MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 plasmid pRMAR01

Total Repeats: 2597

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013502	TGC	2	6	120740	120745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_013502	TAC	2	6	120784	120789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_013502	TGC	2	6	120811	120816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_013502	TGC	2	6	120885	120890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_013502	TGC	2	6	120956	120961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_013502	TGC	2	6	121029	121034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_013502	TCT	2	6	121057	121062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_013502	TCG	2	6	121063	121068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_013502	TGC	2	6	121103	121108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_013502	TGC	2	6	121176	121181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_013502	GGTC	2	8	121210	121217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2512	NC_013502	TGC	2	6	121250	121255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_013502	TC	3	6	121278	121283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_013502	TGC	2	6	121323	121328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_013502	TGC	2	6	121397	121402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_013502	TGC	2	6	121470	121475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_013502	TGC	2	6	121542	121547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_013502	TGC	2	6	121615	121620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_013502	GCG	3	9	121650	121658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_013502	CTC	2	6	121660	121665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_013502	TGC	2	6	121685	121690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_013502	CGA	2	6	121715	121720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_013502	TGC	2	6	121759	121764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_013502	GCT	2	6	121800	121805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_013502	GAG	2	6	121816	121821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_013502	TGC	2	6	121834	121839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_013502	TGC	2	6	121908	121913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_013502	A	6	6	121943	121948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_013502	CTT	2	6	121963	121968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_013502	TGC	2	6	121979	121984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_013502	GC	3	6	122015	122020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_013502	TCGCA	2	10	122022	122031	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2533	NC_013502	TGC	2	6	122052	122057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_013502	GGC	2	6	122099	122104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_013502	T	6	6	122106	122111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_013502	TCCA	2	8	122113	122120	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_013502	TCA	2	6	122157	122162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_013502	ACA	2	6	122188	122193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_013502	CGC	2	6	122233	122238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_013502	TTC	2	6	122289	122294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318440
2541	NC_013502	CCA	2	6	122365	122370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318440
2542	NC_013502	TGAT	2	8	122391	122398	25 %	50 %	25 %	0 %	268318440
2543	NC_013502	AGCC	2	8	122485	122492	25 %	0 %	25 %	50 %	268318440
2544	NC_013502	ATA	2	6	122549	122554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318440
2545	NC_013502	GTA	2	6	122567	122572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318441
2546	NC_013502	TA	3	6	122578	122583	50 %	50 %	0 %	0 %	268318441
2547	NC_013502	GCCTG	2	10	122619	122628	0 %	20 %	40 %	40 %	268318441
2548	NC_013502	GCT	2	6	122697	122702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318441
2549	NC_013502	TTC	2	6	122735	122740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318441
2550	NC_013502	GCA	2	6	122805	122810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318441
2551	NC_013502	TCC	2	6	122840	122845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318441
2552	NC_013502	GCC	2	6	122868	122873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318441
2553	NC_013502	TGA	2	6	122885	122890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318441
2554	NC_013502	CA	3	6	122931	122936	50 %	0 %	0 %	50 %	268318441
2555	NC_013502	AGAAA	2	10	122963	122972	80 %	0 %	20 %	0 %	268318441
2556	NC_013502	GCC	2	6	123000	123005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318441
2557	NC_013502	GCGAT	2	10	123029	123038	20 %	20 %	40 %	20 %	268318441
2558	NC_013502	GCA	2	6	123077	123082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318441
2559	NC_013502	GGA	2	6	123112	123117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318441
2560	NC_013502	CGG	2	6	123122	123127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318441
2561	NC_013502	GCA	2	6	123156	123161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318441
2562	NC_013502	TCG	2	6	123260	123265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318441
2563	NC_013502	CGGC	2	8	123338	123345	0 %	0 %	50 %	50 %	268318441
2564	NC_013502	CCA	2	6	123378	123383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318441
2565	NC_013502	ATCA	2	8	123442	123449	50 %	25 %	0 %	25 %	268318441
2566	NC_013502	AAG	2	6	123487	123492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318441
2567	NC_013502	AAC	2	6	123511	123516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318441
2568	NC_013502	GCC	2	6	123570	123575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318441
2569	NC_013502	CCA	2	6	123639	123644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318441
2570	NC_013502	GGA	2	6	123680	123685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318441
2571	NC_013502	CCTC	2	8	123806	123813	0 %	25 %	0 %	75 %	268318441
2572	NC_013502	TC	3	6	123828	123833	0 %	50 %	0 %	50 %	268318441
2573	NC_013502	GAA	2	6	123834	123839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318441
2574	NC_013502	CTT	2	6	123904	123909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318441
2575	NC_013502	TCA	2	6	123987	123992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318441
2576	NC_013502	TCA	2	6	124028	124033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318441
2577	NC_013502	GTCC	2	8	124060	124067	0 %	25 %	25 %	50 %	268318441
2578	NC_013502	CTA	2	6	124079	124084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318441
2579	NC_013502	TCC	2	6	124106	124111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318441
2580	NC_013502	ACG	2	6	124230	124235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318442
2581	NC_013502	CCA	2	6	124267	124272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318442
2582	NC_013502	ACC	2	6	124478	124483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318442
2583	NC_013502	C	6	6	124531	124536	0 %	0 %	0 %	100 %	268318442
2584	NC_013502	CG	3	6	124576	124581	0 %	0 %	50 %	50 %	268318442
2585	NC_013502	GC	3	6	124663	124668	0 %	0 %	50 %	50 %	268318442
2586	NC_013502	TGG	2	6	124728	124733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318442
2587	NC_013502	TCT	2	6	124773	124778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318442
2588	NC_013502	TCT	2	6	124788	124793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318442
2589	NC_013502	TTC	2	6	124890	124895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318442
2590	NC_013502	ACG	2	6	124956	124961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318442
2591	NC_013502	CTT	2	6	124964	124969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318442
2592	NC_013502	GCA	2	6	124994	124999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318442
2593	NC_013502	GCC	2	6	125021	125026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318442
2594	NC_013502	TCTT	2	8	125030	125037	0 %	75 %	0 %	25 %	268318442
2595	NC_013502	CTCAG	2	10	125049	125058	20 %	20 %	20 %	40 %	268318442
2596	NC_013502	CGGT	2	8	125069	125076	0 %	25 %	50 %	25 %	268318442
2597	NC_013502	CAG	2	6	125120	125125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.