MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24004	NC_013501	TAA	2	6	1005014	1005019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268316456
24005	NC_013501	TGT	3	9	1005059	1005067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316456
24006	NC_013501	TGA	2	6	1005077	1005082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316456
24007	NC_013501	TAT	2	6	1005164	1005169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268316456
24008	NC_013501	AT	3	6	1005168	1005173	50 %	50 %	0 %	0 %	268316456
24009	NC_013501	TGA	2	6	1005186	1005191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316456
24010	NC_013501	GT	3	6	1005209	1005214	0 %	50 %	50 %	0 %	268316456
24011	NC_013501	T	6	6	1005362	1005367	0 %	100 %	0 %	0 %	268316456
24012	NC_013501	TA	3	6	1005374	1005379	50 %	50 %	0 %	0 %	268316456
24013	NC_013501	GTT	2	6	1005402	1005407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316456
24014	NC_013501	T	6	6	1005406	1005411	0 %	100 %	0 %	0 %	268316456
24015	NC_013501	TTGC	2	8	1005424	1005431	0 %	50 %	25 %	25 %	268316456
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24110	NC_013501	CCCG	2	8	1010288	1010295	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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24117	NC_013501	G	6	6	1010510	1010515	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24118	NC_013501	GCTT	2	8	1010557	1010564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24119	NC_013501	CATGA	2	10	1010620	1010629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24120	NC_013501	AAC	2	6	1010671	1010676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24121	NC_013501	ACG	2	6	1010701	1010706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316460
24122	NC_013501	CGC	2	6	1010758	1010763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316460
24123	NC_013501	GCTGGC	2	12	1010781	1010792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268316460
24124	NC_013501	TGG	2	6	1010810	1010815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316460
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24129	NC_013501	TGG	2	6	1010906	1010911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316460
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24189	NC_013501	C	6	6	1013826	1013831	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24190	NC_013501	G	6	6	1013835	1013840	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24191	NC_013501	CGGG	3	12	1013883	1013894	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24192	NC_013501	CAT	2	6	1013957	1013962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24220	NC_013501	ACC	2	6	1014859	1014864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316462
24221	NC_013501	CGCC	2	8	1014930	1014937	0 %	0 %	25 %	75 %	268316462
24222	NC_013501	TGC	2	6	1014941	1014946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316462
24223	NC_013501	CTG	2	6	1014982	1014987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316462
24224	NC_013501	CA	3	6	1015025	1015030	50 %	0 %	0 %	50 %	268316462
24225	NC_013501	ATC	2	6	1015060	1015065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316462
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24231	NC_013501	CGA	2	6	1015425	1015430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316462
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24233	NC_013501	CCA	2	6	1015514	1015519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316462
24234	NC_013501	GAC	2	6	1015522	1015527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316462
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24236	NC_013501	CCGG	2	8	1015553	1015560	0 %	0 %	50 %	50 %	268316462
24237	NC_013501	TTC	2	6	1015573	1015578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316462
24238	NC_013501	GCGCC	2	10	1015590	1015599	0 %	0 %	40 %	60 %	268316462
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24350	NC_013501	GCT	2	6	1020621	1020626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316465
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24353	NC_013501	GCG	2	6	1020726	1020731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316465
24354	NC_013501	TGGC	2	8	1020733	1020740	0 %	25 %	50 %	25 %	268316465
24355	NC_013501	TGG	2	6	1020755	1020760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316465
24356	NC_013501	CGG	2	6	1020762	1020767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316465
24357	NC_013501	GCCG	2	8	1020795	1020802	0 %	0 %	50 %	50 %	268316465
24358	NC_013501	GAA	2	6	1020916	1020921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316465
24359	NC_013501	ATC	2	6	1020940	1020945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316465
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24361	NC_013501	GCA	2	6	1021038	1021043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316465
24362	NC_013501	GCGT	2	8	1021070	1021077	0 %	25 %	50 %	25 %	268316465
24363	NC_013501	CAA	2	6	1021263	1021268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316465
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24366	NC_013501	GGA	2	6	1021521	1021526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316465
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24386	NC_013501	CTG	2	6	1022283	1022288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316466
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24414	NC_013501	ACCA	2	8	1023660	1023667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24415	NC_013501	CCG	2	6	1023716	1023721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24416	NC_013501	A	7	7	1023778	1023784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24417	NC_013501	TCG	2	6	1023853	1023858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316467
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24420	NC_013501	TCG	2	6	1023913	1023918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316467
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24422	NC_013501	CGT	2	6	1023929	1023934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316467
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24424	NC_013501	TCG	2	6	1023970	1023975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316467
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24437	NC_013501	CG	3	6	1024489	1024494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24438	NC_013501	GGA	2	6	1024506	1024511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24439	NC_013501	GAT	2	6	1024552	1024557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316468
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24444	NC_013501	CG	3	6	1024722	1024727	0 %	0 %	50 %	50 %	268316468
24445	NC_013501	TGG	2	6	1024737	1024742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316468
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24449	NC_013501	TGC	3	9	1024821	1024829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316468
24450	NC_013501	TCA	2	6	1024860	1024865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316468
24451	NC_013501	CAG	2	6	1024889	1024894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316468
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24458	NC_013501	TCA	3	9	1025136	1025144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316468
24459	NC_013501	AGC	2	6	1025214	1025219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316468
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24462	NC_013501	ATC	2	6	1025363	1025368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316468
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24467	NC_013501	CGC	2	6	1025596	1025601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316468
24468	NC_013501	ACG	2	6	1025653	1025658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24469	NC_013501	TCG	2	6	1025744	1025749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316469
24470	NC_013501	GGC	2	6	1025773	1025778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316469
24471	NC_013501	GAT	2	6	1025779	1025784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316469
24472	NC_013501	GGC	2	6	1025788	1025793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316469
24473	NC_013501	GTC	2	6	1025803	1025808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316469
24474	NC_013501	GTG	2	6	1025842	1025847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316469
24475	NC_013501	GGT	2	6	1025868	1025873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316469
24476	NC_013501	TGAA	2	8	1025876	1025883	50 %	25 %	25 %	0 %	268316469
24477	NC_013501	GGT	2	6	1025919	1025924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316469
24478	NC_013501	GCC	2	6	1025929	1025934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316469
24479	NC_013501	GCCA	2	8	1025981	1025988	25 %	0 %	25 %	50 %	268316469
24480	NC_013501	TAGA	2	8	1026025	1026032	50 %	25 %	25 %	0 %	268316469
24481	NC_013501	C	6	6	1026033	1026038	0 %	0 %	0 %	100 %	268316469
24482	NC_013501	GCC	3	9	1026046	1026054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316469
24483	NC_013501	GGC	2	6	1026102	1026107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316469
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24487	NC_013501	CAC	2	6	1026349	1026354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316469
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24489	NC_013501	TCG	3	9	1026416	1026424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316469
24490	NC_013501	CGA	2	6	1026606	1026611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316469
24491	NC_013501	GCT	2	6	1026660	1026665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316469
24492	NC_013501	GGC	2	6	1026684	1026689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316469
24493	NC_013501	GCG	2	6	1026730	1026735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316469
24494	NC_013501	GCC	3	9	1026736	1026744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316469
24495	NC_013501	GCCAGC	2	12	1026764	1026775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268316469
24496	NC_013501	CGC	3	9	1026791	1026799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316469
24497	NC_013501	CAG	2	6	1026841	1026846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316469
24498	NC_013501	GGC	2	6	1026877	1026882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316469
24499	NC_013501	ACC	2	6	1026914	1026919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316469
24500	NC_013501	GTG	2	6	1027012	1027017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316469

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