MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_013715	TGC	2	6	489766	489771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11003	NC_013715	AAG	2	6	489849	489854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457533
11004	NC_013715	GATG	2	8	489896	489903	25 %	25 %	50 %	0 %	283457533
11005	NC_013715	GAA	2	6	489929	489934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457533
11006	NC_013715	GCT	2	6	490038	490043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11007	NC_013715	GAC	2	6	490053	490058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11008	NC_013715	CGT	2	6	490089	490094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11009	NC_013715	GGT	2	6	490170	490175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457533
11010	NC_013715	TCG	2	6	490412	490417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11011	NC_013715	TGG	2	6	490420	490425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457533
11012	NC_013715	CGC	2	6	490470	490475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457533
11013	NC_013715	TGAT	2	8	490492	490499	25 %	50 %	25 %	0 %	283457533
11014	NC_013715	GCT	3	9	490590	490598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11015	NC_013715	TGA	2	6	490613	490618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457533
11016	NC_013715	AGGC	2	8	490639	490646	25 %	0 %	50 %	25 %	283457533
11017	NC_013715	GT	4	8	490696	490703	0 %	50 %	50 %	0 %	283457533
11018	NC_013715	TGG	2	6	490741	490746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457533
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11021	NC_013715	CGT	2	6	491025	491030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11022	NC_013715	AGG	2	6	491104	491109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457533
11023	NC_013715	TGC	2	6	491230	491235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11024	NC_013715	CTG	2	6	491271	491276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11025	NC_013715	AAG	2	6	491340	491345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457533
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11027	NC_013715	CGG	2	6	491413	491418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457533
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11031	NC_013715	GCT	2	6	491480	491485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
11032	NC_013715	ATC	2	6	491505	491510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457533
11033	NC_013715	CCG	2	6	491524	491529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457533
11034	NC_013715	CTG	2	6	491584	491589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457533
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11037	NC_013715	CAG	2	6	491885	491890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_013715	T	6	6	491902	491907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_013715	ATTT	2	8	491921	491928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_013715	A	6	6	491931	491936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_013715	ATT	2	6	491949	491954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_013715	T	6	6	491953	491958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_013715	GAT	3	9	491995	492003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11045	NC_013715	TA	3	6	492078	492083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_013715	GAAT	2	8	492086	492093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_013715	GCAT	2	8	492158	492165	25 %	25 %	25 %	25 %	283457534
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11051	NC_013715	GCG	2	6	492445	492450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457534
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11053	NC_013715	TTG	2	6	492587	492592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457534
11054	NC_013715	TGA	2	6	492627	492632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457534
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11058	NC_013715	CGG	2	6	492945	492950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457534
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11063	NC_013715	AATGCT	2	12	493168	493179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	283457534
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11067	NC_013715	TGC	2	6	493533	493538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457534
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11091	NC_013715	CTA	2	6	494265	494270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457534
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11094	NC_013715	GGCG	2	8	494412	494419	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11095	NC_013715	GA	3	6	494467	494472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_013715	TCT	2	6	494484	494489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_013715	GGA	2	6	494530	494535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_013715	G	9	9	494542	494550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_013715	CAA	2	6	494561	494566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_013715	ATC	2	6	494586	494591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_013715	ATG	2	6	494753	494758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_013715	TGG	2	6	494854	494859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_013715	AACC	2	8	494907	494914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11104	NC_013715	CTA	2	6	495032	495037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457535
11105	NC_013715	CAG	2	6	495040	495045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457535
11106	NC_013715	GCGTG	2	10	495117	495126	0 %	20 %	60 %	20 %	283457535
11107	NC_013715	GT	3	6	495134	495139	0 %	50 %	50 %	0 %	283457535
11108	NC_013715	ACC	3	9	495142	495150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457535
11109	NC_013715	GAA	2	6	495153	495158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457535
11110	NC_013715	CGG	2	6	495201	495206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457535
11111	NC_013715	GGT	2	6	495277	495282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457535
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11113	NC_013715	GCTC	2	8	495364	495371	0 %	25 %	25 %	50 %	283457535
11114	NC_013715	AAG	2	6	495385	495390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457535
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11121	NC_013715	ACA	2	6	495601	495606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457536
11122	NC_013715	TC	3	6	495615	495620	0 %	50 %	0 %	50 %	283457536
11123	NC_013715	CGC	2	6	495633	495638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457536
11124	NC_013715	AGC	2	6	495727	495732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457536
11125	NC_013715	AGA	2	6	495739	495744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457536
11126	NC_013715	TGA	2	6	495760	495765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457536
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11128	NC_013715	TAT	2	6	495992	495997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457538
11129	NC_013715	ACC	3	9	496020	496028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457538
11130	NC_013715	ACG	2	6	496081	496086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457538
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11141	NC_013715	CTT	2	6	496543	496548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457538
11142	NC_013715	CTG	2	6	496567	496572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457538
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11144	NC_013715	GCA	2	6	496896	496901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457538
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11150	NC_013715	ACC	2	6	497115	497120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457538
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11156	NC_013715	GGT	2	6	497472	497477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457538
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11162	NC_013715	GC	3	6	497759	497764	0 %	0 %	50 %	50 %	283457538
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11227	NC_013715	GAAC	2	8	501111	501118	50 %	0 %	25 %	25 %	283457540
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11237	NC_013715	AGCC	2	8	501579	501586	25 %	0 %	25 %	50 %	283457540
11238	NC_013715	GAC	2	6	501613	501618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457540
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11242	NC_013715	AAG	2	6	501815	501820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457540
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11244	NC_013715	AG	3	6	501906	501911	50 %	0 %	50 %	0 %	283457540
11245	NC_013715	AAG	2	6	501923	501928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457540
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11291	NC_013715	TGA	2	6	503992	503997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11352	NC_013715	CCGT	2	8	506682	506689	0 %	25 %	25 %	50 %	283457546
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11481	NC_013715	CTC	2	6	512438	512443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457555
11482	NC_013715	CGT	3	9	512477	512485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457555
11483	NC_013715	TGC	2	6	512486	512491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457555
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11489	NC_013715	CGCC	2	8	512827	512834	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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11491	NC_013715	GAA	2	6	512894	512899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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