MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_013715	GCG	2	6	1155306	1155311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458095
26003	NC_013715	TGGT	2	8	1155332	1155339	0 %	50 %	50 %	0 %	283458095
26004	NC_013715	GC	3	6	1155391	1155396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26005	NC_013715	GT	3	6	1155429	1155434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26006	NC_013715	TGG	2	6	1155474	1155479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26007	NC_013715	CAACA	2	10	1155498	1155507	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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26010	NC_013715	ACC	2	6	1155770	1155775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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26014	NC_013715	GCC	2	6	1156140	1156145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26015	NC_013715	CTG	2	6	1156157	1156162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26018	NC_013715	GCG	2	6	1156220	1156225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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26121	NC_013715	CGGT	2	8	1160448	1160455	0 %	25 %	50 %	25 %	283458099
26122	NC_013715	GGA	2	6	1160476	1160481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458099
26123	NC_013715	GCG	2	6	1160487	1160492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458099
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26126	NC_013715	GGTC	2	8	1160674	1160681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26127	NC_013715	TCG	3	9	1160725	1160733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458100
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26132	NC_013715	G	6	6	1160801	1160806	0 %	0 %	100 %	0 %	283458100
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26143	NC_013715	AGA	2	6	1161218	1161223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26211	NC_013715	CACC	2	8	1164393	1164400	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26212	NC_013715	CA	3	6	1164519	1164524	50 %	0 %	0 %	50 %	283458104
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26229	NC_013715	GAG	2	6	1165740	1165745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26230	NC_013715	ACT	2	6	1165755	1165760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26231	NC_013715	T	6	6	1165770	1165775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26232	NC_013715	GAA	2	6	1165803	1165808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26233	NC_013715	G	6	6	1165830	1165835	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26234	NC_013715	CA	3	6	1166011	1166016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26235	NC_013715	GGTT	3	12	1166022	1166033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26236	NC_013715	TCT	2	6	1166051	1166056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26237	NC_013715	AAT	2	6	1166134	1166139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458105
26238	NC_013715	GAA	2	6	1166155	1166160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458105
26239	NC_013715	TCA	2	6	1166180	1166185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458105
26240	NC_013715	ACG	2	6	1166198	1166203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458105
26241	NC_013715	CAC	2	6	1166259	1166264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458105
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26243	NC_013715	GTC	2	6	1166371	1166376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458105
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26250	NC_013715	TCT	2	6	1166684	1166689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458105
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26300	NC_013715	GA	3	6	1168891	1168896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26301	NC_013715	GGT	2	6	1168942	1168947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26302	NC_013715	GCG	2	6	1168977	1168982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26303	NC_013715	GA	3	6	1169152	1169157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26304	NC_013715	CGCT	2	8	1169172	1169179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26305	NC_013715	GAT	2	6	1169252	1169257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458106
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26308	NC_013715	GGA	2	6	1169419	1169424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458106
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26313	NC_013715	CTG	2	6	1169615	1169620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458106
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26323	NC_013715	TCC	2	6	1170125	1170130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458106
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26331	NC_013715	ACG	2	6	1170396	1170401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458106
26332	NC_013715	GAGGAA	2	12	1170425	1170436	50 %	0 %	50 %	0 %	283458106
26333	NC_013715	GGC	2	6	1170487	1170492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26334	NC_013715	CCA	2	6	1170496	1170501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26335	NC_013715	GCC	2	6	1170515	1170520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26336	NC_013715	TGAC	2	8	1170719	1170726	25 %	25 %	25 %	25 %	283458107
26337	NC_013715	TCAG	2	8	1170858	1170865	25 %	25 %	25 %	25 %	283458107
26338	NC_013715	AGA	2	6	1170875	1170880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458107
26339	NC_013715	AAG	2	6	1170886	1170891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458107
26340	NC_013715	GC	3	6	1170904	1170909	0 %	0 %	50 %	50 %	283458107
26341	NC_013715	CCA	2	6	1171101	1171106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458107
26342	NC_013715	GA	3	6	1171118	1171123	50 %	0 %	50 %	0 %	283458107
26343	NC_013715	CCA	2	6	1171171	1171176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458107
26344	NC_013715	CCG	2	6	1171209	1171214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458107
26345	NC_013715	CCGTA	2	10	1171240	1171249	20 %	20 %	20 %	40 %	283458107
26346	NC_013715	GAT	2	6	1171286	1171291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458107
26347	NC_013715	AC	3	6	1171294	1171299	50 %	0 %	0 %	50 %	283458107
26348	NC_013715	ATG	2	6	1171329	1171334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458107
26349	NC_013715	AGC	2	6	1171395	1171400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458107
26350	NC_013715	TAA	2	6	1171423	1171428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458107
26351	NC_013715	GCA	3	9	1171503	1171511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458107
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26472	NC_013715	GCGCGA	2	12	1176539	1176550	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	283458114
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26476	NC_013715	GCTG	2	8	1176773	1176780	0 %	25 %	50 %	25 %	283458115
26477	NC_013715	TCG	2	6	1176789	1176794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458115
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26495	NC_013715	AGA	2	6	1177587	1177592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26496	NC_013715	GCGG	2	8	1177673	1177680	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26497	NC_013715	TCT	2	6	1177686	1177691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26499	NC_013715	ATGT	2	8	1177813	1177820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26500	NC_013715	CA	3	6	1177848	1177853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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