MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28233	NC_013715	GAAG	2	8	1254752	1254759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28234	NC_013715	CGC	2	6	1254770	1254775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28235	NC_013715	GGT	2	6	1254789	1254794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28236	NC_013715	GCG	2	6	1254796	1254801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28237	NC_013715	CCG	2	6	1254925	1254930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28238	NC_013715	CGG	2	6	1254934	1254939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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28348	NC_013715	CTGT	2	8	1259720	1259727	0 %	50 %	25 %	25 %	283458171
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28351	NC_013715	AAT	2	6	1259898	1259903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458171
28352	NC_013715	CGG	2	6	1259927	1259932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458171
28353	NC_013715	CCG	2	6	1260007	1260012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458171
28354	NC_013715	AGC	2	6	1260013	1260018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458171
28355	NC_013715	GC	3	6	1260017	1260022	0 %	0 %	50 %	50 %	283458171
28356	NC_013715	GGT	2	6	1260092	1260097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458171
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28358	NC_013715	GAG	2	6	1260172	1260177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458171
28359	NC_013715	AGGA	2	8	1260220	1260227	50 %	0 %	50 %	0 %	283458171
28360	NC_013715	TGA	2	6	1260296	1260301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458171
28361	NC_013715	GCG	2	6	1260381	1260386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458171
28362	NC_013715	GAA	2	6	1260519	1260524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458171
28363	NC_013715	CGA	2	6	1260554	1260559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458171
28364	NC_013715	CCA	2	6	1260623	1260628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458171
28365	NC_013715	GTT	2	6	1260770	1260775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458171
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28367	NC_013715	T	7	7	1260815	1260821	0 %	100 %	0 %	0 %	283458171
28368	NC_013715	TTC	2	6	1260861	1260866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458171
28369	NC_013715	CTT	2	6	1260875	1260880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458171
28370	NC_013715	CG	3	6	1260881	1260886	0 %	0 %	50 %	50 %	283458171
28371	NC_013715	TC	3	6	1260933	1260938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28372	NC_013715	GTC	2	6	1261004	1261009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28373	NC_013715	CGG	2	6	1261067	1261072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28374	NC_013715	CTACC	2	10	1261199	1261208	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
28375	NC_013715	GTT	2	6	1261260	1261265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28376	NC_013715	CGCC	2	8	1261289	1261296	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28377	NC_013715	TTTC	2	8	1261337	1261344	0 %	75 %	0 %	25 %	283458172
28378	NC_013715	CCG	2	6	1261407	1261412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458172
28379	NC_013715	GCC	2	6	1261499	1261504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458172
28380	NC_013715	GTG	2	6	1261514	1261519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458172
28381	NC_013715	CTA	2	6	1261600	1261605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458172
28382	NC_013715	CTG	2	6	1261726	1261731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458172
28383	NC_013715	CTG	2	6	1261856	1261861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458172
28384	NC_013715	CTG	2	6	1261883	1261888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458172
28385	NC_013715	AGG	2	6	1261923	1261928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458172
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28387	NC_013715	CTA	2	6	1261999	1262004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458172
28388	NC_013715	CCA	2	6	1262007	1262012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458172
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28391	NC_013715	GAAG	2	8	1262137	1262144	50 %	0 %	50 %	0 %	283458172
28392	NC_013715	GTGC	2	8	1262219	1262226	0 %	25 %	50 %	25 %	283458172
28393	NC_013715	CAC	2	6	1262240	1262245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458172
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28397	NC_013715	AGG	2	6	1262292	1262297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458172
28398	NC_013715	CCGTA	2	10	1262356	1262365	20 %	20 %	20 %	40 %	283458172
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28403	NC_013715	CTG	2	6	1262522	1262527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458172
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28411	NC_013715	CAT	2	6	1262752	1262757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458172
28412	NC_013715	GC	3	6	1262780	1262785	0 %	0 %	50 %	50 %	283458172
28413	NC_013715	CGC	3	9	1262783	1262791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458172
28414	NC_013715	GCT	2	6	1262794	1262799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458172
28415	NC_013715	GCT	2	6	1262827	1262832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458172
28416	NC_013715	CGG	2	6	1262836	1262841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458172
28417	NC_013715	CGCTG	2	10	1262950	1262959	0 %	20 %	40 %	40 %	283458172
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28422	NC_013715	CGA	2	6	1263388	1263393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458172
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28430	NC_013715	GC	3	6	1263556	1263561	0 %	0 %	50 %	50 %	283458172
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28433	NC_013715	GAC	2	6	1263689	1263694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458172
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28435	NC_013715	CG	3	6	1263733	1263738	0 %	0 %	50 %	50 %	283458172
28436	NC_013715	CTCGC	2	10	1263739	1263748	0 %	20 %	20 %	60 %	283458172
28437	NC_013715	CCG	2	6	1263771	1263776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458172
28438	NC_013715	CAG	2	6	1263800	1263805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458172
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28440	NC_013715	TATC	2	8	1264000	1264007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28441	NC_013715	AAG	2	6	1264019	1264024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458173
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28443	NC_013715	GTC	2	6	1264078	1264083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458173
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28445	NC_013715	CT	3	6	1264169	1264174	0 %	50 %	0 %	50 %	283458173
28446	NC_013715	GACCA	2	10	1264189	1264198	40 %	0 %	20 %	40 %	283458173
28447	NC_013715	GGC	2	6	1264285	1264290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458173
28448	NC_013715	GGC	2	6	1264324	1264329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458173
28449	NC_013715	TTC	2	6	1264364	1264369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458173
28450	NC_013715	CAT	2	6	1264479	1264484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458173
28451	NC_013715	TGC	2	6	1264511	1264516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458173
28452	NC_013715	CCA	2	6	1264544	1264549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458173
28453	NC_013715	GCC	2	6	1264619	1264624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458173
28454	NC_013715	TAC	2	6	1264711	1264716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458173
28455	NC_013715	TGGC	2	8	1264826	1264833	0 %	25 %	50 %	25 %	283458173
28456	NC_013715	ACT	2	6	1264871	1264876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458173
28457	NC_013715	ACC	2	6	1264907	1264912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458173
28458	NC_013715	TCCCCC	2	12	1265050	1265061	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	283458173
28459	NC_013715	CTG	2	6	1265078	1265083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458173
28460	NC_013715	GGC	2	6	1265091	1265096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458173
28461	NC_013715	TAC	2	6	1265164	1265169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458173
28462	NC_013715	GAG	2	6	1265170	1265175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458173
28463	NC_013715	GCTG	2	8	1265193	1265200	0 %	25 %	50 %	25 %	283458173
28464	NC_013715	CTG	2	6	1265212	1265217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458173
28465	NC_013715	GAA	2	6	1265223	1265228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458173
28466	NC_013715	GCC	2	6	1265237	1265242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458173
28467	NC_013715	GTG	2	6	1265281	1265286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458173
28468	NC_013715	GCG	2	6	1265290	1265295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458173
28469	NC_013715	CGCT	2	8	1265340	1265347	0 %	25 %	25 %	50 %	283458173
28470	NC_013715	CAC	3	9	1265383	1265391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458173
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28472	NC_013715	GCTG	2	8	1265442	1265449	0 %	25 %	50 %	25 %	283458173
28473	NC_013715	TTC	2	6	1265467	1265472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28474	NC_013715	AT	3	6	1265508	1265513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28475	NC_013715	CTA	2	6	1265611	1265616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458174
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28479	NC_013715	CTG	2	6	1265743	1265748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458174
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28481	NC_013715	CGG	3	9	1265775	1265783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458174
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28493	NC_013715	TGA	2	6	1266441	1266446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458174
28494	NC_013715	TGC	2	6	1266448	1266453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458174
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28497	NC_013715	ATA	2	6	1266551	1266556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458174
28498	NC_013715	CTT	2	6	1266591	1266596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458174
28499	NC_013715	GGC	2	6	1266625	1266630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458174
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