MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013715	AGA	2	6	513537	513542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457557
11502	NC_013715	CA	3	6	513656	513661	50 %	0 %	0 %	50 %	283457557
11503	NC_013715	CT	3	6	513675	513680	0 %	50 %	0 %	50 %	283457557
11504	NC_013715	GGA	2	6	513839	513844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457557
11505	NC_013715	CG	3	6	513888	513893	0 %	0 %	50 %	50 %	283457557
11506	NC_013715	TC	3	6	513902	513907	0 %	50 %	0 %	50 %	283457557
11507	NC_013715	GGC	2	6	513983	513988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457557
11508	NC_013715	CACC	2	8	514005	514012	25 %	0 %	0 %	75 %	283457557
11509	NC_013715	CTA	2	6	514064	514069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457557
11510	NC_013715	CCT	2	6	514096	514101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457557
11511	NC_013715	GATT	2	8	514228	514235	25 %	50 %	25 %	0 %	283457557
11512	NC_013715	CG	3	6	514239	514244	0 %	0 %	50 %	50 %	283457557
11513	NC_013715	GGC	2	6	514417	514422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457557
11514	NC_013715	TGG	2	6	514429	514434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457557
11515	NC_013715	ATT	2	6	514472	514477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457557
11516	NC_013715	ACC	2	6	514509	514514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457557
11517	NC_013715	TAC	2	6	514613	514618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457557
11518	NC_013715	AGA	2	6	514627	514632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457557
11519	NC_013715	CCT	2	6	514649	514654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457557
11520	NC_013715	TCGT	2	8	514662	514669	0 %	50 %	25 %	25 %	283457557
11521	NC_013715	TA	3	6	514686	514691	50 %	50 %	0 %	0 %	283457557
11522	NC_013715	TGA	2	6	514701	514706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_013715	AGC	2	6	514723	514728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_013715	AT	3	6	514731	514736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_013715	GTGC	2	8	514744	514751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11526	NC_013715	GGT	2	6	514811	514816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_013715	GTA	2	6	514863	514868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_013715	ATCT	2	8	514879	514886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11529	NC_013715	TTTG	2	8	514889	514896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_013715	CCT	2	6	514964	514969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11531	NC_013715	CT	3	6	515031	515036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_013715	TG	3	6	515132	515137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_013715	GGCT	2	8	515330	515337	0 %	25 %	50 %	25 %	283457558
11534	NC_013715	GAC	2	6	515366	515371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457558
11535	NC_013715	CAG	2	6	515387	515392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457558
11536	NC_013715	ACA	2	6	515415	515420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457558
11537	NC_013715	GGT	2	6	515456	515461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457558
11538	NC_013715	CAT	2	6	515491	515496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457558
11539	NC_013715	CGG	2	6	515524	515529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457558
11540	NC_013715	AAG	2	6	515537	515542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457558
11541	NC_013715	GTC	3	9	515561	515569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457558
11542	NC_013715	AAG	2	6	515576	515581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457558
11543	NC_013715	CGT	2	6	515588	515593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457558
11544	NC_013715	CGA	2	6	515617	515622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457558
11545	NC_013715	GAA	2	6	515641	515646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457558
11546	NC_013715	AAG	2	6	515708	515713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457558
11547	NC_013715	TTG	2	6	515859	515864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457559
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11551	NC_013715	TTG	2	6	515970	515975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457560
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11553	NC_013715	C	6	6	516110	516115	0 %	0 %	0 %	100 %	283457561
11554	NC_013715	GTC	2	6	516139	516144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457561
11555	NC_013715	GTC	2	6	516208	516213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457561
11556	NC_013715	AAG	2	6	516319	516324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457561
11557	NC_013715	TCGA	2	8	516541	516548	25 %	25 %	25 %	25 %	283457561
11558	NC_013715	CGTG	2	8	516552	516559	0 %	25 %	50 %	25 %	283457561
11559	NC_013715	GTG	2	6	516574	516579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457561
11560	NC_013715	CGA	2	6	516594	516599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457561
11561	NC_013715	ATGACT	2	12	516725	516736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	283457562
11562	NC_013715	GACCCT	2	12	516898	516909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283457562
11563	NC_013715	GTCC	2	8	516924	516931	0 %	25 %	25 %	50 %	283457562
11564	NC_013715	GCGT	2	8	516951	516958	0 %	25 %	50 %	25 %	283457562
11565	NC_013715	CCA	2	6	516996	517001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457562
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11567	NC_013715	GCG	2	6	517095	517100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457562
11568	NC_013715	AGA	2	6	517130	517135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_013715	AAT	2	6	517147	517152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457563
11570	NC_013715	CCG	2	6	517185	517190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457563
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11573	NC_013715	AAG	2	6	517403	517408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457563
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11578	NC_013715	GTAA	2	8	517680	517687	50 %	25 %	25 %	0 %	283457563
11579	NC_013715	GCAGC	2	10	517708	517717	20 %	0 %	40 %	40 %	283457564
11580	NC_013715	CGT	2	6	517723	517728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457564
11581	NC_013715	GTTC	2	8	517806	517813	0 %	50 %	25 %	25 %	283457564
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11587	NC_013715	GAGC	2	8	518051	518058	25 %	0 %	50 %	25 %	283457565
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11591	NC_013715	AAC	2	6	518139	518144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457565
11592	NC_013715	CGT	2	6	518154	518159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457565
11593	NC_013715	GTG	2	6	518164	518169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457565
11594	NC_013715	AAC	2	6	518178	518183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457565
11595	NC_013715	GAG	3	9	518193	518201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457565
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11598	NC_013715	GCTTCA	2	12	518269	518280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	283457565
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11601	NC_013715	AGA	2	6	518383	518388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457565
11602	NC_013715	CTT	2	6	518390	518395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457565
11603	NC_013715	CGTG	2	8	518513	518520	0 %	25 %	50 %	25 %	283457565
11604	NC_013715	ACG	2	6	518545	518550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457565
11605	NC_013715	TCC	2	6	518571	518576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457565
11606	NC_013715	GCA	2	6	518607	518612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457565
11607	NC_013715	GAG	2	6	518625	518630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457565
11608	NC_013715	TGGCAG	2	12	518635	518646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283457565
11609	NC_013715	CCG	2	6	518648	518653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457565
11610	NC_013715	GTA	2	6	518720	518725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457565
11611	NC_013715	CAA	2	6	518845	518850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457567
11612	NC_013715	CTG	2	6	518862	518867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457567
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11615	NC_013715	GTT	2	6	519166	519171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457568
11616	NC_013715	GTT	3	9	519307	519315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457568
11617	NC_013715	AGT	2	6	519377	519382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457568
11618	NC_013715	CCGT	2	8	519402	519409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11619	NC_013715	CGG	2	6	519418	519423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_013715	TGC	2	6	519432	519437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_013715	AT	3	6	519458	519463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11857	NC_013715	GAA	2	6	531387	531392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11858	NC_013715	TAAAA	2	10	531431	531440	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11985	NC_013715	TCA	2	6	537600	537605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457586
11986	NC_013715	GCT	2	6	537625	537630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457586
11987	NC_013715	CTG	2	6	537638	537643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457586
11988	NC_013715	GGT	2	6	537807	537812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11989	NC_013715	ACC	2	6	537832	537837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11990	NC_013715	GAT	2	6	537870	537875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11991	NC_013715	CAA	2	6	537877	537882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11992	NC_013715	CAC	2	6	537995	538000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11993	NC_013715	CGAA	2	8	538068	538075	50 %	0 %	25 %	25 %	283457587
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