MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013715	AGC	2	6	242004	242009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457308
5502	NC_013715	GAT	2	6	242015	242020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457308
5503	NC_013715	AG	3	6	242031	242036	50 %	0 %	50 %	0 %	283457308
5504	NC_013715	ACAG	2	8	242055	242062	50 %	0 %	25 %	25 %	283457308
5505	NC_013715	TCA	2	6	242115	242120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457308
5506	NC_013715	CGG	3	9	242121	242129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457308
5507	NC_013715	AGC	2	6	242141	242146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457308
5508	NC_013715	ACC	2	6	242291	242296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457308
5509	NC_013715	GAG	2	6	242319	242324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457308
5510	NC_013715	GAA	2	6	242344	242349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457308
5511	NC_013715	CCTG	2	8	242408	242415	0 %	25 %	25 %	50 %	283457309
5512	NC_013715	CGC	3	9	242527	242535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457309
5513	NC_013715	ACC	2	6	242555	242560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457309
5514	NC_013715	CTG	2	6	242575	242580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5515	NC_013715	CAG	3	9	242593	242601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5516	NC_013715	CG	3	6	242615	242620	0 %	0 %	50 %	50 %	283457309
5517	NC_013715	GC	3	6	242634	242639	0 %	0 %	50 %	50 %	283457309
5518	NC_013715	ACC	2	6	242713	242718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457309
5519	NC_013715	CGG	2	6	242735	242740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457309
5520	NC_013715	CAG	2	6	242770	242775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5521	NC_013715	CTG	2	6	242797	242802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5522	NC_013715	ATC	2	6	242819	242824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457309
5523	NC_013715	GCG	2	6	242825	242830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457309
5524	NC_013715	CTG	2	6	242875	242880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5525	NC_013715	GC	3	6	242903	242908	0 %	0 %	50 %	50 %	283457309
5526	NC_013715	GCTCAC	2	12	242919	242930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283457309
5527	NC_013715	GGT	2	6	243022	243027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457309
5528	NC_013715	ACCGGA	2	12	243031	243042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5529	NC_013715	GCA	2	6	243096	243101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5530	NC_013715	CGCGC	2	10	243148	243157	0 %	0 %	40 %	60 %	283457309
5531	NC_013715	CTG	2	6	243169	243174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5532	NC_013715	CTG	2	6	243178	243183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5533	NC_013715	TAG	2	6	243221	243226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457309
5534	NC_013715	CTG	2	6	243238	243243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5535	NC_013715	CTG	2	6	243247	243252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5536	NC_013715	CTG	2	6	243262	243267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457309
5537	NC_013715	GCC	2	6	243293	243298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457309
5538	NC_013715	ATC	2	6	243411	243416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_013715	A	6	6	243475	243480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_013715	ACC	2	6	243501	243506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_013715	CAG	2	6	243538	243543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_013715	GCG	2	6	243592	243597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_013715	CAT	2	6	243658	243663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457310
5544	NC_013715	CAT	2	6	243697	243702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457310
5545	NC_013715	ACC	2	6	243738	243743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457310
5546	NC_013715	GGC	2	6	243752	243757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457310
5547	NC_013715	GCAG	2	8	243820	243827	25 %	0 %	50 %	25 %	283457310
5548	NC_013715	CAC	2	6	243838	243843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457310
5549	NC_013715	CGC	2	6	243864	243869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457310
5550	NC_013715	CAA	2	6	244018	244023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457310
5551	NC_013715	GAA	2	6	244042	244047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457310
5552	NC_013715	CCG	2	6	244087	244092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457310
5553	NC_013715	CGC	2	6	244120	244125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457310
5554	NC_013715	CCATGA	2	12	244143	244154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283457310
5555	NC_013715	GCA	2	6	244282	244287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457310
5556	NC_013715	CGG	2	6	244320	244325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457310
5557	NC_013715	GCAC	2	8	244439	244446	25 %	0 %	25 %	50 %	283457310
5558	NC_013715	AAG	2	6	244454	244459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457310
5559	NC_013715	CGC	2	6	244500	244505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457310
5560	NC_013715	TGG	2	6	244581	244586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457310
5561	NC_013715	CGC	2	6	244634	244639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457310
5562	NC_013715	CTA	2	6	244651	244656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457310
5563	NC_013715	GTGCG	2	10	244692	244701	0 %	20 %	60 %	20 %	283457310
5564	NC_013715	CGTG	2	8	244717	244724	0 %	25 %	50 %	25 %	283457310
5565	NC_013715	CT	3	6	244727	244732	0 %	50 %	0 %	50 %	283457310
5566	NC_013715	AGA	2	6	244749	244754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457310
5567	NC_013715	CCG	2	6	244783	244788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457310
5568	NC_013715	GCA	2	6	244799	244804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457310
5569	NC_013715	GACCGT	2	12	244819	244830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283457310
5570	NC_013715	CGA	2	6	244897	244902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457310
5571	NC_013715	GGT	2	6	244927	244932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457311
5572	NC_013715	GGC	2	6	244948	244953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457311
5573	NC_013715	GGT	2	6	244988	244993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457311
5574	NC_013715	GCC	2	6	245044	245049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457311
5575	NC_013715	GCT	2	6	245057	245062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457311
5576	NC_013715	CTGC	2	8	245088	245095	0 %	25 %	25 %	50 %	283457311
5577	NC_013715	TCA	2	6	245098	245103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457311
5578	NC_013715	AGC	2	6	245119	245124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457311
5579	NC_013715	TCA	2	6	245134	245139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457311
5580	NC_013715	CGGG	2	8	245149	245156	0 %	0 %	75 %	25 %	283457311
5581	NC_013715	CTG	2	6	245169	245174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457311
5582	NC_013715	TGA	2	6	245287	245292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457311
5583	NC_013715	CTG	2	6	245307	245312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457311
5584	NC_013715	GCG	2	6	245316	245321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457311
5585	NC_013715	CGT	2	6	245346	245351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457311
5586	NC_013715	CGT	2	6	245355	245360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457311
5587	NC_013715	TAAA	2	8	245372	245379	75 %	25 %	0 %	0 %	283457311
5588	NC_013715	TGG	2	6	245495	245500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_013715	CTG	2	6	245674	245679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_013715	TC	3	6	245696	245701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_013715	GAGCA	2	10	245717	245726	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5592	NC_013715	TCC	2	6	245747	245752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_013715	AGA	2	6	245787	245792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457312
5594	NC_013715	TTG	2	6	245816	245821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457312
5595	NC_013715	CGT	2	6	245830	245835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457312
5596	NC_013715	GC	3	6	245854	245859	0 %	0 %	50 %	50 %	283457312
5597	NC_013715	CGT	2	6	245887	245892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457312
5598	NC_013715	GAA	2	6	245908	245913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457312
5599	NC_013715	CCG	2	6	245925	245930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457312
5600	NC_013715	GGT	2	6	245938	245943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457312
5601	NC_013715	TCC	2	6	245977	245982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457312
5602	NC_013715	TCC	2	6	245986	245991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457312
5603	NC_013715	CCA	2	6	246029	246034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457312
5604	NC_013715	TGC	2	6	246047	246052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457312
5605	NC_013715	CCA	2	6	246092	246097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457312
5606	NC_013715	TCA	2	6	246164	246169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457312
5607	NC_013715	TGCAC	2	10	246174	246183	20 %	20 %	20 %	40 %	283457312
5608	NC_013715	GCCGAA	2	12	246199	246210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457312
5609	NC_013715	GGC	2	6	246232	246237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457312
5610	NC_013715	GCT	2	6	246259	246264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457312
5611	NC_013715	CGC	2	6	246276	246281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457312
5612	NC_013715	GGC	2	6	246402	246407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457312
5613	NC_013715	CCG	2	6	246408	246413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457312
5614	NC_013715	ATT	2	6	246573	246578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457313
5615	NC_013715	GC	3	6	246622	246627	0 %	0 %	50 %	50 %	283457313
5616	NC_013715	CAC	3	9	246860	246868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457313
5617	NC_013715	TGG	2	6	246928	246933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457313
5618	NC_013715	GGT	2	6	246959	246964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457313
5619	NC_013715	CTA	2	6	247001	247006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457313
5620	NC_013715	TGG	2	6	247015	247020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457313
5621	NC_013715	GC	3	6	247028	247033	0 %	0 %	50 %	50 %	283457313
5622	NC_013715	GGA	2	6	247133	247138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457313
5623	NC_013715	GAG	2	6	247170	247175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457313
5624	NC_013715	CCGC	2	8	247198	247205	0 %	0 %	25 %	75 %	283457313
5625	NC_013715	GCT	2	6	247217	247222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457313
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5627	NC_013715	GGC	2	6	247263	247268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457313
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5635	NC_013715	ACGC	2	8	247603	247610	25 %	0 %	25 %	50 %	283457314
5636	NC_013715	AC	4	8	247621	247628	50 %	0 %	0 %	50 %	283457314
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5739	NC_013715	T	6	6	252144	252149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5740	NC_013715	G	6	6	252164	252169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5741	NC_013715	TA	4	8	252202	252209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5743	NC_013715	GGGA	2	8	252429	252436	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5850	NC_013715	GAAG	2	8	257588	257595	50 %	0 %	50 %	0 %	283457324
5851	NC_013715	CGC	2	6	257615	257620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457324
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