MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 plasmid pRMAR01

Total Repeats: 2597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013502	CTG	2	6	25516	25521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318359
502	NC_013502	CAC	2	6	25550	25555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318359
503	NC_013502	TGCG	2	8	25590	25597	0 %	25 %	50 %	25 %	268318359
504	NC_013502	CTC	2	6	25633	25638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318359
505	NC_013502	GCG	2	6	25649	25654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318359
506	NC_013502	CCT	2	6	25656	25661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318359
507	NC_013502	AT	3	6	25710	25715	50 %	50 %	0 %	0 %	268318359
508	NC_013502	A	6	6	25766	25771	100 %	0 %	0 %	0 %	268318359
509	NC_013502	TCG	2	6	25895	25900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318359
510	NC_013502	CAG	2	6	25939	25944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318359
511	NC_013502	CCTTT	2	10	25971	25980	0 %	60 %	0 %	40 %	268318359
512	NC_013502	T	7	7	25978	25984	0 %	100 %	0 %	0 %	268318359
513	NC_013502	AGA	2	6	25998	26003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318359
514	NC_013502	TCC	2	6	26006	26011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318359
515	NC_013502	A	7	7	26025	26031	100 %	0 %	0 %	0 %	268318359
516	NC_013502	CT	3	6	26038	26043	0 %	50 %	0 %	50 %	268318359
517	NC_013502	TCT	2	6	26109	26114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318359
518	NC_013502	CCA	2	6	26124	26129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318359
519	NC_013502	GCAG	2	8	26142	26149	25 %	0 %	50 %	25 %	268318359
520	NC_013502	GCT	2	6	26211	26216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318359
521	NC_013502	GCT	2	6	26280	26285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318359
522	NC_013502	CGC	2	6	26322	26327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318359
523	NC_013502	GCG	2	6	26353	26358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318359
524	NC_013502	TGT	2	6	26376	26381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318359
525	NC_013502	CCT	2	6	26442	26447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318359
526	NC_013502	CAG	2	6	26461	26466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318359
527	NC_013502	GAT	2	6	26515	26520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318359
528	NC_013502	CTGT	2	8	26602	26609	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_013502	CAG	2	6	26710	26715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318360
530	NC_013502	AGC	2	6	26903	26908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318360
531	NC_013502	CAGCTC	2	12	26935	26946	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268318360
532	NC_013502	CGC	2	6	26988	26993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318360
533	NC_013502	AGAA	2	8	27056	27063	75 %	0 %	25 %	0 %	268318360
534	NC_013502	GTA	2	6	27085	27090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318360
535	NC_013502	AGA	2	6	27102	27107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318360
536	NC_013502	GGCC	2	8	27111	27118	0 %	0 %	50 %	50 %	268318360
537	NC_013502	GTG	2	6	27134	27139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318360
538	NC_013502	TCGA	2	8	27152	27159	25 %	25 %	25 %	25 %	268318360
539	NC_013502	CTG	2	6	27220	27225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318360
540	NC_013502	CTG	2	6	27235	27240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318360
541	NC_013502	TCG	2	6	27251	27256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318360
542	NC_013502	TTC	2	6	27317	27322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318360
543	NC_013502	CAG	2	6	27373	27378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318360
544	NC_013502	GCG	2	6	27381	27386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318360
545	NC_013502	GGA	2	6	27387	27392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318360
546	NC_013502	GCC	2	6	27423	27428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318360
547	NC_013502	CGG	2	6	27478	27483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318360
548	NC_013502	CCA	2	6	27534	27539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318360
549	NC_013502	AAG	2	6	27597	27602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318360
550	NC_013502	CGGC	2	8	27751	27758	0 %	0 %	50 %	50 %	268318361
551	NC_013502	GTC	2	6	27789	27794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318361
552	NC_013502	GAT	2	6	27804	27809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318361
553	NC_013502	CG	3	6	27845	27850	0 %	0 %	50 %	50 %	268318361
554	NC_013502	CCAG	2	8	27863	27870	25 %	0 %	25 %	50 %	268318361
555	NC_013502	GGC	2	6	28002	28007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318361
556	NC_013502	CGG	2	6	28151	28156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318361
557	NC_013502	AC	3	6	28166	28171	50 %	0 %	0 %	50 %	268318361
558	NC_013502	AGC	2	6	28243	28248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318361
559	NC_013502	GC	4	8	28247	28254	0 %	0 %	50 %	50 %	268318361
560	NC_013502	TCG	2	6	28295	28300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318361
561	NC_013502	CGC	2	6	28328	28333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318361
562	NC_013502	GCC	2	6	28356	28361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318361
563	NC_013502	GCCT	2	8	28556	28563	0 %	25 %	25 %	50 %	268318362
564	NC_013502	GTC	2	6	28567	28572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318362
565	NC_013502	GCC	2	6	28596	28601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318362
566	NC_013502	CGC	2	6	28643	28648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318362
567	NC_013502	TCC	2	6	28784	28789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318362
568	NC_013502	CAG	2	6	28878	28883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
569	NC_013502	GGC	2	6	28890	28895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318363
570	NC_013502	ATG	2	6	28900	28905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318363
571	NC_013502	CAG	2	6	28941	28946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
572	NC_013502	GCGG	2	8	28973	28980	0 %	0 %	75 %	25 %	268318363
573	NC_013502	CTG	2	6	28989	28994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
574	NC_013502	GC	3	6	29019	29024	0 %	0 %	50 %	50 %	268318363
575	NC_013502	GCA	2	6	29036	29041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
576	NC_013502	CGTC	2	8	29077	29084	0 %	25 %	25 %	50 %	268318363
577	NC_013502	TCG	2	6	29086	29091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
578	NC_013502	CTC	2	6	29145	29150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318363
579	NC_013502	TCG	2	6	29164	29169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
580	NC_013502	GCA	2	6	29180	29185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
581	NC_013502	GCT	2	6	29219	29224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
582	NC_013502	CTC	3	9	29283	29291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318363
583	NC_013502	GCCG	2	8	29295	29302	0 %	0 %	50 %	50 %	268318363
584	NC_013502	GCC	2	6	29308	29313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318363
585	NC_013502	GTT	2	6	29373	29378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318363
586	NC_013502	GCA	2	6	29423	29428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
587	NC_013502	GTC	2	6	29457	29462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
588	NC_013502	GAA	2	6	29523	29528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318363
589	NC_013502	GCC	2	6	29551	29556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318363
590	NC_013502	ACCGA	2	10	29568	29577	40 %	0 %	20 %	40 %	268318363
591	NC_013502	CAC	2	6	29604	29609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318363
592	NC_013502	GC	3	6	29615	29620	0 %	0 %	50 %	50 %	268318363
593	NC_013502	CAG	2	6	29652	29657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
594	NC_013502	CGC	2	6	29679	29684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318363
595	NC_013502	CTC	2	6	29688	29693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318363
596	NC_013502	GCC	2	6	29705	29710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318363
597	NC_013502	CGG	2	6	29747	29752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318363
598	NC_013502	CGC	2	6	29773	29778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318363
599	NC_013502	TCG	2	6	29801	29806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
600	NC_013502	GCA	2	6	29849	29854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
601	NC_013502	CCT	3	9	29867	29875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318363
602	NC_013502	GGAT	2	8	30126	30133	25 %	25 %	50 %	0 %	268318363
603	NC_013502	GCA	3	9	30269	30277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
604	NC_013502	GCC	2	6	30288	30293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318363
605	NC_013502	GCT	2	6	30294	30299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
606	NC_013502	GCAC	2	8	30305	30312	25 %	0 %	25 %	50 %	268318363
607	NC_013502	CAC	2	6	30348	30353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318363
608	NC_013502	CAG	2	6	30363	30368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
609	NC_013502	AACG	2	8	30379	30386	50 %	0 %	25 %	25 %	268318363
610	NC_013502	TCG	2	6	30418	30423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
611	NC_013502	CGG	2	6	30485	30490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318363
612	NC_013502	CGC	2	6	30560	30565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318363
613	NC_013502	GC	3	6	30564	30569	0 %	0 %	50 %	50 %	268318363
614	NC_013502	AGC	2	6	30610	30615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
615	NC_013502	GCC	2	6	30634	30639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318363
616	NC_013502	CAT	2	6	30644	30649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318363
617	NC_013502	GAC	2	6	30750	30755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
618	NC_013502	GCA	2	6	30830	30835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
619	NC_013502	CCAG	2	8	30842	30849	25 %	0 %	25 %	50 %	268318363
620	NC_013502	GCC	2	6	30880	30885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318363
621	NC_013502	TGC	2	6	30937	30942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
622	NC_013502	GCT	2	6	31004	31009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318363
623	NC_013502	GCA	2	6	31028	31033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318363
624	NC_013502	TAC	2	6	31075	31080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013502	ATC	2	6	31093	31098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013502	CGCC	2	8	31104	31111	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
627	NC_013502	TTCGA	2	10	31198	31207	20 %	40 %	20 %	20 %	268318364
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996	NC_013502	A	6	6	48614	48619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
997	NC_013502	AGGGG	2	10	48722	48731	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
998	NC_013502	ACC	2	6	48744	48749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1000	NC_013502	GC	3	6	48782	48787	0 %	0 %	50 %	50 %	268318382

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