MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_013715	CAT	2	6	1221069	1221074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458147
27502	NC_013715	GCC	2	6	1221091	1221096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458147
27503	NC_013715	GCA	2	6	1221128	1221133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27504	NC_013715	TCT	2	6	1221230	1221235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458147
27505	NC_013715	CAT	2	6	1221255	1221260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458147
27506	NC_013715	TCT	2	6	1221318	1221323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458147
27507	NC_013715	CAA	2	6	1221325	1221330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458147
27508	NC_013715	GTAA	2	8	1221346	1221353	50 %	25 %	25 %	0 %	283458147
27509	NC_013715	TCA	2	6	1221374	1221379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458147
27510	NC_013715	GCTC	2	8	1221387	1221394	0 %	25 %	25 %	50 %	283458147
27511	NC_013715	CTGG	2	8	1221412	1221419	0 %	25 %	50 %	25 %	283458147
27512	NC_013715	CGC	2	6	1221430	1221435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458147
27513	NC_013715	AAAG	2	8	1221445	1221452	75 %	0 %	25 %	0 %	283458147
27514	NC_013715	TC	3	6	1221453	1221458	0 %	50 %	0 %	50 %	283458147
27515	NC_013715	GAA	2	6	1221603	1221608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458147
27516	NC_013715	TAA	2	6	1221687	1221692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458147
27517	NC_013715	AGC	2	6	1221706	1221711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27518	NC_013715	ACG	2	6	1221795	1221800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27519	NC_013715	GCT	2	6	1221828	1221833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27520	NC_013715	CTG	2	6	1221837	1221842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27521	NC_013715	AAGC	2	8	1221843	1221850	50 %	0 %	25 %	25 %	283458147
27522	NC_013715	AGA	2	6	1221859	1221864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458147
27523	NC_013715	TCA	2	6	1221909	1221914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458147
27524	NC_013715	AAC	2	6	1221931	1221936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458147
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27526	NC_013715	GC	3	6	1221975	1221980	0 %	0 %	50 %	50 %	283458147
27527	NC_013715	GC	3	6	1222010	1222015	0 %	0 %	50 %	50 %	283458147
27528	NC_013715	CGA	2	6	1222122	1222127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27529	NC_013715	TCG	2	6	1222139	1222144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27530	NC_013715	AGT	2	6	1222276	1222281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458147
27531	NC_013715	GGTC	2	8	1222296	1222303	0 %	25 %	50 %	25 %	283458147
27532	NC_013715	TGC	2	6	1222316	1222321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27533	NC_013715	GCT	2	6	1222346	1222351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27534	NC_013715	CACC	2	8	1222377	1222384	25 %	0 %	0 %	75 %	283458147
27535	NC_013715	ACC	2	6	1222391	1222396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458147
27536	NC_013715	CAT	2	6	1222479	1222484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458147
27537	NC_013715	TCA	2	6	1222574	1222579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458147
27538	NC_013715	CGG	2	6	1222584	1222589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458147
27539	NC_013715	GGC	2	6	1222905	1222910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458147
27540	NC_013715	TCT	2	6	1223052	1223057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458147
27541	NC_013715	CGG	2	6	1223159	1223164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458147
27542	NC_013715	CAG	2	6	1223199	1223204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27543	NC_013715	GC	3	6	1223218	1223223	0 %	0 %	50 %	50 %	283458147
27544	NC_013715	TGA	2	6	1223251	1223256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458147
27545	NC_013715	GCA	2	6	1223297	1223302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27546	NC_013715	ACA	2	6	1223330	1223335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458147
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27548	NC_013715	AGT	2	6	1223526	1223531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458147
27549	NC_013715	GAT	2	6	1223577	1223582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458147
27550	NC_013715	CAG	2	6	1223607	1223612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27551	NC_013715	TTC	2	6	1223653	1223658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458147
27552	NC_013715	AGC	2	6	1223908	1223913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27553	NC_013715	TGT	2	6	1223922	1223927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458147
27554	NC_013715	ATC	2	6	1224094	1224099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458147
27555	NC_013715	GCA	2	6	1224212	1224217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27556	NC_013715	GCA	2	6	1224290	1224295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27557	NC_013715	GACGC	2	10	1224356	1224365	20 %	0 %	40 %	40 %	283458147
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27560	NC_013715	GCA	2	6	1224470	1224475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
27561	NC_013715	GGA	2	6	1224505	1224510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458147
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27564	NC_013715	GGGCG	2	10	1224599	1224608	0 %	0 %	80 %	20 %	283458147
27565	NC_013715	GAG	2	6	1224648	1224653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458147
27566	NC_013715	GCA	2	6	1224797	1224802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
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27569	NC_013715	CAG	2	6	1224922	1224927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458147
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27571	NC_013715	TG	3	6	1225174	1225179	0 %	50 %	50 %	0 %	283458147
27572	NC_013715	CA	3	6	1225204	1225209	50 %	0 %	0 %	50 %	283458147
27573	NC_013715	AC	3	6	1225222	1225227	50 %	0 %	0 %	50 %	283458147
27574	NC_013715	AGCC	2	8	1225273	1225280	25 %	0 %	25 %	50 %	283458147
27575	NC_013715	CGG	2	6	1225345	1225350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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27585	NC_013715	CGA	2	6	1226102	1226107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458148
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27589	NC_013715	CTCCC	2	10	1226238	1226247	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
27590	NC_013715	TG	3	6	1226303	1226308	0 %	50 %	50 %	0 %	283458149
27591	NC_013715	CG	3	6	1226346	1226351	0 %	0 %	50 %	50 %	283458149
27592	NC_013715	TTCCA	2	10	1226432	1226441	20 %	40 %	0 %	40 %	283458149
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27599	NC_013715	CGC	2	6	1226674	1226679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458149
27600	NC_013715	GGGC	2	8	1226709	1226716	0 %	0 %	75 %	25 %	283458149
27601	NC_013715	T	6	6	1226838	1226843	0 %	100 %	0 %	0 %	283458149
27602	NC_013715	CCT	2	6	1226844	1226849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458149
27603	NC_013715	GCT	2	6	1226884	1226889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27604	NC_013715	CCGT	2	8	1226961	1226968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27605	NC_013715	GTGC	2	8	1226987	1226994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27606	NC_013715	CTC	2	6	1227061	1227066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27607	NC_013715	AGC	2	6	1227143	1227148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27608	NC_013715	CCG	2	6	1227170	1227175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27609	NC_013715	CAG	2	6	1227198	1227203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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27611	NC_013715	CCA	3	9	1227381	1227389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458150
27612	NC_013715	ATG	2	6	1227390	1227395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458150
27613	NC_013715	CGA	2	6	1227412	1227417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458150
27614	NC_013715	CG	3	6	1227431	1227436	0 %	0 %	50 %	50 %	283458150
27615	NC_013715	AGA	2	6	1227487	1227492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458150
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