MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_013715	GGC	2	6	285594	285599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457349
6503	NC_013715	TCC	2	6	285615	285620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457349
6504	NC_013715	AAC	2	6	285621	285626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457349
6505	NC_013715	GAC	2	6	285702	285707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457349
6506	NC_013715	TCC	2	6	285804	285809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457349
6507	NC_013715	TGG	2	6	285819	285824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457349
6508	NC_013715	ACCGGC	2	12	285849	285860	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	283457349
6509	NC_013715	GCA	2	6	285871	285876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457349
6510	NC_013715	ACC	2	6	286014	286019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457349
6511	NC_013715	CAGGC	2	10	286036	286045	20 %	0 %	40 %	40 %	283457349
6512	NC_013715	CCG	2	6	286069	286074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457349
6513	NC_013715	ACCG	2	8	286094	286101	25 %	0 %	25 %	50 %	283457349
6514	NC_013715	ACC	2	6	286152	286157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457349
6515	NC_013715	TAC	2	6	286194	286199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457349
6516	NC_013715	ACG	2	6	286243	286248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457349
6517	NC_013715	CCA	2	6	286345	286350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457349
6518	NC_013715	GTA	2	6	286384	286389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_013715	CGG	2	6	286431	286436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_013715	TA	3	6	286514	286519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_013715	GA	3	6	286527	286532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_013715	G	6	6	286538	286543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_013715	CGT	2	6	286558	286563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457350
6524	NC_013715	CAG	2	6	286579	286584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457350
6525	NC_013715	CAG	2	6	286657	286662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457350
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6527	NC_013715	GCC	2	6	286672	286677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457350
6528	NC_013715	CAG	2	6	286705	286710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457350
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6542	NC_013715	GAAT	2	8	287364	287371	50 %	25 %	25 %	0 %	283457350
6543	NC_013715	ACCGA	2	10	287372	287381	40 %	0 %	20 %	40 %	283457350
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6549	NC_013715	GC	3	6	287557	287562	0 %	0 %	50 %	50 %	283457350
6550	NC_013715	TCG	2	6	287573	287578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457350
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6553	NC_013715	GTGC	2	8	287724	287731	0 %	25 %	50 %	25 %	283457350
6554	NC_013715	CG	4	8	287746	287753	0 %	0 %	50 %	50 %	283457350
6555	NC_013715	CGGG	2	8	287966	287973	0 %	0 %	75 %	25 %	283457350
6556	NC_013715	CA	3	6	287980	287985	50 %	0 %	0 %	50 %	283457350
6557	NC_013715	CGCC	2	8	287997	288004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6558	NC_013715	CG	3	6	288128	288133	0 %	0 %	50 %	50 %	283457351
6559	NC_013715	CGG	2	6	288160	288165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457351
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6564	NC_013715	CGA	2	6	288394	288399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457351
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6569	NC_013715	TTA	2	6	288660	288665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6571	NC_013715	TAA	2	6	288716	288721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_013715	ATG	2	6	288730	288735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6598	NC_013715	CCGTA	2	10	289753	289762	20 %	20 %	20 %	40 %	283457353
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6603	NC_013715	GGA	2	6	289921	289926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457353
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6619	NC_013715	TCTGC	2	10	290650	290659	0 %	40 %	20 %	40 %	283457354
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6622	NC_013715	ACCGCA	2	12	290749	290760	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	283457354
6623	NC_013715	GAG	2	6	290816	290821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457354
6624	NC_013715	CCCCGA	2	12	290838	290849	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	283457354
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6654	NC_013715	GGT	2	6	292407	292412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457354
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6732	NC_013715	CTG	2	6	296179	296184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457358
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6866	NC_013715	GTC	2	6	302258	302263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457365
6867	NC_013715	CTG	2	6	302300	302305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457365
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6988	NC_013715	ACG	2	6	307456	307461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457368
6989	NC_013715	CCGAC	2	10	307477	307486	20 %	0 %	20 %	60 %	283457368
6990	NC_013715	GGCAC	2	10	307552	307561	20 %	0 %	40 %	40 %	283457368
6991	NC_013715	GCG	2	6	307663	307668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457368
6992	NC_013715	ATT	2	6	307695	307700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457368
6993	NC_013715	GGT	2	6	307710	307715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457368
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6998	NC_013715	CCG	2	6	308000	308005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457368
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7000	NC_013715	GGC	2	6	308096	308101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457368

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