MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013715	CGC	2	6	397326	397331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457446
9002	NC_013715	CACG	2	8	397515	397522	25 %	0 %	25 %	50 %	283457446
9003	NC_013715	GCG	3	9	397547	397555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457446
9004	NC_013715	ACA	2	6	397601	397606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457446
9005	NC_013715	TCA	2	6	397743	397748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_013715	CCAC	2	8	397814	397821	25 %	0 %	0 %	75 %	283457447
9007	NC_013715	TCG	2	6	397921	397926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457447
9008	NC_013715	GCC	2	6	397993	397998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457447
9009	NC_013715	AGA	2	6	398040	398045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457447
9010	NC_013715	CAC	2	6	398046	398051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457447
9011	NC_013715	CCA	2	6	398072	398077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457447
9012	NC_013715	GCG	2	6	398105	398110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457447
9013	NC_013715	TAA	2	6	398117	398122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457447
9014	NC_013715	CG	3	6	398142	398147	0 %	0 %	50 %	50 %	283457447
9015	NC_013715	TCG	2	6	398185	398190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457447
9016	NC_013715	GCGG	2	8	398199	398206	0 %	0 %	75 %	25 %	283457447
9017	NC_013715	TGGCAA	2	12	398219	398230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	283457447
9018	NC_013715	GCT	2	6	398267	398272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457447
9019	NC_013715	AAT	2	6	398280	398285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457447
9020	NC_013715	CCG	2	6	398323	398328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457447
9021	NC_013715	GCC	3	9	398386	398394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457447
9022	NC_013715	TCG	2	6	398407	398412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457447
9023	NC_013715	CCG	2	6	398498	398503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457447
9024	NC_013715	CTG	2	6	398507	398512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457447
9025	NC_013715	CGC	2	6	398568	398573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457447
9026	NC_013715	GC	3	6	398666	398671	0 %	0 %	50 %	50 %	283457447
9027	NC_013715	GGC	2	6	398675	398680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457447
9028	NC_013715	CCT	2	6	398741	398746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457447
9029	NC_013715	GGT	2	6	398752	398757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457447
9030	NC_013715	GGC	2	6	398794	398799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457447
9031	NC_013715	CTT	2	6	398830	398835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457447
9032	NC_013715	A	6	6	398929	398934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_013715	TAG	2	6	398963	398968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_013715	CGG	2	6	399048	399053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457448
9035	NC_013715	GAA	2	6	399103	399108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457448
9036	NC_013715	ACA	2	6	399110	399115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457448
9037	NC_013715	GCT	2	6	399212	399217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457448
9038	NC_013715	TGA	2	6	399247	399252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457448
9039	NC_013715	CT	3	6	399263	399268	0 %	50 %	0 %	50 %	283457448
9040	NC_013715	CT	3	6	399293	399298	0 %	50 %	0 %	50 %	283457448
9041	NC_013715	TGA	2	6	399364	399369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457448
9042	NC_013715	TTC	2	6	399481	399486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457448
9043	NC_013715	CGC	2	6	399576	399581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457448
9044	NC_013715	CCG	2	6	399647	399652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457448
9045	NC_013715	TCC	2	6	399787	399792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457448
9046	NC_013715	GCC	2	6	399867	399872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457448
9047	NC_013715	GTCT	2	8	399960	399967	0 %	50 %	25 %	25 %	283457448
9048	NC_013715	TTC	2	6	399986	399991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457448
9049	NC_013715	CAG	2	6	400010	400015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457448
9050	NC_013715	TGA	2	6	400018	400023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457448
9051	NC_013715	TTG	2	6	400104	400109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457448
9052	NC_013715	GCG	2	6	400196	400201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457448
9053	NC_013715	AGG	2	6	400260	400265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457448
9054	NC_013715	CGG	3	9	400305	400313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457448
9055	NC_013715	GGCGC	2	10	400316	400325	0 %	0 %	60 %	40 %	283457448
9056	NC_013715	GCG	2	6	400334	400339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457448
9057	NC_013715	CT	3	6	400365	400370	0 %	50 %	0 %	50 %	283457448
9058	NC_013715	GCG	2	6	400373	400378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457448
9059	NC_013715	CCTG	2	8	400386	400393	0 %	25 %	25 %	50 %	283457448
9060	NC_013715	ATT	2	6	400409	400414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457448
9061	NC_013715	CGG	2	6	400431	400436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457448
9062	NC_013715	GC	3	6	400529	400534	0 %	0 %	50 %	50 %	283457448
9063	NC_013715	GGT	2	6	400535	400540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457448
9064	NC_013715	TGGTGC	2	12	400542	400553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	283457448
9065	NC_013715	TGA	2	6	400557	400562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457448
9066	NC_013715	GGT	2	6	400634	400639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457448
9067	NC_013715	ATT	2	6	400664	400669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457448
9068	NC_013715	ACG	2	6	400685	400690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457448
9069	NC_013715	TGT	2	6	400767	400772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_013715	CCT	2	6	400776	400781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9071	NC_013715	GGGGA	2	10	400830	400839	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_013715	AG	3	6	400879	400884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_013715	GC	3	6	400890	400895	0 %	0 %	50 %	50 %	283457449
9074	NC_013715	TCAC	2	8	400902	400909	25 %	25 %	0 %	50 %	283457449
9075	NC_013715	TTG	2	6	401024	401029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457449
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9077	NC_013715	GCTG	2	8	401061	401068	0 %	25 %	50 %	25 %	283457449
9078	NC_013715	CAC	2	6	401089	401094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457449
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9080	NC_013715	GC	3	6	401217	401222	0 %	0 %	50 %	50 %	283457449
9081	NC_013715	CTG	2	6	401239	401244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457449
9082	NC_013715	CGC	3	9	401348	401356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9083	NC_013715	GCCT	2	8	401391	401398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9084	NC_013715	CGC	2	6	401472	401477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9085	NC_013715	AAG	2	6	401493	401498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_013715	C	6	6	401501	401506	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9087	NC_013715	CGT	2	6	401597	401602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457450
9088	NC_013715	TCT	2	6	401603	401608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457450
9089	NC_013715	ACG	2	6	401635	401640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457450
9090	NC_013715	GCC	2	6	401682	401687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457450
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9092	NC_013715	GCA	2	6	401780	401785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457450
9093	NC_013715	ATT	2	6	401787	401792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457450
9094	NC_013715	TCA	2	6	401818	401823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457450
9095	NC_013715	CGA	2	6	401870	401875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457450
9096	NC_013715	CGC	2	6	401880	401885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457450
9097	NC_013715	CG	3	6	401912	401917	0 %	0 %	50 %	50 %	283457450
9098	NC_013715	TGC	2	6	401932	401937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457450
9099	NC_013715	GC	3	6	401945	401950	0 %	0 %	50 %	50 %	283457450
9100	NC_013715	CCA	2	6	402028	402033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457450
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9104	NC_013715	TCC	2	6	402237	402242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457450
9105	NC_013715	GC	3	6	402294	402299	0 %	0 %	50 %	50 %	283457450
9106	NC_013715	TGG	2	6	402319	402324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457450
9107	NC_013715	TGC	2	6	402361	402366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457450
9108	NC_013715	GC	3	6	402390	402395	0 %	0 %	50 %	50 %	283457450
9109	NC_013715	TCT	2	6	402400	402405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457450
9110	NC_013715	GCGG	2	8	402441	402448	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9111	NC_013715	TGC	2	6	402449	402454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_013715	CCGC	2	8	402480	402487	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9113	NC_013715	CTA	2	6	402514	402519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457451
9114	NC_013715	CG	3	6	402541	402546	0 %	0 %	50 %	50 %	283457451
9115	NC_013715	CGG	2	6	402595	402600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457451
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9117	NC_013715	GAC	2	6	402635	402640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457451
9118	NC_013715	CAC	2	6	402680	402685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457451
9119	NC_013715	GCT	3	9	402826	402834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457451
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9121	NC_013715	GCT	2	6	402895	402900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457451
9122	NC_013715	CCGCCT	2	12	402910	402921	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	283457451
9123	NC_013715	CTG	2	6	403001	403006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457451
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9125	NC_013715	ATG	2	6	403080	403085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457451
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9246	NC_013715	GT	3	6	408494	408499	0 %	50 %	50 %	0 %	283457458
9247	NC_013715	GCT	2	6	408526	408531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457458
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9370	NC_013715	GGT	2	6	414219	414224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457463
9371	NC_013715	CTT	2	6	414264	414269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457463
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9373	NC_013715	TCA	2	6	414331	414336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9375	NC_013715	CTC	2	6	414400	414405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9485	NC_013715	GAAC	2	8	419603	419610	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9486	NC_013715	AC	4	8	419679	419686	50 %	0 %	0 %	50 %	283457474
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9491	NC_013715	A	6	6	419798	419803	100 %	0 %	0 %	0 %	283457474
9492	NC_013715	ACT	2	6	419854	419859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457474
9493	NC_013715	CTG	2	6	419867	419872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457474
9494	NC_013715	GCC	3	9	419876	419884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457474
9495	NC_013715	CTA	2	6	419902	419907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457474
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9499	NC_013715	CTG	2	6	420293	420298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457474
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