MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_013715	GCT	2	6	420379	420384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457474
9503	NC_013715	CTCGC	2	10	420410	420419	0 %	20 %	20 %	60 %	283457474
9504	NC_013715	GAGT	2	8	420420	420427	25 %	25 %	50 %	0 %	283457474
9505	NC_013715	TGG	2	6	420464	420469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457474
9506	NC_013715	AGA	2	6	420493	420498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457474
9507	NC_013715	GGCT	2	8	420548	420555	0 %	25 %	50 %	25 %	283457474
9508	NC_013715	CCG	2	6	420561	420566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457474
9509	NC_013715	CTC	2	6	420637	420642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457474
9510	NC_013715	GC	3	6	420647	420652	0 %	0 %	50 %	50 %	283457474
9511	NC_013715	CCG	2	6	420657	420662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457474
9512	NC_013715	CCA	2	6	420672	420677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457474
9513	NC_013715	CCG	2	6	420705	420710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457474
9514	NC_013715	GCG	2	6	420744	420749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457474
9515	NC_013715	TCGGC	2	10	420804	420813	0 %	20 %	40 %	40 %	283457474
9516	NC_013715	CAA	2	6	420829	420834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457474
9517	NC_013715	CTG	2	6	420857	420862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457474
9518	NC_013715	CCA	2	6	420942	420947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457474
9519	NC_013715	ACT	2	6	420975	420980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457474
9520	NC_013715	CGT	2	6	420997	421002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457474
9521	NC_013715	CTT	2	6	421003	421008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457474
9522	NC_013715	GC	5	10	421077	421086	0 %	0 %	50 %	50 %	283457474
9523	NC_013715	GCC	2	6	421134	421139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457474
9524	NC_013715	GC	3	6	421151	421156	0 %	0 %	50 %	50 %	283457474
9525	NC_013715	CTGC	2	8	421175	421182	0 %	25 %	25 %	50 %	283457474
9526	NC_013715	CAG	2	6	421229	421234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457474
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9528	NC_013715	GGC	2	6	421457	421462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457474
9529	NC_013715	CCG	2	6	421466	421471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457474
9530	NC_013715	TG	3	6	421590	421595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9531	NC_013715	GCCC	2	8	421606	421613	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9532	NC_013715	GGT	2	6	421751	421756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9533	NC_013715	CTG	2	6	421876	421881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9534	NC_013715	AC	3	6	421888	421893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9535	NC_013715	CCG	2	6	421896	421901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9536	NC_013715	ACC	2	6	421919	421924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9537	NC_013715	ACT	2	6	421983	421988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9538	NC_013715	ACC	2	6	422045	422050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9539	NC_013715	GGA	2	6	422111	422116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_013715	GAT	2	6	422140	422145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9541	NC_013715	CTG	2	6	422319	422324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457475
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9544	NC_013715	CCG	2	6	422379	422384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457475
9545	NC_013715	GAA	3	9	422393	422401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457475
9546	NC_013715	ACGC	2	8	422430	422437	25 %	0 %	25 %	50 %	283457475
9547	NC_013715	ACG	2	6	422520	422525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457475
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9549	NC_013715	ACCGGT	2	12	422543	422554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283457475
9550	NC_013715	GCA	2	6	422561	422566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457475
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9552	NC_013715	TCC	2	6	422690	422695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457475
9553	NC_013715	GGA	2	6	422710	422715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457475
9554	NC_013715	GCTG	2	8	422761	422768	0 %	25 %	50 %	25 %	283457475
9555	NC_013715	GTC	3	9	422789	422797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457475
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9558	NC_013715	AGCA	2	8	422945	422952	50 %	0 %	25 %	25 %	283457475
9559	NC_013715	CAG	2	6	423002	423007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457475
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9599	NC_013715	TGT	2	6	424578	424583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9600	NC_013715	CT	3	6	424779	424784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9601	NC_013715	ATG	2	6	424812	424817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_013715	AGGC	2	8	424987	424994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9603	NC_013715	T	6	6	424995	425000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_013715	TTTG	2	8	425012	425019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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9608	NC_013715	GC	3	6	425233	425238	0 %	0 %	50 %	50 %	283457476
9609	NC_013715	TCT	2	6	425316	425321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457476
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9611	NC_013715	TGC	4	12	425399	425410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457476
9612	NC_013715	GCTC	2	8	425429	425436	0 %	25 %	25 %	50 %	283457476
9613	NC_013715	CACC	2	8	425463	425470	25 %	0 %	0 %	75 %	283457476
9614	NC_013715	CG	3	6	425512	425517	0 %	0 %	50 %	50 %	283457476
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9621	NC_013715	GGC	2	6	425737	425742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457476
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9990	NC_013715	TGCG	2	8	442909	442916	0 %	25 %	50 %	25 %	283457493
9991	NC_013715	GGC	2	6	442923	442928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457493
9992	NC_013715	CGCCGG	2	12	442948	442959	0 %	0 %	50 %	50 %	283457493
9993	NC_013715	GAC	2	6	442982	442987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457493
9994	NC_013715	GGT	2	6	442988	442993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457493
9995	NC_013715	CGT	2	6	443019	443024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457493
9996	NC_013715	CTT	2	6	443042	443047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457493
9997	NC_013715	CCA	2	6	443066	443071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9998	NC_013715	GCT	2	6	443193	443198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457494
9999	NC_013715	GTAC	2	8	443254	443261	25 %	25 %	25 %	25 %	283457494
10000	NC_013715	TCT	2	6	443428	443433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457494

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