MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_013501	CGA	2	6	1048664	1048669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316486
25003	NC_013501	GCC	2	6	1048718	1048723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316486
25004	NC_013501	CACG	2	8	1048724	1048731	25 %	0 %	25 %	50 %	268316486
25005	NC_013501	GCG	2	6	1048762	1048767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316486
25006	NC_013501	AGA	2	6	1048871	1048876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316486
25007	NC_013501	TGCGC	2	10	1048913	1048922	0 %	20 %	40 %	40 %	268316486
25008	NC_013501	GCA	2	6	1048937	1048942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316486
25009	NC_013501	CGA	2	6	1049099	1049104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316486
25010	NC_013501	TTC	3	9	1049124	1049132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316486
25011	NC_013501	GTG	2	6	1049193	1049198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316486
25012	NC_013501	ACG	2	6	1049307	1049312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316486
25013	NC_013501	ACG	2	6	1049368	1049373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316486
25014	NC_013501	ACG	2	6	1049382	1049387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316486
25015	NC_013501	CGC	2	6	1049406	1049411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316486
25016	NC_013501	GCCATC	2	12	1049412	1049423	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268316486
25017	NC_013501	TCA	3	9	1049428	1049436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316486
25018	NC_013501	TCA	2	6	1049485	1049490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316486
25019	NC_013501	GACC	2	8	1049501	1049508	25 %	0 %	25 %	50 %	268316486
25020	NC_013501	GAA	2	6	1049514	1049519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316486
25021	NC_013501	TGC	2	6	1049524	1049529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316486
25022	NC_013501	CGAC	2	8	1049546	1049553	25 %	0 %	25 %	50 %	268316486
25023	NC_013501	AGG	2	6	1049605	1049610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316486
25024	NC_013501	GCT	2	6	1049615	1049620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316486
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25030	NC_013501	GCG	2	6	1049774	1049779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316486
25031	NC_013501	GCA	2	6	1049816	1049821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316486
25032	NC_013501	GCTC	2	8	1049878	1049885	0 %	25 %	25 %	50 %	268316486
25033	NC_013501	CGG	2	6	1049915	1049920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316486
25034	NC_013501	TGT	2	6	1049950	1049955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25035	NC_013501	TGC	2	6	1050077	1050082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316487
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25041	NC_013501	TGC	2	6	1050312	1050317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25042	NC_013501	CAG	2	6	1050507	1050512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316488
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25068	NC_013501	CG	3	6	1051866	1051871	0 %	0 %	50 %	50 %	268316488
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25082	NC_013501	GCC	2	6	1052329	1052334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316488
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25109	NC_013501	CAG	2	6	1053270	1053275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316488
25110	NC_013501	GGA	2	6	1053288	1053293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25111	NC_013501	CGC	2	6	1053334	1053339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25112	NC_013501	TCATT	2	10	1053370	1053379	20 %	60 %	0 %	20 %	268316489
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25115	NC_013501	ACG	2	6	1053456	1053461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316489
25116	NC_013501	CTG	2	6	1053494	1053499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316489
25117	NC_013501	CGAG	2	8	1053508	1053515	25 %	0 %	50 %	25 %	268316489
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25219	NC_013501	ATCC	2	8	1058047	1058054	25 %	25 %	0 %	50 %	268316492
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25224	NC_013501	GCC	2	6	1058230	1058235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25225	NC_013501	TGC	2	6	1058253	1058258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316493
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25227	NC_013501	TGC	2	6	1058286	1058291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316493
25228	NC_013501	CAGGTG	2	12	1058294	1058305	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268316493
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25347	NC_013501	GGA	2	6	1062916	1062921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316498
25348	NC_013501	CGT	3	9	1062922	1062930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316498
25349	NC_013501	GTC	2	6	1062933	1062938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316498
25350	NC_013501	GTT	2	6	1063124	1063129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316498
25351	NC_013501	CGG	2	6	1063160	1063165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316498
25352	NC_013501	GAC	2	6	1063175	1063180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316498
25353	NC_013501	GTG	2	6	1063221	1063226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316498
25354	NC_013501	TGA	2	6	1063231	1063236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316498
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25356	NC_013501	TGA	2	6	1063321	1063326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316498
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25358	NC_013501	CGA	2	6	1063390	1063395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316498
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25372	NC_013501	TGA	2	6	1064014	1064019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316498
25373	NC_013501	CGA	2	6	1064050	1064055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316498
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25379	NC_013501	GGCG	2	8	1064320	1064327	0 %	0 %	75 %	25 %	268316499
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25430	NC_013501	TCGAG	2	10	1066745	1066754	20 %	20 %	40 %	20 %	268316501
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25450	NC_013501	CGGCG	2	10	1067653	1067662	0 %	0 %	60 %	40 %	268316502
25451	NC_013501	CGT	2	6	1067698	1067703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316502
25452	NC_013501	CG	3	6	1067730	1067735	0 %	0 %	50 %	50 %	268316502
25453	NC_013501	GCCAGC	2	12	1067762	1067773	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268316502
25454	NC_013501	AAG	2	6	1067788	1067793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316502
25455	NC_013501	TGGT	2	8	1067811	1067818	0 %	50 %	50 %	0 %	268316502
25456	NC_013501	GATG	2	8	1067828	1067835	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25457	NC_013501	CGGC	2	8	1067848	1067855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25458	NC_013501	CCG	2	6	1067875	1067880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25459	NC_013501	TTG	2	6	1067909	1067914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25461	NC_013501	GTG	2	6	1068024	1068029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316503
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