MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_013715	TTA	2	6	583353	583358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457630
13003	NC_013715	GCA	2	6	583402	583407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457630
13004	NC_013715	CGA	2	6	583450	583455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457630
13005	NC_013715	ACG	2	6	583476	583481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457630
13006	NC_013715	CGA	2	6	583516	583521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457630
13007	NC_013715	GAA	2	6	583606	583611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457630
13008	NC_013715	GGC	2	6	583706	583711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457630
13009	NC_013715	CGG	2	6	583741	583746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457630
13010	NC_013715	AGC	2	6	583758	583763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457630
13011	NC_013715	CGA	3	9	583873	583881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457630
13012	NC_013715	AGA	2	6	583911	583916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457630
13013	NC_013715	CG	3	6	583934	583939	0 %	0 %	50 %	50 %	283457630
13014	NC_013715	TGA	2	6	584106	584111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_013715	GC	3	6	584148	584153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_013715	G	9	9	584180	584188	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_013715	AGG	2	6	584189	584194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_013715	AG	3	6	584195	584200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_013715	CCTG	2	8	584228	584235	0 %	25 %	25 %	50 %	283457631
13020	NC_013715	CGC	2	6	584262	584267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457631
13021	NC_013715	GC	3	6	584289	584294	0 %	0 %	50 %	50 %	283457631
13022	NC_013715	GCGG	2	8	584314	584321	0 %	0 %	75 %	25 %	283457631
13023	NC_013715	CGC	2	6	584606	584611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457632
13024	NC_013715	GA	3	6	584716	584721	50 %	0 %	50 %	0 %	283457632
13025	NC_013715	TGC	2	6	584778	584783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457632
13026	NC_013715	GC	3	6	584796	584801	0 %	0 %	50 %	50 %	283457632
13027	NC_013715	CTC	2	6	584819	584824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457632
13028	NC_013715	GGA	2	6	584840	584845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457632
13029	NC_013715	GGGT	2	8	584850	584857	0 %	25 %	75 %	0 %	283457632
13030	NC_013715	GGC	2	6	584866	584871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457632
13031	NC_013715	GGCG	2	8	584932	584939	0 %	0 %	75 %	25 %	283457632
13032	NC_013715	CG	3	6	584938	584943	0 %	0 %	50 %	50 %	283457632
13033	NC_013715	GCGG	2	8	584954	584961	0 %	0 %	75 %	25 %	283457632
13034	NC_013715	TCC	2	6	584964	584969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457632
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13037	NC_013715	CCT	2	6	585115	585120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457632
13038	NC_013715	GCA	2	6	585130	585135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457632
13039	NC_013715	GCC	3	9	585149	585157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457632
13040	NC_013715	CGATGA	2	12	585163	585174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	283457632
13041	NC_013715	TGGG	2	8	585185	585192	0 %	25 %	75 %	0 %	283457632
13042	NC_013715	GCC	2	6	585225	585230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457632
13043	NC_013715	CTT	2	6	585374	585379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457632
13044	NC_013715	CG	3	6	585381	585386	0 %	0 %	50 %	50 %	283457632
13045	NC_013715	CGG	2	6	585403	585408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457632
13046	NC_013715	GCT	2	6	585433	585438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457632
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13049	NC_013715	GCC	2	6	585641	585646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457632
13050	NC_013715	GAGG	2	8	585656	585663	25 %	0 %	75 %	0 %	283457632
13051	NC_013715	TGG	2	6	585748	585753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457632
13052	NC_013715	GGT	2	6	585755	585760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457632
13053	NC_013715	CAC	2	6	585803	585808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457632
13054	NC_013715	GCTGC	2	10	585823	585832	0 %	20 %	40 %	40 %	283457632
13055	NC_013715	CA	3	6	585924	585929	50 %	0 %	0 %	50 %	283457633
13056	NC_013715	GCAG	2	8	585932	585939	25 %	0 %	50 %	25 %	283457633
13057	NC_013715	TCAG	2	8	586023	586030	25 %	25 %	25 %	25 %	283457633
13058	NC_013715	AAC	2	6	586039	586044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457633
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13061	NC_013715	GC	3	6	586085	586090	0 %	0 %	50 %	50 %	283457633
13062	NC_013715	CGG	2	6	586100	586105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457633
13063	NC_013715	GTC	2	6	586117	586122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457633
13064	NC_013715	ACGG	2	8	586141	586148	25 %	0 %	50 %	25 %	283457633
13065	NC_013715	CTA	2	6	586149	586154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457633
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13069	NC_013715	TGTGC	2	10	586287	586296	0 %	40 %	40 %	20 %	283457633
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13074	NC_013715	CGC	2	6	586624	586629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457633
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13085	NC_013715	GGCTG	2	10	586975	586984	0 %	20 %	60 %	20 %	283457633
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13088	NC_013715	GGC	3	9	587109	587117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457633
13089	NC_013715	CTG	2	6	587149	587154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457633
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13091	NC_013715	CA	3	6	587217	587222	50 %	0 %	0 %	50 %	283457633
13092	NC_013715	AAC	2	6	587234	587239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13097	NC_013715	CCGTG	2	10	587397	587406	0 %	20 %	40 %	40 %	283457634
13098	NC_013715	GC	3	6	587438	587443	0 %	0 %	50 %	50 %	283457634
13099	NC_013715	GTG	2	6	587482	587487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457634
13100	NC_013715	TGA	2	6	587520	587525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457634
13101	NC_013715	CGG	2	6	587582	587587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457634
13102	NC_013715	CGA	2	6	587781	587786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457634
13103	NC_013715	GTC	2	6	587821	587826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457634
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13105	NC_013715	CCCT	2	8	587896	587903	0 %	25 %	0 %	75 %	283457634
13106	NC_013715	GAC	2	6	587920	587925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457634
13107	NC_013715	CG	3	6	587975	587980	0 %	0 %	50 %	50 %	283457634
13108	NC_013715	TGGT	2	8	587996	588003	0 %	50 %	50 %	0 %	283457634
13109	NC_013715	CTC	2	6	588012	588017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457634
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13111	NC_013715	AGG	2	6	588170	588175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457634
13112	NC_013715	ACA	2	6	588203	588208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457634
13113	NC_013715	GAAG	2	8	588231	588238	50 %	0 %	50 %	0 %	283457634
13114	NC_013715	TTCTC	2	10	588242	588251	0 %	60 %	0 %	40 %	283457634
13115	NC_013715	GAA	2	6	588279	588284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457634
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13117	NC_013715	CGG	2	6	588434	588439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_013715	GGTGC	2	10	588457	588466	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13119	NC_013715	TGT	2	6	588548	588553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_013715	TAA	2	6	588558	588563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13488	NC_013715	TCA	2	6	603417	603422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457650
13489	NC_013715	CAT	2	6	603454	603459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457650
13490	NC_013715	GCA	2	6	603504	603509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457650
13491	NC_013715	CT	3	6	603626	603631	0 %	50 %	0 %	50 %	283457650
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