MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_013715	CGC	2	6	1332003	1332008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458230
30003	NC_013715	GATT	2	8	1332054	1332061	25 %	50 %	25 %	0 %	283458230
30004	NC_013715	CAC	2	6	1332069	1332074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458230
30005	NC_013715	GAC	2	6	1332114	1332119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458230
30006	NC_013715	AAG	2	6	1332145	1332150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458230
30007	NC_013715	ATC	2	6	1332251	1332256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458230
30008	NC_013715	TCACCT	2	12	1332299	1332310	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	283458230
30009	NC_013715	AAG	2	6	1332319	1332324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458230
30010	NC_013715	GCC	2	6	1332337	1332342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458230
30011	NC_013715	GTG	2	6	1332361	1332366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458230
30012	NC_013715	CTA	2	6	1332372	1332377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458230
30013	NC_013715	CGG	2	6	1332380	1332385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458230
30014	NC_013715	GCGAGC	2	12	1332386	1332397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	283458230
30015	NC_013715	GAG	2	6	1332406	1332411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458230
30016	NC_013715	TAC	2	6	1332477	1332482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458230
30017	NC_013715	CGG	2	6	1332500	1332505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458230
30018	NC_013715	TC	3	6	1332555	1332560	0 %	50 %	0 %	50 %	283458230
30019	NC_013715	AGC	2	6	1332563	1332568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458230
30020	NC_013715	TTG	2	6	1332569	1332574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458230
30021	NC_013715	TGG	2	6	1332635	1332640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458230
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30024	NC_013715	GAG	2	6	1332811	1332816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458230
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30041	NC_013715	CAG	2	6	1333492	1333497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458230
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30051	NC_013715	CGG	2	6	1333845	1333850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458230
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30053	NC_013715	T	6	6	1334042	1334047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30054	NC_013715	CTTT	2	8	1334051	1334058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30055	NC_013715	T	6	6	1334056	1334061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30056	NC_013715	AC	3	6	1334167	1334172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30057	NC_013715	TGA	2	6	1334188	1334193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30059	NC_013715	GGCG	2	8	1334361	1334368	0 %	0 %	75 %	25 %	283458231
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30082	NC_013715	CTGG	2	8	1335742	1335749	0 %	25 %	50 %	25 %	283458231
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30089	NC_013715	AGC	2	6	1336019	1336024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458231
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30097	NC_013715	GC	3	6	1336362	1336367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30098	NC_013715	G	6	6	1336388	1336393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30099	NC_013715	GC	3	6	1336498	1336503	0 %	0 %	50 %	50 %	283458232
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30117	NC_013715	CGG	2	6	1337084	1337089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458232
30118	NC_013715	TGA	2	6	1337124	1337129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458232
30119	NC_013715	ATG	2	6	1337144	1337149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458232
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30220	NC_013715	GCA	2	6	1343420	1343425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458235
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30227	NC_013715	CCG	2	6	1343864	1343869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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30229	NC_013715	TCT	2	6	1343938	1343943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458236
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30233	NC_013715	TGC	2	6	1344054	1344059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458236
30234	NC_013715	ACG	2	6	1344137	1344142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458236
30235	NC_013715	CCCT	2	8	1344151	1344158	0 %	25 %	0 %	75 %	283458236
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30237	NC_013715	TGC	2	6	1344299	1344304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458236
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30349	NC_013715	TACGA	2	10	1349822	1349831	40 %	20 %	20 %	20 %	283458240
30350	NC_013715	TGA	2	6	1349853	1349858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458240
30351	NC_013715	AGA	2	6	1349986	1349991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458240
30352	NC_013715	TTG	2	6	1350015	1350020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458240
30353	NC_013715	AGG	2	6	1350030	1350035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458240
30354	NC_013715	TTC	2	6	1350139	1350144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30355	NC_013715	ATG	2	6	1350198	1350203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30356	NC_013715	ACTC	2	8	1350210	1350217	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30357	NC_013715	CTT	2	6	1350233	1350238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458241
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30376	NC_013715	GAC	2	6	1351190	1351195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30377	NC_013715	ATG	2	6	1351225	1351230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30378	NC_013715	ACTC	2	8	1351240	1351247	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30379	NC_013715	TTG	2	6	1351256	1351261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458242
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30383	NC_013715	GCTG	2	8	1351354	1351361	0 %	25 %	50 %	25 %	283458242
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30422	NC_013715	GGT	2	6	1353223	1353228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30423	NC_013715	AT	3	6	1353250	1353255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30424	NC_013715	GT	3	6	1353303	1353308	0 %	50 %	50 %	0 %	283458244
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30444	NC_013715	TTTC	2	8	1354152	1354159	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30445	NC_013715	AGC	2	6	1354175	1354180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30447	NC_013715	TCCG	2	8	1354231	1354238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30448	NC_013715	TTC	2	6	1354328	1354333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30451	NC_013715	AAGC	2	8	1354501	1354508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30452	NC_013715	ACT	2	6	1354513	1354518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30453	NC_013715	AAG	2	6	1354549	1354554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30454	NC_013715	C	6	6	1354666	1354671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30455	NC_013715	GCC	2	6	1354851	1354856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30456	NC_013715	GCG	2	6	1354864	1354869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30457	NC_013715	CCAAGC	2	12	1354881	1354892	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30458	NC_013715	TAA	2	6	1354919	1354924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30459	NC_013715	TAA	2	6	1354985	1354990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30460	NC_013715	TTTC	2	8	1355047	1355054	0 %	75 %	0 %	25 %	283458245
30461	NC_013715	GCT	3	9	1355071	1355079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458245
30462	NC_013715	TCCG	2	8	1355126	1355133	0 %	25 %	25 %	50 %	283458245
30463	NC_013715	CTT	2	6	1355147	1355152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458245
30464	NC_013715	AGCGCT	2	12	1355176	1355187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283458245
30465	NC_013715	ACT	2	6	1355224	1355229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458245
30466	NC_013715	AAG	2	6	1355236	1355241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458245
30467	NC_013715	GAA	2	6	1355277	1355282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458245
30468	NC_013715	GAA	2	6	1355310	1355315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458245
30469	NC_013715	AAG	2	6	1355449	1355454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458245
30470	NC_013715	GCA	2	6	1355486	1355491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458245
30471	NC_013715	ATC	2	6	1355500	1355505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458245
30472	NC_013715	GAA	2	6	1355577	1355582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458245
30473	NC_013715	CAT	2	6	1355622	1355627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458245
30474	NC_013715	CAAC	2	8	1355705	1355712	50 %	0 %	0 %	50 %	283458245
30475	NC_013715	CGG	2	6	1355717	1355722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458245
30476	NC_013715	TGA	2	6	1355754	1355759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458245
30477	NC_013715	AGC	2	6	1355788	1355793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458245
30478	NC_013715	CGC	2	6	1356016	1356021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458246
30479	NC_013715	CGCT	2	8	1356050	1356057	0 %	25 %	25 %	50 %	283458246
30480	NC_013715	CTGC	2	8	1356065	1356072	0 %	25 %	25 %	50 %	283458246
30481	NC_013715	GGA	2	6	1356093	1356098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458246
30482	NC_013715	CAC	2	6	1356186	1356191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458246
30483	NC_013715	GAA	2	6	1356192	1356197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458246
30484	NC_013715	TCC	2	6	1356222	1356227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458246
30485	NC_013715	GCG	2	6	1356265	1356270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458246
30486	NC_013715	AGA	2	6	1356362	1356367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458246
30487	NC_013715	CGC	2	6	1356425	1356430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458246
30488	NC_013715	GCTGA	2	10	1356436	1356445	20 %	20 %	40 %	20 %	283458246
30489	NC_013715	GCC	2	6	1356514	1356519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458246
30490	NC_013715	GGA	2	6	1356537	1356542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458246
30491	NC_013715	ATG	2	6	1356584	1356589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458246
30492	NC_013715	CTC	2	6	1356672	1356677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458246
30493	NC_013715	GACACC	2	12	1356723	1356734	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30494	NC_013715	AACA	2	8	1356745	1356752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30495	NC_013715	GTA	2	6	1356781	1356786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30496	NC_013715	CGC	2	6	1356906	1356911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458247
30497	NC_013715	CCA	3	9	1356923	1356931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458247
30498	NC_013715	CCT	2	6	1356941	1356946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458247
30499	NC_013715	AAC	2	6	1357001	1357006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458247
30500	NC_013715	GAA	2	6	1357077	1357082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458247

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