MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_013715	ATA	2	6	1380296	1380301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31003	NC_013715	AAGG	2	8	1380351	1380358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31004	NC_013715	CAA	2	6	1380379	1380384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31005	NC_013715	AAGG	2	8	1380424	1380431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31006	NC_013715	CG	3	6	1380454	1380459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31007	NC_013715	AAG	2	6	1380499	1380504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31008	NC_013715	AAGG	2	8	1380573	1380580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31009	NC_013715	CGC	3	9	1380602	1380610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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31011	NC_013715	CGG	2	6	1380681	1380686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31012	NC_013715	AAGG	2	8	1380718	1380725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31013	NC_013715	AAGG	2	8	1380789	1380796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31014	NC_013715	AAAG	2	8	1380844	1380851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_013715	AGGA	2	8	1380863	1380870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_013715	GTT	2	6	1380890	1380895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_013715	AAGG	2	8	1380934	1380941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_013715	CAG	2	6	1380956	1380961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31019	NC_013715	AAGG	2	8	1381007	1381014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_013715	CGGCC	2	10	1381037	1381046	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31021	NC_013715	AAGG	2	8	1381082	1381089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31022	NC_013715	TGG	2	6	1381098	1381103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31023	NC_013715	A	6	6	1381150	1381155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31024	NC_013715	CGC	2	6	1381169	1381174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31025	NC_013715	GACG	2	8	1381176	1381183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31026	NC_013715	AAG	3	9	1381223	1381231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31027	NC_013715	ATA	2	6	1381259	1381264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31028	NC_013715	CGCCT	2	10	1381271	1381280	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31029	NC_013715	GAAG	2	8	1381299	1381306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31030	NC_013715	AAGG	2	8	1381369	1381376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31031	NC_013715	GCT	3	9	1381409	1381417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31032	NC_013715	TCCC	2	8	1381432	1381439	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31033	NC_013715	AAGG	2	8	1381442	1381449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31034	NC_013715	AAGG	2	8	1381515	1381522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31035	NC_013715	CG	3	6	1381548	1381553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31036	NC_013715	AAGG	2	8	1381588	1381595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31037	NC_013715	AAGG	2	8	1381659	1381666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31038	NC_013715	CAGA	2	8	1381673	1381680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31039	NC_013715	GCC	2	6	1381693	1381698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31040	NC_013715	AAGG	2	8	1381733	1381740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_013715	GTA	2	6	1381770	1381775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31042	NC_013715	AAGG	2	8	1381809	1381816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31043	NC_013715	AAGG	2	8	1381884	1381891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31044	NC_013715	ACC	2	6	1381903	1381908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31047	NC_013715	CAT	2	6	1381984	1381989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31048	NC_013715	ATT	2	6	1382037	1382042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31049	NC_013715	GGT	2	6	1382050	1382055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31051	NC_013715	AAGG	2	8	1382098	1382105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31052	NC_013715	AAGG	2	8	1382170	1382177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31053	NC_013715	AAG	2	6	1382189	1382194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31054	NC_013715	AAGG	2	8	1382240	1382247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31055	NC_013715	GCC	2	6	1382285	1382290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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31057	NC_013715	AAGG	2	8	1382385	1382392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31058	NC_013715	GAA	2	6	1382521	1382526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31059	NC_013715	GCGA	2	8	1382532	1382539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31060	NC_013715	CA	3	6	1382575	1382580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31061	NC_013715	CCG	2	6	1382588	1382593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31062	NC_013715	AGAA	2	8	1382714	1382721	75 %	0 %	25 %	0 %	283458259
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31092	NC_013715	ATTT	2	8	1384281	1384288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_013715	AAT	2	6	1384314	1384319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31096	NC_013715	GGT	2	6	1384446	1384451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31097	NC_013715	ACA	2	6	1384490	1384495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31099	NC_013715	TCT	2	6	1384521	1384526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31100	NC_013715	CTG	2	6	1384557	1384562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31102	NC_013715	CAG	2	6	1384611	1384616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31103	NC_013715	GGC	2	6	1384628	1384633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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31108	NC_013715	TTTA	2	8	1385037	1385044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31109	NC_013715	TGA	2	6	1385045	1385050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31110	NC_013715	A	6	6	1385050	1385055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31111	NC_013715	ATGT	2	8	1385100	1385107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31112	NC_013715	GCG	2	6	1385161	1385166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31113	NC_013715	GGAT	2	8	1385186	1385193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31114	NC_013715	AGC	2	6	1385224	1385229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31478	NC_013715	CAG	2	6	1401003	1401008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458274
31479	NC_013715	CAC	2	6	1401045	1401050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458274
31480	NC_013715	AGT	2	6	1401053	1401058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458274
31481	NC_013715	CGGTA	2	10	1401071	1401080	20 %	20 %	40 %	20 %	283458274
31482	NC_013715	CCA	2	6	1401107	1401112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458274
31483	NC_013715	CGCC	2	8	1401170	1401177	0 %	0 %	25 %	75 %	283458274
31484	NC_013715	CAGC	2	8	1401179	1401186	25 %	0 %	25 %	50 %	283458274
31485	NC_013715	CCA	2	6	1401263	1401268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458274
31486	NC_013715	GCC	2	6	1401279	1401284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458274
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31488	NC_013715	TCC	2	6	1401373	1401378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458274
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31490	NC_013715	TGA	2	6	1401518	1401523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458275
31491	NC_013715	ACACC	2	10	1401534	1401543	40 %	0 %	0 %	60 %	283458275
31492	NC_013715	CAA	2	6	1401553	1401558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458275
31493	NC_013715	CAG	2	6	1401604	1401609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458275
31494	NC_013715	CGG	2	6	1401640	1401645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458275
31495	NC_013715	TGC	2	6	1401707	1401712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458275
31496	NC_013715	TCC	2	6	1401731	1401736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458275
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31498	NC_013715	CCA	3	9	1401819	1401827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458275
31499	NC_013715	GCAG	2	8	1401860	1401867	25 %	0 %	50 %	25 %	283458275
31500	NC_013715	CTC	2	6	1401937	1401942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458275

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