MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_013501	GCT	2	6	898369	898374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21502	NC_013501	CCTGCA	2	12	898387	898398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268316341
21503	NC_013501	CAT	2	6	898403	898408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316341
21504	NC_013501	CGA	2	6	898438	898443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21505	NC_013501	GCT	3	9	898444	898452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21506	NC_013501	TGC	2	6	898485	898490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21507	NC_013501	CAG	2	6	898502	898507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21508	NC_013501	GCT	2	6	898552	898557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21509	NC_013501	CCT	2	6	898558	898563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316341
21510	NC_013501	CAC	2	6	898634	898639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316341
21511	NC_013501	GTG	2	6	898662	898667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316341
21512	NC_013501	GAG	2	6	898760	898765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316341
21513	NC_013501	GGA	2	6	898780	898785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316341
21514	NC_013501	ACC	2	6	898791	898796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316341
21515	NC_013501	GC	3	6	898839	898844	0 %	0 %	50 %	50 %	268316341
21516	NC_013501	AGC	2	6	898863	898868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21517	NC_013501	GTC	2	6	898884	898889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316341
21518	NC_013501	CCT	2	6	898897	898902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316342
21519	NC_013501	GTT	2	6	898971	898976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316342
21520	NC_013501	TCC	2	6	899005	899010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316342
21521	NC_013501	GTG	2	6	899023	899028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316342
21522	NC_013501	TGA	2	6	899120	899125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316342
21523	NC_013501	ATC	2	6	899247	899252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316342
21524	NC_013501	GAC	2	6	899253	899258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316342
21525	NC_013501	CTGGCT	2	12	899385	899396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316343
21526	NC_013501	AGCGC	2	10	899462	899471	20 %	0 %	40 %	40 %	268316343
21527	NC_013501	T	6	6	899546	899551	0 %	100 %	0 %	0 %	268316343
21528	NC_013501	GTC	2	6	899640	899645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316343
21529	NC_013501	GAC	2	6	899646	899651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316343
21530	NC_013501	CTT	2	6	899700	899705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316344
21531	NC_013501	GCC	2	6	899794	899799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316344
21532	NC_013501	TCG	2	6	899849	899854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316344
21533	NC_013501	GAT	2	6	899878	899883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316344
21534	NC_013501	CTG	2	6	899989	899994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316344
21535	NC_013501	GGC	2	6	900020	900025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316344
21536	NC_013501	CTG	2	6	900058	900063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316344
21537	NC_013501	CTG	2	6	900067	900072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316344
21538	NC_013501	GAT	2	6	900100	900105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316344
21539	NC_013501	CGC	2	6	900177	900182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316344
21540	NC_013501	AGC	2	6	900186	900191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316344
21541	NC_013501	TTC	2	6	900247	900252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316344
21542	NC_013501	GC	3	6	900273	900278	0 %	0 %	50 %	50 %	268316344
21543	NC_013501	GAAA	2	8	900279	900286	75 %	0 %	25 %	0 %	268316344
21544	NC_013501	TGATGG	2	12	900297	900308	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	268316344
21545	NC_013501	TCC	2	6	900329	900334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316344
21546	NC_013501	TTCA	2	8	900391	900398	25 %	50 %	0 %	25 %	268316344
21547	NC_013501	GGC	2	6	900399	900404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316344
21548	NC_013501	CAG	2	6	900421	900426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316344
21549	NC_013501	TTG	2	6	900434	900439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316344
21550	NC_013501	CTG	2	6	900484	900489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316344
21551	NC_013501	TGT	2	6	900515	900520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316344
21552	NC_013501	CAG	2	6	900544	900549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316344
21553	NC_013501	CGG	2	6	900592	900597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316345
21554	NC_013501	CGT	2	6	900611	900616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316345
21555	NC_013501	CTG	2	6	900657	900662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316345
21556	NC_013501	AAG	2	6	900673	900678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316345
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21559	NC_013501	GCC	2	6	900766	900771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316345
21560	NC_013501	GTC	2	6	900786	900791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316345
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21564	NC_013501	TCG	2	6	900931	900936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316345
21565	NC_013501	TGC	2	6	900937	900942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316345
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21567	NC_013501	T	6	6	901011	901016	0 %	100 %	0 %	0 %	268316345
21568	NC_013501	CAG	2	6	901047	901052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316345
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21571	NC_013501	GCA	2	6	901181	901186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316345
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21573	NC_013501	GCG	3	9	901219	901227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316345
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21578	NC_013501	GCA	2	6	901355	901360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316345
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21582	NC_013501	TCG	2	6	901519	901524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316345
21583	NC_013501	GC	3	6	901559	901564	0 %	0 %	50 %	50 %	268316345
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21587	NC_013501	CGG	2	6	901742	901747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316345
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21589	NC_013501	TGC	2	6	901804	901809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316345
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21591	NC_013501	GCTTCG	2	12	901867	901878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316346
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21601	NC_013501	TCGCGC	2	12	902128	902139	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268316346
21602	NC_013501	ACG	2	6	902170	902175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316346
21603	NC_013501	TGA	2	6	902198	902203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316346
21604	NC_013501	CGA	2	6	902210	902215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316346
21605	NC_013501	CG	3	6	902234	902239	0 %	0 %	50 %	50 %	268316346
21606	NC_013501	GAT	2	6	902256	902261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316346
21607	NC_013501	CTG	3	9	902346	902354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316346
21608	NC_013501	CTT	2	6	902422	902427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21609	NC_013501	A	6	6	902452	902457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21610	NC_013501	TCG	2	6	902542	902547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316347
21611	NC_013501	TGA	2	6	902555	902560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316347
21612	NC_013501	GAG	2	6	902707	902712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316347
21613	NC_013501	GTT	2	6	902760	902765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316347
21614	NC_013501	T	6	6	902792	902797	0 %	100 %	0 %	0 %	268316347
21615	NC_013501	CGA	2	6	902825	902830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316347
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