MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_013501	ATGTTC	2	12	941882	941893	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268316391
22503	NC_013501	T	6	6	941895	941900	0 %	100 %	0 %	0 %	268316391
22504	NC_013501	CTG	2	6	941938	941943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316391
22505	NC_013501	TGG	2	6	941981	941986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316391
22506	NC_013501	GCTT	2	8	942183	942190	0 %	50 %	25 %	25 %	268316391
22507	NC_013501	TTG	2	6	942203	942208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316391
22508	NC_013501	TCC	2	6	942252	942257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316391
22509	NC_013501	TCA	2	6	942305	942310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316391
22510	NC_013501	TGG	2	6	942311	942316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316391
22511	NC_013501	TGC	2	6	942350	942355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316391
22512	NC_013501	AGC	2	6	942431	942436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316391
22513	NC_013501	TGCG	2	8	942575	942582	0 %	25 %	50 %	25 %	268316391
22514	NC_013501	GTT	2	6	942592	942597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316391
22515	NC_013501	ACA	2	6	942630	942635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316391
22516	NC_013501	GAA	2	6	942673	942678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316391
22517	NC_013501	GCA	2	6	942693	942698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316391
22518	NC_013501	ATA	2	6	942867	942872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22519	NC_013501	GCT	2	6	942878	942883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22520	NC_013501	TAT	2	6	942891	942896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22521	NC_013501	T	7	7	942908	942914	0 %	100 %	0 %	0 %	268316392
22522	NC_013501	CCT	2	6	943060	943065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316392
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22524	NC_013501	GGT	2	6	943112	943117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316392
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22526	NC_013501	GAG	2	6	943176	943181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316392
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22529	NC_013501	T	7	7	943218	943224	0 %	100 %	0 %	0 %	268316392
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22532	NC_013501	TCTGT	2	10	943338	943347	0 %	60 %	20 %	20 %	268316392
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22535	NC_013501	TG	3	6	943412	943417	0 %	50 %	50 %	0 %	268316392
22536	NC_013501	AGAA	2	8	943422	943429	75 %	0 %	25 %	0 %	268316392
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22541	NC_013501	TAT	2	6	943559	943564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268316392
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22544	NC_013501	CTG	2	6	943695	943700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316392
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22548	NC_013501	CGG	3	9	943912	943920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316393
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22555	NC_013501	ACG	2	6	944112	944117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316393
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22571	NC_013501	CGGC	2	8	944836	944843	0 %	0 %	50 %	50 %	268316393
22572	NC_013501	CCGC	2	8	944874	944881	0 %	0 %	25 %	75 %	268316393
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22574	NC_013501	GCT	2	6	945025	945030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316393
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22578	NC_013501	GGCG	2	8	945201	945208	0 %	0 %	75 %	25 %	268316394
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22594	NC_013501	CGCA	2	8	945802	945809	25 %	0 %	25 %	50 %	268316394
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22979	NC_013501	AAG	2	6	961138	961143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316404
22980	NC_013501	AGA	2	6	961154	961159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316404
22981	NC_013501	GAG	2	6	961186	961191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316404
22982	NC_013501	GCGG	2	8	961224	961231	0 %	0 %	75 %	25 %	268316404
22983	NC_013501	AAC	2	6	961234	961239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316404
22984	NC_013501	GCCGC	2	10	961240	961249	0 %	0 %	40 %	60 %	268316404
22985	NC_013501	GCC	2	6	961265	961270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316404
22986	NC_013501	GTGG	2	8	961273	961280	0 %	25 %	75 %	0 %	268316404
22987	NC_013501	ATC	2	6	961345	961350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316404
22988	NC_013501	GGC	2	6	961410	961415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316404
22989	NC_013501	AAG	3	9	961441	961449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316404
22990	NC_013501	GAC	2	6	961450	961455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316404
22991	NC_013501	AGA	2	6	961539	961544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22992	NC_013501	CAT	2	6	961597	961602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316405
22993	NC_013501	ACG	2	6	961628	961633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316405
22994	NC_013501	CGGG	2	8	961657	961664	0 %	0 %	75 %	25 %	268316405
22995	NC_013501	GGC	2	6	961693	961698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316405
22996	NC_013501	TGGA	2	8	961709	961716	25 %	25 %	50 %	0 %	268316405
22997	NC_013501	ATCACG	2	12	961736	961747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268316405
22998	NC_013501	ACC	2	6	961757	961762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316405
22999	NC_013501	CAT	2	6	961810	961815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316405
23000	NC_013501	GCTC	2	8	961857	961864	0 %	25 %	25 %	50 %	268316405

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