MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013715	CATCGC	3	18	538341	538358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283457587
12003	NC_013715	CCG	2	6	538361	538366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457587
12004	NC_013715	CGA	2	6	538443	538448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457587
12005	NC_013715	CGA	2	6	538452	538457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457587
12006	NC_013715	CGA	2	6	538471	538476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_013715	ACACC	2	10	538496	538505	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
12008	NC_013715	GCC	2	6	538607	538612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457589
12009	NC_013715	ACG	2	6	538617	538622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457589
12010	NC_013715	CGC	2	6	538639	538644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457589
12011	NC_013715	CAA	2	6	538723	538728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457589
12012	NC_013715	GGC	2	6	538838	538843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457589
12013	NC_013715	AC	3	6	538870	538875	50 %	0 %	0 %	50 %	283457589
12014	NC_013715	AGC	2	6	538881	538886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457589
12015	NC_013715	GCG	2	6	538935	538940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457589
12016	NC_013715	CCGCG	2	10	538978	538987	0 %	0 %	40 %	60 %	283457589
12017	NC_013715	ACA	2	6	539043	539048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457589
12018	NC_013715	CCCT	2	8	539069	539076	0 %	25 %	0 %	75 %	283457589
12019	NC_013715	GGCA	2	8	539119	539126	25 %	0 %	50 %	25 %	283457589
12020	NC_013715	GCCC	2	8	539200	539207	0 %	0 %	25 %	75 %	283457589
12021	NC_013715	CGA	2	6	539254	539259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457589
12022	NC_013715	GTGC	2	8	539339	539346	0 %	25 %	50 %	25 %	283457589
12023	NC_013715	GCG	2	6	539445	539450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457589
12024	NC_013715	CGG	2	6	539482	539487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457589
12025	NC_013715	GGC	2	6	539578	539583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457589
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12033	NC_013715	CGC	2	6	540154	540159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12034	NC_013715	TC	3	6	540194	540199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12035	NC_013715	AAGG	2	8	540222	540229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_013715	GAT	2	6	540284	540289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12037	NC_013715	CATA	2	8	540329	540336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12038	NC_013715	GA	3	6	540342	540347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_013715	CTT	2	6	540357	540362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457590
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12041	NC_013715	AGA	2	6	540404	540409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457590
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12053	NC_013715	CAG	2	6	540865	540870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457590
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12058	NC_013715	GAA	2	6	540943	540948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457590
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12080	NC_013715	TGA	2	6	542167	542172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12083	NC_013715	GAA	2	6	542211	542216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12100	NC_013715	TC	3	6	543050	543055	0 %	50 %	0 %	50 %	283457591
12101	NC_013715	CTC	2	6	543140	543145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12102	NC_013715	GC	3	6	543211	543216	0 %	0 %	50 %	50 %	283457592
12103	NC_013715	CGC	2	6	543247	543252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457592
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12121	NC_013715	CGG	2	6	543897	543902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457592
12122	NC_013715	TTC	2	6	543910	543915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457592
12123	NC_013715	CCTCGC	2	12	543927	543938	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	283457592
12124	NC_013715	GC	3	6	543943	543948	0 %	0 %	50 %	50 %	283457592
12125	NC_013715	TGG	2	6	543954	543959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457592
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12129	NC_013715	ATC	2	6	544120	544125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457592
12130	NC_013715	CAGC	2	8	544134	544141	25 %	0 %	25 %	50 %	283457592
12131	NC_013715	TTC	2	6	544145	544150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457592
12132	NC_013715	CGGA	2	8	544164	544171	25 %	0 %	50 %	25 %	283457592
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12138	NC_013715	CT	3	6	544436	544441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12139	NC_013715	TAG	2	6	544503	544508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457593
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12141	NC_013715	GCT	2	6	544516	544521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457593
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12146	NC_013715	CTG	2	6	544786	544791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457593
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12359	NC_013715	CCT	2	6	554341	554346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457603
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12361	NC_013715	TGG	2	6	554380	554385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457603
12362	NC_013715	GAA	2	6	554397	554402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457603
12363	NC_013715	GAA	2	6	554406	554411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457603
12364	NC_013715	GT	4	8	554421	554428	0 %	50 %	50 %	0 %	283457603
12365	NC_013715	GCC	2	6	554436	554441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457603
12366	NC_013715	C	6	6	554440	554445	0 %	0 %	0 %	100 %	283457603
12367	NC_013715	CCA	2	6	554447	554452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457603
12368	NC_013715	GC	3	6	554491	554496	0 %	0 %	50 %	50 %	283457603
12369	NC_013715	ACC	2	6	554624	554629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457603
12370	NC_013715	TGC	2	6	554798	554803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457605
12371	NC_013715	CAT	2	6	554880	554885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457605
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12376	NC_013715	ATC	2	6	555148	555153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457605
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12380	NC_013715	AGGACG	2	12	555392	555403	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	283457605
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12382	NC_013715	GCT	2	6	555421	555426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457605
12383	NC_013715	CTT	2	6	555432	555437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457605
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12385	NC_013715	AGGC	2	8	555473	555480	25 %	0 %	50 %	25 %	283457605
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12390	NC_013715	GCA	2	6	555742	555747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457605
12391	NC_013715	CGG	2	6	555777	555782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457605
12392	NC_013715	GCA	2	6	555786	555791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457605
12393	NC_013715	CTG	2	6	555850	555855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457605
12394	NC_013715	ACC	2	6	555862	555867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457605
12395	NC_013715	GCC	2	6	555956	555961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457605
12396	NC_013715	GAG	2	6	556135	556140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457605
12397	NC_013715	CAT	2	6	556206	556211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457606
12398	NC_013715	GAT	2	6	556260	556265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12399	NC_013715	CGC	2	6	556267	556272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12400	NC_013715	GCCC	2	8	556299	556306	0 %	0 %	25 %	75 %	283457607
12401	NC_013715	CGGG	2	8	556324	556331	0 %	0 %	75 %	25 %	283457607
12402	NC_013715	AAT	2	6	556342	556347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457607
12403	NC_013715	CT	3	6	556412	556417	0 %	50 %	0 %	50 %	283457607
12404	NC_013715	CGCC	2	8	556423	556430	0 %	0 %	25 %	75 %	283457607
12405	NC_013715	CCG	2	6	556468	556473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457607
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12409	NC_013715	GCT	2	6	556660	556665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457607
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12413	NC_013715	GTT	2	6	556796	556801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457607
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12415	NC_013715	GAA	2	6	556936	556941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457607
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12417	NC_013715	TGGC	2	8	556983	556990	0 %	25 %	50 %	25 %	283457607
12418	NC_013715	TGG	2	6	557037	557042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457607
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12420	NC_013715	GCA	2	6	557126	557131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457607
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12423	NC_013715	GGA	2	6	557371	557376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457607
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12426	NC_013715	ACGC	2	8	557593	557600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12427	NC_013715	CGG	2	6	557659	557664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457609
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12429	NC_013715	CGTCC	2	10	557777	557786	0 %	20 %	20 %	60 %	283457609
12430	NC_013715	TGG	2	6	557787	557792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457609
12431	NC_013715	TCG	2	6	557827	557832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457609
12432	NC_013715	CGTG	2	8	557833	557840	0 %	25 %	50 %	25 %	283457609
12433	NC_013715	CTC	2	6	557935	557940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457609
12434	NC_013715	CGG	2	6	558043	558048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457609
12435	NC_013715	CTC	2	6	558112	558117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457609
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12457	NC_013715	CTG	2	6	559229	559234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457610
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12459	NC_013715	GCC	2	6	559380	559385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12460	NC_013715	CTT	2	6	559417	559422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12461	NC_013715	ATGC	2	8	559475	559482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12462	NC_013715	AGG	2	6	559521	559526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12463	NC_013715	TCC	2	6	559580	559585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12464	NC_013715	GCC	2	6	559708	559713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12465	NC_013715	CTT	2	6	559745	559750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12466	NC_013715	T	7	7	559785	559791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12467	NC_013715	A	6	6	559800	559805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12468	NC_013715	TATT	2	8	559811	559818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12469	NC_013715	TAAA	2	8	559832	559839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12470	NC_013715	AAAT	2	8	559850	559857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12471	NC_013715	A	6	6	559863	559868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12472	NC_013715	GGT	2	6	559899	559904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12473	NC_013715	CGAAT	2	10	559913	559922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12474	NC_013715	CCCAA	2	10	559943	559952	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
12475	NC_013715	A	6	6	559963	559968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12476	NC_013715	CAG	2	6	559979	559984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12477	NC_013715	CAT	2	6	560023	560028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12478	NC_013715	ACGT	2	8	560160	560167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12479	NC_013715	GCA	2	6	560195	560200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12480	NC_013715	CAA	2	6	560205	560210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12481	NC_013715	CTG	2	6	560241	560246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12482	NC_013715	AGA	2	6	560257	560262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12483	NC_013715	TGC	2	6	560288	560293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12484	NC_013715	GAG	2	6	560349	560354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12485	NC_013715	AAGA	2	8	560355	560362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12486	NC_013715	TGC	2	6	560369	560374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12487	NC_013715	GAA	2	6	560408	560413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12488	NC_013715	ACA	2	6	560414	560419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12489	NC_013715	ATG	2	6	560429	560434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12490	NC_013715	AT	3	6	560479	560484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12491	NC_013715	A	6	6	560520	560525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12492	NC_013715	ATG	2	6	560543	560548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12493	NC_013715	A	6	6	560582	560587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12494	NC_013715	TCAACC	2	12	560591	560602	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
12495	NC_013715	AGGGT	2	10	560612	560621	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12496	NC_013715	CAG	2	6	560650	560655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12497	NC_013715	ATC	2	6	560684	560689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457611
12498	NC_013715	CTAGGT	2	12	560705	560716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283457611
12499	NC_013715	AGA	2	6	560764	560769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457611
12500	NC_013715	CTG	2	6	560780	560785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457611

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