MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_013501	AGC	2	6	1027118	1027123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316469
24502	NC_013501	TCG	2	6	1027170	1027175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316469
24503	NC_013501	GCTCC	2	10	1027186	1027195	0 %	20 %	20 %	60 %	268316469
24504	NC_013501	CTC	2	6	1027201	1027206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316469
24505	NC_013501	AGCC	2	8	1027283	1027290	25 %	0 %	25 %	50 %	268316469
24506	NC_013501	TG	3	6	1027291	1027296	0 %	50 %	50 %	0 %	268316469
24507	NC_013501	TCCT	2	8	1027355	1027362	0 %	50 %	0 %	50 %	268316470
24508	NC_013501	TTC	2	6	1027403	1027408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316470
24509	NC_013501	CGA	2	6	1027414	1027419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316470
24510	NC_013501	ACC	2	6	1027425	1027430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316470
24511	NC_013501	ATG	2	6	1027497	1027502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316470
24512	NC_013501	GCA	2	6	1027507	1027512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316470
24513	NC_013501	CGGC	2	8	1027568	1027575	0 %	0 %	50 %	50 %	268316470
24514	NC_013501	CGGT	2	8	1027584	1027591	0 %	25 %	50 %	25 %	268316470
24515	NC_013501	GCA	2	6	1027609	1027614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316470
24516	NC_013501	CGG	2	6	1027624	1027629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316470
24517	NC_013501	CAA	2	6	1027660	1027665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316471
24518	NC_013501	GGCG	2	8	1027668	1027675	0 %	0 %	75 %	25 %	268316471
24519	NC_013501	CAG	2	6	1027699	1027704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316471
24520	NC_013501	CAG	2	6	1027723	1027728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316471
24521	NC_013501	CAG	2	6	1027732	1027737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316471
24522	NC_013501	GCA	2	6	1027761	1027766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316471
24523	NC_013501	G	6	6	1027835	1027840	0 %	0 %	100 %	0 %	268316471
24524	NC_013501	AGC	2	6	1027896	1027901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316471
24525	NC_013501	ACC	2	6	1027913	1027918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316471
24526	NC_013501	CCAG	2	8	1027944	1027951	25 %	0 %	25 %	50 %	268316471
24527	NC_013501	GCC	2	6	1027999	1028004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316471
24528	NC_013501	CAG	3	9	1028014	1028022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316471
24529	NC_013501	GTT	2	6	1028043	1028048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316472
24530	NC_013501	GCA	2	6	1028113	1028118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316472
24531	NC_013501	CGT	2	6	1028129	1028134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316472
24532	NC_013501	CAG	2	6	1028151	1028156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316472
24533	NC_013501	AGC	2	6	1028215	1028220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316472
24534	NC_013501	GAC	2	6	1028232	1028237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316472
24535	NC_013501	GC	3	6	1028250	1028255	0 %	0 %	50 %	50 %	268316472
24536	NC_013501	GCA	2	6	1028273	1028278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316472
24537	NC_013501	CGC	2	6	1028291	1028296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316472
24538	NC_013501	CGGC	2	8	1028433	1028440	0 %	0 %	50 %	50 %	268316472
24539	NC_013501	A	6	6	1028493	1028498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24540	NC_013501	CTG	2	6	1028518	1028523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24541	NC_013501	CTG	2	6	1028583	1028588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24542	NC_013501	GGCGCA	2	12	1028609	1028620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	268316473
24543	NC_013501	GCC	2	6	1028636	1028641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316473
24544	NC_013501	CTCG	2	8	1028699	1028706	0 %	25 %	25 %	50 %	268316473
24545	NC_013501	GCA	2	6	1028725	1028730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24546	NC_013501	CAT	2	6	1028741	1028746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316473
24547	NC_013501	GTG	2	6	1028757	1028762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316473
24548	NC_013501	GAC	2	6	1028781	1028786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24549	NC_013501	CCGA	2	8	1028787	1028794	25 %	0 %	25 %	50 %	268316473
24550	NC_013501	GGC	2	6	1028817	1028822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316473
24551	NC_013501	AAC	2	6	1028838	1028843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316473
24552	NC_013501	TTCC	2	8	1028849	1028856	0 %	50 %	0 %	50 %	268316473
24553	NC_013501	TGGG	2	8	1028931	1028938	0 %	25 %	75 %	0 %	268316473
24554	NC_013501	ACGG	2	8	1028997	1029004	25 %	0 %	50 %	25 %	268316473
24555	NC_013501	CAC	2	6	1029042	1029047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316473
24556	NC_013501	ATCC	2	8	1029063	1029070	25 %	25 %	0 %	50 %	268316473
24557	NC_013501	ACGG	2	8	1029150	1029157	25 %	0 %	50 %	25 %	268316473
24558	NC_013501	GAC	2	6	1029189	1029194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24559	NC_013501	GCGCC	2	10	1029269	1029278	0 %	0 %	40 %	60 %	268316473
24560	NC_013501	TCG	2	6	1029286	1029291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24561	NC_013501	GGCC	2	8	1029293	1029300	0 %	0 %	50 %	50 %	268316473
24562	NC_013501	CGAC	2	8	1029322	1029329	25 %	0 %	25 %	50 %	268316473
24563	NC_013501	GGC	2	6	1029330	1029335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316473
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24567	NC_013501	GAC	2	6	1029549	1029554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24568	NC_013501	CCTT	2	8	1029565	1029572	0 %	50 %	0 %	50 %	268316473
24569	NC_013501	CG	3	6	1029589	1029594	0 %	0 %	50 %	50 %	268316473
24570	NC_013501	CG	3	6	1029607	1029612	0 %	0 %	50 %	50 %	268316473
24571	NC_013501	GAAA	2	8	1029614	1029621	75 %	0 %	25 %	0 %	268316473
24572	NC_013501	GCG	2	6	1029626	1029631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316473
24573	NC_013501	GAC	2	6	1029729	1029734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
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24575	NC_013501	CTA	2	6	1029797	1029802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316473
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24579	NC_013501	TCGA	2	8	1029900	1029907	25 %	25 %	25 %	25 %	268316473
24580	NC_013501	ACC	2	6	1029928	1029933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316473
24581	NC_013501	CCGG	2	8	1029956	1029963	0 %	0 %	50 %	50 %	268316473
24582	NC_013501	ACG	2	6	1029982	1029987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24583	NC_013501	G	7	7	1029987	1029993	0 %	0 %	100 %	0 %	268316473
24584	NC_013501	GAC	2	6	1030008	1030013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
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24586	NC_013501	CGG	2	6	1030100	1030105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316473
24587	NC_013501	GGTC	2	8	1030127	1030134	0 %	25 %	50 %	25 %	268316473
24588	NC_013501	GCT	2	6	1030193	1030198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24589	NC_013501	TGCAGG	2	12	1030213	1030224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268316473
24590	NC_013501	CACG	2	8	1030231	1030238	25 %	0 %	25 %	50 %	268316473
24591	NC_013501	ACT	2	6	1030273	1030278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316473
24592	NC_013501	CCGCT	2	10	1030344	1030353	0 %	20 %	20 %	60 %	268316473
24593	NC_013501	CCA	2	6	1030385	1030390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316473
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24596	NC_013501	ACG	2	6	1030518	1030523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
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24598	NC_013501	CG	3	6	1030591	1030596	0 %	0 %	50 %	50 %	268316473
24599	NC_013501	CGG	2	6	1030598	1030603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316473
24600	NC_013501	GCA	2	6	1030637	1030642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24601	NC_013501	GCA	2	6	1030670	1030675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24602	NC_013501	GAC	2	6	1030719	1030724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24603	NC_013501	GACC	2	8	1030781	1030788	25 %	0 %	25 %	50 %	268316473
24604	NC_013501	CGT	2	6	1030808	1030813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24605	NC_013501	CGG	2	6	1030859	1030864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316473
24606	NC_013501	CGG	2	6	1030883	1030888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316473
24607	NC_013501	TGG	3	9	1030969	1030977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316473
24608	NC_013501	CACG	2	8	1030979	1030986	25 %	0 %	25 %	50 %	268316473
24609	NC_013501	CGCT	2	8	1030989	1030996	0 %	25 %	25 %	50 %	268316473
24610	NC_013501	GGA	2	6	1031012	1031017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316473
24611	NC_013501	AGC	2	6	1031023	1031028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
24612	NC_013501	GCC	2	6	1031112	1031117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316473
24613	NC_013501	CGCC	2	8	1031134	1031141	0 %	0 %	25 %	75 %	268316473
24614	NC_013501	TAC	2	6	1031154	1031159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316473
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24616	NC_013501	GAC	2	6	1031202	1031207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316473
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24733	NC_013501	GGCGT	2	10	1035832	1035841	0 %	20 %	60 %	20 %	268316477
24734	NC_013501	GCA	2	6	1035888	1035893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316477
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24742	NC_013501	CGT	2	6	1036165	1036170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316477
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24841	NC_013501	ACGCTG	2	12	1041336	1041347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268316480
24842	NC_013501	CTG	2	6	1041366	1041371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316480
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24845	NC_013501	CTG	2	6	1041420	1041425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316480
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