MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_013501	TAA	2	6	983187	983192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23502	NC_013501	CGCA	2	8	983224	983231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23503	NC_013501	AAGA	2	8	983317	983324	75 %	0 %	25 %	0 %	268316438
23504	NC_013501	CG	3	6	983328	983333	0 %	0 %	50 %	50 %	268316438
23505	NC_013501	GC	3	6	983500	983505	0 %	0 %	50 %	50 %	268316438
23506	NC_013501	CGT	2	6	983542	983547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316438
23507	NC_013501	GCC	2	6	983659	983664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316438
23508	NC_013501	T	6	6	983743	983748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23509	NC_013501	TGC	2	6	983766	983771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23510	NC_013501	GTG	2	6	983795	983800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316439
23511	NC_013501	ACTGGC	2	12	983830	983841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268316439
23512	NC_013501	GCG	2	6	983891	983896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316439
23513	NC_013501	TGC	2	6	983904	983909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316439
23514	NC_013501	GCT	2	6	984028	984033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316439
23515	NC_013501	AAG	2	6	984119	984124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316439
23516	NC_013501	GGC	2	6	984154	984159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316439
23517	NC_013501	TCA	2	6	984162	984167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316439
23518	NC_013501	CAG	2	6	984188	984193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316439
23519	NC_013501	CA	3	6	984246	984251	50 %	0 %	0 %	50 %	268316440
23520	NC_013501	GCC	2	6	984311	984316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316440
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23522	NC_013501	CGA	2	6	984343	984348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316440
23523	NC_013501	TGGCC	2	10	984382	984391	0 %	20 %	40 %	40 %	268316440
23524	NC_013501	TGG	2	6	984426	984431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316440
23525	NC_013501	AGG	2	6	984447	984452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316440
23526	NC_013501	GCCCAT	2	12	984481	984492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268316440
23527	NC_013501	TTC	2	6	984494	984499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316440
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23529	NC_013501	GAG	2	6	984545	984550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316440
23530	NC_013501	CTGT	2	8	984553	984560	0 %	50 %	25 %	25 %	268316440
23531	NC_013501	GGT	2	6	984580	984585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316440
23532	NC_013501	ATC	2	6	984690	984695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316440
23533	NC_013501	GCC	2	6	984833	984838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23534	NC_013501	GCG	2	6	984922	984927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316441
23535	NC_013501	CGG	2	6	984968	984973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316441
23536	NC_013501	CGGT	2	8	985019	985026	0 %	25 %	50 %	25 %	268316441
23537	NC_013501	CGCT	2	8	985093	985100	0 %	25 %	25 %	50 %	268316441
23538	NC_013501	CCG	2	6	985103	985108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316441
23539	NC_013501	GAG	2	6	985144	985149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316441
23540	NC_013501	GCCG	2	8	985232	985239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23541	NC_013501	TC	3	6	985258	985263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23542	NC_013501	ACT	2	6	985335	985340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316442
23543	NC_013501	CGTGCT	2	12	985443	985454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316442
23544	NC_013501	CGAC	2	8	985475	985482	25 %	0 %	25 %	50 %	268316442
23545	NC_013501	CG	3	6	985565	985570	0 %	0 %	50 %	50 %	268316442
23546	NC_013501	CCG	2	6	985640	985645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316442
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23548	NC_013501	GAT	2	6	985815	985820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316442
23549	NC_013501	TGG	2	6	985847	985852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316442
23550	NC_013501	CAG	2	6	985879	985884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316442
23551	NC_013501	CGA	2	6	985890	985895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316442
23552	NC_013501	GGT	2	6	985938	985943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316442
23553	NC_013501	GCGG	2	8	986098	986105	0 %	0 %	75 %	25 %	268316442
23554	NC_013501	GGA	2	6	986199	986204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316442
23555	NC_013501	CGC	2	6	986241	986246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316442
23556	NC_013501	GC	3	6	986245	986250	0 %	0 %	50 %	50 %	268316442
23557	NC_013501	TTC	2	6	986290	986295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316442
23558	NC_013501	GGA	2	6	986301	986306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316442
23559	NC_013501	CAG	2	6	986359	986364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316442
23560	NC_013501	CTG	2	6	986377	986382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316442
23561	NC_013501	TCGC	2	8	986388	986395	0 %	25 %	25 %	50 %	268316442
23562	NC_013501	CGG	3	9	986449	986457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316442
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23564	NC_013501	GAG	2	6	986644	986649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316442
23565	NC_013501	GC	4	8	986663	986670	0 %	0 %	50 %	50 %	268316442
23566	NC_013501	GAG	2	6	986698	986703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316442
23567	NC_013501	GCG	2	6	986729	986734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316442
23568	NC_013501	CGG	2	6	986752	986757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316442
23569	NC_013501	TGGTG	2	10	986784	986793	0 %	40 %	60 %	0 %	268316442
23570	NC_013501	CTGGC	2	10	986836	986845	0 %	20 %	40 %	40 %	268316442
23571	NC_013501	CGCTG	2	10	987005	987014	0 %	20 %	40 %	40 %	268316442
23572	NC_013501	TATC	2	8	987120	987127	25 %	50 %	0 %	25 %	268316442
23573	NC_013501	CCAGGC	2	12	987135	987146	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268316442
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23575	NC_013501	G	7	7	987155	987161	0 %	0 %	100 %	0 %	268316442
23576	NC_013501	GCT	3	9	987165	987173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316442
23577	NC_013501	GTGG	2	8	987208	987215	0 %	25 %	75 %	0 %	268316442
23578	NC_013501	CGC	4	12	987266	987277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316442
23579	NC_013501	GGCC	2	8	987317	987324	0 %	0 %	50 %	50 %	268316442
23580	NC_013501	TGG	2	6	987356	987361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316442
23581	NC_013501	GAG	2	6	987385	987390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316442
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23583	NC_013501	CTG	2	6	987487	987492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316442
23584	NC_013501	GCC	2	6	987518	987523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316442
23585	NC_013501	TGC	2	6	987575	987580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316442
23586	NC_013501	CAAA	2	8	987607	987614	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23587	NC_013501	T	6	6	987641	987646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23588	NC_013501	GCG	2	6	987738	987743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316443
23589	NC_013501	CTG	3	9	987790	987798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316443
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23591	NC_013501	CGC	2	6	987855	987860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316443
23592	NC_013501	CGA	2	6	987879	987884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316443
23593	NC_013501	CGTTC	2	10	987924	987933	0 %	40 %	20 %	40 %	268316443
23594	NC_013501	CCA	2	6	988026	988031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316443
23595	NC_013501	GCCGG	2	10	988096	988105	0 %	0 %	60 %	40 %	268316443
23596	NC_013501	CTT	2	6	988158	988163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316443
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23598	NC_013501	GGAT	2	8	988227	988234	25 %	25 %	50 %	0 %	268316443
23599	NC_013501	CGA	2	6	988335	988340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316443
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23601	NC_013501	GC	3	6	988384	988389	0 %	0 %	50 %	50 %	268316443
23602	NC_013501	ACC	2	6	988436	988441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316443
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23604	NC_013501	GGATCG	2	12	988578	988589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268316443
23605	NC_013501	AGCCC	2	10	988629	988638	20 %	0 %	20 %	60 %	268316443
23606	NC_013501	GCA	2	6	988646	988651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316443
23607	NC_013501	CTTC	2	8	988703	988710	0 %	50 %	0 %	50 %	268316443
23608	NC_013501	GCG	2	6	988757	988762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316443
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23613	NC_013501	GAT	2	6	988884	988889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316443
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23616	NC_013501	GCC	2	6	989096	989101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316443
23617	NC_013501	AGC	2	6	989108	989113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316443
23618	NC_013501	CGTAA	2	10	989124	989133	40 %	20 %	20 %	20 %	268316443
23619	NC_013501	GGC	2	6	989239	989244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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23621	NC_013501	AAC	2	6	989316	989321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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