MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013715	TCA	2	6	560808	560813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457611
12502	NC_013715	CGC	2	6	560854	560859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457611
12503	NC_013715	CCA	2	6	560862	560867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457611
12504	NC_013715	CTC	2	6	560879	560884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457611
12505	NC_013715	CAT	2	6	561037	561042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457611
12506	NC_013715	GCT	2	6	561064	561069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457611
12507	NC_013715	GGT	2	6	561074	561079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457611
12508	NC_013715	GCCC	2	8	561183	561190	0 %	0 %	25 %	75 %	283457611
12509	NC_013715	GTG	3	9	561200	561208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457611
12510	NC_013715	CTGC	2	8	561217	561224	0 %	25 %	25 %	50 %	283457611
12511	NC_013715	CCG	2	6	561225	561230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457611
12512	NC_013715	GCC	2	6	561326	561331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457611
12513	NC_013715	CGC	2	6	561358	561363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457611
12514	NC_013715	CGG	2	6	561444	561449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457611
12515	NC_013715	GCT	2	6	561466	561471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457611
12516	NC_013715	GCC	2	6	561508	561513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457611
12517	NC_013715	GCC	2	6	561578	561583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457611
12518	NC_013715	GTC	2	6	561590	561595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457611
12519	NC_013715	AAG	2	6	561683	561688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_013715	ACA	2	6	561689	561694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_013715	AGG	2	6	561708	561713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_013715	G	6	6	561716	561721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_013715	CCT	2	6	561734	561739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12524	NC_013715	CAG	2	6	561908	561913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457612
12525	NC_013715	CAG	2	6	561959	561964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457612
12526	NC_013715	CCTCGT	2	12	562021	562032	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	283457612
12527	NC_013715	CGC	2	6	562096	562101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457612
12528	NC_013715	TGGTAG	2	12	562122	562133	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	283457612
12529	NC_013715	TCA	2	6	562146	562151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457612
12530	NC_013715	ACC	2	6	562229	562234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457612
12531	NC_013715	AATCG	2	10	562385	562394	40 %	20 %	20 %	20 %	283457612
12532	NC_013715	TTC	2	6	562418	562423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457612
12533	NC_013715	GCT	2	6	562474	562479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457612
12534	NC_013715	GTT	2	6	562547	562552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457612
12535	NC_013715	GGT	2	6	562586	562591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457612
12536	NC_013715	GCC	2	6	562652	562657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457612
12537	NC_013715	AG	3	6	562659	562664	50 %	0 %	50 %	0 %	283457612
12538	NC_013715	AGCC	2	8	562732	562739	25 %	0 %	25 %	50 %	283457612
12539	NC_013715	TCA	2	6	562786	562791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457612
12540	NC_013715	CGT	2	6	562792	562797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457612
12541	NC_013715	GAG	2	6	562875	562880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457612
12542	NC_013715	GAT	2	6	562934	562939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457612
12543	NC_013715	CCA	2	6	562982	562987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457612
12544	NC_013715	GAA	2	6	563054	563059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457612
12545	NC_013715	TCCCAC	2	12	563091	563102	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	283457612
12546	NC_013715	GTT	2	6	563129	563134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457612
12547	NC_013715	GGA	2	6	563136	563141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457612
12548	NC_013715	TCG	2	6	563157	563162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457612
12549	NC_013715	GTA	2	6	563186	563191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457612
12550	NC_013715	ATG	2	6	563349	563354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457612
12551	NC_013715	AGT	2	6	563359	563364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457612
12552	NC_013715	CGT	2	6	563500	563505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457612
12553	NC_013715	CTTC	2	8	563539	563546	0 %	50 %	0 %	50 %	283457612
12554	NC_013715	CAC	2	6	563547	563552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457612
12555	NC_013715	GGC	2	6	563554	563559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457612
12556	NC_013715	AGG	2	6	563566	563571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457612
12557	NC_013715	CGG	2	6	563616	563621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457612
12558	NC_013715	ATT	2	6	563709	563714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457612
12559	NC_013715	GCA	2	6	563770	563775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457613
12560	NC_013715	TCG	2	6	563784	563789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457613
12561	NC_013715	TCGG	2	8	563859	563866	0 %	25 %	50 %	25 %	283457613
12562	NC_013715	GCC	2	6	563909	563914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457613
12563	NC_013715	GTC	2	6	563936	563941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457613
12564	NC_013715	CGA	2	6	563953	563958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457613
12565	NC_013715	CAG	2	6	563960	563965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457613
12566	NC_013715	GC	3	6	563967	563972	0 %	0 %	50 %	50 %	283457613
12567	NC_013715	TCG	2	6	563994	563999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457613
12568	NC_013715	CAG	2	6	564044	564049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457613
12569	NC_013715	TAA	2	6	564094	564099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457613
12570	NC_013715	TTCAGC	2	12	564174	564185	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	283457613
12571	NC_013715	GGT	2	6	564197	564202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457613
12572	NC_013715	GCA	2	6	564277	564282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457613
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12574	NC_013715	CGT	2	6	564364	564369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457613
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12579	NC_013715	CTT	2	6	564587	564592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457613
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12584	NC_013715	CGG	2	6	564871	564876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457613
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12586	NC_013715	CCAG	2	8	564949	564956	25 %	0 %	25 %	50 %	283457613
12587	NC_013715	ATG	2	6	564963	564968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457613
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12592	NC_013715	TCG	2	6	565128	565133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457613
12593	NC_013715	GTA	2	6	565157	565162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457613
12594	NC_013715	GGA	2	6	565184	565189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457613
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12599	NC_013715	ATG	2	6	565320	565325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457613
12600	NC_013715	TCT	2	6	565426	565431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457613
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12602	NC_013715	GTC	2	6	565533	565538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457613
12603	NC_013715	TTC	2	6	565543	565548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12604	NC_013715	TG	3	6	565572	565577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_013715	GGC	2	6	565591	565596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_013715	GTG	2	6	565622	565627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457614
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12608	NC_013715	CGA	2	6	565749	565754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457614
12609	NC_013715	CGGT	2	8	565757	565764	0 %	25 %	50 %	25 %	283457614
12610	NC_013715	GAG	2	6	565793	565798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457614
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12616	NC_013715	GCGCG	2	10	566097	566106	0 %	0 %	60 %	40 %	283457614
12617	NC_013715	TCG	2	6	566195	566200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457614
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12983	NC_013715	ACC	2	6	582347	582352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457629
12984	NC_013715	TCT	2	6	582410	582415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457629
12985	NC_013715	GAC	2	6	582515	582520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457629
12986	NC_013715	CGAG	2	8	582526	582533	25 %	0 %	50 %	25 %	283457629
12987	NC_013715	CTG	2	6	582569	582574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457629
12988	NC_013715	CAG	2	6	582577	582582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457629
12989	NC_013715	GCA	3	9	582643	582651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457629
12990	NC_013715	CGT	2	6	582668	582673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457629
12991	NC_013715	ATC	2	6	582712	582717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457629
12992	NC_013715	GAC	2	6	582785	582790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457629
12993	NC_013715	GCA	2	6	582791	582796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457629
12994	NC_013715	ATC	2	6	582827	582832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12995	NC_013715	ATG	2	6	582995	583000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457630
12996	NC_013715	CAT	2	6	583003	583008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457630
12997	NC_013715	GCA	2	6	583078	583083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457630
12998	NC_013715	CAT	2	6	583099	583104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457630
12999	NC_013715	CGA	2	6	583189	583194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457630
13000	NC_013715	GGC	2	6	583250	583255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457630

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