MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_013715	CGGGTA	2	12	1067461	1067472	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283458015
24003	NC_013715	ACC	2	6	1067475	1067480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458015
24004	NC_013715	GC	5	10	1067496	1067505	0 %	0 %	50 %	50 %	283458015
24005	NC_013715	GC	3	6	1067558	1067563	0 %	0 %	50 %	50 %	283458015
24006	NC_013715	GTACG	2	10	1067597	1067606	20 %	20 %	40 %	20 %	283458015
24007	NC_013715	CGA	2	6	1067624	1067629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458015
24008	NC_013715	CAG	2	6	1067652	1067657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458015
24009	NC_013715	TGG	2	6	1067698	1067703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458015
24010	NC_013715	ACG	2	6	1067709	1067714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458015
24011	NC_013715	CGT	2	6	1067722	1067727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458015
24012	NC_013715	ATT	2	6	1067733	1067738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283458015
24013	NC_013715	CGC	2	6	1067740	1067745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458015
24014	NC_013715	CGCT	2	8	1067754	1067761	0 %	25 %	25 %	50 %	283458015
24015	NC_013715	GCT	3	9	1067759	1067767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458015
24016	NC_013715	AGC	2	6	1067800	1067805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458015
24017	NC_013715	CG	3	6	1067830	1067835	0 %	0 %	50 %	50 %	283458015
24018	NC_013715	GCG	2	6	1067847	1067852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458015
24019	NC_013715	TGA	2	6	1067858	1067863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458015
24020	NC_013715	GC	4	8	1067868	1067875	0 %	0 %	50 %	50 %	283458015
24021	NC_013715	CGG	2	6	1067884	1067889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458015
24022	NC_013715	CGC	2	6	1067907	1067912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458015
24023	NC_013715	GGC	3	9	1067930	1067938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458015
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24033	NC_013715	TAT	2	6	1068365	1068370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283458015
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24035	NC_013715	CG	3	6	1068438	1068443	0 %	0 %	50 %	50 %	283458015
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24042	NC_013715	GTA	2	6	1068833	1068838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24043	NC_013715	GTA	2	6	1068844	1068849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24044	NC_013715	TCTAG	2	10	1068937	1068946	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24045	NC_013715	AAT	2	6	1069077	1069082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24046	NC_013715	CCG	2	6	1069273	1069278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24054	NC_013715	ACA	2	6	1069589	1069594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458017
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24062	NC_013715	CG	3	6	1070096	1070101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24063	NC_013715	TA	3	6	1070113	1070118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24067	NC_013715	CAT	2	6	1070307	1070312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24093	NC_013715	GGCA	2	8	1071339	1071346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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24103	NC_013715	AAGG	2	8	1071950	1071957	50 %	0 %	50 %	0 %	283458020
24104	NC_013715	CGG	2	6	1071963	1071968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458020
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24108	NC_013715	GACC	2	8	1072147	1072154	25 %	0 %	25 %	50 %	283458020
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24114	NC_013715	GCTGAT	2	12	1072285	1072296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283458020
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24117	NC_013715	GAC	2	6	1072463	1072468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458020
24118	NC_013715	GAG	2	6	1072499	1072504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458020
24119	NC_013715	TGC	2	6	1072558	1072563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458020
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24125	NC_013715	GC	3	6	1072849	1072854	0 %	0 %	50 %	50 %	283458020
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24188	NC_013715	GAAG	2	8	1075379	1075386	50 %	0 %	50 %	0 %	283458022
24189	NC_013715	GCG	2	6	1075396	1075401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458022
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24197	NC_013715	TAC	3	9	1075716	1075724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458022
24198	NC_013715	GTG	2	6	1075811	1075816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458022
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24202	NC_013715	TATC	2	8	1076117	1076124	25 %	50 %	0 %	25 %	283458023
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24210	NC_013715	TGGG	2	8	1076559	1076566	0 %	25 %	75 %	0 %	283458023
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24220	NC_013715	CTG	2	6	1076996	1077001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458023
24221	NC_013715	GCG	2	6	1077023	1077028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458023
24222	NC_013715	A	6	6	1077061	1077066	100 %	0 %	0 %	0 %	283458023
24223	NC_013715	GAA	2	6	1077120	1077125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24224	NC_013715	TTA	2	6	1077126	1077131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24225	NC_013715	TTCC	2	8	1077132	1077139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24226	NC_013715	CTGCG	2	10	1077142	1077151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24227	NC_013715	TCG	2	6	1077227	1077232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458024
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24229	NC_013715	CCG	2	6	1077251	1077256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458024
24230	NC_013715	TCG	2	6	1077297	1077302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458024
24231	NC_013715	GAG	2	6	1077340	1077345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458024
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24233	NC_013715	TGA	2	6	1077446	1077451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458024
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24336	NC_013715	TGCT	2	8	1082259	1082266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24337	NC_013715	CCG	2	6	1082308	1082313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24338	NC_013715	CGG	2	6	1082334	1082339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24339	NC_013715	TGGT	2	8	1082365	1082372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24340	NC_013715	GGGTA	2	10	1082456	1082465	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24341	NC_013715	GGC	2	6	1082466	1082471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24342	NC_013715	GCG	2	6	1082520	1082525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24343	NC_013715	GT	3	6	1082754	1082759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24344	NC_013715	AT	3	6	1082769	1082774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24345	NC_013715	TGT	2	6	1082820	1082825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24346	NC_013715	CA	3	6	1082855	1082860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24347	NC_013715	ATG	2	6	1082878	1082883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24348	NC_013715	CT	3	6	1082917	1082922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24349	NC_013715	AAT	2	6	1082928	1082933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24350	NC_013715	CGG	2	6	1082955	1082960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24351	NC_013715	ACTCCC	2	12	1083034	1083045	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24469	NC_013715	GGC	2	6	1088332	1088337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458033
24470	NC_013715	CACCCA	2	12	1088389	1088400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24471	NC_013715	CCG	2	6	1088429	1088434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458034
24472	NC_013715	GAA	2	6	1088509	1088514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458034
24473	NC_013715	TGAC	2	8	1088520	1088527	25 %	25 %	25 %	25 %	283458034
24474	NC_013715	CG	3	6	1088558	1088563	0 %	0 %	50 %	50 %	283458034
24475	NC_013715	GGA	2	6	1088575	1088580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458034
24476	NC_013715	CGGCTA	2	12	1088596	1088607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283458034
24477	NC_013715	GACC	2	8	1088677	1088684	25 %	0 %	25 %	50 %	283458034
24478	NC_013715	CCT	2	6	1088685	1088690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458034
24479	NC_013715	ACC	2	6	1088747	1088752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458034
24480	NC_013715	GCA	2	6	1088801	1088806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458034
24481	NC_013715	CGA	2	6	1088842	1088847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458034
24482	NC_013715	TCG	2	6	1088868	1088873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458034
24483	NC_013715	CGC	2	6	1088906	1088911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458034
24484	NC_013715	TGCG	2	8	1088931	1088938	0 %	25 %	50 %	25 %	283458034
24485	NC_013715	CTG	2	6	1088981	1088986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458034
24486	NC_013715	GAG	2	6	1088987	1088992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458034
24487	NC_013715	GC	3	6	1088995	1089000	0 %	0 %	50 %	50 %	283458034
24488	NC_013715	TGGC	2	8	1089012	1089019	0 %	25 %	50 %	25 %	283458034
24489	NC_013715	TCGGTT	2	12	1089035	1089046	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	283458034
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24492	NC_013715	TTC	2	6	1089236	1089241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458034
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24494	NC_013715	TGC	2	6	1089300	1089305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458034
24495	NC_013715	TTC	2	6	1089320	1089325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458034
24496	NC_013715	GCT	2	6	1089346	1089351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458034
24497	NC_013715	ACC	2	6	1089428	1089433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458034
24498	NC_013715	GGTCA	2	10	1089521	1089530	20 %	20 %	40 %	20 %	283458034
24499	NC_013715	ACC	2	6	1089609	1089614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458034
24500	NC_013715	GCT	2	6	1089620	1089625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458034

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