
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34094	NC_013715	CGA	2	6	1516416	1516421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34095	NC_013715	ATG	2	6	1516519	1516524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458378
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34097	NC_013715	GCA	2	6	1516562	1516567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34098	NC_013715	CAG	3	9	1516602	1516610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34099	NC_013715	CAG	2	6	1516626	1516631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34100	NC_013715	CTC	2	6	1516638	1516643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458378
34101	NC_013715	AAT	2	6	1516647	1516652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458378
34102	NC_013715	AGT	2	6	1516685	1516690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458378
34103	NC_013715	AAG	2	6	1516726	1516731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458378
34104	NC_013715	CCG	2	6	1516732	1516737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458378
34105	NC_013715	GTC	2	6	1516738	1516743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34106	NC_013715	CCA	2	6	1516844	1516849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458378
34107	NC_013715	CGC	2	6	1516857	1516862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458378
34108	NC_013715	CGC	2	6	1516868	1516873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458378
34109	NC_013715	CAG	2	6	1516881	1516886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458378
34110	NC_013715	GCCA	2	8	1516906	1516913	25 %	0 %	25 %	50 %	283458378
34111	NC_013715	CAT	2	6	1516914	1516919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458378
34112	NC_013715	CGC	2	6	1516961	1516966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458378
34113	NC_013715	GGC	2	6	1517051	1517056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458378
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34115	NC_013715	ATA	2	6	1517077	1517082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458378
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34232	NC_013715	TCA	2	6	1522491	1522496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458383
34233	NC_013715	CAC	2	6	1522709	1522714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458383
34234	NC_013715	ACGCTC	2	12	1522754	1522765	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283458383
34235	NC_013715	GCC	2	6	1522797	1522802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458383
34236	NC_013715	GCA	2	6	1522806	1522811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458383
34237	NC_013715	CAC	2	6	1522916	1522921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458383
34238	NC_013715	CG	3	6	1522972	1522977	0 %	0 %	50 %	50 %	283458383
34239	NC_013715	CTG	2	6	1522997	1523002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458383
34240	NC_013715	GCG	2	6	1523022	1523027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458383
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34242	NC_013715	TCA	2	6	1523052	1523057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458383
34243	NC_013715	CAGC	2	8	1523068	1523075	25 %	0 %	25 %	50 %	283458383
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34247	NC_013715	AATC	2	8	1523209	1523216	50 %	25 %	0 %	25 %	283458383
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34259	NC_013715	CAG	2	6	1523858	1523863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458383
34260	NC_013715	CTT	2	6	1523901	1523906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458383
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34262	NC_013715	CTT	2	6	1524018	1524023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458384
34263	NC_013715	C	6	6	1524052	1524057	0 %	0 %	0 %	100 %	283458384
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34332	NC_013715	CGG	2	6	1527057	1527062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458387
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34334	NC_013715	TCG	2	6	1527107	1527112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458387
34335	NC_013715	CGA	2	6	1527261	1527266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458387
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34338	NC_013715	TGCGC	2	10	1527387	1527396	0 %	20 %	40 %	40 %	283458387
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34340	NC_013715	GGT	2	6	1527439	1527444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458387
34341	NC_013715	GCGG	2	8	1527463	1527470	0 %	0 %	75 %	25 %	283458387
34342	NC_013715	GCG	2	6	1527529	1527534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458387
34343	NC_013715	ACA	2	6	1527560	1527565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458387
34344	NC_013715	CGT	2	6	1527615	1527620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458387
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34465	NC_013715	GCC	2	6	1534689	1534694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458395
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