MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_013715	GAC	2	6	668552	668557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15003	NC_013715	GCT	2	6	668561	668566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15004	NC_013715	GCC	2	6	668594	668599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15005	NC_013715	GGA	2	6	668635	668640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457707
15006	NC_013715	TCC	2	6	668642	668647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457707
15007	NC_013715	GCC	2	6	668733	668738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15008	NC_013715	GCG	2	6	668750	668755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
15009	NC_013715	TGC	2	6	668853	668858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15010	NC_013715	CG	3	6	668906	668911	0 %	0 %	50 %	50 %	283457707
15011	NC_013715	GCC	3	9	668936	668944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15012	NC_013715	GAT	2	6	668974	668979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457707
15013	NC_013715	GGA	2	6	669007	669012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457707
15014	NC_013715	GC	3	6	669026	669031	0 %	0 %	50 %	50 %	283457707
15015	NC_013715	CTG	2	6	669038	669043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15016	NC_013715	GCG	2	6	669051	669056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
15017	NC_013715	GAT	2	6	669098	669103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457707
15018	NC_013715	GAG	2	6	669104	669109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457707
15019	NC_013715	TGA	2	6	669159	669164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457707
15020	NC_013715	CGC	2	6	669172	669177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15021	NC_013715	CGG	2	6	669232	669237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
15022	NC_013715	GTG	2	6	669294	669299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457707
15023	NC_013715	CGG	2	6	669330	669335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
15024	NC_013715	CGC	2	6	669400	669405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15025	NC_013715	GGA	2	6	669421	669426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457707
15026	NC_013715	CCG	2	6	669427	669432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15027	NC_013715	CTG	2	6	669467	669472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15028	NC_013715	CGC	2	6	669499	669504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15029	NC_013715	GAG	2	6	669536	669541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457707
15030	NC_013715	GAG	2	6	669614	669619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457707
15031	NC_013715	GCG	2	6	669638	669643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
15032	NC_013715	TGG	2	6	669651	669656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457707
15033	NC_013715	CCG	2	6	669687	669692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15034	NC_013715	CGC	2	6	669725	669730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15035	NC_013715	ACGGT	2	10	669789	669798	20 %	20 %	40 %	20 %	283457707
15036	NC_013715	GCC	2	6	669817	669822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15037	NC_013715	GGC	2	6	669835	669840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
15038	NC_013715	GCT	2	6	669841	669846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15039	NC_013715	GGA	2	6	669847	669852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457707
15040	NC_013715	GC	4	8	669905	669912	0 %	0 %	50 %	50 %	283457707
15041	NC_013715	GGC	2	6	670006	670011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
15042	NC_013715	GCAC	2	8	670025	670032	25 %	0 %	25 %	50 %	283457707
15043	NC_013715	GGC	3	9	670150	670158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
15044	NC_013715	AGA	2	6	670191	670196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457707
15045	NC_013715	GGTGC	2	10	670223	670232	0 %	20 %	60 %	20 %	283457707
15046	NC_013715	CGC	2	6	670328	670333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15047	NC_013715	AGC	2	6	670344	670349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15048	NC_013715	TGAGAT	2	12	670357	670368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457707
15049	NC_013715	CTC	2	6	670372	670377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457707
15050	NC_013715	GCC	2	6	670403	670408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457707
15051	NC_013715	GAT	2	6	670436	670441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457707
15052	NC_013715	CAG	2	6	670442	670447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15053	NC_013715	ACC	2	6	670482	670487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457707
15054	NC_013715	AC	3	6	670508	670513	50 %	0 %	0 %	50 %	283457707
15055	NC_013715	CAG	2	6	670544	670549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15056	NC_013715	CTG	3	9	670577	670585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15057	NC_013715	ATG	2	6	670589	670594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457707
15058	NC_013715	GACC	2	8	670600	670607	25 %	0 %	25 %	50 %	283457707
15059	NC_013715	TGC	2	6	670611	670616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15060	NC_013715	AGC	2	6	670620	670625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457707
15061	NC_013715	CGG	2	6	670743	670748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
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15065	NC_013715	CCTG	2	8	670837	670844	0 %	25 %	25 %	50 %	283457707
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15068	NC_013715	GAG	2	6	670967	670972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457707
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15072	NC_013715	CCCG	2	8	671190	671197	0 %	0 %	25 %	75 %	283457707
15073	NC_013715	GGC	2	6	671309	671314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457707
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15076	NC_013715	GCA	2	6	671411	671416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15077	NC_013715	GGC	2	6	671436	671441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15078	NC_013715	CG	3	6	671455	671460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15079	NC_013715	AGC	2	6	671492	671497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15080	NC_013715	GCT	2	6	671522	671527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_013715	TG	3	6	671532	671537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_013715	TGA	2	6	671589	671594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_013715	GAA	2	6	671611	671616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_013715	CGC	2	6	671695	671700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15085	NC_013715	TGCG	2	8	671718	671725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15086	NC_013715	GT	3	6	671901	671906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_013715	A	6	6	671953	671958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_013715	TCAT	2	8	672139	672146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15089	NC_013715	CAT	2	6	672245	672250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_013715	GACA	2	8	672262	672269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15091	NC_013715	GCAGT	2	10	672354	672363	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15092	NC_013715	CTGAA	2	10	672373	672382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15093	NC_013715	CTGAA	2	10	672390	672399	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15094	NC_013715	ACA	2	6	672430	672435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_013715	GGC	2	6	672440	672445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_013715	CGG	2	6	672467	672472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15097	NC_013715	GACC	2	8	672473	672480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15098	NC_013715	CGG	2	6	672491	672496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_013715	CGG	2	6	672515	672520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457708
15100	NC_013715	CCT	3	9	672539	672547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457708
15101	NC_013715	GTC	2	6	672576	672581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457708
15102	NC_013715	CG	3	6	672687	672692	0 %	0 %	50 %	50 %	283457708
15103	NC_013715	CTG	2	6	672726	672731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457708
15104	NC_013715	TCG	2	6	672751	672756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457708
15105	NC_013715	GC	3	6	672849	672854	0 %	0 %	50 %	50 %	283457708
15106	NC_013715	GCACG	2	10	672947	672956	20 %	0 %	40 %	40 %	283457708
15107	NC_013715	CGG	2	6	672974	672979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457708
15108	NC_013715	GCG	2	6	672994	672999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457708
15109	NC_013715	ATG	2	6	673072	673077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457708
15110	NC_013715	GAT	2	6	673116	673121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457708
15111	NC_013715	AGGG	2	8	673129	673136	25 %	0 %	75 %	0 %	283457708
15112	NC_013715	GCG	2	6	673137	673142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457708
15113	NC_013715	CGC	2	6	673143	673148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457708
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15116	NC_013715	GC	3	6	673282	673287	0 %	0 %	50 %	50 %	283457708
15117	NC_013715	GCG	2	6	673350	673355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457708
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15119	NC_013715	GCG	2	6	673374	673379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457708
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15121	NC_013715	GTC	2	6	673413	673418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457708
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15345	NC_013715	CGC	2	6	683231	683236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15346	NC_013715	GTTTT	2	10	683352	683361	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15347	NC_013715	CGT	2	6	683418	683423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15348	NC_013715	G	7	7	683430	683436	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15349	NC_013715	G	6	6	683438	683443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15350	NC_013715	ATC	2	6	683467	683472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15351	NC_013715	ATC	2	6	683498	683503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15352	NC_013715	GGGA	2	8	683553	683560	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15353	NC_013715	AGG	2	6	683569	683574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15354	NC_013715	TA	4	8	683708	683715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_013715	GGC	2	6	683777	683782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15356	NC_013715	AC	3	6	683784	683789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15357	NC_013715	GTG	2	6	683881	683886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15358	NC_013715	GTG	2	6	683894	683899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15360	NC_013715	CTG	2	6	684017	684022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457714
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