MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_013715	ACG	2	6	1446626	1446631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458314
32502	NC_013715	GCG	2	6	1446638	1446643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458314
32503	NC_013715	CTAG	2	8	1446679	1446686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32504	NC_013715	CAT	2	6	1446763	1446768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32505	NC_013715	CG	3	6	1446795	1446800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32506	NC_013715	GAG	2	6	1446863	1446868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32507	NC_013715	AGC	2	6	1447024	1447029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458315
32508	NC_013715	CAG	2	6	1447044	1447049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458315
32509	NC_013715	CTTCG	2	10	1447116	1447125	0 %	40 %	20 %	40 %	283458315
32510	NC_013715	ACG	2	6	1447135	1447140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458315
32511	NC_013715	CAACTT	2	12	1447154	1447165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458315
32512	NC_013715	GCG	2	6	1447214	1447219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458316
32513	NC_013715	CGT	2	6	1447225	1447230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458316
32514	NC_013715	ACC	2	6	1447235	1447240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458316
32515	NC_013715	TGT	2	6	1447243	1447248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458316
32516	NC_013715	ATC	2	6	1447290	1447295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458316
32517	NC_013715	ACG	2	6	1447394	1447399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458316
32518	NC_013715	ACG	2	6	1447410	1447415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458316
32519	NC_013715	TCT	2	6	1447417	1447422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458316
32520	NC_013715	CTC	2	6	1447424	1447429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458316
32521	NC_013715	GAT	2	6	1447457	1447462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458316
32522	NC_013715	GGA	2	6	1447562	1447567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458316
32523	NC_013715	CG	3	6	1447594	1447599	0 %	0 %	50 %	50 %	283458316
32524	NC_013715	GA	3	6	1447612	1447617	50 %	0 %	50 %	0 %	283458316
32525	NC_013715	GGT	2	6	1447622	1447627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458316
32526	NC_013715	GGT	2	6	1447646	1447651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458316
32527	NC_013715	GCA	2	6	1447744	1447749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458316
32528	NC_013715	CAG	2	6	1447805	1447810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458316
32529	NC_013715	CCTG	2	8	1447827	1447834	0 %	25 %	25 %	50 %	283458316
32530	NC_013715	TGT	2	6	1447849	1447854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458316
32531	NC_013715	CAG	2	6	1447862	1447867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458316
32532	NC_013715	CATC	2	8	1447951	1447958	25 %	25 %	0 %	50 %	283458316
32533	NC_013715	CTT	2	6	1447996	1448001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458316
32534	NC_013715	ACC	2	6	1448066	1448071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458316
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32537	NC_013715	GGTGCG	2	12	1448474	1448485	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	283458316
32538	NC_013715	GGT	2	6	1448504	1448509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458316
32539	NC_013715	CGG	2	6	1448539	1448544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458316
32540	NC_013715	ACTT	2	8	1448649	1448656	25 %	50 %	0 %	25 %	283458316
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32544	NC_013715	TGC	3	9	1448857	1448865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458318
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32551	NC_013715	CGC	2	6	1449117	1449122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458318
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32554	NC_013715	CACG	2	8	1449212	1449219	25 %	0 %	25 %	50 %	283458318
32555	NC_013715	ACCA	2	8	1449265	1449272	50 %	0 %	0 %	50 %	283458318
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32598	NC_013715	CGGTG	2	10	1451055	1451064	0 %	20 %	60 %	20 %	283458319
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32601	NC_013715	AACC	2	8	1451384	1451391	50 %	0 %	0 %	50 %	283458320
32602	NC_013715	CGGG	2	8	1451414	1451421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32603	NC_013715	GCC	2	6	1451426	1451431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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32610	NC_013715	CG	3	6	1451728	1451733	0 %	0 %	50 %	50 %	283458321
32611	NC_013715	GAT	2	6	1451759	1451764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458321
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32615	NC_013715	CTT	2	6	1451893	1451898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458321
32616	NC_013715	AGT	2	6	1451967	1451972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458321
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32723	NC_013715	CAG	2	6	1456947	1456952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458327
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32843	NC_013715	AT	3	6	1462057	1462062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32844	NC_013715	TCC	2	6	1462137	1462142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458330
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32969	NC_013715	GC	4	8	1467503	1467510	0 %	0 %	50 %	50 %	283458334
32970	NC_013715	GAG	2	6	1467539	1467544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458334
32971	NC_013715	CAG	2	6	1467597	1467602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458334
32972	NC_013715	CGG	2	6	1467659	1467664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458334
32973	NC_013715	AGC	2	6	1467724	1467729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458334
32974	NC_013715	GCA	2	6	1467770	1467775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458334
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32976	NC_013715	CTC	2	6	1467805	1467810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458334
32977	NC_013715	CTT	2	6	1467832	1467837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458334
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32979	NC_013715	CCGTA	2	10	1467927	1467936	20 %	20 %	20 %	40 %	283458334
32980	NC_013715	ACA	2	6	1467947	1467952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458334
32981	NC_013715	CGGG	2	8	1468014	1468021	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32982	NC_013715	GAAA	2	8	1468055	1468062	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32983	NC_013715	CAG	2	6	1468064	1468069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32984	NC_013715	CA	3	6	1468149	1468154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32985	NC_013715	CAT	2	6	1468198	1468203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32986	NC_013715	CGC	2	6	1468261	1468266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32987	NC_013715	AAAG	2	8	1468310	1468317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32988	NC_013715	ACG	2	6	1468438	1468443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32989	NC_013715	TAA	2	6	1468468	1468473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32990	NC_013715	GAA	2	6	1468519	1468524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458335
32991	NC_013715	GCG	2	6	1468538	1468543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458335
32992	NC_013715	CCT	2	6	1468591	1468596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458335
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