MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_013715	GC	3	6	626116	626121	0 %	0 %	50 %	50 %	283457672
14003	NC_013715	GCA	2	6	626133	626138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457672
14004	NC_013715	CGG	2	6	626157	626162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457672
14005	NC_013715	CAG	2	6	626230	626235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457672
14006	NC_013715	CTT	2	6	626260	626265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457672
14007	NC_013715	CCG	2	6	626267	626272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457672
14008	NC_013715	GCC	2	6	626299	626304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457672
14009	NC_013715	CAC	2	6	626326	626331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457672
14010	NC_013715	CAGGCG	2	12	626440	626451	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	283457672
14011	NC_013715	ACGC	2	8	626467	626474	25 %	0 %	25 %	50 %	283457672
14012	NC_013715	CGG	2	6	626475	626480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457672
14013	NC_013715	CCA	2	6	626493	626498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457672
14014	NC_013715	CGG	2	6	626574	626579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457672
14015	NC_013715	GC	3	6	626764	626769	0 %	0 %	50 %	50 %	283457672
14016	NC_013715	TCC	2	6	626789	626794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457672
14017	NC_013715	GAGG	2	8	626830	626837	25 %	0 %	75 %	0 %	283457672
14018	NC_013715	AAC	2	6	626887	626892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457672
14019	NC_013715	GT	4	8	627018	627025	0 %	50 %	50 %	0 %	283457673
14020	NC_013715	CTG	2	6	627141	627146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457673
14021	NC_013715	AACG	3	12	627168	627179	50 %	0 %	25 %	25 %	283457673
14022	NC_013715	GCACCT	2	12	627218	627229	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283457673
14023	NC_013715	CGC	2	6	627271	627276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457673
14024	NC_013715	ATT	2	6	627306	627311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457673
14025	NC_013715	GCG	2	6	627439	627444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457673
14026	NC_013715	GCC	2	6	627465	627470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457673
14027	NC_013715	TCT	2	6	627511	627516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457673
14028	NC_013715	GAA	2	6	627525	627530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457673
14029	NC_013715	TCA	2	6	627583	627588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457673
14030	NC_013715	TGC	2	6	627607	627612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457673
14031	NC_013715	GGC	2	6	627639	627644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457673
14032	NC_013715	TTC	2	6	627663	627668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457673
14033	NC_013715	TGC	2	6	627686	627691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457673
14034	NC_013715	CGTG	2	8	627702	627709	0 %	25 %	50 %	25 %	283457673
14035	NC_013715	GCG	2	6	627712	627717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457673
14036	NC_013715	CCT	2	6	627760	627765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457673
14037	NC_013715	TGG	2	6	627833	627838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457673
14038	NC_013715	GCG	2	6	627864	627869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457673
14039	NC_013715	CGTG	2	8	627929	627936	0 %	25 %	50 %	25 %	283457673
14040	NC_013715	CGG	2	6	627979	627984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457673
14041	NC_013715	GGC	2	6	628010	628015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457673
14042	NC_013715	GAG	2	6	628038	628043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457673
14043	NC_013715	CCG	2	6	628099	628104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457673
14044	NC_013715	CTG	2	6	628128	628133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457673
14045	NC_013715	GCT	2	6	628202	628207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457673
14046	NC_013715	ACA	2	6	628232	628237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457673
14047	NC_013715	CTA	2	6	628274	628279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_013715	TCT	2	6	628342	628347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457675
14049	NC_013715	CTG	2	6	628361	628366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457675
14050	NC_013715	CGG	2	6	628402	628407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457675
14051	NC_013715	CGTGC	2	10	628412	628421	0 %	20 %	40 %	40 %	283457675
14052	NC_013715	GCG	2	6	628440	628445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457675
14053	NC_013715	GGA	2	6	628480	628485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457675
14054	NC_013715	TTC	2	6	628505	628510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457675
14055	NC_013715	GAGT	2	8	628540	628547	25 %	25 %	50 %	0 %	283457675
14056	NC_013715	AGC	2	6	628573	628578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457675
14057	NC_013715	TGC	2	6	628597	628602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457675
14058	NC_013715	GCGTC	2	10	628612	628621	0 %	20 %	40 %	40 %	283457675
14059	NC_013715	GCTG	2	8	628630	628637	0 %	25 %	50 %	25 %	283457675
14060	NC_013715	ATG	2	6	628638	628643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457675
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14062	NC_013715	GCT	2	6	628851	628856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457676
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14064	NC_013715	TGCCC	2	10	628914	628923	0 %	20 %	20 %	60 %	283457676
14065	NC_013715	GGTC	2	8	628989	628996	0 %	25 %	50 %	25 %	283457676
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14103	NC_013715	GAGCGT	2	12	630550	630561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283457677
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14106	NC_013715	TTCT	2	8	630708	630715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14107	NC_013715	CCCG	2	8	630780	630787	0 %	0 %	25 %	75 %	283457678
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14119	NC_013715	ATG	2	6	631242	631247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457678
14120	NC_013715	GCA	2	6	631267	631272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457678
14121	NC_013715	CGCCA	2	10	631281	631290	20 %	0 %	20 %	60 %	283457678
14122	NC_013715	GCC	2	6	631340	631345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457678
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14124	NC_013715	CGG	2	6	631397	631402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457678
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14128	NC_013715	CGG	2	6	631519	631524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457678
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14133	NC_013715	GGC	2	6	631715	631720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457678
14134	NC_013715	CTG	2	6	631733	631738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457678
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14141	NC_013715	CTG	2	6	631998	632003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457679
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14143	NC_013715	TG	3	6	632050	632055	0 %	50 %	50 %	0 %	283457679
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14164	NC_013715	CGG	2	6	632860	632865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457679
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14202	NC_013715	GAG	2	6	634277	634282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14203	NC_013715	GCGG	2	8	634311	634318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14204	NC_013715	TAGAA	2	10	634319	634328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14225	NC_013715	AGA	2	6	635322	635327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14226	NC_013715	CGCAG	2	10	635330	635339	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14227	NC_013715	TGG	2	6	635420	635425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457683
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14230	NC_013715	CGT	2	6	635536	635541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457683
14231	NC_013715	GATACC	2	12	635552	635563	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283457683
14232	NC_013715	CTC	2	6	635570	635575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457683
14233	NC_013715	GC	3	6	635677	635682	0 %	0 %	50 %	50 %	283457683
14234	NC_013715	GGT	2	6	635704	635709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457683
14235	NC_013715	GCG	2	6	635732	635737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457683
14236	NC_013715	GCA	2	6	635782	635787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457683
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14362	NC_013715	TCG	2	6	642653	642658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457687
14363	NC_013715	CTC	2	6	642679	642684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457687
14364	NC_013715	GGC	2	6	642693	642698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457687
14365	NC_013715	CGT	2	6	642789	642794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457687
14366	NC_013715	TCT	2	6	642894	642899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457687
14367	NC_013715	GGT	2	6	642915	642920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457687
14368	NC_013715	GCC	2	6	642959	642964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457687
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14372	NC_013715	CGGCCG	2	12	643136	643147	0 %	0 %	50 %	50 %	283457687
14373	NC_013715	GC	3	6	643151	643156	0 %	0 %	50 %	50 %	283457687
14374	NC_013715	ATC	2	6	643169	643174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457687
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14390	NC_013715	ATG	2	6	643772	643777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457687
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14392	NC_013715	CCG	2	6	643842	643847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457687
14393	NC_013715	GT	3	6	643965	643970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14394	NC_013715	CCAG	2	8	643994	644001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14395	NC_013715	TGG	2	6	644010	644015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14396	NC_013715	CGGG	2	8	644025	644032	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14397	NC_013715	GCCG	2	8	644041	644048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14398	NC_013715	CGC	2	6	644098	644103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14399	NC_013715	TTCA	2	8	644116	644123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14400	NC_013715	TGA	2	6	644124	644129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14402	NC_013715	GGA	2	6	644379	644384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457688
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14407	NC_013715	TAA	2	6	644775	644780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14408	NC_013715	CGC	2	6	644787	644792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14409	NC_013715	AGGGG	2	10	644852	644861	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14410	NC_013715	CTC	2	6	644880	644885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457690
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14427	NC_013715	CGC	2	6	645438	645443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457690
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14430	NC_013715	GCG	2	6	645756	645761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457690
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14461	NC_013715	GGCG	2	8	647105	647112	0 %	0 %	75 %	25 %	283457691
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14470	NC_013715	ACCA	2	8	647695	647702	50 %	0 %	0 %	50 %	283457692
14471	NC_013715	ACCGC	2	10	647711	647720	20 %	0 %	20 %	60 %	283457692
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14473	NC_013715	CACC	2	8	647780	647787	25 %	0 %	0 %	75 %	283457692
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14477	NC_013715	CAC	2	6	647878	647883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457692
14478	NC_013715	GGC	2	6	647914	647919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457692
14479	NC_013715	CTG	2	6	647923	647928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457692
14480	NC_013715	CAT	2	6	648078	648083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457692
14481	NC_013715	GCGCC	2	10	648144	648153	0 %	0 %	40 %	60 %	283457692
14482	NC_013715	TCG	2	6	648251	648256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457692
14483	NC_013715	CCAC	2	8	648281	648288	25 %	0 %	0 %	75 %	283457692
14484	NC_013715	CGC	2	6	648357	648362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457692
14485	NC_013715	GGC	2	6	648421	648426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457692
14486	NC_013715	TCG	2	6	648449	648454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457692
14487	NC_013715	TCA	2	6	648539	648544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457692
14488	NC_013715	CAC	2	6	648555	648560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457692
14489	NC_013715	C	6	6	648575	648580	0 %	0 %	0 %	100 %	283457692
14490	NC_013715	TCG	3	9	648701	648709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457692
14491	NC_013715	GAA	2	6	648760	648765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457692
14492	NC_013715	CCG	2	6	648770	648775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457692
14493	NC_013715	CGC	2	6	648828	648833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457692
14494	NC_013715	CGG	2	6	648873	648878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457692
14495	NC_013715	CGA	2	6	648912	648917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457692
14496	NC_013715	TCA	2	6	648923	648928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457692
14497	NC_013715	ATG	2	6	648955	648960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457692
14498	NC_013715	GCA	2	6	648977	648982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457692
14499	NC_013715	CGT	2	6	648999	649004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457692
14500	NC_013715	GCG	2	6	649013	649018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457692

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